| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC JC | REL606 | 2,405,131 | IS1 (–) +9 bp | coding (168‑176/1347 nt) | fadL → | long‑chain fatty acid outer membrane transporter |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | REL606 | = 2263507 | NA (NA) | 108 (1.360) | 52/100 | 0.2 | 100% | noncoding (1/768 nt) | IS1 | repeat region |
| ? | REL606 | 2405131 = | 0 (0.000) | coding (168/1347 nt) | fadL | long‑chain fatty acid outer membrane transporter | |||||
| * | ? | REL606 | = 2405139 | 0 (0.000) | 85 (1.070) | 53/100 | 0.2 | 100% | coding (176/1347 nt) | fadL | long‑chain fatty acid outer membrane transporter |
| ? | REL606 | 2407442 = | NA (NA) | noncoding (768/768 nt) | IS1 | repeat region | |||||
GCTTATTCAGGGGAAGGCGCAATTGCCGATGATGCAGGTAACGTCAGCCG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > REL606/2405090‑2405139‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGA > REL606/2407442‑2407491 GCTTATTCAGGGGAAGGCGCAATTGCCGATGATGCAGGTAACGTCAGCCGG < 1:6648697/51‑1GCTTATTCAGGGGAAGGCGCAATTGCCGATGATGCAGGTAACGTCAGCCGG < 1:4308367/51‑1 CTTATTCAGGGGAAGGCGCAATTGCCGATGATGCAGGTAACGTCAGCCGGG > 1:6323639/1‑51 CTTATTCAGGGGAAGGCGCAATTGCCGATGATGCAGGTAACGTCAGCCGGG > 1:277425/1‑51 TTATTCAGGGGAAGGCGCAATTGCCGATGATGCAGGTAACGTCAGCCGGGT > 1:570035/1‑51 TTATTCAGGGGAAGGCGCAATTGCCGATGATGCAGGTAACGTCAGCCGGGT < 1:6649837/51‑1 TTATTCAGGGGAAGGCGCAATTGCCGATGATGCAGGTAACGTCAGCCGGGT > 1:2057205/1‑51 TTATTCAGGGGAAGGCGCAATTGCCGATGATGCAGGTAACGTCAGCCGGGT < 1:1586805/51‑1 TATTCAGGGGAAGGCGCAATTGCCGATGATGCAGGTAACGTCAGCCGGGTA < 1:2320195/51‑1 TTCAGGGGAAGGCGCAATTGCCGATGATGCAGGTAACGTCAGCCGGGTAAT > 1:1882656/1‑51 TCAGGGGAAGGCGCAATTGCCGATGATGCAGGTAACGTCAGCCGGGTAATG < 1:4432057/51‑1 TCAGGGGAAGGCGCAATTGCCGATGATGCAGGTAACGTCAGCCGGGTAATG > 1:4068466/1‑51 CAGGGGAAGGCGCAATTGCCGATGATGCAGGTAACGTCAGCCGGGTAATGA > 1:3137369/1‑51 AGGGGAAGGCGCAATTGCCGATGATGCAGGTAACGTCAGCCGGGTAATGAC > 1:3693362/1‑51 AGGGGAAGGCGCAATTGCCGATGATGCAGGTAACGTCAGCCGGGTAATGAC > 1:4299094/1‑51 AGGGGAAGGCGCAATTGCCGATGATGCAGGTAACGTCAGCCGGGTAATGAC < 1:1826030/51‑1 GGGGAAGGCGCAATTGCCGATGATGCAGGTAACGTCAGCCGGGTAATGACT < 1:2055365/51‑1 GAAGGCGCAATTGCCGATGATGCAGGTAACGTCAGCCGGGTAATGACTCCA < 1:1447998/51‑1 AAGGCGCAATTGCCGATGATGCAGGTAACGTCAGCCGGGTAATGACTCCAA > 1:5797193/1‑51 GGCGCAATTGCCGATGATGCAGGTAACGTCAGCCGGGTAATGACTCCAACT < 1:5323549/51‑1 GGCGCAATTGCCGATGATGCAGGTAACGTCAGCCGGGTAATGACTCCAACT < 1:4985342/51‑1 GCGCAATTGCCGATGATGCAGGTAACGTCAGCCGGGTAATGACTCCAACTT < 1:5391882/51‑1 CGCAATTGCCGATGATGCAGGTAACGTCAGCCGGGTAATGACTCCAACTTA > 1:3585127/1‑51 CGCAATTGCCGATGATGCAGGTAACGTCAGCCGGGTAATGACTCCAACTTA < 1:6815347/51‑1 GCAATTGCCGATGATGCAGGTAACGTCAGCCGGGTAATGACTCCAACTTAT > 1:2742164/1‑51 CAATTGCCGATGATGCAGGTAACGTCAGCCGGGTAATGACTCCAACTTATT > 1:4077499/1‑51 CAATTGCCGATGATGCAGGTAACGTCAGCCGGGTAATGACTCCAACTTATT > 1:1176978/1‑51 CAATTGCCGATGATGCAGGTAACGTCAGCCGGGTAATGACTCCAACTTATT < 1:1021588/51‑1 AATTGCCGATGATGCAGGTAACGTCAGCCGGGTAATAACTCCAACTTATTG < 1:1335523/51‑1 ATTGCCGATGATGCAGGTAACGTCAGCCGGGTAATGACTCCAACTTATTGA < 1:3708351/51‑1 ATTGCCGATGATGCAGGTAACGTCAGCCGGGTAATGACTCCAACTTATTGA < 1:2737197/51‑1 ATTGCCGATGATGCAGGTAACGTCAGCCGGGTAATGACTCCAACTTATTGA > 1:1322399/1‑51 TTGCCGATGATGCAGGTAACGTCAGCCGGGTAATGACTCCAACTTATTGAT < 1:351554/51‑1 TGCCGATGATGCAGGTAACGTCAGCCGGGTAATGACTCCAACTTATTGATA < 1:1669763/51‑1 GCCGATGATGCAGGTAACGTCAGCCGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAG > 1:1430077/1‑51 GCCGATGATGCAGGTAACGTCAGCCGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAG < 1:299192/51‑1 GCCGATGATGCAGGTAACGTCAGCCGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAG < 1:1817579/51‑1 CCGATGATGCAGGTAACGTCAGCCGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGT < 1:7201292/51‑1 CCGATGATGCAGGTAACGTCAGCCGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGT < 1:4050977/51‑1 CCGATGATGCAGGTAACGTCAGCCGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGT > 1:7058797/1‑51 CCGATGATGCAGGTAACGTCAGCCGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGT > 1:2852958/1‑51 CGATGATGCAGGTAACGTCAGCCGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTG > 1:4867533/1‑51 TGATGCAGGTAACGTCAGCCGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTT > 1:3628335/1‑51 TGATGCAGGTAACGTCAGCCGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTT < 1:410809/51‑1 TGATGCAGGTAACGTCAGCCGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTT < 1:4509724/51‑1 TGATGCAGGTAACGTCAGCCGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTT < 1:4112349/51‑1 GATGCAGGTAACGTCAGCCGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTT > 1:4733495/1‑51 GATGCAGGTAACGTCAGCCGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTT < 1:2792952/51‑1 ATGCAGGTAACGTCAGCCGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTA < 1:3359738/51‑1 ATGCAGGTAACGTCAGCCGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTA > 1:1981824/1‑51 TGCAGGTAACGTCAGCCGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTAT < 1:6182979/51‑1 GCAGGTAACGTCAGCCGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATG < 1:772266/51‑1 AGGTAACGTCAGCCGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTT > 1:3189353/1‑51 AGGTAACGTCAGCCGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTT < 1:2063871/51‑1 GTAACGTCAGCCGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCA < 1:1318279/51‑1 AACGTCAGCCGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGA > 1:4856508/1‑51 ACGTCAGCCGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGAT < 1:594278/51‑1 CGTCAGCCGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTGTGTTCAGATA < 1:5078680/51‑1 CGTCAGCCGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATA < 1:3927196/51‑1 GTCAGCCGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAA < 1:4751257/51‑1 GTCAGCCGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAA > 1:3070785/1‑51 GTCAGCCGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAA > 1:6021934/1‑51 TCAGCCGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAAT < 1:6393737/51‑1 TCAGCCGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAAT > 1:3770880/1‑51 TCAGCCGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAAT < 1:3127447/51‑1 CAGCCGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATG < 1:934835/51‑1 AGCCGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGC < 1:5245958/51‑1 AGCCGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGC > 1:3110415/1‑51 AGCCGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGC > 1:951352/1‑51 GCCGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCC > 1:3817171/1‑51 CGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCG < 1:5538305/51‑1 CGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCG < 1:5053662/51‑1 CGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCG > 1:47049/1‑51 CGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCG < 1:4641806/51‑1 CGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCG > 1:275626/1‑51 CGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCG < 1:2830186/51‑1 CGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCG < 1:362131/51‑1 GGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGA > 1:3279808/1‑51 GGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGA < 1:5017785/51‑1 GGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGA > 1:2872766/1‑51 GGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGA < 1:2835462/51‑1 GGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGA < 1:5779635/51‑1 GGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGA > 1:4422031/1‑51 GGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGA > 1:1495150/1‑51 GGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGA < 1:5801550/51‑1 GCTTATTCAGGGGAAGGCGCAATTGCCGATGATGCAGGTAACGTCAGCCG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > REL606/2405090‑2405139‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGA > REL606/2407442‑2407491 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |