| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| JC JC | REL606 | 2,448,493 | IS186 (–) +6 bp | 100% | intergenic (+24/+21) | nupC → / ← yfeA | nucleoside (except guanosine) transporter/predicted diguanylate cyclase |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | REL606 | 2448493 = | 0 (0.000) | 93 (1.060) | 50/74 | NT | 100% | intergenic (+24/+26) | nupC/yfeA | nucleoside (except guanosine) transporter/predicted diguanylate cyclase |
| ? | REL606 | 2772854 = | NA (NA) | noncoding (1/1343 nt) | IS186 | repeat region | |||||
| * | ? | REL606 | = 2448498 | 0 (0.000) | 95 (1.080) | 48/74 | NT | 100% | intergenic (+29/+21) | nupC/yfeA | nucleoside (except guanosine) transporter/predicted diguanylate cyclase |
| ? | REL606 | = 2774196 | NA (NA) | noncoding (1343/1343 nt) | IS186 | repeat region | |||||
Only 100 of 288 total aligned reads displayed.
GCGTCAATCGCAGCACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCCGGTTTTTTTACGCCTGTTAATCAGCTAATGGCTGCGGGCGA > REL606/2448443‑2448543 | ttaaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatggga < 1:2145560‑M1/1‑1 (MQ=255)ttaaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatggga > 1:8451702‑M1/51‑51 (MQ=255)ttaaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatggga < 1:2747197‑M1/1‑1 (MQ=255)gCGTCAATCGCAGCACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGa < 1:5907922/51‑1 (MQ=255) taaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatgggAt > 1:8515038‑M1/50‑51 (MQ=255) taaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatgggAt > 1:4039873‑M1/50‑51 (MQ=255) cGTCAATCGCAGCACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGAt < 1:10257686/51‑1 (MQ=255) aaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatgggATa > 1:4947605‑M1/49‑51 (MQ=255) aaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatgggATa < 1:2629252‑M1/3‑1 (MQ=255) tCAATCGCAGCACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATaa > 1:1530850/1‑51 (MQ=255) tCAATCGCAGCACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATaa < 1:5573590/51‑1 (MQ=255) cAATCGCAGCACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAAt > 1:5362145/1‑51 (MQ=255) cAATCGCAGCACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAAt > 1:5487197/1‑51 (MQ=255) tCGCAGCACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTcc < 1:8052809‑M1/51‑3 (MQ=255) gcagcaCTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTccca > 1:828519‑M1/1‑47 (MQ=255) gcagcaCTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTccca > 1:8932279‑M1/1‑47 (MQ=255) tcaggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatgggATAATTCCCCg > 1:1326115‑M1/41‑51 (MQ=255) tcaggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatgggATAATTCCCCg < 1:9528913‑M1/11‑1 (MQ=255) agcaCTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTcccata > 1:4922820‑M1/1‑45 (MQ=255) agcaCTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTcccata < 1:7763632‑M1/51‑7 (MQ=255) agcaCTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTcccata < 1:10358064‑M1/51‑7 (MQ=255) gcaCTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTcccataa < 1:757932‑M1/51‑8 (MQ=255) gcaCTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTcccataa < 1:8095500‑M1/51‑8 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |