| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | 100 | 1 = | 0 (0.000) | 20 (0.300) | 17/200 | 3.3 | 37.7% | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| ? | 6 | = 55690 | 66 (0.990) | intergenic (–/–) | –/– | –/– | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
CAGTACGCTGGCAGCGTTAAACCCGAATCGGTTATGGGTGCGGAAATTGTTGAAGGGTAAAGCGGTTAAGGCGGGGTAATCTGCTCTCGCAGTGTTTGC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < 100/99‑1‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGAACTACGTCCGACAAAC < 6/55690‑55648 CAGTACGCTGGCAGCGTTAAACCCGAATCGGTTATGGGTGCGGAAATTGTTGAAGGGTAAAGCGGTTAAGGCGGGGTAATCTGCTCTCGCAGTGTTTGCCG > 1:646544/1‑101 AGTACGCTGGCAGCGTTAAACCCGAATCGGTTATGGGTGCGGAAATTGTTGAAGGGTAAAGCGGTTAAGGCGGGGTAATCTGCTCTCGCAGTGTTTGCCGG > 2:973454/1‑101 ACGCTGGCAGCGTTAAACCCGAATCGGTTATGGGTGCGGAAATTGTTGAAGGGTAAAGCGGTTAAGGCGGGGTAATCTGCTCTCGCAGTGTTTGCCGGATG < 1:612099/101‑1 CGCTGGCAGCGTTAAACCCGAATCGGTTATGGGTGCGGAAATTGTTGAAGGGTAAAGCGGTTAAGGCGGGGTAATCTGCTCTCGCAGTGTTTGCCGGATGC < 1:1190518/101‑1 GCTGGCAGCGTTAAACCCGAATCGGTTATGGGTGCGGAAATTGTTGAAGGGTAAAGCGGTTAAGGCGGGGTAATCTGCTCTCGCAGTGTTTGCCGGATGCG < 1:1399522/101‑1 CTGGCAGCGTTAAACCCGAATCGGTTATGGGTGCGGAAATTGTTGAAGGGTAAAGCGGTTAAGGCGGGGTAATCTGCTCTCGCAGTGTTTGCCGGATGCGG < 2:485996/101‑1 CTGGCAGCGTTAAACCCGAATCGGTTATGGGTGCGGAAATTGTTGAAGGGTAAAGCGGTTAAGGCGGGGCAATCTGCTCTCGCAGTGTTTGCCGGATGCGG > 2:813081/1‑101 AGCGTTAAACCCGAATCGGTTATGGGTGCGGAAATTGTTGAAGGGTAAAGCGGTTAAGGCGGGGTAATCTGCTCTCGCAGTGTTTGCCGGATGCGGCGTGA > 2:1471005/1‑101 CGTTAAACCCGAATCGGTTATGGGTGCGGAAATTGTTGAAGGGTAAAGCGGTTAAGGCGGGGTAATCTGCTCTCGCAGTGTTTGCCGGATGCGGCGTGAAC > 1:1107082/1‑101 CGTTAAACCCGAATCGGTTATGGGTGCGGAAATTGTTGAAGGGTAAAGCGGTTAAGGCGGGGTAATCTGCTCTCGCAGTGTTTGCCGGATGCGGCGTGAAC < 2:1262570/101‑1 CGTTAAACCCGAATCGGTTATGGGTGCGGAAATTGTTGAAGGGTAAAGCGGTTAAGGCGGGGTAATCTGCTCTCGCAGTGTTTGCCGGATGCGGCGTGAAC > 2:1688033/1‑101 AAACCCGAATCGGTTATGGGTGCGGAAATTGTTGAAGGGTAAAGCGGTTAAGGCGGGGTAATCTGCTCTCGCAGTGTTTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCT > 2:1546725/1‑101 CGAATCGGTTATGGGTGCGGAAATTGTTGAAGGGTAAAGCGGTTAAGGCGGGGTAATCTGCTCTCGCAGTGTTTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCC > 2:351015/1‑101 CGAATCGGTTATGGGTGCGGAAATTGTTGAAGGGTAAAGCGGTTAAGGCGGGGTAATCTGCTCTCGCAGTGTTTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCC > 2:884715/1‑101 CGAATCGGTTATGGGTGCGGAAATTGTTGAAGGGTAAAGCGGTTAAGGCGGAGTAATCTGCTCTCGCAGTGTTTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCC < 2:176852/101‑1 GGTTGTGGGTGCGGAAATTGTTGAAGGGTAAAGCGGTTAAGGCGGGGTAATCTGCTCTCGCAGTGTTTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGACCTA > 1:627066/1‑101 TATGGGTGCGGAAATTGTTGAAGGGTAAAGCGGTTAAGGCGGGGTAATCTGCTCTCGCAGTGTTTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGACCTACGT < 1:1147447/101‑1 GGGTGCGGAAATTGTTGAAGGGTAAAGCGGTTAAGGCGGGGTAATCTGCTCTCGCAGTGTTTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGACCTACGTgtg > 2:383234/1‑98 GTGCGGAAATTGTTGAAGGGTAAAGCGGTTAAGGCGGGGTAATCTGCTCTCGCAGTGTTTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGACCTACGTgtgac > 1:695411/1‑96 GGAAATTGTTGAAGGGTAAAGCGGTTAAGGCGGGGTAATCTGCTCTCGCAGTGTTTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGACCTACGTgtgacgtgt > 1:1510553/1‑92 CAGTACGCTGGCAGCGTTAAACCCGAATCGGTTATGGGTGCGGAAATTGTTGAAGGGTAAAGCGGTTAAGGCGGGGTAATCTGCTCTCGCAGTGTTTGC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < 100/99‑1‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGAACTACGTCCGACAAAC < 6/55690‑55648 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 18 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |