| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC JC | REL606 | 2,405,131 | IS1 (–) +9 bp | coding (168‑176/1347 nt) | fadL → | long‑chain fatty acid outer membrane transporter |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | REL606 | = 2263507 | NA (NA) | 108 (1.360) | 52/100 | 0.2 | 100% | noncoding (1/768 nt) | IS1 | repeat region |
| ? | REL606 | 2405131 = | 0 (0.000) | coding (168/1347 nt) | fadL | long‑chain fatty acid outer membrane transporter | |||||
| * | ? | REL606 | = 2405139 | 0 (0.000) | 85 (1.070) | 53/100 | 0.2 | 100% | coding (176/1347 nt) | fadL | long‑chain fatty acid outer membrane transporter |
| ? | REL606 | 2407442 = | NA (NA) | noncoding (768/768 nt) | IS1 | repeat region | |||||
GCTATCATGGCAGAATCATTTGCAACTGGTTCCGATCATCAGGTTGTAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCC > REL606/2407394‑2407489 | gCTATCATGGCAGAATCATTTGCAACTGGTTCCGATCATCAGGTTGTAGGt < 1:533051/51‑1 (MQ=255) cTATCATGGCAGAATCATTTGCAACTGGTTCCGATCATCAGGTTGTAGGTa < 1:6699332/51‑1 (MQ=255) aTCATGGCAGAATCATTTGCAACTGGTTCCGATCATCAGGTTGTAGGTAAt < 1:7101236/51‑1 (MQ=255) aTCATGGCAGAATCATTTGCAACTGGTTCCGATCATCAGGTTGTAGGTAAt > 1:4066659/1‑51 (MQ=255) aTCATGGCAGAATCATTTGCAACTGGTTCCGATCATCAGGTTGTAGGTAAt < 1:6044149/51‑1 (MQ=255) aTCATGGCAGAATCATTTGCAACTGGTTCCGATCATCAGGTTGTAGGTAAt > 1:614267/1‑51 (MQ=255) aTCATGGCAGAATCATTTGCAACTGGTTCCGATCATCAGGTTGTAGGTAAt > 1:5063416/1‑51 (MQ=255) aTCATGGCAGAATCATTTGCAACTGGTTCCGATCATCAGGTTGTAGGTAAt > 1:1782947/1‑51 (MQ=255) aTCATGGCAGAATCATTTGCAACTGGTTCCGATCATCAGGTTGTAGGTAAt < 1:1846370/51‑1 (MQ=255) tCATGGCAGAATCATTTGCAACTGGTTCCGATCATCAGGTTGTAGGTAATg < 1:3850970/51‑1 (MQ=255) tCATGGCAGAATCATTTGCAACTGGTTCCGATCATCAGGTTGTAGGTAATg > 1:6603019/1‑51 (MQ=255) 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1:803435/51‑1 (MQ=255) tGGTTCCGATCATCAGGTTGTAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGtt < 1:3099010/51‑1 (MQ=255) ggTTCCGATCATCAGGTTGTAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGttt < 1:2832887/51‑1 (MQ=255) ggTTCCGATCATCAGGTTGTAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGttt < 1:3428207/51‑1 (MQ=255) ggTTCCGATCATCAGGTTGTAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGttt < 1:5823915/51‑1 (MQ=255) gTTCCGATCATCAGGTTGTAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGtttt < 1:571545/51‑1 (MQ=255) ttCCGATCATCAGGTTGTAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTa < 1:4346504/51‑1 (MQ=255) ttCCGATCATCAGGTTGTAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTa < 1:1886709/51‑1 (MQ=255) ttCCGATCATCAGGTTGTAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTa > 1:811785/1‑51 (MQ=255) tCCGATCATCAGGTTGTAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTAt < 1:2421605/51‑1 (MQ=255) ccGATCATCAGGTTGTAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATg < 1:2447322/51‑1 (MQ=255) ccGATCATCAGGTTGTAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATg > 1:2308386/1‑51 (MQ=255) ccGATCATCAGGTTGTAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATg < 1:3516113/51‑1 (MQ=255) ccGATCATCAGGTTGTAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATg > 1:1577928/1‑51 (MQ=255) cGATCATCAGGTTGTAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGt > 1:2579771/1‑51 (MQ=255) cGATCATCAGGTTGTAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGt > 1:1890102/1‑51 (MQ=255) gATCATCAGGTTGTAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGtt < 1:1642869/51‑1 (MQ=255) gATCATCAGGTTGTAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGtt < 1:3578774/51‑1 (MQ=255) gATCATCAGGTTGTAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGtt < 1:1470837/51‑1 (MQ=255) gATCATCAGGTTGTAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGtt > 1:1459159/1‑51 (MQ=255) atcatcAGGTTGTAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTc > 1:6578690/1‑51 (MQ=255) atcatcAGGTTGTAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTc < 1:3026505/51‑1 (MQ=255) atcatcAGGTTGTAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTc > 1:6245463/1‑51 (MQ=255) atcatcAGGTTGTAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTc < 1:4928927/51‑1 (MQ=255) atcatcAGGTTGTAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTc > 1:5532168/1‑51 (MQ=255) atcatcAGGTTGTAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTc > 1:6249687/1‑51 (MQ=255) tcatcaGGTTGTAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCa > 1:2006046/1‑51 (MQ=255) tcatcaGGTTGTAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCa < 1:1536775/51‑1 (MQ=255) tcatcaGGTTGTAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCa < 1:2667021/51‑1 (MQ=255) catcaGGTTGTAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAg < 1:7096874/51‑1 (MQ=255) atcaGGTTGTAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGa > 1:7023567/1‑51 (MQ=255) tcaGGTTGTAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGAt > 1:2613527/1‑51 (MQ=255) caGGTTGTAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGAt < 1:3952414/50‑1 (MQ=255) caGGTTGTAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATa < 1:4385462/51‑1 (MQ=255) caGGTTGTAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATa < 1:2739208/51‑1 (MQ=255) aGGTTGTAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATaa < 1:4645879/51‑1 (MQ=255) ggTTGTAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAAt < 1:3630542/51‑1 (MQ=38) ggTTGTAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAAt > 1:2116006/1‑51 (MQ=38) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |