| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC | 9 | 39,136 | (TAATTGA)2→3 | intergenic (–/–) | – / – | –/– |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | 9 | = 39117 | 0 (0.000) | 72 (1.100) +ATTGATA |
50/148 | 0.0 | 99.4% | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| ? | 9 | 39118 = | 1 (0.010) | intergenic (–/–) | –/– | –/– | |||||
AGAGCGGCGGCGACAGCTACAACAAGAAGTTTGGGTGAAAACGAAAATTCCATGCAAAATGCTCCGGTTTCATGTCGTCAAAATGTTGACGTAATTAAGCATTGATAATTGATAATTGAGATCCCTCTCCCTGACAGGATGATTGCATAAATAATAGTGATGAAAATAAATTATTTATTTATCCAGAAAATGAATTGGAA > 9/39018‑39217 | cggcgacagctacaacaagaagtttgggtgaaaacgaaaattccatgcaaaatgctccggtttcatgtcgtcaaaatgttgacgtaattaagcattgataa < 2:66908‑M2/1‑1 (MQ=255) agctacaacaagaagtttgggtgaaaacgaaaattccatgcaaaatgctccggtttcatgtcgtcaaaatgttgacgtaattaagcattgataattgataa < 1:188177‑M2/8‑1 (MQ=255) agctacaacaagaagtttgggtgaaaacgaaaattccatgcaaaatgctccggtttcatgtcgtcaaaatgttgacgtaattaagcattgataattgataa > 2:445238‑M2/94‑101 (MQ=255) agctacaacaagaagtttgggtgaaaacgaaaattccatgcaaaatgctccggtttcatgtcgtcaaaatgttgacgtaattaagcattgataattgataa > 2:1170278‑M2/94‑101 (MQ=255) agctacaacaagaagtttgggtgaaaacgaaaattccatgcaaaatgctccggtttcatgtcgtcaaaatgttgacgtaattaagcattgataattgataa > 1:183703‑M2/94‑101 (MQ=255) agctacaacaagaagtttgggtgaaaacgaaaattccatgcaaaatgctccggtttcatgtcgtcaaaatgttgacgtaattaagcattgataattgataa > 2:105639‑M2/94‑101 (MQ=255) agctacaacaagaagtttgggtgaaaacgaaaattccatgcaaaatgctccggtttcatgtcgtcaaaatgttgacgtaattaagcattgataattgataa > 2:1683616‑M2/94‑101 (MQ=255) agctacaacaagaagtttgggtgaaaacgaaaattccatgcaaaatgctccggtttcatgtcgtcaaaatgttgacgtaattaagcattgataattgataa > 1:642765‑M2/94‑101 (MQ=255) acaacaagaagtttgggtgaaaacgaaaattccatgcaaaatgctccggtttcatgtcgtcaaaatgttgacgtaattaagcattgataattgataattga < 2:1213897‑M2/12‑1 (MQ=255) acaacaagaagtttgggtgaaaacgaaaattccatgcaaaatgctccggtttcatgtcgtcaaaatgttgacgtaattaagcattgataattgataattga > 2:1112973‑M2/90‑101 (MQ=255) acaacaagaagtttgggtgaaaacgaaaattccatgcaaaatgctccggtttcatgtcgtcaaaatgttgacgtaattaagcattgataattgataattga > 2:913157‑M2/90‑101 (MQ=255) aacaagaagtttgggtgaaaacgaaaattccatgcaaaatgctccggtttcatgtcgtcaaaatgttgacgtaattaagcattgataattgataattgata < 1:264382‑M2/14‑1 (MQ=255) aacaagaagtttgggtgaaaacgaaaattccatgcaaaatgctccggtttcatgtcgtcaaaatgttgacgtaattaagcattgataattgataattgata < 2:310454‑M2/14‑1 (MQ=255) 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taATTGATAATTGATAATTGAGATCCCTCTCCCTGACAGGATGATTGCATAAATAATAGTGATGAAAATAAATTATTTATTTATCCAGAAAATGAATTGGa < 2:57525‑M2/99‑1 (MQ=255) aATTGATAATTGATAATTGAGATCCCTCTCCCTGACAGGATGATTGCATAAATAATAGTGATGAAAATAAATTATTTATTTATCCAGAAAATGAATTGGaa > 1:811734‑M2/2‑101 (MQ=255) | AGAGCGGCGGCGACAGCTACAACAAGAAGTTTGGGTGAAAACGAAAATTCCATGCAAAATGCTCCGGTTTCATGTCGTCAAAATGTTGACGTAATTAAGCATTGATAATTGATAATTGAGATCCCTCTCCCTGACAGGATGATTGCATAAATAATAGTGATGAAAATAAATTATTTATTTATCCAGAAAATGAATTGGAA > 9/39018‑39217 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |