| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC | 9 | 39,136 | (TAATTGA)2→3 | intergenic (–/–) | – / – | –/– |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | 9 | = 39117 | 0 (0.000) | 72 (1.100) +ATTGATA |
50/148 | 0.0 | 99.4% | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| ? | 9 | 39118 = | 1 (0.010) | intergenic (–/–) | –/– | –/– | |||||
AAGAGCGGCGGCGACAGCTACAACAAGAAGTTTGGGTGAAAACGAAAATTCCATGCAAAATGCTCCGGTTTCATGTCGTCAAAATGTTGACGTAATTAAGCATTGATAATTGATAATTGAGATCCCTCTCCCTGACAGGATGATTGCATAAATAATAGTGATGAAAATAAATTATTTATTTATCCAGAAAATGAATTGGAA > 9/39017‑39217 | aaGAGCGGCGGCGACAGCTACAACAAGAAGTTTGGGTGAAAACGAAAATTCCATGCAAAATGCTCCGGTTTCATGTCGTCAAAATGTTGACGTAATTAAGc > 1:609410/1‑101 (MQ=255) ggcggcgACAGCTACAACAAGAAGTTTGGGTGAAAACGAAAATTCCATGCAAAATGCTCCGGTTTCATGTCGTCAAAATGTTGACGTAATTAAGCattgat < 2:1389698‑M1/101‑7 (MQ=255) cggcgACAGCTACAACAAGAAGTTTGGGTGAAAACGAAAATTCCATGCAAAATGCTCCGGTTTCATGTCGTCAAAATGTTGACGTAATTAAGCattgataa < 2:66908‑M1/101‑9 (MQ=255) aGCTACAACAAGAAGTTTGGGTGAAAACGAAAATTCCATGCAAAATGCTCCGGTTTCATGTCGTCAAAATGTTGACGTAATTAAGCattgataattgataa > 1:642765‑M1/1‑86 (MQ=255) aGCTACAACAAGAAGTTTGGGTGAAAACGAAAATTCCATGCAAAATGCTCCGGTTTCATGTCGTCAAAATGTTGACGTAATTAAGCattgataattgataa > 2:105639‑M1/1‑86 (MQ=255) aGCTACAACAAGAAGTTTGGGTGAAAACGAAAATTCCATGCAAAATGCTCCGGTTTCATGTCGTCAAAATGTTGACGTAATTAAGCattgataattgataa > 1:183703‑M1/1‑86 (MQ=255) aGCTACAACAAGAAGTTTGGGTGAAAACGAAAATTCCATGCAAAATGCTCCGGTTTCATGTCGTCAAAATGTTGACGTAATTAAGCattgataattgataa < 1:188177‑M1/101‑16 (MQ=255) aGCTACAACAAGAAGTTTGGGTGAAAACGAAAATTCCATGCAAAATGCTCCGGTTTCATGTCGTCAAAATGTTGACGTAATTAAGCattgataattgataa > 2:1170278‑M1/1‑86 (MQ=255) aGCTACAACAAGAAGTTTGGGTGAAAACGAAAATTCCATGCAAAATGCTCCGGTTTCATGTCGTCAAAATGTTGACGTAATTAAGCattgataattgataa > 2:1683616‑M1/1‑86 (MQ=255) aGCTACAACAAGAAGTTTGGGTGAAAACGAAAATTCCATGCAAAATGCTCCGGTTTCATGTCGTCAAAATGTTGACGTAATTAAGCattgataattgataa > 2:445238‑M1/1‑86 (MQ=255) acaacaAGAAGTTTGGGTGAAAACGAAAATTCCATGCAAAATGCTCCGGTTTCATGTCGTCAAAATGTTGACGTAATTAAGCattgataattgataattga > 2:1112973‑M1/1‑82 (MQ=255) acaacaAGAAGTTTGGGTGAAAACGAAAATTCCATGCAAAATGCTCCGGTTTCATGTCGTCAAAATGTTGACGTAATTAAGCattgataattgataattga > 2:913157‑M1/1‑82 (MQ=255) acaacaAGAAGTTTGGGTGAAAACGAAAATTCCATGCAAAATGCTCCGGTTTCATGTCGTCAAAATGTTGACGTAATTAAGCattgataattgataattga < 2:1213897‑M1/101‑20 (MQ=255) aacaaGAAGTTTGGGTGAAAACGAAAATTCCATGCAAAATGCTCCGGTTTCATGTCGTCAAAATGTTGACGTAATTAAGCattgataattgataattgata < 1:264382‑M1/101‑22 (MQ=255) aacaaGAAGTTTGGGTGAAAACGAAAATTCCATGCAAAATGCTCCGGTTTCATGTCGTCAAAATGTTGACGTAATTAAGCattgataattgataattgata < 2:310454‑M1/101‑22 (MQ=255) acaaGAAGTTTGGGTGAAAACGAAAATTCCATGCAAAATGCTCCGGTTTCATGTCGTCAAAATGTTGACGTAATTAAGCattgataattgataattgataa > 2:375635‑M1/1‑79 (MQ=255) acaaGAAGTTTGGGTGAAAACGAAAATTCCATGCAAAATGCTCCGGTTTCATGTCGTCAAAATGTTGACGTAATTAAGAattgataattgataattgataa > 2:1169288‑M1/1‑79 (MQ=255) caaGAAGTTTGGGTGAAAACGAAAATTCCATGCAAAATGCTCCGGTTTCATGTCGTCAAAATGTTGACGTAATTAAGCattgataattgataattgataat < 2:183703‑M1/101‑24 (MQ=255) aagaagTTTGGGTGAAAACGAAAATTCCATGCAAAATGCTCCGGTTTCATGTCGTCAAAATGTTGACGTAATTAAGCattgataattgataattgataatt > 2:1146038‑M1/1‑77 (MQ=255) agaagTTTGGGTGAAAACGAAAATTCCATGCAAAATGCTCCGGTTTCATGTCGTCAAAATGTTGACGTAATTAAGCattgataattgataattgataattg > 1:1143486‑M1/1‑76 (MQ=255) agaagTTTGGGTGAAAACGAAAATTCCATGCAAAATGCTCCGGTTTCATGTCGTCAAAATGTTGACGTAATTAAGCattgataattgataattgataattg > 2:965945‑M1/1‑76 (MQ=255) agaagTTTGGGTGAAAACGAAAATTCCATGCAAAATGCTCCGGTTTCATGTCGTCAAAATGGTGACGTAATTAAGCattgataattgataattgataatta > 1:6298‑M1/1‑76 (MQ=255) ttGGGTGAAAACGAAAATTCCATGCAAAATGCTCCGGTTTCATGTCGTCAAAATGTTGACGTAATTAAGCattgataattgataattgataattgagatcc > 2:1401852‑M1/1‑70 (MQ=255) tGGGTGAAAACGAAAATTCCATGCAAAATGCTCCGGTTTCATGTCGTCAAAATGTTGACGTAATTAAGCattgataattgataattgataattgagatccc > 2:1672399‑M1/1‑69 (MQ=255) gggTGAAAACGAAAATTCCATGCAAAATGCTCCGGTTTCATGTCGTCAAAATGTTGACGTAATTAAGCattgataattgataattgataattgagatccct < 1:1112718‑M1/101‑34 (MQ=255) tGAAAACGAAAATTCCATGCAAAATGCTCCGGTTTCATGTCGTCAAAATGTTGACGTAATTAAGCattgataattgataattgataattgagatccctctc > 1:1205589‑M1/1‑65 (MQ=255) gAAAACGAAAATTCCATGCAAAATGCTCCGGTTTCATGTCGTCAAAATGTTGACGTAATTAAGCattgataattgataattgataattgagatccctctcc > 2:1455020‑M1/1‑64 (MQ=255) 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aTTCCATGCAAAATGCTCCGGTTTCATGTCGTCAAAATGTTGACGTAATTAAGCattgataattgataattgataattgagatccctctccctgacaggat > 2:92470‑M1/1‑54 (MQ=255) aTTCCATGCAAAACGCTCCGGTTTCATGTCGTCAAAATGTTGACGTAATTAAGCattgataattgataattgataactgagatcccgctccctgacaggat < 2:1659403‑M1/101‑48 (MQ=255) ttCCATGCAAAATGCTCCGGTTTCATGTCGTCAAAATGTTGACGTAATTAAGCattgataattgataattgataattgagatccctctccctgacaggatg > 2:1051080‑M1/1‑53 (MQ=255) tCCATGCAAAATGCTCCGGTTTCATGTCGTCAAAATGTTGACGTAATTAAGCattgataattgataattgataattgagatccctctccctgacaggatga > 2:1517038‑M1/1‑52 (MQ=255) tCCATGCAAAATGCTCCGGTTTCATGTCGTCAAAATGTTGACGTAATTAAGCattgataattgataattgataattgagatccctctccctgacaggatga > 1:442117‑M1/1‑52 (MQ=255) cATGCAAAATGCTCCGGTTTCATGTCGTCAAAATGTTGACGTAATTAAGCattgataattgataattgataattgagatccctctccctgaccggatgatt > 2:470907‑M1/1‑50 (MQ=255) cATGCAAAATGCTCCGGTTTCATGTCGTCAAAATGTTGACGTAATTAAGCattgataattgataattgataattgagatccctctccctgacaggatgatt < 1:281618‑M1/101‑52 (MQ=255) cATGCAAAATGCTCCGGTTTCATGTCGTCAAAATGTTGACGTAATTAAGCattgataattgataattgataattgagatccctctccctgacaggatgatt < 1:1111118‑M1/101‑52 (MQ=255) aTGCAAAATGCTCCGGTTTCATGTCGTCAAAATGTTGACGTAATTAAGCattgataattgataattgataattgagatccctctccctgacaggatgattg > 1:297954‑M1/1‑49 (MQ=255) aaaaTGCTCCGGTTTCATGTCGTCAAAATGTTGACGTAATTAAGCattgataattgataattgataattgagatccctctccctgacaggatgattgcata < 1:1112978‑M1/101‑57 (MQ=255) aaaaTGCTCCGGTTTCATGTCGTCAAAATGTTGACGTAATTAAGCattgataattgataattcataattgagatccctctccctgacaggatgattgcata < 1:843193‑M1/101‑57 (MQ=255) aaaTGCTCCGGTTTCATGTCGTCAAAATGTTGACGTAATTAAGCattgataattgataattgataattgagatccctctccctgacaggatgattgcataa < 1:705837‑M1/101‑58 (MQ=255) aaaTGCTCCGGTTTCATGTCGTCAAAATGTTGACGTAATTAAGCattgataattgataattgataattgagatccctctccctgacaggatgattgcataa < 2:268449‑M1/101‑58 (MQ=255) aaaTGCTCCGGTTTCATGTCGTCAAAATGTTGACGTAATTAAGCattgataattgataattgataattgagatccctctccctgacaggatgattgcataa > 2:371246‑M1/1‑44 (MQ=255) aaTGCTCCGGTTTCATGTCGTCAAAATGTTGACGTAATTAAGCattgataattgataattgataattgagatccctctccctgacaggatgattgcataaa > 2:322448‑M1/1‑43 (MQ=255) aaTGCTCCGGTTTCATGTCGTCAAAATGTTGACGTAATTAAGCattgataattgataattgataattgagatccctctccctgacaggatgattgcataaa > 2:371695‑M1/1‑43 (MQ=255) aaTGCTCCGGTTTCATGTCGTCAAAATGTTGACGTAATTAAGCattgataattgataattgataattgagatccctctccctgacaggatgattgcataaa > 1:1215076‑M1/1‑43 (MQ=255) aTGCTCCGGTTTCATGTCGTCAAAATGTTGACGTAATTAAGCattgataattgataattgataattgagatccctctccctgacaggatgattgcataaat < 2:1176507‑M1/101‑60 (MQ=255) gCTCCGGTTTCATGTCGTCAAAATGTTGACGTAATTAAGCattgataattgataattgataattgagatccctctccctgacaggatgattgcataaataa < 1:734217‑M1/101‑62 (MQ=255) gCTCCGGTTTCATGTCGTCAAAATGTTGACGTAATTAAGCattgataattgataattgataattgagatccctctccctgacaggatgattgcataaataa < 1:1170283‑M1/101‑62 (MQ=255) cTCCGGTTTCATGTCGTCAAAATGTTGACGTAATTAAGCattgataattgataattgataattgagatccctctccctgacaggatgattgcataaataat > 1:955687‑M1/1‑39 (MQ=255) tCCGGTTTCATGTCGTCAAAATGTTGACGTAATTAAGCattgataattgataattgataattgagatccctctccctgacaggatgattgcataaataata < 2:547989‑M1/101‑64 (MQ=255) tCCGGTTTCATGTCGTCAAAATGTTGACGTAATTAAGCattgataattgataattgataattgagatccctctccctgacaggatgattgcataaataata < 1:1634583‑M1/101‑64 (MQ=255) ccGGTTTCATGTCGTCAAAATGTTGACGTAATTAAGCattgataattgataattgataattgagatccctctccctgacaggatgattgcataaataatag < 2:57122‑M1/101‑65 (MQ=255) ggTTTCATGTCGTCAAAATGTTGACGTAATTAAGCattgataattgataattgataattgagatccctctccctgacaggatgattgcataaataatagtg > 2:129234‑M1/1‑35 (MQ=255) ggTTTCATGTCGTCAAAATGTTGACGTAATTAAGCattgataattgataattgataattgagatccctctccctgacaggatgattgcataaataatagtg < 2:1216080‑M1/101‑67 (MQ=255) ggTTTCATGTCGTCAAAATGTTGACGTAATTAAGCattgataattgataattgataattgagatccctctccctgacaggatgattgcataaataatagtg < 1:946334‑M1/101‑67 (MQ=255) tttCATGTCGTCAAAATGTTGACGTAATTAAGCattgataattgataattgataattgagatccctctccctgacaggatgattgcataaataatagtgat < 2:1143481‑M1/101‑69 (MQ=255) ttCATGTCGTCAAAATGTTGACGTAATTAAGCattgataattgataattgataattgagatccctctccctgacaggatgattgcataaataatagtgatg < 2:994431‑M1/101‑70 (MQ=255) ttCATGTCGTCAAAATGTTGACGTAATTAAGCattgataattgataattgataattgagatccctctccctgacaggatgattgcataaataatagtgatg < 1:375778‑M1/101‑70 (MQ=255) tCATGTCGTCAAAATGTTGACGTAATTAAGCattgataattgataattgataattgagatccctctccctgacaggatgattgcataaataatagtgatga > 2:700626‑M1/1‑31 (MQ=255) cATGTCGTCAAAATGTTGACGTAATTAAGCattgataattgataattgataattgagatccctctccctgacaggatgattgcataaataatagtgatgaa < 1:1401858‑M1/101‑72 (MQ=255) cATGTCGTCAAAATGTTGACGTAATTAAGCattgataattgataattgataattgagatccctctccctgacaggatgattgcataaataatagtgacgaa < 2:1309809‑M1/101‑72 (MQ=255) tGTCGTCAAAATGTTGACGTAATTAAGCattgataattgataattgataattgagatccctctccctgacaggatgattgcataaataatagtgatgaaaa > 2:817835‑M1/1‑28 (MQ=255) gtcAAAATGTTGACGTAATTAAGCattgataattgataattgataattgagatccctctccctgacaggatgattgcataaataatagtgatgaaaataaa > 1:244827‑M1/1‑24 (MQ=255) tcAAAATGTTGACGTAATTAAGCattgataattgataattgataattgagatccctctccctgacaggatgattgcataaataatagtgatgaaaataaat < 2:83795‑M1/101‑79 (MQ=255) tcAAAATGTTGACGTAATTAAGCattgataattgataattgataattgagatccctctccctgacaggatgattgcataaataatagtgatgaaaataaat < 2:1452652‑M1/101‑79 (MQ=255) cAAAATGTTGACGTAATTAAGCattgataattgataattgataattgagatccctctccctgacaggatgattgcataaataatagtgatgaaaataaatt > 1:117716‑M1/1‑22 (MQ=255) aaaaTGTTGACGTAATTAAGCattgataattgataattgataattgagatccctctccctgacaggatgattgcataaataatagtgatgaaaataaatta < 1:1146043‑M1/101‑81 (MQ=255) aaTGTTGACGTAATTAAGCattgataattgataattgataattgagatccctctccctgacaggatgattgcataaataatagtgatgaaaataaattatt < 1:92470‑M1/101‑83 (MQ=255) aTGTTGACGTAATTAAGCattgataattgataattgataattgagatccctctccctgacaggatgattgcataaataatagtgatgaaaataaattattt < 2:924273‑M1/101‑84 (MQ=255) ttGACGTAATTAAGCattgataaatgataatagataattgagatccctctccctgacaggatgattgcataaataatagtgatgaaaataaattatttatt < 1:767223‑M1/101‑87 (MQ=255) 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gTAATTAAGAattgataattgataattgataattgagatccctctccctgacaggatgattgcataaataatagtgatgaaaataaattatttatttatcc < 2:604637‑M1/101‑92 (MQ=255) tAATTAAGCattgataattgataattgataattgagatccctctccctgacaggatgattgcataaataatagtgatgaaaataaattatttatttatcca < 2:1152871‑M1/101‑93 (MQ=255) aaGCattgataattgataattgataattgagatccctctccctgacaggatgattgcataaataatagtgatgaaaataaattatttatttatccagaaaa < 1:887047‑M1/101‑98 (MQ=255) aGCattgataattgataattgataattgagatccctctccctgacaggatgattgcataaataatagtgatgaaaataaattatttatttatccagaaaat < 1:105639‑M1/101‑99 (MQ=255) cattgataattgataattgataattgagatccctctccctgacaggatgattgcataaataatagtgatgaaaataaattatttatttatccagaaaatga > 2:1376714‑M1/1‑1 (MQ=255) cattgataattgataattgataattgagatccctctccctgacaggatgattgcataaataatagtgatgaaaataaattatttatttatccagaaaatga < 1:913162‑M1/101‑101 (MQ=255) cattgataattgataattgataattgagatccctctccctgacaggatgattgcataaataatagtgatgaaaataaattatttatttatccagaaaatga > 1:579943‑M1/1‑1 (MQ=255) | AAGAGCGGCGGCGACAGCTACAACAAGAAGTTTGGGTGAAAACGAAAATTCCATGCAAAATGCTCCGGTTTCATGTCGTCAAAATGTTGACGTAATTAAGCATTGATAATTGATAATTGAGATCCCTCTCCCTGACAGGATGATTGCATAAATAATAGTGATGAAAATAAATTATTTATTTATCCAGAAAATGAATTGGAA > 9/39017‑39217 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |