Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
JC | 9 | 41,027 | (GCAGGT)5→6 | intergenic (–/–) | – / – | –/– |
New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | 9 | = 40994 | 0 (0.000) | 42 (0.670) +GGTGCA |
31/122 | 0.4 | 100% | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
? | 9 | 40995 = | 0 (0.000) | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
CGGGCCAACCACGATCCCCGCAATCAGCAAAACAAAGAGCAATAACACTTTTAGCATGGTTATTCTCCTTGCGGCGCGGCTGCCGGAGTATCAGCTTGC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > 9/40896‑40994 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GGTGCAGGTGCAGGTGCAGGTGCAGGTGCAGGTTTAGCTTCCGTTGCCCCCGCTGCCGGTTGTGCCAGCAGGTTACGCACGCGAGTCTGCATCAGTTTT > 9/40995‑41093 |||||| CGGGCCAACCACGATCCCCGCAATCAGCAAAACAAAGAGCAATAACACTTTTAGCATGGTTATTCTCCTTGCGGCGCGGCTGCCGGAGTATCAGCTTGCGG < 1:1108578/101‑1 GGCCAACCACGATCCCCGCAATCAGCAAAACAAAGAGCAATAACACTTTTAGCATGGTTATTCTCCTTGCGGCGCGGCTGCCGGAGTATCAGCTTGCGGTG < 1:422436/101‑1 ACGATCCCCGCAATCAGCAAAACAAAGAGCAATAACTCTTTTAGCATGGTTATTCTCCTTGCGGCGCGGCTGCCGGAGTATCAGCTTGCGGTGCAGGTGCA < 2:383814/101‑1 ACGATCCCCGCAATCAGCAAAACAAAGAGCAATAACACTTTTAGCATGGTTATTCTCCTTGCGGCGCGGCTGCCGGAGTATCAGCTTGCGGTGCAGGTGCA < 1:68487/101‑1 GATCCCCGCAATCAGCAAAACAAAGAGCAATAACACTTTTAGCATGGTTATTCTCCTTGCGGCGCGGCTGCCGGAGTATCAGCTTGCGGTGCAGGTGCAGG < 2:865078/101‑1 ATCCCCGCAATCAGCAAAACAAAGAGCAATAACACTTTTAGCATGGTTATTCTCCTTGCGGCGCGGCTGCCGGAGTATCAGCTTGCGGTGCAGGTGCAGGT < 1:1218443/101‑1 CCGCAATCAGCAAAACAAAGAGCAATAACACTTTTAGCATGGTTATTCTCCTTGCGGCGCGGCTGCCGGAGTATCAGCTTGCGGTGCAGGTGCAGGTGCAG > 2:794314/1‑101 CGCAATCAGCAAAACAAAGAGCAATAACACTTTTAGCATGGTTATTCTCCTTGCGGCGCGGCTGCCGGAGTATCAGCTTGCGGTGCAGGTGCAGGTGCAGG < 2:959374/101‑1 AATCAGCAAAACAAAGAGCAATAACACTTTTAGCATGGTTATTCTCCTTGCGGCGCGGCTGCCGGAGTATCAGCTTGCGGTGCAGGTGCAGGTGCAGGTGC < 2:403575/101‑1 AATCAGCAAAACAAAGAGCAATAACACTTTTAGCATGGTTATTCTCCTTGCGGCGCGGCTGCCGGAGTATCAGCTTGCGGTGCAGGTGCAGGTGCAGGTGC > 2:691819/1‑101 CAGCAAAACAAAGAGCAATAACACTTTTAGCATGGTTATTCTCCTTGCGGCGCGGCTGCCGGAGTATCAGCTTGCGGTGCAGGTGCAGGTGCAGGTGCAGG < 1:1484731/101‑1 AAAACAAAGAGCAATAACACTTTTAGCATGGTTATTCTCCTTGCGGCGCGGCTGCCGGAGTATCAGCTTGCGGTGCAGGTGCAGGTGCAGGTGCAGGTGCA > 2:1264697/1‑101 AACAAAGAGCAATAACACTTTTAGCATGGTTATTCTCCTTGCGGCGCGGCTGCCGGAGTATCAGCTTGCGGTGCAGGTGCAGGTGCAGGTGCAGGTGCAGG < 2:600413/101‑1 AACAAAGAGCAATAACACTTTTAGCATGGTTATTCTCCTTGCGGCGCGGCTGCCGGAGTATCAGCTTGCGGTGCAGGTGCAGGTGCAGGTGCAGGTGCAGG > 1:734507/1‑101 ACAAAGAGCAATAACACTTTTAGCATGGTTATTCTCCTTGCGGCGCGGCTGCCGGAGTATCAGCTTGCGGCGCAGGTGCAGGTGCAGGTGCAGGTGCAGcg > 1:634820/1‑99 CAAAGAGCAATAACACTTTTAGCATGGTTATTCTCCTTGCGGCGCGGCTGCCGGAGTATCAGCTTGCGGTGCAGGTGCAGGTGCAGGTGCAGGTGCAGGTG > 1:666038/1‑101 CAAAGAGCAATAACACTTTTAGCATGGTTATTCTCCTTGCGGCGCGGCTGCCGGAGTATCAGCTTGCGGTGCAGGTGCAGGTGCAGGTGCAGGTGCAGGTG > 1:1480971/1‑101 AAGAGCAATAACACTTTTAGCATTGTTATTTTCTTTGCGCCGCGGCTGCCGGAGTATCAGCTTGCGGTGCAGGTGCAGGTGCAGGTGCAGGTGCAGGTGCA < 2:1135993/101‑1 AAGAGCAATAACACTTTTAGCATGGTTATTCTCCTTGCGGCGCGGCTGCCGGAGTATCAGCTTGCGGTGCAGGTGCAGGTGCAGGTGCAGGTGCAGGTGCA < 2:1318690/101‑1 AGCAATAACACTTTTAGCATGGTTATTCTCCTTGCGGCGCGGCTGCCGGAGTATCAGCTTGCGGTGCAGGTGCAGGTGCAGGTGCAGGTGCAGGTGCAGGT > 1:668553/1‑101 GCAATAACACTTTTAGCATGGTTATTCTCCTTGCGGCGCGGCTGCCGGAGTATCAGCTTGCGGTGCAGGTGCAGGTGCAGGTGCAGGTGCAGGTGCAGGTT > 1:1631063/1‑101 ATAACACTTTTAGCATGGTTATTCTCCTTGCGGCGCGGCTGCCGGAGTATCAGCTTGCGGTGCAGGTGCAGGTGCAGGTGCAGGTGCAGGTGCAGGTTTAG > 1:1555276/1‑101 ATAACACTTTTAGCATGGTTATTCTCCTTGCGGCGCGGCTGCCGGAGTATCAGCTTGCGGTGCAGGTGCAGGTGCAGGTGCAGGTGCAGGTGCAGGTTTAG > 2:917101/1‑101 TAACACTTTTAGCATGGTTATTCTCCTTGCGGCGCGGCTGCCGGAGTATCAGCTTGCGGTGCAGGTGCAGGTGCAGGTGCAGGTGCAGGTGCAGGTTTAGC > 1:420978/1‑101 TAACACTTTTAGCATGGTTATTCTCCTTGCGGCGCGGCTGCCGGAGTATCAGCTTGCGGTGCAGGTGCAGGTGCAGGTGCAGGTGCAGGTGCAGGTTTAGC > 1:1627017/1‑101 TAACACTTTTAGCATGGTTATTCTCCTTGCGGCGCGGCTGCCGGAGTATCAGCTTGCGGTGCAGGTGCAGGTGCAGGTGCAGGTGCAGGTGCAGGTTTAGC < 2:895978/101‑1 AACACTTTTAGCATGGTTATTCTCCTTGCGGCGCGGCTGCCGGGGAATCAGATTGCGGGGCAGGTGCAGGCGCAGGGGCAGGAGCAGGGGCAAGTTTAGCT > 1:204150/1‑101 AACACTTTTAGCATGGTTATTCTCCTTGCGGCGCGGCTGCCGGAGTATCAGCTTGCGGTGCAGGTGCAGGTGCAGGTGCAGGTGCAGGTGCAGGTTTAGCT > 1:1524685/1‑101 ACACTTTTAGCATGGTTATTCTCCTTGCGGCGCGGCTGCCGGAGTATCAGCTTGCGGTGCAGGTGCAGGTGCAGGTGCAGGTGCAGGTGCAGGTTTAGCTT < 2:338508/101‑1 ACTTTTAGCATGGTTATTCTCCTTGCGGCGCGGCTGCCGGAGTATCAGCTTGCGGGGCAGGTGCAGGTGCAGGTGCAGGTGCAGGTGCAGGTTTAGCTTCC > 1:1044477/1‑101 TAGCATGGTTATTCTCCTTGCGGCGCGGCTGCCGGAGTATCAGCTTGCGGTGCAGGTGCAGGTGCAGGTGCAGGTGCAGGTGCAGGTTTAGCTTCCGTTGC < 2:373404/101‑1 TAGCATGGTTATTCTCCTTGCGGCGCGGCTGCCGGAGTATCAGCTTGCGGTGCAGGTGCAGGTGCAGGTGCAGGTGCAGGTGCAGGTTTAGCTTCCGTTGC > 1:1572280/1‑101 CATGGTTATTCTCCTTGCGGCGCGGCTGCCGGAGTATCAGCTTGCGGTGCAGGTGCAGGTGCAGGTGCAGGTGCAGGTGCAGGTTTAGCTTCCGTTGCCCC > 2:732229/1‑101 CATGGTTATTCTCCTTGCGGCGCGGCTGCCGGAGTATCAGCTTGCGGTGCAGGTGCAGGTGCAGGTGCAGGTGCAGGTGCAGGTTTAGCTTCCGTTGCCCC > 1:1448737/1‑101 CATGGTTATTCTCCTTGCGGCGCGGCTGCCGGAGTATCAGCTTGCGGTGCAGGTGCAGGTGCAGGTGCAGGGGCAGGTGCAGGTTTAGCTTCCGTTGGCCC > 2:913788/1‑101 GTTATTCTCCTTGCGGCGCGGCTGCCGGAGTATCAGCTTGCGGTGCAGGTGCAGGTGCAGGTGCAGGTGCAGGTGCAGGTTTAGCTTCCGTTGCCCCCGCT < 1:639645/101‑1 TATTCTCCTTGCGGCGCGGCTGCCGGAGTATCAGCTTGCGGTGCAGGTGCAGGTGCAGGTGCAGGTGCAGGTGCAGGTTTAGCTTCCGTTGCCCCCGCTGC > 2:659190/1‑101 ATTCTCCTTGCGGCGCGGCTGCCGGAGTATCAGCTTGCGGTGCAGGTGCAGGTGCAGGTGCAGGTGCAGGTGCAGGTTTAGCTTCCGTTGCCCCCGCTGCC < 2:1182682/101‑1 ATTCTCCTTGCGGCGCGGCTGCCGGAGTATCAGCTTGCGGTGCAGGTGCAGGTGCAGGTGCAGGTGCAGGTGCAGGTTTAGCTTCCGTTGCCCCCGCTGCC > 2:1545892/1‑101 TTCTCCTTGCGGCGCGGCTGCCGGAGTATCAGCTTGCGGTGCAGGTGCAGGTGCAGGTGCAGGTGCAGGTGCAGGTTTAGCTTCCGTTGCCCCCGCTGCCG < 1:1647841/101‑1 TCTCCTTGCGGCGCGGCTGCCGGAGTATCAGCTTGCGGTGCAGGTGCAGGTGCAGGTGCAGGTGCAGGTGCAGGTTTAGCTTCCGTTGCCCCCGCTGCCGG > 1:1242616/1‑101 CTCCTTGCGGCGCGGCTGCCGGAGTATCAGCTTGCGGTGCAGGTGCAGGTGCAGGTGCAGGTGCAGGTGCAGGTTTAGCTTCCGTTGCCCCCGCTGCCGGT > 1:1017298/1‑101 CGCGGCTGCCGGAGTATCAGCTTGCGGTGCAGGTGCAGGTGCAGGTGCAGGTGCAGGTGCAGGTTTAGCTTCCGTTGCCCCCGCTGCCGGTTGTGCCAGCA > 2:336904/1‑101 CTGCCGGAGTATCAGCTTGCGGTGCAGGTGCAGGTGCAGGTGCAGGTGCAGGTGCAGGTTTAGCTTCCGTTGCCCCCGCTGCCGGTTGTGCCAGCAGGTTA < 2:686969/101‑1 GCCGGAGTATCAGCTTGCGGTGCAGGTGCAGGTGCAGGTGCAGGTGCAGGTGCAGGTTTAGCTTCCGTTGCCCCCGCTGCCGGTTGTGCCAGCAGGTTACG > 2:1244663/1‑101 GCCGGAGTATCAGCTTGCGGTGCAGGTGCAGGTGCAGGTGCAGGTGCAGGTGCAGGTTTAGCTTCCGTTGCCCCCGCTGCCGGTTGTGCCAGCAGGTTACG > 1:635196/1‑101 GGAGTATCACCTTGCGGTGCAGGTTCAGCTGCAGATGCAGGTGCAGGTGCAGGTTTAGCCTCCGTTGCCCCCGCTGCCGGTTGTGCCAGCAGATTACGCAC < 2:1379660/101‑1 GTATCAGCTTGCGGTGCAGGTGCAGGTGCAGGTGCAGGTGCAGGTGCAGGTTTAGCTTCCGTTGCCCCCGCTGCCGGTTGTGCCAGCAGGTTACGCACGCG > 1:1650946/1‑101 GTATCAGCTTGCGGTGCAGGTGCAGGTGCAGGTGCAGGTGCAGGTGCAGGTTTAGCTTCCGTTGCCCCCGCTGCCGGTTGTGCCAGCAGGTTACGCACGCG > 2:549173/1‑101 GTATCAGCTTGCGGTGCAGGTGCAGGTGCAGGTGCAGGTGCAGGTGCAGGTTTAGCTTCCGTTGCCCCCGCTGCCGGTTGTGCCAGCAGGTTACGCACGCG > 1:1643566/1‑101 GTATCAGCTTGCGGTGCAGGTGCAGGTGCAGGTGCAGGTGCAGGTGCAGGTTTAGCTTCCGTTGCCCCCGCTGCCGGTTGTGCCAGCAGGTTACGCACGCG > 2:1600594/1‑101 ATCAGCTTGCGGTGCAGGTGCAGGTGCAGGTGCAGGTGCAGGTGCAGGTTTAGCTTCCGTTGCCCCCGCTGCCGGTTGTGCCAGCAGGTTACGCACGCGAG > 1:1135959/1‑101 AGCTTGCGGTGCAGGTGCAGGTGCAGGTGCAGGTGCAGGTGCAGGTTTAGCTTCCGTTGCCCCCGCTGCCGGTTGTGCCAGCAGGTTACGCACGCGAGTCT < 1:991422/101‑1 AGCTTGCGGTGCAGGTGCAGGTGCAGGTGCAGGTGCAGGTGCAGGTTTAGCTTCCGTTGCCCCCGCTGCCGGTTGTGCCAGCAGGTTACGCACGCGAGTCT < 2:1242611/101‑1 GCTTGCGGTGCAGGTGCAGGTGCAGGTGCAGGTGCAGGTGCAGGTTTAGCTTCCGTTGCCCCCGCTGCCGGTTGTGCCAGCAGGTTACGCACGGGAGTCTG < 2:204150/101‑1 GCTTGCGGTGCAGGTGCAGGTGCAGGTGCAGGTGCAGGTGCAGGTTTAGCTTCCGTTGCCCCCGCTGCCGGTTGTGCCAGCAGGTTACGCACGCGAGTCTG < 2:1297967/101‑1 CTTGCGGTGCAGGTGCAGGTGCAGGTGCAGGTGCAGGTGCAGGTTTAGCTTCCGTTGCCCCCGCTGCCGGTTGTGCCAGCAGGTTACGCACGCGAGTCTGC < 1:451133/101‑1 TTGCGGTGCAGGTGCAGGTGCAGGTGCAGGTGCAGGTGCAGGTTTAGCTTCCGTTGCCCCCGCTGCCGGTTGTGCCAGCAGGTTACGCACGCGAGTCTGCA < 2:1448731/101‑1 CGGTGCAGGTGCAGGTGCAGGTGCAGGTGCAGGTGCAGGTTTAGCTTCCGTTGCCCCCGCTGCCGGTTGTGCCAGCAGGTTACGCACGCGAGTCTGCATCA > 1:1234612/1‑101 GTGCAGGTGCAGGTGCAGGTGCAGGTGCAGGTGCAGGTTTAGCTTCCGTTGCCCCCGCTGCCGGTTGTGCCAGCAGGTTACGCACGCGAGTCTGCATCAGT < 2:533183/101‑1 CAGGTGCAGGTGCAGGTGCAGGTGCAGGTGCAGGTTTAGCTTCCGTTGCCCCCGCTGCCGGTTGTGCCAGCAGGTTACGCACGCGAGTCTGCATCAGTTTT < 1:1444043/101‑1 |||||| CGGGCCAACCACGATCCCCGCAATCAGCAAAACAAAGAGCAATAACACTTTTAGCATGGTTATTCTCCTTGCGGCGCGGCTGCCGGAGTATCAGCTTGC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > 9/40896‑40994 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GGTGCAGGTGCAGGTGCAGGTGCAGGTGCAGGTTTAGCTTCCGTTGCCCCCGCTGCCGGTTGTGCCAGCAGGTTACGCACGCGAGTCTGCATCAGTTTT > 9/40995‑41093 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 23 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |