| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC JC | REL606 | 2,405,131 | IS1 (–) +9 bp | coding (168‑176/1347 nt) | fadL → | long‑chain fatty acid outer membrane transporter |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | REL606 | = 2263507 | NA (NA) | 108 (1.360) | 52/100 | 0.2 | 100% | noncoding (1/768 nt) | IS1 | repeat region |
| ? | REL606 | 2405131 = | 0 (0.000) | coding (168/1347 nt) | fadL | long‑chain fatty acid outer membrane transporter | |||||
| * | ? | REL606 | = 2405139 | 0 (0.000) | 85 (1.070) | 53/100 | 0.2 | 100% | coding (176/1347 nt) | fadL | long‑chain fatty acid outer membrane transporter |
| ? | REL606 | 2407442 = | NA (NA) | noncoding (768/768 nt) | IS1 | repeat region | |||||
Only 100 of 171 total aligned reads displayed.
GGCTTATTCAGGGGAAGGCGCAATTGCCGATGATGCAGGTAACGTCAGCCGTAACCCCGCATTGATTACTATGTTTGACCGCCCGACATTTTCTGCGGGTG > REL606/2405089‑2405189 | ggCTTATTCAGGGGAAGGCGCAATTGCCGATGATGCAGGTAACGTCAGCCg < 1:237563/51‑1 (MQ=255)ggCTTATTCAGGGGAAGGCGCAATTGCCGATGATGCAGGTAACGTCAGCCg > 1:5328493/1‑51 (MQ=255)aaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccCGTCAGCCg < 1:2675845‑M2/9‑1 (MQ=255) gCTTATTCAGGGGAAGGCGCAATTGCCGATGATGCAGGTAACGTCAGCCGg < 1:6648697‑M1/51‑2 (MQ=255) gCTTATTCAGGGGAAGGCGCAATTGCCGATGATGCAGGTAACGTCAGCCGg < 1:4308367‑M1/51‑2 (MQ=255) cTTATTCAGGGGAAGGCGCAATTGCCGATGATGCAGGTAACGTCAGCCGgg > 1:277425‑M1/1‑49 (MQ=255) ttATTCAGGGGAAGGCGCAATTGCCGATGATGCAGGTAACGTCAGCCg > 1:7287972/1‑48 (MQ=255) ttATTCAGGGGAAGGCGCAATTGCCGATGATGCAGGTAACGTCAGCCGggt > 1:2057205‑M1/1‑48 (MQ=255) caccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccCGTCAGCCGTaa < 1:1990390‑M2/12‑1 (MQ=255) tATTCAGGGGAAGGCGCAATTGCCGATGATGCAGGTAACGTCAGCCGggta < 1:2320195‑M1/51‑5 (MQ=255) accatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccCGTCAGCCGTAAc > 1:656463‑M2/39‑51 (MQ=255) accatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccCGTCAGCCGTAAc > 1:4876351‑M2/39‑51 (MQ=255) catcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccCGTCAGCCGTAAccc < 1:279302‑M2/15‑1 (MQ=255) catcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccCGTCAGCCGTAAccc < 1:4818999‑M2/15‑1 (MQ=255) tCAGGGGAAGGCGCAATTGCCGATGATGCAGGTAACGTCAGCCGggtaatg > 1:4068466‑M1/1‑44 (MQ=255) atcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccCGTCAGCCGTAAcccc < 1:2412281‑M2/16‑1 (MQ=255) atcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccCGTCAGCCGTAAcccc > 1:6371661‑M2/36‑51 (MQ=255) cAGGGGAAGGCGCAATTGCCGATGATGCAGGTAACGTCAGCCGggtaatga > 1:3137369‑M1/1‑43 (MQ=255) aGGGGAAGGCGCAATTGCCGATGATGCAGGTAACGTCAGCCGggtaatgac < 1:1826030‑M1/51‑10 (MQ=255) aGGGGAAGGCGCAATTGCCGATGATGCAGGTAACGTCAGCCGggtaatgac > 1:3693362‑M1/1‑42 (MQ=255) atacactaaatcagtaagttggcagcatcaccCGTCAGCCGTAACCCCGCa > 1:7250658‑M2/33‑51 (MQ=255) atacactaaatcagtaagttggcagcatcaccCGTCAGCCGTAACCCCGCa < 1:1110246‑M2/19‑1 (MQ=255) gAAGGCGCAATTGCCGATGATGCAGGTAACGTCAGCCGggtaatgactcca < 1:1447998‑M1/51‑14 (MQ=255) actaaatcagtaagttggcagcatcaccCGTCAGCCGTAACCCCGCATTGa > 1:7024857‑M2/29‑51 (MQ=255) aaGGCGCAATTGCCGATGATGCAGGTAACGTCAGCCGggtaatgactccaa > 1:5797193‑M1/1‑37 (MQ=255) ctaaatcagtaagttggcagcatcaccCGTCAGCCGTAACCCCGCATTGAt > 1:6117524‑M2/28‑51 (MQ=255) ggCGCAATTGCCGATGATGCAGGTAACGTCAGCCGggtaatgactccaact < 1:4985342‑M1/51‑17 (MQ=255) aaatcagtaagttggcagcatcaccCGTCAGCCGTAACCCCGCATTGATTa > 1:3311659‑M2/26‑51 (MQ=255) aaatcagtaagttggcagcatcaccCGTCAGCCGTAACCCCGCATTGATTa > 1:3084373‑M2/26‑51 (MQ=255) aaatcagtaagttggcagcatcaccCGTCAGCCGTAACCCCGCATTGATTa < 1:1868052‑M2/26‑1 (MQ=255) aatcagtaagttggcagcatcaccCGTCAGCCGTAACCCCGCATTGATTAc > 1:3900811‑M2/25‑51 (MQ=255) gcAATTGCCGATGATGCAGGTAACGTCAGCCGggtaatgactccaacttat > 1:2742164‑M1/1‑32 (MQ=255) cAATTGCCGATGATGCAGGTAACGTCAGCCGggtaatgactccaacttatt < 1:1021588‑M1/51‑21 (MQ=255) cAATTGCCGATGATGCAGGTAACGTCAGCCGggtaatgactccaacttatt > 1:4077499‑M1/1‑31 (MQ=255) cagtaagttggcagcatcaccCGTCAGCCGTAACCCCGCATTGATTACTAt > 1:5274835‑M2/22‑51 (MQ=255) aaTTGCCGATGATGCAGGTAACGTCAGCCGggtaataactccaacttattg < 1:1335523‑M1/51‑22 (MQ=255) agtaagttggcagcatcaccCGTCAGCCGTAACCCCGCATTGATTACTATg > 1:7203594‑M2/21‑51 (MQ=255) aTTGCCGATGATGCAGGTAACGTCAGCCGggtaatgactccaacttattga > 1:1322399‑M1/1‑29 (MQ=255) ttGCCGATGATGCAGGTAACGTCAGCCGggtaatgactccaacttattgat < 1:351554‑M1/51‑24 (MQ=255) tGCCGATGATGCAGGTAACGTCAGCCGggtaatgactccaacttattgata < 1:1669763‑M1/51‑25 (MQ=255) gCCGATGATGCAGGTAACGTCAGCCGggtaatgactccaacttattgatag > 1:1430077‑M1/1‑26 (MQ=255) gCCGATGATGCAGGTAACGTCAGCCGggtaatgactccaacttattgatag < 1:299192‑M1/51‑26 (MQ=255) aagttggcagcatcaccCGTCAGCCGTAACCCCGCATTGATTACTATGttt > 1:2880016‑M2/18‑51 (MQ=255) ccGATGATGCAGGTAACGTCAGCCGggtaatgactccaacttattgatagt > 1:7058797‑M1/1‑25 (MQ=255) agttggcagcatcaccCGTCAGCCGTAACCCCGCATTGATTACTATGTTTg > 1:2584754‑M2/17‑51 (MQ=255) gttggcagcatcaccCGTCAGCCGTAACCCCGCATTGATTACTATGTTTGa > 1:217220‑M2/16‑51 (MQ=255) gttggcagcatcaccCGTCAGCCGTAACCCCGCATTGATTACTATGTTTGa > 1:2191870‑M2/16‑51 (MQ=255) gttggcagcatcaccCGTCAGCCGTAACCCCGCATTGATTACTATGTTTGa < 1:1074119‑M2/36‑1 (MQ=255) cGATGATGCAGGTAACGTCAGCCGggtaatgactccaacttattgatagtg > 1:4867533‑M1/1‑24 (MQ=255) tggcagcatcaccCGTCAGCCGTAACCCCGCATTGATTACTATGTTTGAcc < 1:1692984‑M2/38‑1 (MQ=255) tggcagcatcaccCGTCAGCCGTAACCCCGCATTGATTACTATGTTTGAcc < 1:5094423‑M2/38‑1 (MQ=255) tgatgCAGGTAACGTCAGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttt < 1:4112349‑M1/51‑31 (MQ=255) tgatgCAGGTAACGTCAGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttt > 1:3628335‑M1/1‑21 (MQ=255) tgatgCAGGTAACGTCAGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttt < 1:4509724‑M1/51‑31 (MQ=255) ggcagcatcaccCGTCAGCCGTAACCCCGCATTGATTACTATGTTTGACCg > 1:5671579‑M2/13‑51 (MQ=255) gcagcatcgccCGTCAGCCGTAACCCCGCATTGATTACTATGTTTGACCGc < 1:322058‑M2/40‑1 (MQ=255) gcagcatcaccCGTCAGCCGTAACCCCGCATTGATTACTATGTTTGACCGc < 1:6717441‑M2/40‑1 (MQ=255) gatgCAGGTAACGTCAGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgtttt > 1:4733495‑M1/1‑20 (MQ=255) cagcatcaccCGTCAGCCGTAACCCCGCATTGATTACTATGTTTGACCGcc < 1:5242088‑M2/41‑1 (MQ=255) atgCAGGTAACGTCAGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgtttta > 1:1981824‑M1/1‑19 (MQ=255) atgCAGGTAACGTCAGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgtttta < 1:3359738‑M1/51‑33 (MQ=255) tgCAGGTAACGTCAGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttat < 1:6182979‑M1/51‑34 (MQ=255) agcatcaccCGTCAGCCGTAACCCCGCATTGATTACTATGTTTGAcc < 1:4986800‑M2/38‑1 (MQ=255) agcatcaccCGTCAGCCGTAACCCCGCATTGATTACTATGTTTGACCGccc < 1:5300923‑M2/42‑1 (MQ=255) agcatcaccCGTCAGCCGTAACCCCGCATTGATTACTATGTTTGACCGccc > 1:4692624‑M2/10‑51 (MQ=255) agcatcaccCGTCAGCCGTAACCCCGCATTGATTACTATGTTTGACCGccc > 1:4204385‑M2/10‑51 (MQ=255) gcatcaccCGTCAGCCGTAACCCCGCATTGATTACTATGTTTGACCGCCCg < 1:2778140‑M2/43‑1 (MQ=255) aGGTAACGTCAGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgtt > 1:3189353‑M1/1‑15 (MQ=255) aGGTAACGTCAGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgtt < 1:2063871‑M1/51‑37 (MQ=255) gTAACGTCAGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttca < 1:1318279‑M1/51‑39 (MQ=255) accCGTCAGCCGTAACCCCGCATTGATTACTATGTTTGACCGCCCGACAtt > 1:6031437‑M2/4‑51 (MQ=255) ccCGTCAGCCGTAACCCCGCATTGATTACTATGTTTGACCGccc < 1:3899221‑M2/42‑1 (MQ=255) ccCGTCAGCCGTAACCCCGCATTGATTACTATGTTTGACCGCCCGACAttt > 1:1771148‑M2/3‑51 (MQ=255) ccCGTCAGCCGTAACCCCGCATTGATTACTATGTTTGACCGCCCGACAt < 1:876652‑M2/47‑1 (MQ=255) aaCGTCAGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcaga > 1:4856508‑M1/1‑11 (MQ=255) aCGTCAGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagat < 1:594278‑M1/51‑42 (MQ=255) cGTCAGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttgtgttcagata < 1:5078680‑M1/51‑43 (MQ=255) gTCAGCCGTAACCCCGCATTGATTACTATGTTTGACCGCCCGACATTTTCt < 1:5715708/51‑1 (MQ=255) gTCAGCCGTAACCCCGCATTGATTACTATGTTTGACCGCCCGACATTTTCt > 1:5615902/1‑51 (MQ=255) tCAGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataat > 1:3770880‑M1/1‑7 (MQ=255) tCAGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataat < 1:6393737‑M1/51‑45 (MQ=255) tCAGCCGTAACCCCGCATTGATTACTATGTTTGACCGCCCGACATTTTCTg > 1:6685122/1‑51 (MQ=255) cAGCCGTAACCCCGCATTGATTACTATGTTTGACCGCCCGACATTTTCTGc > 1:6795198/1‑51 (MQ=255) aGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgc > 1:951352‑M1/1‑5 (MQ=255) aGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgc > 1:3110415‑M1/1‑5 (MQ=255) aGCCGTAACCCCGCATTGATTACTATGTTTGACCGCCCGACATTTTCTGCg < 1:6836340/51‑1 (MQ=255) aGCCGTAACCCCGCATTGATTACTATGTTTGACCGCCCGACATTTTCTGCg > 1:3592604/1‑51 (MQ=255) gCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcc > 1:3817171‑M1/1‑4 (MQ=255) gCCGTAACCCCGCATTGATTACTATGTTTGACCGCCCGACATTTTCTGCgg < 1:3987910/51‑1 (MQ=255) gCCGTAACCCCGCATTGATTACTATGTTTGACCGCCCGACATTTTCTGCgg < 1:3520909/51‑1 (MQ=255) ccGTAACCCCGCATTGATTACTATGTTTGACCGCCCGACATTTTCTGCggg > 1:1653335/1‑51 (MQ=255) cGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccg < 1:5538305‑M1/51‑50 (MQ=255) cGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccg < 1:5053662‑M1/51‑50 (MQ=255) cGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccg < 1:4641806‑M1/51‑50 (MQ=255) gggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccga < 1:5017785‑M1/51‑51 (MQ=255) gggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccga > 1:2872766‑M1/1‑1 (MQ=255) gggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccga < 1:2835462‑M1/51‑51 (MQ=255) gggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccga > 1:4422031‑M1/1‑1 (MQ=255) gggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccga > 1:1495150‑M1/1‑1 (MQ=255) gggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccga < 1:5801550‑M1/51‑51 (MQ=255) | GGCTTATTCAGGGGAAGGCGCAATTGCCGATGATGCAGGTAACGTCAGCCGTAACCCCGCATTGATTACTATGTTTGACCGCCCGACATTTTCTGCGGGTG > REL606/2405089‑2405189 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |