Predicted mutation
evidence seq id position mutation annotation gene description
JC 9 39,136 (TAATTGA)2→3 intergenic (–/–)  /  –/–

New junction evidence
  seq id position reads (cov) reads (cov) score skew freq annotation gene product
* ? 9 = 391170 (0.000)72 (1.100)
+ATTGATA
50/148 0.0 99.4% intergenic (–/–) –/– –/–
?9 39118 = 1 (0.010)intergenic (–/–) –/– –/–

GGCGGCGACAGCTACAACAAGAAGTTTGGGTGAAAACGAAAATTCCATGCAAAATGCTCCGGTTTCATGTCGTCAAAATGTTGACGTAATTAAGC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑  >  9/39023‑39117
‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ATTGATAATTGATAATTGAGATCCCTCTCCCTGACAGGATGATTGCATAAATAATAGTGATGAAAATAAATTATTTATTTATCCAGAAAATGAATTGGAA  >  9/39118‑39217
                                                                                               |||||||                                                                                                    
GGCGGCGACAGCTACAACAAGAAGTTTGGGTGAAAACGAAAATTCCATGCAAAATGCTCCGGTTTCATGTCGTCAAAATGTTGACGTAATTAAGCATTGAT                                                                                                       <  2:1389698/101‑1
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                   AGAAGTTTGGGTGAAAACGAAAATTCCATGCAAAATGCTCCGGTTTCATGTCGTCAAAATGTTGACGTAATTAAGCATTGATAATTGATAATTGATAATTG                                                                                    >  2:965945/1‑101
                   AGAAGTTTGGGTGAAAACGAAAATTCCATGCAAAATGCTCCGGTTTCATGTCGTCAAAATGGTGACGTAATTAAGCATTGATAATTGATAATTGATAATTa                                                                                    >  1:6298/1‑100
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                          TGGGTGAAAACGAAAATTCCATGCAAAATGCTCCGGTTTCATGTCGTCAAAATGTTGACGTAATTAAGCATTGATAATTGATAATTGATAATTGAGATCCC                                                                             >  2:1672399/1‑101
                           GGGTGAAAACGAAAATTCCATGCAAAATGCTCCGGTTTCATGTCGTCAAAATGTTGACGTAATTAAGCATTGATAATTGATAATTGATAATTGAGATCCCT                                                                            <  1:1112718/101‑1
                              TGAAAACGAAAATTCCATGCAAAATGCTCCGGTTTCATGTCGTCAAAATGTTGACGTAATTAAGCATTGATAATTGATAATTGATAATTGAGATCCCTCTC                                                                         >  1:1205589/1‑101
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                               GAAAACGAAAATTCCATGCAAAATGCTCCGGTTTCATGTCGTCAAAATGTTGACGTAATTAAGCATTGATAATTGATAATTGATAATTGAGATCCCTCTCC                                                                        >  1:963982/1‑101
                               GAAAACGAAAATTCCATGCAAAATGCTCCGGTTTCATGTCGTCAAAATGTTGACGTAATTAAGCATTGATAATTGATAATTGATAATTGAGATCCCTCTCC                                                                        <  1:439654/101‑1
                               GAAAACGAAAATTCCATGCAAAATGCTCCGGTTTCATGTCGTCAAAATGTTGACGTAATTAAGCATTGATAATTGATAATTGATAATTGAGATCCCTCTCC                                                                        >  2:1455020/1‑101
                                     GAAAATTCCATGCAAAATGCTCCGGTTTAATGTCGTCAAAATGTTGACGTAATTAAGCATTGATAATTGATAATTGATAATAGAGATCAATCTCCCTGACA                                                                  >  2:1375951/1‑101
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                                         ATTCCATGCAAAATGCTCCGGTTTCATGTCGTCAAAATGTTGACGTAATTAAGCATTGATAATTGATAATTGATAATTGAGATCCCTCTCCCTGACAGGAT                                                              >  2:486839/1‑101
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                                           TCCATGCAAAATGCTCCGGTTTCATGTCGTCAAAATGTTGACGTAATTAAGCATTGATAATTGATAATTGATAATTGAGATCCCTCTCCCTGACAGGATGA                                                            >  1:442117/1‑101
                                           TCCATGCAAAATGCTCCGGTTTCATGTCGTCAAAATGTTGACGTAATTAAGCATTGATAATTGATAATTGATAATTGAGATCCCTCTCCCTGACAGGATGA                                                            >  2:1517038/1‑101
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                                                            GGTTTCATGTCGTCAAAATGTTGACGTAATTAAGCATTGATAATTGATAATTGATAATTGAGATCCCTCTCCCTGACAGGATGATTGCATAAATAATAGTG                                           >  2:129234/1‑101
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                                                                TCATGTCGTCAAAATGTTGACGTAATTAAGCATTGATAATTGATAATTGATAATTGAGATCCCTCTCCCTGACAGGATGATTGCATAAATAATAGTGATGA                                       >  2:700626/1‑101
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                                                                         CAAAATGTTGACGTAATTAAGCATTGATAATTGATAATTGATAATTGAGATCCCTCTCCCTGACAGGATGATTGCATAAATAATAGTGATGAAAATAAATT                              >  1:117716/1‑101
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                                                                            AATGTTGACGTAATTAAGCATTGATAATTGATAATTGATAATTGAGATCCCTCTCCCTGACAGGATGATTGCATAAATAATAGTGATGAAAATAAATTATT                           <  1:92470/101‑1
                                                                             ATGTTGACGTAATTAAGCATTGATAATTGATAATTGATAATTGAGATCCCTCTCCCTGACAGGATGATTGCATAAATAATAGTGATGAAAATAAATTATTT                          <  2:924273/101‑1
                                                                                TTGACGTAATTAAGCATTGATAAATGATAATAGATAATTGAGATCCCTCTCCCTGACAGGATGATTGCATAAATAATAGTGATGAAAATAAATTATTTATT                       <  1:767223/101‑1
                                                                                  GACGTAATTAAGCATTGATAATTGATAATTGATAATTGAGATCCCTCTCCCTGACAGGATGATTGCATAAATAATAGTGATGAAAATAAATTATTTATTTA                     >  2:632289/1‑101
                                                                                  GACGTAATTAAGCATTGATAATTGATAATTGATAATTGAGATCCCTCTCCCTGACAGGATGATTGCATAAATAATAGTGATGAAAATAAATTATTTATTTA                     >  2:549532/1‑101
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                                                                                     GTAATTAAGCATTGATAATTGATAATTGATAATTGAGATCCCTCTCCCTGACAGGATGATTGCATAAATAATAGTGATGAAAATAAATTATTTATTTATCC                  <  2:1270217/101‑1
                                                                                     GTAATTAAGCATTGATAATTGATAATTGATAATTGAGATCCCTCTCCCTGACAGGATGATTGCATAAATAATAGTGATGAAAATAAATTATTTATTTATCC                  >  1:1132434/1‑101
                                                                                     GTAATTAAGAATTGATAATTGATAATTGATAATTGAGATCCCTCTCCCTGACAGGATGATTGCATAAATAATAGTGATGAAAATAAATTATTTATTTATCC                  <  2:604637/101‑1
                                                                                      TAATTAAGCATTGATAATTGATAATTGATAATTGAGATCCCTCTCCCTGACAGGATGATTGCATAAATAATAGTGATGAAAATAAATTATTTATTTATCCA                 <  2:1152871/101‑1
                                                                                           AAGCATTGATAATTGATAATTGATAATTGAGATCCCTCTCCCTGACAGGATGATTGCATAAATAATAGTGATGAAAATAAATTATTTATTTATCCAGAAAA            <  1:887047/101‑1
                                                                                            AGCATTGATAATTGATAATTGATAATTGAGATCCCTCTCCCTGACAGGATGATTGCATAAATAATAGTGATGAAAATAAATTATTTATTTATCCAGAAAAT           <  1:105639/101‑1
                                                                                              CATTGATAATTGATAATTGATAATTGAGATCCCTCTCCCTGACAGGATGATTGCATAAATAATAGTGATGAAAATAAATTATTTATTTATCCAGAAAATGA         >  1:579943/1‑101
                                                                                              CATTGATAATTGATAATTGATAATTGAGATCCCTCTCCCTGACAGGATGATTGCATAAATAATAGTGATGAAAATAAATTATTTATTTATCCAGAAAATGA         >  2:1376714/1‑101
                                                                                              CATTGATAATTGATAATTGATAATTGAGATCCCTCTCCCTGACAGGATGATTGCATAAATAATAGTGATGAAAATAAATTATTTATTTATCCAGAAAATGA         <  1:913162/101‑1
                                                                                               ATTGATAATTGATAATTGATAATTGAGATCCTTCTCCCTGACAGGATGATTGCATAAATAATAGTGATGAAAATAAATTATTTATTTATCCAGAAAATGAA        >  2:157378/1‑101
                                                                                               ATTGATAATTGATAATTGATAATTGAGATCCCTCTCCCTGACAGGATGATTGCATAAATAATAGTGATGAAAATAAATTATTTATTTATCCAGAAAATGAA        >  1:1050689/1‑101
                                                                                               ATTGATAATTGATAATTGATAATTGAGATCCCTCTCCCTGACAGGATGATTGCATAAATAATAGTGATGAAAATAAATTATTTATTTATCCAGAAAATGAA        <  1:1707131/101‑1
                                                                                               ATTGATAATTGATAATTGATAATTGAGATCCCTCTCCCTGACAGGATGATTGCATAAATAATAGTGATGAAAATAAATTATTTATTTATCCAGAAAATGAA        >  2:167796/1‑101
                                                                                               ATTGATAATTGATAATTGATAATTGAGATCCCTCTCCCTGACAGGATGATTGCATAAATAATAGTGATGAAAATAAATTATTTATTTATCCAGAAAATGAA        >  2:97260/1‑101
                                                                                               ATTGATAATTGATAATTGATAATTGAGATCCCTCTCCCTGACAGGATGATTGCATAAATAATAGTGATGAAAATAAATTATTTATTTATCCAGAAAATGAA        >  2:1622582/1‑101
                                                                                                TTGATAATTGATAATTGATAATTGAGATCCCTCTCCCTGACAGGATGATTGCATAAATAATAGTGATGAAAATAAATTATTTATTTATCCAGAAAATGAAT       <  2:297954/101‑1
                                                                                                 TGATAATTGATAATTGATAATTGAGATCCCTCTCCCTGACAGGATGATTGCATAAATAATAGTGATGAAAATAAATTATTTATTTATCCAGAAAATGAATT      <  1:675946/101‑1
                                                                                                   ATAATTGATAATTGATAATTGAGATCCCTCTCCCTGACAGGATGATTGCATAAATAATAGTGATGAAAATAAATTATTTATTTATCCAGAAAATGAATTGG    <  1:1180084/101‑1
                                                                                                    TAATTGATAATTGATAATTGAGATCCCTCTCCCTGACAGGATGATTGCATAAATAATAGTGATGAAAATAAATTATTTATTTATCCAGAAAATGAATTGGA   <  2:57525/101‑1
                                                                                                     AATTGATAATTGATAATTGAGATCCCTCTCCCTGACAGGATGATTGCATAAATAATAGTGATGAAAATAAATTATTTATTTATCCAGAAAATGAATTGGAA  >  1:811734/1‑101
                                                                                               |||||||                                                                                                    
GGCGGCGACAGCTACAACAAGAAGTTTGGGTGAAAACGAAAATTCCATGCAAAATGCTCCGGTTTCATGTCGTCAAAATGTTGACGTAATTAAGC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑  >  9/39023‑39117
‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ATTGATAATTGATAATTGAGATCCCTCTCCCTGACAGGATGATTGCATAAATAATAGTGATGAAAATAAATTATTTATTTATCCAGAAAATGAATTGGAA  >  9/39118‑39217

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap:     Deleted base: 
Reads not counted as support for junction
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint.
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication.