| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| JC JC | REL606 | 2,448,493 | IS186 (–) +6 bp | 100% | intergenic (+24/+21) | nupC → / ← yfeA | nucleoside (except guanosine) transporter/predicted diguanylate cyclase |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | REL606 | 2448493 = | 0 (0.000) | 93 (1.060) | 50/74 | NT | 100% | intergenic (+24/+26) | nupC/yfeA | nucleoside (except guanosine) transporter/predicted diguanylate cyclase |
| ? | REL606 | 2772854 = | NA (NA) | noncoding (1/1343 nt) | IS186 | repeat region | |||||
| * | ? | REL606 | = 2448498 | 0 (0.000) | 95 (1.080) | 48/74 | NT | 100% | intergenic (+29/+21) | nupC/yfeA | nucleoside (except guanosine) transporter/predicted diguanylate cyclase |
| ? | REL606 | = 2774196 | NA (NA) | noncoding (1343/1343 nt) | IS186 | repeat region | |||||
Only 100 of 184 total aligned reads displayed.
CGCCCGCAGCCATTAGCTGATTAACAGGCGTAAAAAAACCGGGGAATTATccc‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < REL606/2448542‑2448493‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGT > REL606/2772854‑2772906 CGCCCGCAGCCATTAGCTGATTAACAGGCGTAAAAAAACCGGGGAATTATC < 1:2662830/51‑1CGCCCGCAGCCATTAGCTGATTAACAGGCGTAAAAAAACCGGGGAATTATC < 1:3042393/51‑1CGCCCGCAGCCATTAGCTGATTAACAGGCGTAAAAAAACCGGGGAATTATC < 1:794360/51‑1 GCCCGCAGCCATTAGCTGATTAACAGGCGTAAAAAAACCGGGGAATTATCC < 1:7066607/51‑1 GCCCGCAGCCATTAGCTGATTAACAGGCGTAAAAAAACCGGGGAATTATCC > 1:1048717/1‑51 GCCCGCAGCCATTAGCTGATTAACAGGCGTAAAAAAACCGGGGAATTATCC > 1:7746107/1‑51 GCCCGCAGCCATTAGCTGATTAACAGGCGTAAAAAAACCGGGGAATTATCC > 1:8443861/1‑51 CCCGCAGCCATTAGCTGATTAACAGGCGTAAAAAAACCGGGGAATTATCCC < 1:2464604/51‑1 CGCAGCCATTAGCTGATTAACAGGCGTAAAAAAACCGGGGAATTATCCCAT < 1:9094227/51‑1 GCAGCCATTAGCTGATTAACAGGCGTAAAAAAACCGGGGAATTATCCCATA < 1:5235088/51‑1 GCAGCCATTAGCTGATTAACAGGCGTAAAAAAACCGGGGAATTATCCCATA > 1:4586924/1‑51 GCAGCCATTAGCTGATTAACAGGCGTAAAAAAACCGGGGAATTATCCCATA < 1:6674423/51‑1 GCAGCCATTAGCTGATTAACAGGCGTAAAAAAACCGGGGAATTATCCCATA > 1:10833393/1‑51 GCAGCCATTAGCTGATTAACAGGCGTAAAAAAACCGGGGAATTATCCCATA > 1:6346284/1‑51 AGCCATTAGCTGATTAACAGGCGTAAAAAAACCGGGGAATTATCCCATAAG > 1:4537041/1‑51 AGCCATTAGCTGATTAACAGGCGTAAAAAAACCGGGGAATTATCCCATAAG < 1:10527280/51‑1 AGCCATTAGCTGATTAACAGGCGTAAAAAAACCGGGGAATTATCCCATAAG > 1:4275889/1‑51 AGCCATTAGCTGATTAACAGGCGTAAAAAAACCGGGGAATTATCCCATAAG > 1:6796266/1‑51 AGCCATTAGCTGATTAACAGGCGTAAAAAAACCGGGGAATTATCCCATAAG > 1:1703816/1‑51 AGCCATTAGCTGATTAACAGGCGTAAAAAAACCGGGGAATTATCCCATA > 1:4194610/1‑49 GCCATTAGCTGATTAACAGGCGTAAAAAAACCGGGGAATTATCCCATAAGC > 1:2063829/1‑51 GCCATTAGCTGATTAACAGGCGTAAAAAAACCGGGGAATTATCCCATAAGC < 1:10533284/51‑1 CCATTAGCTGATTAACAGGCGTAAAAAAACCGGGGAATTATCCCATAAGCG < 1:9616917/51‑1 CCATTAGCTGATTAACAGGCGTAAAAAAACCGGGGAATTATCCCATAAGCG > 1:5873579/1‑51 CCATTAGCTGATTAACAGGCGTAAAAAAACCGGGGAATTATCCCATAAGCG < 1:4255723/51‑1 CATTAGCTGATTAACAGGCGTAAAAAAACCGGGGAATTATCCCATAAGCGC < 1:10281888/51‑1 TTAGCTGATTAACAGGCGTAAAAAAACCGGGGAATTATCCCATAAGCGCTA > 1:7066587/1‑51 TTAGCTGATTAACAGGCGTAAAAAAACCGGGGAATTATCCCATAAGCGCTA < 1:364359/51‑1 TAGCTGATTAACAGGCGTAAAAAAACCGGGGAATTATCCCATAAGCGCTAA < 1:6568143/51‑1 TAGCTGATTAACAGGCGTAAAAAAACCGGGGAATTATCCCATAAGCGCTAA > 1:3573058/1‑51 GCTGATTAACAGGCGTAAAAAAACCGGGGAATTATCCCATAAGCGCTAACT < 1:6018406/51‑1 CTGATTAACAGGCGTAAAAAAACCGGGGAATTATCCCATAAGCGCTAACT < 1:10771127/50‑1 TGATTAACAGGCGTAAAAAAACCGGGGAATTATCCCATAAGCGCTAACTTA < 1:4052070/51‑1 TGATTAACAGGCGTAAAAAAACCGGGGAATTATCCCATAAGCGCTAACTTA < 1:1280667/51‑1 TGATTAACAGGCGTAAAAAAACCGGGGAATTATCCCATAAGCGCTAACTTA < 1:7799681/51‑1 GATTAACAGGCGTAAAAAAACCGGGGAATTATCCCATAAGCGCTAACTTAA > 1:6229427/1‑51 GATTAACAGGCGTAAAAAAACCGGGGAATTATCCCATAAGCGCTAACTTAA > 1:2306616/1‑51 GATTAACAGGCGTAAAAAAACCGGGGAATTATCCCATAAGCGCTAACTTAA < 1:5060831/51‑1 ATTAACAGGCGTAAAAAAACCGGGGAATTATCCCATAAGCGCTAACTTAAG < 1:1972033/51‑1 ATTAACAGGCGTAAAAAAACCGGGGAATTATCCCATAAGCGCTAACTTAAG < 1:7299215/51‑1 TTAACAGGCGTAAAAAAACCGGGGAATTATCCCATAAGCGCTAACTTAAGG > 1:10606523/1‑51 TAACAGGCGTAAAAAAACCGGGGAATTATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGG > 1:1822903/1‑51 ACAGGCGTAAAAAAACCGGGGAATTATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTT < 1:6654481/51‑1 ACAGGCGTAAAAAAACCGGGGAATTATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTT > 1:5782289/1‑51 ACAGGCGTAAAAAAACCGGGGAATTATCCCAAAAGCGCTAACTTAAGGGTT > 1:7511309/1‑51 CAGGCGTAAAAAAACCGGGGAATTATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTG > 1:10009850/1‑51 CAGGCGTAAAAAAACCGGGGAATTATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTG > 1:8809745/1‑51 CAGGCGTAAAAAAACCGGGGAATTATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTG < 1:4015538/51‑1 CAGGCGTAAAAAAACCGGGGAATTATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTG > 1:1350287/1‑51 CAGGCGTAAAAAAACCGGGGAATTATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTG < 1:430758/51‑1 AGGCGTAAAAAAACCGGGGAATTATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGT < 1:5755556/51‑1 GGCGTAAAAAAACCGGGGAATTATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTG < 1:3853366/51‑1 CGTAAAAAAACCGGGGAATTATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGT < 1:8620187/51‑1 CGTAAAAAAACCGGGGAATTATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGT < 1:9308514/51‑1 CGTAAAAAAACCGGGGAATTATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGT > 1:7048663/1‑51 GTAAAAAAACCGGGGAATTATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTA > 1:6873501/1‑51 AAAAAAACCGGGGAATTATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATT > 1:2331116/1‑51 AAAAAAACCGGGGAATTATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATT > 1:5417524/1‑51 AAAAAAACCGGGGAATTATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATT > 1:4540437/1‑51 AAAAAAACCGGGGAATTATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATT > 1:465555/1‑51 AAAAAACCGGGGAATTATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTA < 1:9759814/51‑1 AAAAACCGGGGAATTATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTAC < 1:1700708/51‑1 AAAAACCGGGGAATTATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTAC < 1:340115/51‑1 AAACCGGGGAATTATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGC < 1:9537038/51‑1 ACCGGGGAATTATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCT < 1:2728595/51‑1 CCGGGGAATTATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTG > 1:8259655/1‑51 CGGGGAATTATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGA > 1:1326115/1‑51 CGGGGAATTATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGA < 1:4820673/51‑1 GGAATTATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATAT > 1:2562081/1‑51 GGAATTATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATAT < 1:7354377/51‑1 GAATTATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATG < 1:2080371/51‑1 ATTATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGAT > 1:1295971/1‑51 TATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTT < 1:2629252/51‑1 ATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTA > 1:4039873/1‑51 ATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTA < 1:4143283/51‑1 ATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTA > 1:8515038/1‑51 TCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAA < 1:3559714/51‑1 TCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAA < 1:2145560/51‑1 TCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAA > 1:2838419/1‑51 TCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAA < 1:10339775/51‑1 TCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAA < 1:10211941/51‑1 TCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAA < 1:2747197/51‑1 CCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAAC > 1:818074/1‑51 CCCATAAGCACTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAAC > 1:720492/1‑51 CCCATAAGCACTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAAC < 1:7993691/51‑1 CCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACG > 1:8242113/1‑51 CCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACG < 1:2772509/51‑1 CCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACG > 1:648921/1‑51 CCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACG < 1:8978397/51‑1 CCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACG < 1:1519330/51‑1 CCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACG < 1:7088784/51‑1 CCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACG > 1:9501734/1‑51 CCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACG < 1:10025708/51‑1 CCATAAGCACTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACG < 1:5676233/51‑1 CCATAAGCACTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACG < 1:10849167/51‑1 CATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGT > 1:3746609/1‑51 CATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGT > 1:6814694/1‑51 CATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGT > 1:6954080/1‑51 CATAAGCACTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGT > 1:5566977/1‑51 CATAAGCACTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGT > 1:1608886/1‑51 CGCCCGCAGCCATTAGCTGATTAACAGGCGTAAAAAAACCGGGGAATTATccc‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < REL606/2448542‑2448493‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGT > REL606/2772854‑2772906 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |