| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| JC JC | REL606 | 2,405,131 | IS1 (–) +9 bp | 100% | coding (168‑176/1347 nt) | fadL → | long‑chain fatty acid outer membrane transporter |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | REL606 | = 2263507 | NA (NA) | 97 (1.020) | 57/80 | NT | 100% | noncoding (1/768 nt) | IS1 | repeat region |
| ? | REL606 | 2405131 = | 0 (0.000) | coding (168/1347 nt) | fadL | long‑chain fatty acid outer membrane transporter | |||||
| * | ? | REL606 | = 2405139 | 0 (0.000) | 97 (1.020) | 56/80 | NT | 100% | coding (176/1347 nt) | fadL | long‑chain fatty acid outer membrane transporter |
| ? | REL606 | 2407442 = | NA (NA) | noncoding (768/768 nt) | IS1 | repeat region | |||||
Only 100 of 259 total aligned reads displayed.
GGCTTATTCAGGGGAAGGCGCAATTGCCGATGATGCAGGTAACGTCAGCCGTAACCCCGCATTGATTACTATGTTTGACCGCCCGACATTTTCTGCGGGTG > REL606/2405089‑2405189 | aaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccCGTCAGCCg < 1:2675845‑M2/9‑1 (MQ=255) gCTTATTCAGGGGAAGGCGCAATTGCCGATGATGCAGGTAACGTCAGCCGg < 1:6648697‑M1/51‑2 (MQ=255) ttATTCAGGGGAAGGCGCAATTGCCGATGATGCAGGTAACGTCAGCCGggt > 1:8990675‑M1/1‑48 (MQ=255) ttATTCAGGGGAAGGCGCAATTGCCGATGATGCAGGTAACGTCAGCCGggt > 1:2057205‑M1/1‑48 (MQ=255) ttATTCAGGGGAAGGCGCAATTGCCGATGATGCAGGTAACGTCAGCCGggt > 1:570035‑M1/1‑48 (MQ=255) caccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccCGTCAGCCGTaa > 1:9219804‑M2/40‑51 (MQ=255) caccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccCGTCAGCCGTaa > 1:10003448‑M2/40‑51 (MQ=255) accatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccCGTCAGCCGTAAc > 1:4876351‑M2/39‑51 (MQ=255) accatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccCGTCAGCCGTAAc > 1:656463‑M2/39‑51 (MQ=255) ccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccCGTCAGCCGTAAc < 1:1654070‑M2/13‑1 (MQ=255) ttCAGGGGAAGGCGCAATTGCCGATGATGCAGGTAACGTCAGCCGggtaat > 1:10740826‑M1/1‑45 (MQ=255) ttCAGGGGAAGGCGCAATTGCCGATGATGCAGGTAACGTCAGCCGggtaat > 1:1882656‑M1/1‑45 (MQ=255) ttCAGGGGAAGGCGCAATTGCCGATGATGCAGGTAACGTCAGCCGggtaat < 1:8776379‑M1/51‑7 (MQ=255) catcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccCGTCAGCCGTAAccc < 1:279302‑M2/15‑1 (MQ=255) catcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccCGTCAGCCGTAAccc < 1:4818999‑M2/15‑1 (MQ=255) tCAGGGGAAGGCGCAATTGCCGATGATGCAGGTAACGTCAGCCGggtaatg < 1:4432057‑M1/51‑8 (MQ=255) atcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccCGTCAGCCGTAAcccc > 1:6371661‑M2/36‑51 (MQ=255) atcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccCGTCAGCCGTAAcccc < 1:2343779‑M2/16‑1 (MQ=255) atcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccCGTCAGCCGTAAcccc < 1:2412281‑M2/16‑1 (MQ=255) tcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccCGTCAGCCGTAACCCCg > 1:700491‑M2/35‑51 (MQ=255) cAGGGGAAGGCGCAATTGCCGATGATGCAGGTAACGTCAGCCGggtaatga < 1:10810833‑M1/51‑9 (MQ=255) aGGGGAAGGCGCAATTGCCGATGATGCAGGTAACGTCAGCCGggtaatgac > 1:4299094‑M1/1‑42 (MQ=255) aGGGGAAGGCGCAATTGCCGATGATGCAGGTAACGTCAGCCGggtaatgac < 1:9391546‑M1/51‑10 (MQ=255) ggggAAGGCGCAATTGCCGATGATGCAGGTAACGTCAGCCGggtaatgact < 1:8841851‑M1/51‑11 (MQ=255) atacactaaatcagtaagttggcagcatcaccCGTCAGCCGTAACCCCGCa > 1:9102231‑M2/33‑51 (MQ=255) atacactaaatcagtaagttggcagcatcaccCGTCAGCCGTAACCCCGCa < 1:1110246‑M2/19‑1 (MQ=255) gAAGGCGCAATTGCCGATGATGCAGGTAACGTCAGCCGggtaatgactcca < 1:8722744‑M1/51‑14 (MQ=255) gAAGGCGCAATTGCCGATGATGCAGGTAACGTCAGCCGggtaatgactcca < 1:1447998‑M1/51‑14 (MQ=255) aaGGCGCAATTGCCGATGATGCAGGTAACGTCAGCCGggtaatgactccaa > 1:5797193‑M1/1‑37 (MQ=255) ggCGCAATTGCCGATGATGCAGGTAACGTCAGCCGggtaatgactccaact < 1:5323549‑M1/51‑17 (MQ=255) gcgcAATTGCCGATGATGCAGGTAACGTCAGCCGggtaatgactccaactt < 1:5391882‑M1/51‑18 (MQ=255) aaatcagtaagttggcagcatcaccCGTCAGCCGTAACCCCGCATTGATTa > 1:7242594‑M2/26‑51 (MQ=255) cgcAATTGCCGATGATGCAGGTAACGTCAGCCGggtaatgactccaactta < 1:6815347‑M1/51‑19 (MQ=255) aatcagtaagttggcagcatcaccCGTCAGCCGTAACCCCGCATTGATTAc > 1:3900811‑M2/25‑51 (MQ=255) aatcagtaagttggcagcatcaccCGTCAGCCGTAACCCCGCATTGATTAc > 1:5668197‑M2/25‑51 (MQ=255) gcAATTGCCGATGATGCAGGTAACGTCAGCCGggtaatgactccaacttat > 1:2742164‑M1/1‑32 (MQ=255) gcAATTGCCGATGATGCAGGTAACGTCAGCCGggtaatgactccaacttat < 1:7723540‑M1/51‑20 (MQ=255) cAATTGCCGATGATGCAGGTAACGTCAGCCGggtaatgactccaacttatt > 1:4077499‑M1/1‑31 (MQ=255) cAATTGCCGATGATGCAGGTAACGTCAGCCGggtaatgactccaacttatt < 1:8307602‑M1/51‑21 (MQ=255) cagtaagttggcagcatccccCGTCAGCCGTAACCCCGCATTGATTACTAt < 1:5910799‑M2/30‑1 (MQ=255) aaTTGCCGATGATGCAGGTAACGTCAGCCGggtaatgactccaacttattg < 1:9306273‑M1/51‑22 (MQ=255) aaTTGCCGATGATGCAGGTAACGTCAGCCGggtaataactccaacttattg < 1:1335523‑M1/51‑22 (MQ=255) aTTGCCGATGATGCAGGTAACGTCAGCCGggtaatgactccaacttattga > 1:10630748‑M1/1‑29 (MQ=255) ttGCCGATGATGCAGGTAACGTCAGCCGggtaatgactccaacttattgat < 1:10281137‑M1/51‑24 (MQ=255) ttGCCGATGATGCAGGTAACGTCAGCCGggtaatgactccaacttattgat < 1:351554‑M1/51‑24 (MQ=255) gtaagttggcagcatcaccCGTCAGCCGTAACCCCGCATTGATTACTATGt > 1:1085149‑M2/20‑51 (MQ=255) gtaagttggcagcatcaccCGTCAGCCGTAACCCCGCATTGATTACTATGt < 1:8091790‑M2/32‑1 (MQ=255) taagttggcagcatcaccCGTCAGCCGTAACCCCGCATTGATTACTATGtt > 1:7335298‑M2/19‑51 (MQ=255) tGCCGATGATGCAGGTAACGTCAGCCGggtaatgactccaacttattgata < 1:9173642‑M1/51‑25 (MQ=255) gCCGATGATGCAGGTAACGTCAGCCGggtaatgactccaacttattgatag < 1:1817579‑M1/51‑26 (MQ=255) ccGATGATGCAGGTAACGTCAGCCGggtaatgactccaacttattgatagt < 1:7201292‑M1/51‑27 (MQ=255) ccGATGATGCAGGTAACGTCAGCCGggtaatgactccaacttattgatagt > 1:2852958‑M1/1‑25 (MQ=255) ccGATGATGCAGGTAACGTCAGCCGggtaatgactccaacttattgatagt < 1:4050977‑M1/51‑27 (MQ=255) agttggcagcatcaccCGTCAGCCGTAACCCCGCATTGATTACTATGTTTg < 1:10538079‑M2/35‑1 (MQ=255) gttggcagcatcaccCGTCAGCCGTAACCCCGCATTGATTACTATGTTTGa < 1:1982931‑M2/36‑1 (MQ=255) gttggcagcatcaccCGTCAGCCGTAACCCCGCATTGATTACTATGTTTGa > 1:2191870‑M2/16‑51 (MQ=255) gttggcagcatcaccCGTCAGCCGTAACCCCGCATTGATTACTATGTTTGa > 1:9542563‑M2/16‑51 (MQ=255) cGATGATGCAGGTAACGTCAGCCGggtaatgactccaacttattgatagtg < 1:8396143‑M1/51‑28 (MQ=255) gatgatGCAGGTAACGTCAGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgt > 1:10103699‑M1/1‑23 (MQ=255) tggcagcatcaccCGTCAGCCGTAACCCCGCATTGATTACTATGTTTGAcc < 1:5094423‑M2/38‑1 (MQ=255) tggcagcatcaccCGTCAGCCGTAACCCCGCATTGATTACTATGTTTGAcc < 1:1692984‑M2/38‑1 (MQ=255) tggcagcatcaccCGTCAGCCGTAACCCCGCATTGATTACTATGTTTGAcc < 1:3186444‑M2/38‑1 (MQ=255) tgatgCAGGTAACGTCAGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttt > 1:3628335‑M1/1‑21 (MQ=255) ggcagcatcaccCGTCAGCCGTAACCCCGCATTGATTACTATGTTTGACCg < 1:7826738‑M2/39‑1 (MQ=255) gcagcatcaccCGTCAGCCGTAACCCCGCATTGATTACTATGTTTGACCGc < 1:6717441‑M2/40‑1 (MQ=255) gatgCAGGTAACGTCAGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgtttt > 1:10670579‑M1/1‑20 (MQ=255) cagcatcaccCGTCAGCCGTAACCCCGCATTGATTACTATGTTTGACCGcc > 1:210669‑M2/11‑51 (MQ=255) atgCAGGTAACGTCAGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgtttta < 1:3359738‑M1/51‑33 (MQ=255) tgCAGGTAACGTCAGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttat < 1:6182979‑M1/51‑34 (MQ=255) agcatcaccCGTCAGCCGTAACCCCGCATTGATTACTATGTTTGAcc < 1:4986800‑M2/38‑1 (MQ=255) agcatcaccCGTCAGCCGTAACCCCGCATTGATTACTATGTTTGACCGccc > 1:9880573‑M2/10‑51 (MQ=255) agcatcaccCGTCAGCCGTAACCCCGCATTGATTACTATGTTTGACCGccc < 1:7689311‑M2/42‑1 (MQ=255) gcatcaccCGTCAGCCGTAACCCCGCATTGATTACTATGTTTGACCGCCCg < 1:2778140‑M2/43‑1 (MQ=255) gCAGGTAACGTCAGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatg > 1:8445485‑M1/1‑17 (MQ=255) cAGGTAACGTCAGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgt > 1:7530654‑M1/1‑16 (MQ=255) gTAACGTCAGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttca < 1:1318279‑M1/51‑39 (MQ=255) accCGTCAGCCGTAACCCCGCATTGATTACTATGTTTGACCGCCCGACAtt > 1:6031437‑M2/4‑51 (MQ=255) ccCGTCAGCCGTAACCCCGCATTGATTACTATGTTTGACCGCCCGAc < 1:7445316‑M2/45‑1 (MQ=255) ccCGTCAGCCGTAACCCCGCATTGATTACTATGTTTGACCGCCCGACAttt > 1:381738‑M2/3‑51 (MQ=255) ccCGTCAGCCGTAACCCCGCATTGATTACTATGTTTGACCGCCCGACAtt < 1:4114814‑M2/48‑1 (MQ=255) aaCGTCAGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcaga > 1:4856508‑M1/1‑11 (MQ=255) cGTCAGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttgtgttcagata < 1:5078680‑M1/51‑43 (MQ=255) gTCAGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataa > 1:3070785‑M1/1‑8 (MQ=255) gTCAGCCGTAACCCCGCATTGATTACTATGTTTGACCGCCCGACATTTTCt < 1:9487001/51‑1 (MQ=255) tCAGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataat > 1:3770880‑M1/1‑7 (MQ=255) tCAGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataat < 1:3127447‑M1/51‑45 (MQ=255) aGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgc < 1:5245958‑M1/51‑47 (MQ=255) aGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgc > 1:9059763‑M1/1‑5 (MQ=255) aGCCGTAACCCCGCATTGATTACTATGTTTGACCGCCCGACATTTTCTGCg > 1:9504331/1‑51 (MQ=255) aGCCGTAACCCCGCATTGATTACTATGTTTGACCGCCCGACATTTTCTGCg > 1:3592604/1‑51 (MQ=255) ccGTAACCCCGCATTGATTACTATGTTTGACCGCCCGACATTTTCTGCggg < 1:2966379/51‑1 (MQ=255) cGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccg < 1:8590885‑M1/51‑50 (MQ=255) cGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccg < 1:4641806‑M1/51‑50 (MQ=255) cGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccg > 1:47049‑M1/1‑2 (MQ=255) cGTAACCCCGCATTGATTACTATGTTTGACCGCCCGACATTTTCTGCGGGt > 1:9334403/1‑51 (MQ=255) gggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccga > 1:1495150‑M1/1‑1 (MQ=255) gggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccga > 1:8485827‑M1/1‑1 (MQ=255) gggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccga < 1:5017785‑M1/51‑51 (MQ=255) gggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccga < 1:9604683‑M1/51‑51 (MQ=255) gggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccga > 1:3279808‑M1/1‑1 (MQ=255) | GGCTTATTCAGGGGAAGGCGCAATTGCCGATGATGCAGGTAACGTCAGCCGTAACCCCGCATTGATTACTATGTTTGACCGCCCGACATTTTCTGCGGGTG > REL606/2405089‑2405189 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |