| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC | 9 | 41,027 | (GCAGGT)5→6 | intergenic (–/–) | – / – | –/– |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | 9 | = 40994 | 0 (0.000) | 42 (0.670) +GGTGCA |
31/122 | 0.4 | 100% | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| ? | 9 | 40995 = | 0 (0.000) | intergenic (–/–) | –/– | –/– | |||||
ATCGGGCCAACCACGATCCCCGCAATCAGCAAAACAAAGAGCAATAACACTTTTAGCATGGTTATTCTCCTTGCGGCGCGGCTGCCGGAGTATCAGCTTGCGGTGCAGGTGCAGGTGCAGGTGCAGGTGCAGGTTTAGCTTCCGTTGCCCCCGCTGCCGGTTGTGCCAGCAGGTTACGCACGCGAGTCTGCATCAGTTTTT > 9/40894‑41094 | atcGGGCCAACCACGATCCCCGCAATCAGCAAAACAAAGAGCAATAACACTTTTAGCATGGTTATTCTCCTTGCGGCGCGGCTGCCGGAGTATCAGCTTGc > 2:1695544/1‑101 (MQ=255) cGGGCCAACCACGATCCCCGCAATCAGCAAAACAAAGAGCAATAACACTTTTAGCATGGTTATTCTCCTTGCGGCGCGGCTGCCGGAGTATCAGCTTGCgg < 1:1108578‑M1/101‑3 (MQ=255) ggCCAACCACGATCCCCGCAATCAGCAAAACAAAGAGCAATAACACTTTTAGCATGGTTATTCTCCTTGCGGCGCGGCTGCCGGAGTATCAGCTTGCggtg < 1:422436‑M1/101‑5 (MQ=255) aCGATCCCCGCAATCAGCAAAACAAAGAGCAATAACTCTTTTAGCATGGTTATTCTCCTTGCGGCGCGGCTGCCGGAGTATCAGCTTGCggtgcaggtgca < 2:383814‑M1/101‑13 (MQ=255) aCGATCCCCGCAATCAGCAAAACAAAGAGCAATAACACTTTTAGCATGGTTATTCTCCTTGCGGCGCGGCTGCCGGAGTATCAGCTTGCggtgcaggtgca < 1:68487‑M1/101‑13 (MQ=255) gATCCCCGCAATCAGCAAAACAAAGAGCAATAACACTTTTAGCATGGTTATTCTCCTTGCGGCGCGGCTGCCGGAGTATCAGCTTGCggtgcaggtgcagg < 2:865078‑M1/101‑15 (MQ=255) aTCCCCGCAATCAGCAAAACAAAGAGCAATAACACTTTTAGCATGGTTATTCTCCTTGCGGCGCGGCTGCCGGAGTATCAGCTTGCggtgcaggtgcaggt < 1:1218443‑M1/101‑16 (MQ=255) ccGCAATCAGCAAAACAAAGAGCAATAACACTTTTAGCATGGTTATTCTCCTTGCGGCGCGGCTGCCGGAGTATCAGCTTGCggtgcaggtgcaggtgcag > 2:794314‑M1/1‑82 (MQ=255) cGCAATCAGCAAAACAAAGAGCAATAACACTTTTAGCATGGTTATTCTCCTTGCGGCGCGGCTGCCGGAGTATCAGCTTGCggtgcaggtgcaggtgcagg < 2:959374‑M1/101‑21 (MQ=255) aaTCAGCAAAACAAAGAGCAATAACACTTTTAGCATGGTTATTCTCCTTGCGGCGCGGCTGCCGGAGTATCAGCTTGCggtgcaggtgcaggtgcaggtgc < 2:403575‑M1/101‑24 (MQ=255) aaTCAGCAAAACAAAGAGCAATAACACTTTTAGCATGGTTATTCTCCTTGCGGCGCGGCTGCCGGAGTATCAGCTTGCggtgcaggtgcaggtgcaggtgc > 2:691819‑M1/1‑78 (MQ=255) cAGCAAAACAAAGAGCAATAACACTTTTAGCATGGTTATTCTCCTTGCGGCGCGGCTGCCGGAGTATCAGCTTGCggtgcaggtgcaggtgcaggtgcagg < 1:1484731‑M1/101‑27 (MQ=255) aaaaCAAAGAGCAATAACACTTTTAGCATGGTTATTCTCCTTGCGGCGCGGCTGCCGGAGTATCAGCTTGCggtgcaggtgcaggtgcaggtgcaggtgca > 2:1264697‑M1/1‑71 (MQ=255) aaCAAAGAGCAATAACACTTTTAGCATGGTTATTCTCCTTGCGGCGCGGCTGCCGGAGTATCAGCTTGCggtgcaggtgcaggtgcaggtgcaggtgcagg > 1:734507‑M1/1‑69 (MQ=255) aaCAAAGAGCAATAACACTTTTAGCATGGTTATTCTCCTTGCGGCGCGGCTGCCGGAGTATCAGCTTGCggtgcaggtgcaggtgcaggtgcaggtgcagg < 2:600413‑M1/101‑33 (MQ=255) aCAAAGAGCAATAACACTTTTAGCATGGTTATTCTCCTTGCGGCGCGGCTGCCGGAGTATCAGCTTGCggcgcaggtgcaggtgcaggtgcaggtgcagcg > 1:634820‑M1/1‑68 (MQ=255) cAAAGAGCAATAACACTTTTAGCATGGTTATTCTCCTTGCGGCGCGGCTGCCGGAGTATCAGCTTGCggtgcaggtgcaggtgcaggtgcaggtgcaggtg > 1:666038‑M1/1‑67 (MQ=255) cAAAGAGCAATAACACTTTTAGCATGGTTATTCTCCTTGCGGCGCGGCTGCCGGAGTATCAGCTTGCggtgcaggtgcaggtgcaggtgcaggtgcaggtg > 1:1480971‑M1/1‑67 (MQ=255) aaGAGCAATAACACTTTTAGCATTGTTATTTTCTTTGCGCCGCGGCTGCCGGAGTATCAGCTTGCggtgcaggtgcaggtgcaggtgcaggtgcaggtgca < 2:1135993‑M1/101‑37 (MQ=255) aaGAGCAATAACACTTTTAGCATGGTTATTCTCCTTGCGGCGCGGCTGCCGGAGTATCAGCTTGCggtgcaggtgcaggtgcaggtgcaggtgcaggtgca < 2:1318690‑M1/101‑37 (MQ=255) agCAATAACACTTTTAGCATGGTTATTCTCCTTGCGGCGCGGCTGCCGGAGTATCAGCTTGCggtgcaggtgcaggtgcaggtgcaggtgcaggtgcaggt > 1:668553‑M1/1‑62 (MQ=255) gCAATAACACTTTTAGCATGGTTATTCTCCTTGCGGCGCGGCTGCCGGAGTATCAGCTTGCggtgcaggtgcaggtgcaggtgcaggtgcaggtgcaggtt > 1:1631063‑M1/1‑61 (MQ=255) aTAACACTTTTAGCATGGTTATTCTCCTTGCGGCGCGGCTGCCGGAGTATCAGCTTGCggtgcaggtgcaggtgcaggtgcaggtgcaggtgcaggtttag > 1:1555276‑M1/1‑58 (MQ=255) aTAACACTTTTAGCATGGTTATTCTCCTTGCGGCGCGGCTGCCGGAGTATCAGCTTGCggtgcaggtgcaggtgcaggtgcaggtgcaggtgcaggtttag > 2:917101‑M1/1‑58 (MQ=255) tAACACTTTTAGCATGGTTATTCTCCTTGCGGCGCGGCTGCCGGAGTATCAGCTTGCggtgcaggtgcaggtgcaggtgcaggtgcaggtgcaggtttagc > 1:420978‑M1/1‑57 (MQ=255) tAACACTTTTAGCATGGTTATTCTCCTTGCGGCGCGGCTGCCGGAGTATCAGCTTGCggtgcaggtgcaggtgcaggtgcaggtgcaggtgcaggtttagc > 1:1627017‑M1/1‑57 (MQ=255) tAACACTTTTAGCATGGTTATTCTCCTTGCGGCGCGGCTGCCGGAGTATCAGCTTGCggtgcaggtgcaggtgcaggtgcaggtgcaggtgcaggtttagc < 2:895978‑M1/101‑45 (MQ=255) aaCACTTTTAGCATGGTTATTCTCCTTGCGGCGCGGCTGCCGGGGAATCAGATTGCggggcaggtgcaggcgcaggggcaggagcaggggcaagtttagct > 1:204150‑M1/1‑56 (MQ=255) aaCACTTTTAGCATGGTTATTCTCCTTGCGGCGCGGCTGCCGGAGTATCAGCTTGCggtgcaggtgcaggtgcaggtgcaggtgcaggtgcaggtttagct > 1:1524685‑M1/1‑56 (MQ=255) acacTTTTAGCATGGTTATTCTCCTTGCGGCGCGGCTGCCGGAGTATCAGCTTGCggtgcaggtgcaggtgcaggtgcaggtgcaggtgcaggtttagctt < 2:338508‑M1/101‑47 (MQ=255) acTTTTAGCATGGTTATTCTCCTTGCGGCGCGGCTGCCGGAGTATCAGCTTGCggggcaggtgcaggtgcaggtgcaggtgcaggtgcaggtttagcttcc > 1:1044477‑M1/1‑53 (MQ=255) tAGCATGGTTATTCTCCTTGCGGCGCGGCTGCCGGAGTATCAGCTTGCggtgcaggtgcaggtgcaggtgcaggtgcaggtgcaggtttagcttccgttgc < 2:373404‑M1/101‑54 (MQ=255) tAGCATGGTTATTCTCCTTGCGGCGCGGCTGCCGGAGTATCAGCTTGCggtgcaggtgcaggtgcaggtgcaggtgcaggtgcaggtttagcttccgttgc > 1:1572280‑M1/1‑48 (MQ=255) cATGGTTATTCTCCTTGCGGCGCGGCTGCCGGAGTATCAGCTTGCggtgcaggtgcaggtgcaggtgcaggtgcaggtgcaggtttagcttccgttgcccc > 2:732229‑M1/1‑45 (MQ=255) cATGGTTATTCTCCTTGCGGCGCGGCTGCCGGAGTATCAGCTTGCggtgcaggtgcaggtgcaggtgcaggtgcaggtgcaggtttagcttccgttgcccc > 1:1448737‑M1/1‑45 (MQ=255) cATGGTTATTCTCCTTGCGGCGCGGCTGCCGGAGTATCAGCTTGCggtgcaggtgcaggtgcaggtgcaggggcaggtgcaggtttagcttccgttggccc > 2:913788‑M1/1‑45 (MQ=255) gTTATTCTCCTTGCGGCGCGGCTGCCGGAGTATCAGCTTGCggtgcaggtgcaggtgcaggtgcaggtgcaggtgcaggtttagcttccgttgcccccgct < 1:639645‑M1/101‑61 (MQ=255) tATTCTCCTTGCGGCGCGGCTGCCGGAGTATCAGCTTGCggtgcaggtgcaggtgcaggtgcaggtgcaggtgcaggtttagcttccgttgcccccgctgc > 2:659190‑M1/1‑39 (MQ=255) aTTCTCCTTGCGGCGCGGCTGCCGGAGTATCAGCTTGCggtgcaggtgcaggtgcaggtgcaggtgcaggtgcaggtttagcttccgttgcccccgctgcc > 2:1545892‑M1/1‑38 (MQ=255) aTTCTCCTTGCGGCGCGGCTGCCGGAGTATCAGCTTGCggtgcaggtgcaggtgcaggtgcaggtgcaggtgcaggtttagcttccgttgcccccgctgcc < 2:1182682‑M1/101‑64 (MQ=255) ttCTCCTTGCGGCGCGGCTGCCGGAGTATCAGCTTGCggtgcaggtgcaggtgcaggtgcaggtgcaggtgcaggtttagcttccgttgcccccgctgccg < 1:1647841‑M1/101‑65 (MQ=255) tctcCTTGCGGCGCGGCTGCCGGAGTATCAGCTTGCggtgcaggtgcaggtgcaggtgcaggtgcaggtgcaggtttagcttccgttgcccccgctgccgg > 1:1242616‑M1/1‑36 (MQ=255) ctcCTTGCGGCGCGGCTGCCGGAGTATCAGCTTGCggtgcaggtgcaggtgcaggtgcaggtgcaggtgcaggtttagcttccgttgcccccgctgccggt > 1:1017298‑M1/1‑35 (MQ=255) cgcggcTGCCGGAGTATCAGCTTGCggtgcaggtgcaggtgcaggtgcaggtgcaggtgcaggtttagcttccgttgcccccgctgccggttgtgccagca > 2:336904‑M1/1‑25 (MQ=255) cTGCCGGAGTATCAGCTTGCggtgcaggtgcaggtgcaggtgcaggtgcaggtgcaggtttagcttccgttgcccccgctgccggttgtgccagcaggtta < 2:686969‑M1/101‑82 (MQ=255) gCCGGAGTATCAGCTTGCggtgcaggtgcaggtgcaggtgcaggtgcaggtgcaggtttagcttccgttgcccccgctgccggttgtgccagcaggttacg > 2:1244663‑M1/1‑18 (MQ=255) gCCGGAGTATCAGCTTGCggtgcaggtgcaggtgcaggtgcaggtgcaggtgcaggtttagcttccgttgcccccgctgccggttgtgccagcaggttacg > 1:635196‑M1/1‑18 (MQ=255) ggAGTATCACCTTGCggtgcaggttcagctgcagatgcaggtgcaggtgcaggtttagcctccgttgcccccgctgccggttgtgccagcagattacgcac < 2:1379660‑M1/101‑87 (MQ=255) gTATCAGCTTGCggtgcaggtgcaggtgcaggtgcaggtgcaggtgcaggtttagcttccgttgcccccgctgccggttgtgccagcaggttacgcacgcg > 2:549173‑M1/1‑12 (MQ=255) gTATCAGCTTGCggtgcaggtgcaggtgcaggtgcaggtgcaggtgcaggtttagcttccgttgcccccgctgccggttgtgccagcaggttacgcacgcg > 2:1600594‑M1/1‑12 (MQ=255) gTATCAGCTTGCggtgcaggtgcaggtgcaggtgcaggtgcaggtgcaggtttagcttccgttgcccccgctgccggttgtgccagcaggttacgcacgcg > 1:1650946‑M1/1‑12 (MQ=255) gTATCAGCTTGCggtgcaggtgcaggtgcaggtgcaggtgcaggtgcaggtttagcttccgttgcccccgctgccggttgtgccagcaggttacgcacgcg > 1:1643566‑M1/1‑12 (MQ=255) aTCAGCTTGCggtgcaggtgcaggtgcaggtgcaggtgcaggtgcaggtttagcttccgttgcccccgctgccggttgtgccagcaggttacgcacgcgag > 1:1135959‑M1/1‑10 (MQ=255) aGCTTGCggtgcaggtgcaggtgcaggtgcaggtgcaggtgcaggtttagcttccgttgcccccgctgccggttgtgccagcaggttacgcacgcgagtct < 2:1242611‑M1/101‑95 (MQ=255) aGCTTGCggtgcaggtgcaggtgcaggtgcaggtgcaggtgcaggtttagcttccgttgcccccgctgccggttgtgccagcaggttacgcacgcgagtct < 1:991422‑M1/101‑95 (MQ=255) gCTTGCggtgcaggtgcaggtgcaggtgcaggtgcaggtgcaggtttagcttccgttgcccccgctgccggttgtgccagcaggttacgcacgggagtctg < 2:204150‑M1/101‑96 (MQ=255) gCTTGCggtgcaggtgcaggtgcaggtgcaggtgcaggtgcaggtttagcttccgttgcccccgctgccggttgtgccagcaggttacgcacgcgagtctg < 2:1297967‑M1/101‑96 (MQ=255) cTTGCggtgcaggtgcaggtgcaggtgcaggtgcaggtgcaggtttagcttccgttgcccccgctgccggttgtgccagcaggttacgcacgcgagtctgc < 1:451133‑M1/101‑97 (MQ=255) ttGCggtgcaggtgcaggtgcaggtgcaggtgcaggtgcaggtttagcttccgttgcccccgctgccggttgtgccagcaggttacgcacgcgagtctgca < 2:1448731‑M1/101‑98 (MQ=255) cggtgcaggtgcaggtgcaggtgcaggtgcaggtgcaggtttagcttccgttgcccccgctgccggttgtgccagcaggttacgcacgcgagtctgcatca > 1:1234612‑M1/1‑1 (MQ=255) | ATCGGGCCAACCACGATCCCCGCAATCAGCAAAACAAAGAGCAATAACACTTTTAGCATGGTTATTCTCCTTGCGGCGCGGCTGCCGGAGTATCAGCTTGCGGTGCAGGTGCAGGTGCAGGTGCAGGTGCAGGTTTAGCTTCCGTTGCCCCCGCTGCCGGTTGTGCCAGCAGGTTACGCACGCGAGTCTGCATCAGTTTTT > 9/40894‑41094 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |