| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| JC JC | REL606 | 2,448,493 | IS186 (–) +6 bp | 100% | intergenic (+24/+21) | nupC → / ← yfeA | nucleoside (except guanosine) transporter/predicted diguanylate cyclase |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | REL606 | 2448493 = | 0 (0.000) | 93 (1.060) | 50/74 | NT | 100% | intergenic (+24/+26) | nupC/yfeA | nucleoside (except guanosine) transporter/predicted diguanylate cyclase |
| ? | REL606 | 2772854 = | NA (NA) | noncoding (1/1343 nt) | IS186 | repeat region | |||||
| * | ? | REL606 | = 2448498 | 0 (0.000) | 95 (1.080) | 48/74 | NT | 100% | intergenic (+29/+21) | nupC/yfeA | nucleoside (except guanosine) transporter/predicted diguanylate cyclase |
| ? | REL606 | = 2774196 | NA (NA) | noncoding (1343/1343 nt) | IS186 | repeat region | |||||
Only 100 of 142 total aligned reads displayed.
GAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGTTTTACCCCCGCGTGGTGGCTACTTCTTCGATTCGTAAGCGAGAACTGCC > REL606/2774147‑2774246 | gAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGt < 1:4312593/51‑1 (MQ=31)gAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGt > 1:3611359/1‑51 (MQ=31)gAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGt < 1:3459724/51‑1 (MQ=31) aGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGtt < 1:4734832/51‑1 (MQ=33) aGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGtt > 1:8701104/1‑51 (MQ=33) aGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGtt < 1:1488700/51‑1 (MQ=33) ggCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGttt < 1:1059419/51‑1 (MQ=35) ggCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGttt < 1:8550791/51‑1 (MQ=35) ggCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGttt > 1:3229697/1‑51 (MQ=35) ggCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGttt < 1:8838710/51‑1 (MQ=35) cGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGTTTTa < 1:3817164/51‑1 (MQ=40) 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1:5792057/1‑51 (MQ=255) cATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGTTTTAccccc > 1:4868204/1‑51 (MQ=255) aTTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGTTTTACCCCcg > 1:6550023/1‑51 (MQ=255) aTTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGTTTTACCCCcg < 1:290229/51‑1 (MQ=255) aTTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGTTTTACCCCcg > 1:6542798/1‑51 (MQ=255) aTTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGTTTTACCCCcg < 1:8458047/51‑1 (MQ=255) aTTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGTTTTACCCCcg > 1:5139125/1‑51 (MQ=255) ttcttcAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGTTTTACCCCcgc < 1:9419368/51‑1 (MQ=255) ttcttcAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGTTTTACCCCcgc > 1:1558541/1‑51 (MQ=255) cttcAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGTTTTACCCCCGCgt > 1:10059802/1‑51 (MQ=255) cttcAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGTTTTACCCCCGCgt < 1:6515223/51‑1 (MQ=255) ttcAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGTTTTACCCCCGCgtg > 1:8841856/1‑51 (MQ=255) ttcAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGTTTTACCCCCGCgtg > 1:10428760/1‑51 (MQ=255) 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(MQ=255) ttCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGTTTTACCCCCGCGTGGTGGCTAct < 1:1168147/51‑1 (MQ=255) ttCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGTTTTACCCCCGCGTGGTGGCTAct > 1:3859341/1‑51 (MQ=255) tCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGTTTTACCCCCGCGTGGTGGCTActt > 1:3578607/1‑51 (MQ=255) cAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGTTTTACCCCCGCGTGGTGGCTActtc < 1:4760866/51‑1 (MQ=255) aaCCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGTTTTACCCCCGCGtggtgg > 1:1112268/1‑43 (MQ=255) aaCCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGTTTTACCCCCGCGTGGTGGCTActtct > 1:7617908/1‑51 (MQ=255) aCCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGTTTTACCCCCGCGTGGTGGCTActtctt < 1:2244666/51‑1 (MQ=255) aCCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGTTTTACCCCCGCGTGGTGGCTActtctt > 1:9151034/1‑51 (MQ=255) aCCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGTTTTACCCCCGCGTGGTGGCTAcctctt > 1:9222122/1‑51 (MQ=255) ccTTAAGTTAGCGCTTATGGGTTTTACCCCCGCGTGGTGGCTACTTCTTCg < 1:3845046/51‑1 (MQ=255) ccTTAAGTTAGCGCTTATGGGTTTTACCCCCGCGTGGTGGCTACTTCTTCg < 1:10090635/51‑1 (MQ=255) cTTAAGTTAGCGCTTATGGGTTTTACCCCCGCGTGGTGGCTACTTCTTCGa < 1:5135785/51‑1 (MQ=255) aaGTTAGCGCTTATGGGTTTTACCCCCGCGTGGTGGCTACTTCTTCGATTc < 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(MQ=255) | GAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGTTTTACCCCCGCGTGGTGGCTACTTCTTCGATTCGTAAGCGAGAACTGCC > REL606/2774147‑2774246 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 28 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |