| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| JC JC | REL606 | 4,462,655 | IS1 (+) +9 bp | 100% | intergenic (‑85/‑100) | yjgM ← / → yjgN | predicted acetyltransferase/conserved inner membrane protein |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | REL606 | 4462655 = | 0 (0.000) | 114 (1.200) | 63/80 | NT | 100% | intergenic (‑85/‑108) | yjgM/yjgN | predicted acetyltransferase/conserved inner membrane protein |
| ? | REL606 | 4521571 = | NA (NA) | noncoding (768/768 nt) | IS1 | repeat region | |||||
| * | ? | REL606 | = 4462663 | 0 (0.000) | 95 (1.030) | 48/78 | NT | 100% | intergenic (‑93/‑100) | yjgM/yjgN | predicted acetyltransferase/conserved inner membrane protein |
| ? | REL606 | = 4506109 | NA (NA) | noncoding (1/768 nt) | IS1 | repeat region | |||||
Only 100 of 200 total aligned reads displayed.
ACCACTCTCTTCTTACGTGCGCAAGCATCTTATAAAGCAATAAAGTTTTTg‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > REL606/4462614‑4462663‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGC < REL606/4506109‑4506059 ACCACTCTCTTCTTACGTGCGCAAGCATCTTATAAAGCAATAAAGTTTTTG < 1:1570660/51‑1ACCACTCTCTTCTTACGTGCGCAAGCATCTTATAAAGCAATAAAGTTTTTG > 1:8880903/1‑51 CCACTCTCTTCTTACGTGCGCAAGCATCTTATAAAGCAATAAAGTTTTTGG > 1:9408722/1‑51 CCACTCTCTTCTTACGTGCGCAAGCATCTTATAAAGCAATAAAGTTTTTGG < 1:10257741/51‑1 CCACTCTCTTCTTACGTGCGCAAGCATCTTATAAAGCAATAAAGTTTTTGG < 1:7576465/51‑1 CTCTCTTCTTACGTGCGCAAGCATCTTATAAAGCAATAAAGTTTTTGGTGA > 1:9688361/1‑51 TCTCTTCTTACGTGCGCAAGCATCTTATAAAGCAATAAAGTTTTTGGTGAT > 1:10341616/1‑51 TCTCTTCTTACGTGCGCAAGCATCTTATAAAGCAATAAAGTTTTTGGTGAT > 1:9272867/1‑51 CTCTTCTTACGTGCGCAAGCATCTTATAAAGCAATAAAGTTTTTGGTGATG > 1:1627729/1‑51 CTCTTCTTACGTGCGCAAGCATCTTATAAAGCAATAAAGTTTTTGGTGATG < 1:4844010/51‑1 CTCTTCTTACGTGCGCAAGCATCTTATAAAGCAATAAAGTTTTTGGTGATG < 1:1783507/51‑1 CTCTTCTTACGTGCGCAAGCATCTTATAAAGCAATAAAGTTTTTGGTGATG < 1:9026616/51‑1 TTCTTACGTGCGCAAGCATCTTATAAAGCAATAAAGTTTTTGGTGATGCTG > 1:3646603/1‑51 TTCTTACGTGCGCAAGCATCTTATAAAGCAATAAAGTTTTTGGTGATGCTG > 1:146041/1‑51 TTACGTGCGCAAGCATCTTATAAAGCAATAAAGTTTTTGGTGATGCTGCCA < 1:2792036/51‑1 TTACGTGCGCAAGCATCTTATAAAGCAATAAAGTTTTTGGTGATGCTGCCA > 1:10786775/1‑51 TTACGTGCGCAAGCATCTTATAAAGCAATAAAGTTTTTGGTGATGCTGCCA > 1:620591/1‑51 TTACGTGCGCAAGCATCTTATAAAGCAATAAAGTTTTTGGTGATGCTGCCA > 1:2231025/1‑51 TTACGTGCGCAAGCATCTTATAAAGCAATAAAGTTTTTGGTGATGCTGCCA > 1:694542/1‑51 TACGTGCGCAAGCATCTTATAAAGCAATAAAGTTTTTGGTGATGCTGCCAA < 1:6501891/51‑1 TACGTGCGCAAGCATCTTATAAAGCAATAAAGTTTTTGGTGATGCTGCCAA > 1:5783580/1‑51 TGCGCAAGCATCTTATAAAGCAATAAAGTTTTTGGTGATGCTGCCAACTTA > 1:10494901/1‑51 TGCGCAAGCATCTTATAAAGCAATAAAGTTTTTGGTGATGCTGCCAACTTA < 1:1386694/51‑1 GCGCAAGCATCTTATAAAGCAATAAAGTTTTTGGTGATGCTGCCAACTTAC > 1:2637558/1‑51 GCAAGCATCTTATAAAGCAATAAAGTTTTTGGTGATGCTGCCAACTTACTG < 1:6388127/51‑1 GCAAGCATCTTATAAAGCAATAAAGTTTTTGGTGATGCTGCCAACTTACTG > 1:5386413/1‑51 AAGCATCTTATAAAGCAATAAAGTTTTTGGTGATGCTGCCAACTTACTGAT > 1:3116066/1‑51 AAGCATCTTATAAAGCAATAAAGTTTTTGGTGATGCTGCCAACTTACTGAT > 1:1185411/1‑51 AGCATCTTATAAAGCAATAAAGTTTTTGGTGATGCTGCCAACTTACTGATT > 1:9653902/1‑51 GCATCTTATAAAGCAATAAAGTTTTTGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTT < 1:6719204/51‑1 GCATCTTATAAAGCAATAAAGTTTTTGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTT > 1:10182793/1‑51 CATCTTATAAAGCAATAAAGTTTTTGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTA < 1:2492321/51‑1 CATCTTATAAAGCAATAAAGTTTTTGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTA < 1:1250252/51‑1 TCTTATAAAGCAATAAAGTTTTTGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGT > 1:7830716/1‑51 TCTTATAAAGCAATAAAGTTTTTGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGT < 1:5241355/51‑1 TTATAAAGCAATAAAGTTTTTGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGT > 1:10727346/1‑51 TATAAAGCAATAAAGTTTTTGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTA > 1:4862051/1‑51 TATAAAGCAATAAAGTTTTTGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGT > 1:3827313/1‑50 TAAAGCAATAAAGTTTTTGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATG > 1:1950316/1‑51 TAAAGCAATAAAGTTTTTGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATG > 1:4720485/1‑51 AATAAAGTTTTTGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTG < 1:10015141/51‑1 AATAAAGTTTTTGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTG < 1:1419649/51‑1 ATAAAGTTTTTGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGT > 1:5663390/1‑51 ATAAAGTTTTTGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGT < 1:2962273/51‑1 TAAAGTTTTTGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTT > 1:7690067/1‑51 TAAAGTTTTTGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTT > 1:6908875/1‑51 TAAAGTTTTTGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTT > 1:854295/1‑51 AAAGTTTTTGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTT < 1:6124716/51‑1 AAAGTTTTTGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTT > 1:3209237/1‑51 AAGTTTTTGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTT < 1:5122951/51‑1 AGTTTTTGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTT < 1:7422018/51‑1 AGTTTTTGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTT < 1:10821460/51‑1 GTTTTTGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTG < 1:3621702/51‑1 TTTTTGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGA > 1:5381457/1‑51 TTTTTGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGA < 1:914967/51‑1 TTTTTGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGA > 1:1235209/1‑51 TTTTGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAG > 1:3743954/1‑51 TTTTGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAG > 1:10423315/1‑51 TTTTGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAG < 1:10562125/51‑1 TTTGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAag < 1:2342080/51‑3 TTTGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGG < 1:4646971/51‑1 TTTGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGG > 1:8691466/1‑51 TTGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGT < 1:7122753/51‑1 TTGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGT > 1:8132459/1‑51 TGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTG > 1:1116574/1‑51 TGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTG > 1:9490738/1‑51 TGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTG < 1:2549010/51‑1 TGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTG > 1:3566930/1‑51 TGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTG > 1:4460109/1‑51 TGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTG < 1:7028704/51‑1 TGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTG > 1:5879490/1‑51 GGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGC < 1:2183334/51‑1 GGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGC > 1:2082534/1‑51 GGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGC < 1:6598556/51‑1 GGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGC > 1:7110948/1‑51 GGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGC < 1:6547009/51‑1 GGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGC > 1:724698/1‑51 GGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGC > 1:7269922/1‑51 GGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGC > 1:7401151/1‑51 GGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGC > 1:6350103/1‑51 GGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGC < 1:1926029/51‑1 GGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGC > 1:3017997/1‑51 GGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGC > 1:5710907/1‑51 GGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGC > 1:792276/1‑51 GGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGC > 1:7959352/1‑51 GGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGC < 1:7996187/51‑1 GGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGC < 1:54788/51‑1 GGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGC < 1:8350562/51‑1 GGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGC < 1:3441539/51‑1 GGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGC < 1:5039070/51‑1 GGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGC > 1:8736488/1‑51 GGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGC > 1:1335959/1‑51 GGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGC > 1:4985859/1‑51 GGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGC > 1:4932307/1‑51 GGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGC > 1:3599577/1‑51 GGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGC > 1:4390999/1‑51 GGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGC > 1:4204303/1‑51 GGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGC < 1:4031216/51‑1 GGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGC < 1:3953562/51‑1 GGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGC < 1:9893729/51‑1 ACCACTCTCTTCTTACGTGCGCAAGCATCTTATAAAGCAATAAAGTTTTTg‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > REL606/4462614‑4462663‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGC < REL606/4506109‑4506059 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |