| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| JC JC | REL606 | 2,448,493 | IS186 (–) +6 bp | 100% | intergenic (+24/+21) | nupC → / ← yfeA | nucleoside (except guanosine) transporter/predicted diguanylate cyclase |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | REL606 | 2448493 = | 0 (0.000) | 93 (1.060) | 50/74 | NT | 100% | intergenic (+24/+26) | nupC/yfeA | nucleoside (except guanosine) transporter/predicted diguanylate cyclase |
| ? | REL606 | 2772854 = | NA (NA) | noncoding (1/1343 nt) | IS186 | repeat region | |||||
| * | ? | REL606 | = 2448498 | 0 (0.000) | 95 (1.080) | 48/74 | NT | 100% | intergenic (+29/+21) | nupC/yfeA | nucleoside (except guanosine) transporter/predicted diguanylate cyclase |
| ? | REL606 | = 2774196 | NA (NA) | noncoding (1343/1343 nt) | IS186 | repeat region | |||||
Only 100 of 290 total aligned reads displayed.
AATCGCAGCACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCCGGTTTTTTTACGCCTGTTAATCAGCTAATGGCTGCGGGCGACCAAT > REL606/2448448‑2448548 | catatcaggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatgggATAATTc < 1:2080371‑M1/7‑1 (MQ=255) tCGCAGCACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTcc < 1:8052809‑M1/51‑3 (MQ=255) atatcaggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatgggATAATTcc > 1:2562081‑M1/44‑51 (MQ=255) gcagcaCTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTccca > 1:828519‑M1/1‑47 (MQ=255) tcaggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatgggATAATTCCCCg < 1:9528913‑M1/11‑1 (MQ=255) tcaggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatgggATAATTCCCCg > 1:1326115‑M1/41‑51 (MQ=255) catcactgGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTcccat > 1:2601784‑M1/4‑46 (MQ=255) cagcaCTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTcccat > 1:5785699‑M1/1‑46 (MQ=255) caggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatgggATAATTCCCCgg > 1:7348529‑M1/40‑51 (MQ=255) agcaCTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTcccata < 1:7763632‑M1/51‑7 (MQ=255) gcaCTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTcccataa < 1:757932‑M1/51‑8 (MQ=255) caCTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTcccataag > 1:10541688‑M1/1‑43 (MQ=255) aCTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTcccataagc > 1:5311689‑M1/1‑42 (MQ=255) tGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTcccataagcgc > 1:1179464‑M1/1‑40 (MQ=255) gtaataccacaacccttaagttagcgcttatgggATAATTCCCCGGttttt < 1:1700708‑M1/17‑1 (MQ=255) taataccacaacccttaagttagcgcttatgggATAATTCCCCGGtttttt < 1:9759814‑M1/18‑1 (MQ=255) gTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTcccataagcgcta < 1:2712740‑M1/51‑14 (MQ=255) gTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTcccataagcgcta < 1:4949841‑M1/51‑14 (MQ=255) aataccacaacccttaagttagcgcttatgggATAATTCCCCGGttttttt < 1:5853500‑M1/19‑1 (MQ=255) aataccacaacccttaagttagcgcttatgggATAATTCCCCGGttttttt > 1:4540437‑M1/33‑51 (MQ=255) aataccacaacccttaagttagcgcttatgggATAATTCCCCGGttttttt > 1:2898902‑M1/33‑51 (MQ=255) tGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTcccataagcgctaa > 1:5992394‑M1/1‑37 (MQ=255) tGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTcccataagcgctaa > 1:9380346‑M1/1‑37 (MQ=255) taccacaacccttaagttagcgcttatgggATAATTCCCCGGTTTTTTTAc > 1:6873501‑M1/31‑51 (MQ=255) taccacaacccttaagttagcgcttatgggATAATTCCCCGGTTTTTTTAc < 1:10075347‑M1/21‑1 (MQ=255) gCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTcccataagcgctaac > 1:6137200‑M1/1‑36 (MQ=255) gCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTcccataagcgctaac > 1:498640‑M1/1‑36 (MQ=255) cTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTcccataagcgctaact > 1:57576‑M1/1‑35 (MQ=255) accacaacccttaagttagcgcttatgggATAATTCCCCGGTTTTTTTACg < 1:8620187‑M1/22‑1 (MQ=255) tGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTcccataagcgctaactt > 1:1264588‑M1/1‑34 (MQ=255) ccacaacccttaagttagcgcttatgggATAATTCCCCGGTTTTTTTACGc > 1:4068598‑M1/29‑51 (MQ=255) caacccttaagttagcgcttatgggATAATTCCCCGGTTTTTTTACGCCTg > 1:10009850‑M1/26‑51 (MQ=255) caacccttaagttagcgcttatgggATAATTCCCCGGTTTTTTTACGCCTg > 1:1350287‑M1/26‑51 (MQ=255) caacccttaagttagcgcttatgggATAATTCCCCGGTTTTTTTACGCCTg < 1:4015538‑M1/26‑1 (MQ=255) aacccttaagttagcgcttttgggATAATTCCCCGGTTTTTTTACGCCTGt > 1:7511309‑M1/25‑51 (MQ=255) aacccttaagttagcgcttatgggATAATTCCCCGGTTTTTTTACGCCTGt < 1:6654481‑M1/27‑1 (MQ=255) aacccttaagttagcgcttatgggATAATTCCCCGGTTTTTTTACGCCTGt < 1:5160174‑M1/27‑1 (MQ=255) aacccttaagttagcgcttatgggATAATTCCCCGGTTTTTTTACGCCTGt < 1:4642495‑M1/27‑1 (MQ=255) acccttaagttagcgcttatgggATAATTCCCCGGTTTTTTTACGCCTGtt > 1:10410264‑M1/24‑51 (MQ=255) aCCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTcccataagcgctaacttaagggt > 1:1806962‑M1/1‑28 (MQ=255) ccATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTcccataagcgctaacttaagggtt > 1:854290‑M1/1‑27 (MQ=255) ccATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTcccataagcgctaacttaagggtt > 1:6915894‑M1/1‑27 (MQ=255) cttaagttagcgcttatgggATAATTCCCCGGTTTTTTTACGCCTGTTAAt < 1:7299215‑M1/31‑1 (MQ=255) cttaagttagcgcttatgggATAATTCCCCGGTTTTTTTACGCCTGTTAAt > 1:6705379‑M1/21‑51 (MQ=255) catacataAAAAAGCCGGGGATAATTcccataagcgctaacttaagggttg > 1:10607820‑M1/1‑26 (MQ=255) catacataAAAAAGCCGGGGATAATTcccataagcgctaacttaagggttg > 1:9890002‑M1/1‑26 (MQ=255) ttaagttagcgcttatgggATAATTCCCCGGTTTTTTTACGCCTGTTAATc > 1:2306616‑M1/20‑51 (MQ=255) ttaagttagcgcttatgggATAATTCCCCGGTTTTTTTACGCCTGTTAATc > 1:6229427‑M1/20‑51 (MQ=255) tacataAAAAAGCCGGGGATAATTcccataagcgctaacttaagggttgaa < 1:7041613‑M1/51‑28 (MQ=255) taagttagcgcttatgggATAATTCCCCGGTTTTTTTACGCCTGTTAATCa > 1:4763705‑M1/19‑51 (MQ=255) taagttagcgcttatgggATAATTCCCCGGTTTTTTTACGCCTGTTAATCa < 1:3784854‑M1/33‑1 (MQ=255) ataAAAAAGCCGGGGATAATTcccataagcgctaacttaagggttgaacca > 1:3848971‑M1/1‑21 (MQ=255) ataAAAAAGCCGGGGATAATTcccataagcgctaacttaagggttgaacca > 1:6794600‑M1/1‑21 (MQ=255) ataAAAAAGCCGGGGATAATTcccataagcgctaacttaagggttgaacca > 1:6828345‑M1/1‑21 (MQ=255) ttagcgcttatgggATAATTCCCCGGTTTTTTTACGCCTGTTAATCAGCTa < 1:6568143‑M1/37‑1 (MQ=255) taAAAAAGCCGGGGATAATTcccataagcgctaacttaagggttgaaccat < 1:4508480‑M1/51‑32 (MQ=255) tagcgcttatgggATAATTCCCCGGTTTTTTTACGCCTGTTAATCAGCTaa > 1:7066587‑M1/14‑51 (MQ=255) tagcgcttatgggATAATTCCCCGGTTTTTTTACGCCTGTTAATCAGCTaa < 1:2421410‑M1/38‑1 (MQ=255) tagcgcttatgggATAATTCCCCGGTTTTTTTACGCCTGTTAATCAGCTaa > 1:7075267‑M1/14‑51 (MQ=255) tagcgcttatgggATAATTCCCCGGTTTTTTTACGCCTGTTAATCAGCTaa < 1:364359‑M1/38‑1 (MQ=255) aaaaaaGCCGGGGATAATTcccataagcgctaacttaagggttgaaccatc > 1:3428756‑M1/1‑19 (MQ=255) gcgcttatgggATAATTCCCCGGTTTTTTTACGCCTGTTAATCAGCTAATg < 1:10281888‑M1/40‑1 (MQ=255) aaaaGCCGGGGATAATTcccataagcgctaacttaagggttgaaccatctg > 1:8928499‑M1/1‑17 (MQ=255) cgcttatgggATAATTCCCCGGTTTTTTTACGCCTGTTAATCAGCTAATgg > 1:2806838‑M1/11‑51 (MQ=255) cgcttatgggATAATTCCCCGGTTTTTTTACGCCTGTTAATCAGCTAATgg < 1:4255723‑M1/41‑1 (MQ=255) aaaGCCGGGGATAATTcccataagcgctaacttaagggttgaaccatctga < 1:1370246‑M1/51‑36 (MQ=255) aaaGCCGGGGATAATTcccataagcgctaacttaagggttgaaccatctga > 1:4410941‑M1/1‑16 (MQ=255) cttatgggATAATTCCCCGGTTTTTTTACGCCTGTTAATCAGCTAATGGCt > 1:4275889‑M1/9‑51 (MQ=255) cttatgggATAATTCCCCGGTTTTTTTACGCCTGTTAATCAGCTAATGGCt < 1:10527280‑M1/43‑1 (MQ=255) ttatgggATAATTCCCCGGTTTTTTTACGCCTGTTAATCAGCTAATGGCTg > 1:10816933‑M1/8‑51 (MQ=255) ttatgggATAATTCCCCGGTTTTTTTACGCCTGTTAATCAGCTAATGGCTg < 1:4572807‑M1/44‑1 (MQ=255) tatgggATAATTCCCCGGTTTTTTTACGCCTGTTAATCAGCTAATGGCt > 1:4194610‑M1/7‑49 (MQ=255) tatgggATAATTCCCCGGTTTTTTTACGCCTGTTAATCAGCTAATGGCTGc < 1:32746‑M1/45‑1 (MQ=255) tatgggATAATTCCCCGGTTTTTTTACGCCTGTTAATCAGCTAATGGCTGc < 1:3728676‑M1/45‑1 (MQ=255) tatgggATAATTCCCCGGTTTTTTTACGCCTGTTAATCAGCTAATGGCTGc > 1:6346284‑M1/7‑51 (MQ=255) ccGGGGATAATTcccataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaagaa > 1:7643585‑M1/1‑12 (MQ=255) cGGGGATAATTcccataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaagaat > 1:3045460‑M1/1‑11 (MQ=255) cGGGGATAATTcccataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaagaat > 1:2474481‑M1/1‑11 (MQ=255) cGGGGATAATTcccataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaagaat > 1:10260249‑M1/1‑11 (MQ=255) tgggATAATTCCCCGGTTTTTTTACGCCTGTTAATCAGCTAATGGCTGCgg < 1:1935016‑M1/47‑1 (MQ=255) tgggATAATTCCCCGGTTTTTTTACGCCTGTTAATCAGCTAATGGCTGCgg > 1:8138626‑M1/5‑51 (MQ=255) gggATAATTcccataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaagaatgc > 1:8346008‑M1/1‑9 (MQ=255) ggATAATTcccataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaagaatgcg < 1:10943699‑M1/51‑44 (MQ=255) ggATAATTCCCCGGTTTTTTTACGCCTGTTAATCAGCTAATGGCTGCGGGc > 1:8443861‑M1/3‑51 (MQ=255) gATAATTcccataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaagaatgcga > 1:8203013‑M1/1‑7 (MQ=255) aTAATTcccataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaagaatgcgac < 1:9214580‑M1/51‑46 (MQ=255) aTAATTCCCCGGTTTTTTTACGCCTGTTAATCAGCTAATGGCTGCGGGCGa < 1:10715774/51‑1 (MQ=255) aTAATTCCCCGGTTTTTTTACGCCTGTTAATCAGCTAATGGCTGCGGGCGa > 1:8697159/1‑51 (MQ=255) aTAATTCCCCGGTTTTTTTACGCCTGTTAATCAGCTAATGGCTGCGGGCGa < 1:5575444/51‑1 (MQ=255) tAATTcccataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaagaatgcgacg > 1:8996919‑M1/1‑5 (MQ=255) tAATTcccataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaagaatgcgacg < 1:10886739‑M1/51‑47 (MQ=255) tAATTCCCCGGTTTTTTTACGCCTGTTAATCAGCTAATGGCTGCGGGCGAc > 1:5452661/1‑51 (MQ=255) aaTTcccataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaagaatgcgacgc > 1:6396197‑M1/1‑4 (MQ=255) aaTTcccataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaagaatgcgacgc > 1:4900638‑M1/1‑4 (MQ=255) ttcccataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaagaatgcgacgcct < 1:5943985‑M1/51‑50 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |