| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC | 9 | 41,027 | (GCAGGT)5→6 | intergenic (–/–) | – / – | –/– |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | 9 | = 40994 | 0 (0.000) | 42 (0.670) +GGTGCA |
31/122 | 0.4 | 100% | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| ? | 9 | 40995 = | 0 (0.000) | intergenic (–/–) | –/– | –/– | |||||
CCAACCACGATCCCCGCAATCAGCAAAACAAAGAGCAATAACACTTTTAGCATGGTTATTCTCCTTGCGGCGCGGCTGCCGGAGTATCAGCTTGCGGTGCAGGTGCAGGTGCAGGTGCAGGTGCAGGTTTAGCTTCCGTTGCCCCCGCTGCCGGTTGTGCCAGCAGGTTACGCACGCGAGTCTGCATCAGTTTTTC > 9/40900‑41095 | acgatccccgcaatcagcaaaacaaagagcaataactcttttagcatggttattctccttgcggcgcggctgccggagtatcagcttgcggtgcaggtgca < 2:383814‑M2/6‑1 (MQ=255)acgatccccgcaatcagcaaaacaaagagcaataacacttttagcatggttattctccttgcggcgcggctgccggagtatcagcttgcggtgcaggtgca < 1:68487‑M2/6‑1 (MQ=255) gatccccgcaatcagcaaaacaaagagcaataacacttttagcatggttattctccttgcggcgcggctgccggagtatcagcttgcggtgcaggtgcagg < 2:865078‑M2/8‑1 (MQ=255) atccccgcaatcagcaaaacaaagagcaataacacttttagcatggttattctccttgcggcgcggctgccggagtatcagcttgcggtgcaggtgcaggt < 1:1218443‑M2/9‑1 (MQ=255) ccgcaatcagcaaaacaaagagcaataacacttttagcatggttattctccttgcggcgcggctgccggagtatcagcttgcggtgcaggtgcaggtgcag > 2:794314‑M2/89‑101 (MQ=255) cgcaatcagcaaaacaaagagcaataacacttttagcatggttattctccttgcggcgcggctgccggagtatcagcttgcggtgcaggtgcaggtgcagg < 2:959374‑M2/14‑1 (MQ=255) aatcagcaaaacaaagagcaataacacttttagcatggttattctccttgcggcgcggctgccggagtatcagcttgcggtgcaggtgcaggtgcaggtgc < 2:403575‑M2/17‑1 (MQ=255) aatcagcaaaacaaagagcaataacacttttagcatggttattctccttgcggcgcggctgccggagtatcagcttgcggtgcaggtgcaggtgcaggtgc > 2:691819‑M2/85‑101 (MQ=255) cagcaaaacaaagagcaataacacttttagcatggttattctccttgcggcgcggctgccggagtatcagcttgcggtgcaggtgcaggtgcaggtgcagg < 1:1484731‑M2/20‑1 (MQ=255) aaaacaaagagcaataacacttttagcatggttattctccttgcggcgcggctgccggagtatcagcttgcggtgcaggtgcaggtgcaggtgcaggtgca > 2:1264697‑M2/78‑101 (MQ=255) aacaaagagcaataacacttttagcatggttattctccttgcggcgcggctgccggagtatcagcttgcggtgcaggtgcaggtgcaggtgcaggtgcagg > 1:734507‑M2/76‑101 (MQ=255) aacaaagagcaataacacttttagcatggttattctccttgcggcgcggctgccggagtatcagcttgcggtgcaggtgcaggtgcaggtgcaggtgcagg < 2:600413‑M2/26‑1 (MQ=255) acaaagagcaataacacttttagcatggttattctccttgcggcgcggctgccggagtatcagcttgcggcgcaggtgcaggtgcaggtgcaggtgcagcg > 1:634820‑M2/75‑99 (MQ=255) caaagagcaataacacttttagcatggttattctccttgcggcgcggctgccggagtatcagcttgcggtgcaggtgcaggtgcaggtgcaggtgcaggtg > 1:1480971‑M2/74‑101 (MQ=255) caaagagcaataacacttttagcatggttattctccttgcggcgcggctgccggagtatcagcttgcggtgcaggtgcaggtgcaggtgcaggtgcaggtg > 1:666038‑M2/74‑101 (MQ=255) aagagcaataacacttttagcattgttattttctttgcgccgcggctgccggagtatcagcttgcggtgcaggtgcaggtgcaggtgcaggtgcaggtgca < 2:1135993‑M2/30‑1 (MQ=255) aagagcaataacacttttagcatggttattctccttgcggcgcggctgccggagtatcagcttgcggtgcaggtgcaggtgcaggtgcaggtgcaggtgca < 2:1318690‑M2/30‑1 (MQ=255) agcaataacacttttagcatggttattctccttgcggcgcggctgccggagtatcagcttgcggtgcaggtgcaggtgcaggtgcaggtgcaggtgcaggt > 1:668553‑M2/69‑101 (MQ=255) gcaataacacttttagcatggttattctccttgcggcgcggctgccggagtatcagcttgcggtgcaGGTGCAGGTGCAGGTGCAGGTGCAGGTGCAGGtt > 1:1631063‑M2/68‑101 (MQ=255) ataacacttttagcatggttattctccttgcggcgcggctgccggagtatcagcttgcggtgcaGGTGCAGGTGCAGGTGCAGGTGCAGGTGCAGGTTTAg > 1:1555276‑M2/65‑101 (MQ=255) ataacacttttagcatggttattctccttgcggcgcggctgccggagtatcagcttgcggtgcaGGTGCAGGTGCAGGTGCAGGTGCAGGTGCAGGTTTAg > 2:917101‑M2/65‑101 (MQ=255) taacacttttagcatggttattctccttgcggcgcggctgccggagtatcagcttgcggtgcaGGTGCAGGTGCAGGTGCAGGTGCAGGTGCAGGTTTAGc > 1:420978‑M2/64‑101 (MQ=255) taacacttttagcatggttattctccttgcggcgcggctgccggagtatcagcttgcggtgcaGGTGCAGGTGCAGGTGCAGGTGCAGGTGCAGGTTTAGc < 2:895978‑M2/38‑1 (MQ=255) taacacttttagcatggttattctccttgcggcgcggctgccggagtatcagcttgcggtgcaGGTGCAGGTGCAGGTGCAGGTGCAGGTGCAGGTTTAGc > 1:1627017‑M2/64‑101 (MQ=255) aacacttttagcatggttattctccttgcggcgcggctgccggggaatcagattgcggggcaGGTGCAGGCGCAGGGGCAGGAGCAGGGGCAAGTTTAGCt > 1:204150‑M2/63‑101 (MQ=255) aacacttttagcatggttattctccttgcggcgcggctgccggagtatcagcttgcggtgcaGGTGCAGGTGCAGGTGCAGGTGCAGGTGCAGGTTTAGCt > 1:1524685‑M2/63‑101 (MQ=255) acacttttagcatggttattctccttgcggcgcggctgccggagtatcagcttgcggtgcaGGTGCAGGTGCAGGTGCAGGTGCAGGTGCAGGTTTAGCtt < 2:338508‑M2/40‑1 (MQ=255) acttttagcatggttattctccttgcggcgcggctgccggagtatcagcttgcggggcaGGTGCAGGTGCAGGTGCAGGTGCAGGTGCAGGTTTAGCTTcc > 1:1044477‑M2/60‑101 (MQ=255) tagcatggttattctccttgcggcgcggctgccggagtatcagcttgcggtgcaGGTGCAGGTGCAGGTGCAGGTGCAGGTGCAGGTTTAGCTTCCGTTGc > 1:1572280‑M2/55‑101 (MQ=255) tagcatggttattctccttgcggcgcggctgccggagtatcagcttgcggtgcaGGTGCAGGTGCAGGTGCAGGTGCAGGTGCAGGTTTAGCTTCCGTTGc < 2:373404‑M2/47‑1 (MQ=255) catggttattctccttgcggcgcggctgccggagtatcagcttgcggtgcaGGTGCAGGTGCAGGTGCAGGTGCAGGTGCAGGTTTAGCTTCCGTTGcccc > 1:1448737‑M2/52‑101 (MQ=255) catggttattctccttgcggcgcggctgccggagtatcagcttgcggtgcaGGTGCAGGTGCAGGTGCAGGTGCAGGTGCAGGTTTAGCTTCCGTTGcccc > 2:732229‑M2/52‑101 (MQ=255) catggttattctccttgcggcgcggctgccggagtatcagcttgcggtgcaGGTGCAGGTGCAGGTGCAGGGGCAGGTGCAGGTTTAGCTTCCGTTGgccc > 2:913788‑M2/52‑101 (MQ=255) gttattctccttgcggcgcggctgccggagtatcagcttgcggtgcaGGTGCAGGTGCAGGTGCAGGTGCAGGTGCAGGTTTAGCTTCCGTTGCCCCCGCt < 1:639645‑M2/54‑1 (MQ=255) tattctccttgcggcgcggctgccggagtatcagcttgcggtgcaGGTGCAGGTGCAGGTGCAGGTGCAGGTGCAGGTTTAGCTTCCGTTGCCCCCGCTGc > 2:659190‑M2/46‑101 (MQ=255) attctccttgcggcgcggctgccggagtatcagcttgcggtgcaGGTGCAGGTGCAGGTGCAGGTGCAGGTGCAGGTTTAGCTTCCGTTGCCCCCGCTGcc < 2:1182682‑M2/57‑1 (MQ=255) attctccttgcggcgcggctgccggagtatcagcttgcggtgcaGGTGCAGGTGCAGGTGCAGGTGCAGGTGCAGGTTTAGCTTCCGTTGCCCCCGCTGcc > 2:1545892‑M2/45‑101 (MQ=255) ttctccttgcggcgcggctgccggagtatcagcttgcggtgcaGGTGCAGGTGCAGGTGCAGGTGCAGGTGCAGGTTTAGCTTCCGTTGCCCCCGCTGCCg < 1:1647841‑M2/58‑1 (MQ=255) tctccttgcggcgcggctgccggagtatcagcttgcggtgcaGGTGCAGGTGCAGGTGCAGGTGCAGGTGCAGGTTTAGCTTCCGTTGCCCCCGCTGCCgg > 1:1242616‑M2/43‑101 (MQ=255) ctccttgcggcgcggctgccggagtatcagcttgcggtgcaGGTGCAGGTGCAGGTGCAGGTGCAGGTGCAGGTTTAGCTTCCGTTGCCCCCGCTGCCGGt > 1:1017298‑M2/42‑101 (MQ=255) cgcggctgccggagtatcagcttgcggtgcaGGTGCAGGTGCAGGTGCAGGTGCAGGTGCAGGTTTAGCTTCCGTTGCCCCCGCTGCCGGTTGTGCcagca > 2:336904‑M2/32‑101 (MQ=255) ctgccggagtatcagcttgcggtgcaGGTGCAGGTGCAGGTGCAGGTGCAGGTGCAGGTTTAGCTTCCGTTGCCCCCGCTGCCGGTTGTGCCAGCAGGTTa < 2:686969‑M2/75‑1 (MQ=255) gccggagtatcagcttgcggtgcaGGTGCAGGTGCAGGTGCAGGTGCAGGTGCAGGTTTAGCTTCCGTTGCCCCCGCTGCCGGTTGTGCCAGCAGGTTacg > 2:1244663‑M2/25‑101 (MQ=255) gccggagtatcagcttgcggtgcaGGTGCAGGTGCAGGTGCAGGTGCAGGTGCAGGTTTAGCTTCCGTTGCCCCCGCTGCCGGTTGTGCCAGCAGGTTacg > 1:635196‑M2/25‑101 (MQ=255) ggagtatcaccttgcggtgcaGGTTCAGCTGCAGATGCAGGTGCAGGTGCAGGTTTAGCCTCCGTTGCCCCCGCTGCCGGTTGTGCCAGCAGATTacgcac < 2:1379660‑M2/80‑1 (MQ=255) gtatcagcttgcggtgcaGGTGCAGGTGCAGGTGCAGGTGCAGGTGCAGGTTTAGCTTCCGTTGCCCCCGCTGCCGGTTGTGCCAGCAGGTTACGCAcgcg > 1:1643566‑M2/19‑101 (MQ=255) gtatcagcttgcggtgcaGGTGCAGGTGCAGGTGCAGGTGCAGGTGCAGGTTTAGCTTCCGTTGCCCCCGCTGCCGGTTGTGCCAGCAGGTTACGCAcgcg > 1:1650946‑M2/19‑101 (MQ=255) gtatcagcttgcggtgcaGGTGCAGGTGCAGGTGCAGGTGCAGGTGCAGGTTTAGCTTCCGTTGCCCCCGCTGCCGGTTGTGCCAGCAGGTTACGCAcgcg > 2:549173‑M2/19‑101 (MQ=255) gtatcagcttgcggtgcaGGTGCAGGTGCAGGTGCAGGTGCAGGTGCAGGTTTAGCTTCCGTTGCCCCCGCTGCCGGTTGTGCCAGCAGGTTACGCAcgcg > 2:1600594‑M2/19‑101 (MQ=255) atcagcttgcggtgcaGGTGCAGGTGCAGGTGCAGGTGCAGGTGCAGGTTTAGCTTCCGTTGCCCCCGCTGCCGGTTGTGCCAGCAGGTTACGCACGCGAg > 1:1135959‑M2/17‑101 (MQ=255) agcttgcggtgcaGGTGCAGGTGCAGGTGCAGGTGCAGGTGCAGGTTTAGCTTCCGTTGCCCCCGCTGCCGGTTGTGCCAGCAGGTTACGCACGCGAGTCt < 1:991422‑M2/88‑1 (MQ=255) agcttgcggtgcaGGTGCAGGTGCAGGTGCAGGTGCAGGTGCAGGTTTAGCTTCCGTTGCCCCCGCTGCCGGTTGTGCCAGCAGGTTACGCACGCGAGTCt < 2:1242611‑M2/88‑1 (MQ=255) gcttgcggtgcaGGTGCAGGTGCAGGTGCAGGTGCAGGTGCAGGTTTAGCTTCCGTTGCCCCCGCTGCCGGTTGTGCCAGCAGGTTACGCACGGGAGTCTg < 2:204150‑M2/89‑1 (MQ=255) gcttgcggtgcaGGTGCAGGTGCAGGTGCAGGTGCAGGTGCAGGTTTAGCTTCCGTTGCCCCCGCTGCCGGTTGTGCCAGCAGGTTACGCACGCGAGTCTg < 2:1297967‑M2/89‑1 (MQ=255) cttgcggtgcaGGTGCAGGTGCAGGTGCAGGTGCAGGTGCAGGTTTAGCTTCCGTTGCCCCCGCTGCCGGTTGTGCCAGCAGGTTACGCACGCGAGTCTGc < 1:451133‑M2/90‑1 (MQ=255) ttgcggtgcaGGTGCAGGTGCAGGTGCAGGTGCAGGTGCAGGTTTAGCTTCCGTTGCCCCCGCTGCCGGTTGTGCCAGCAGGTTACGCACGCGAGTCTGCa < 2:1448731‑M2/91‑1 (MQ=255) cggtgcaGGTGCAGGTGCAGGTGCAGGTGCAGGTGCAGGTTTAGCTTCCGTTGCCCCCGCTGCCGGTTGTGCCAGCAGGTTACGCACGCGAGTCTGCATCa > 1:1234612‑M2/8‑101 (MQ=255) gtgcaGGTGCAGGTGCAGGTGCAGGTGCAGGTGCAGGTTTAGCTTCCGTTGCCCCCGCTGCCGGTTGTGCCAGCAGGTTACGCACGCGAGTCTGCATCAGt < 2:533183‑M2/96‑1 (MQ=255) caGGTGCAGGTGCAGGTGCAGGTGCAGGTGCAGGTTTAGCTTCCGTTGCCCCCGCTGCCGGTTGTGCCAGCAGGTTACGCACGCGAGTCTGCATCAGtttt < 1:1444043‑M2/99‑1 (MQ=255) ggtgcaggtgcaggtgcaggtgcaggtgcaGGTTTAGCTTCCGTTGCCCCCGCTGCCGGTTGTGCCAGCAGGTTACGCACGCGAGTCTGCATCAGTTTTTc < 1:1036743/101‑1 (MQ=255) ggtgcaggtgcaggtgcaggtgcaggtgcaGGTTTAGCTTCCGTTGCCCCCGCTGCCGGTTGTGCCAGCAGGTTACGCACGCGAGTCTGCATCAGTTTTTc < 2:925495/101‑1 (MQ=255) | CCAACCACGATCCCCGCAATCAGCAAAACAAAGAGCAATAACACTTTTAGCATGGTTATTCTCCTTGCGGCGCGGCTGCCGGAGTATCAGCTTGCGGTGCAGGTGCAGGTGCAGGTGCAGGTGCAGGTTTAGCTTCCGTTGCCCCCGCTGCCGGTTGTGCCAGCAGGTTACGCACGCGAGTCTGCATCAGTTTTTC > 9/40900‑41095 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 23 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |