| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC | 58 | 7,019 | Δ5 bp | intergenic (–/–) | – / – | –/– |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | 58 | = 7018 | 4 (0.060) | 69 (0.990) | 53/196 | 0.3 | 94.6% | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| ? | 58 | 7024 = | 4 (0.060) | intergenic (–/–) | –/– | –/– | |||||
AAGAGCAGGGCAAAACCAACGGCAAGATGGTGATCGCCACCGTGAAGGGCGACGTCCACGACATCGGTAAAAATATCGTTGGTGTGGTGCTGCAATGTAACAACTACGAAATTGTCGATCTCGGCGTTATGGTGCCTGCGGAAAAAATTCTCCGTACCGCTAAAGAAGTGAATGCTGATCTGATTGGCCTTTCGGGG > 58/6927‑7123 | cagcaaagagcagggcaaaaccaacggcaagatggtgatcgccaccgtgaagggcgacgtccacgacatcggtaaaaatatcgttggtgtggtgctgTaac > 2:220780‑M2/98‑101 (MQ=255)cagcaaagagcagggcaaaaccaacggcaagatggtgatcgccaccgtgaagggcgacgtccacgacatcggtaaaaatatcgttggtgtggtgctgTaac < 1:58995‑M2/4‑1 (MQ=255) gcaaagagcagggcaaaaccaacggcaagatggtgatcgccaccgtgaagggcgacgtccacgacatcggtaaaaatatcgttggtgtggtgctgTaacaa < 2:72931‑M2/6‑1 (MQ=255) caaagagcagggcaaaaccaacggcaagatggtgatcgccaccgtgaagggcgacgtccacgacatcggtaaaaatatcgttggtgtggtgctgTaacaac < 1:981889‑M2/7‑1 (MQ=255) caaagagcagggcaaaaccaacggcaagatggtgatcgccaccgtgaagggcgacgtccacgacatcggtaaaaatatcgttggtgtggtgctgTaacaac < 1:642696‑M2/7‑1 (MQ=255) aaagagcagggcaaaaccaacggcaagatggtgatcgccaccgtgaagggcgacgtccacgacatcggtaaaaatatcgttggtgtggtgctgTAACAACt > 1:231535‑M2/94‑101 (MQ=255) aaagagcagggcaaaaccaacggcaaaatggtgctcgccaccgtgaagggcgacgtcaacgacatcggtaaaaatatcgttggtgtggtgctgTAACAACt > 2:1473758‑M2/94‑101 (MQ=255) agagcagggcaaaacnaaaggcatnatggtgatcgccaccgtgaagggcgacgtccacgacatcggtaaaaatatcgttggtgtggtgccgTAACAACTAc < 2:1140997‑M2/10‑1 (MQ=255) aaaaccaacggcaagatggtgatcgccaccgtgaagggcgacgtccacgacatcggtaaaaatatcgttggtgtggtgctgTAACAACTACGAAATTGTCg > 2:1455457‑M2/82‑101 (MQ=255) aaaaccaacggcaagatggtgatcgccaccgtgaagggcgacgtccacgacatcggtaaaaatatcgttggtgtggtgctgTAACAACTACGAAATTGTCg > 1:909187‑M2/82‑101 (MQ=255) aaccaacggcaagatggtgatcgccaccgtgaagggcgacgtccacgacatcggtaaaaatatcgttggtgtggtgctgTAACAACTACGAAATTGTCGAt > 1:591771‑M2/80‑101 (MQ=255) aaccaacggcaagatggtgatcgccaccgtgaagggcgacgtccacgacatcggtaaaaatatcgttggtgtggtgctgTAACAACTACGAAATTGTCGAt < 1:1117120‑M2/22‑1 (MQ=255) accaacggcaagatggtgatcgccaccgtgaagggcgacgtccacgacatcggtaaaaatatcgttggtgtggtgctgTAACAACTACGAAATTGTCGAtc > 2:1648945‑M2/79‑101 (MQ=255) accaacggcaagatggtgatcgccaccgtgaagggcgacgtccacgacatcggtaaaaatatcgttcgtgtggtgctgTAACAACTACGAAATTGTCGAtc > 2:111773‑M2/79‑101 (MQ=255) cggcaagatggtgatcgccaccgtgaagggcgacgtccacgacatcggtaaaaatatcgttggtgtggtgctgTAACAACTACGAAATTGTCGATCTCGGc < 2:1087934‑M2/28‑1 (MQ=255) gcaagatggtgatcgccaccgtgaagggcgacgtccacgacatcggtaaaaatatcgttggtgtggtgctgTAACAACTACGAAATTGTCGATCTCGGCGt < 1:724514‑M2/30‑1 (MQ=255) gcaagatggtgatcgccaccgtgaagggcgacgtccacgacatcggtaaaaatatcgttggtgtggtgctgTAACAACTACGAAATTGTCGATCTCGGCGt > 1:641051‑M2/72‑101 (MQ=255) tGGTGATCGCCACCGGGAAGGGCGACCTCCACGAGATCGGTAAAAATATCGTTGGGGTGGTGC‑‑‑‑‑TGTAACAACTAAGAAATTGTCGATCTCGGCGTTATGGt > 2:1477807/1‑101 (MQ=255) agatggtgatcgccaccgtgaagggcgacgtccacgacatcggtaaaaatatcgttggtgtggtgctgTAACAACTACGAAATTGTCGATCTCGGCGTTAt < 2:61268‑M2/33‑1 (MQ=255) gatggtgatcgccaccgtgaagggcgacgtccacgacatcggtaaaaatatcgttggtgtggtgctgTAACAACTACGAAATTGTCGATCTCGGCGTTATg < 2:542674‑M2/34‑1 (MQ=255) atggtgatcgccaccgtgaagggcgacgtccacgacatcggtaaaaatatcgttggtgtggtgctgTAACAACTACGAAATTGTCGATCTCGGCGTTATgg < 2:571949‑M2/35‑1 (MQ=255) atggtgatcgccaccgtgaagggcgacgtccacgacatcggtaaaaatatcgttggtgtggtgctgTAACAACTACGAAATTGTCGATCTCGGCGTTATgg < 1:220780‑M2/35‑1 (MQ=255) tgatcgccaccgtgaagggcgacgtccacgacatcggtaaaaatatcgttggtgtggagctgTAACAACTACGAAATTGTCGATCTCGGCGTTATGATGcc > 1:234962‑M2/63‑101 (MQ=255) gatcgccaccgtgaagggcgacgtccacgacatcggtaaaaatatcgttggtgtggtgctgTAACAACTACGAAATTGTCGATCTCGGCGTTATGGTGCCt > 1:169597‑M2/62‑101 (MQ=255) gatcgccaccgtgaagggcgacgtccacgacatcggtaaaaatatcgttggtgtggtgctgTAACAACTACGAAATTGTCGATCTCGGCGTTATGGTGCCt > 2:312742‑M2/62‑101 (MQ=255) cgccaccgtgaagggcgacgtccacgacatcggtaaaaatatcgttggtgtggtgctgTAACAACTACGAAATTGTCGATCTCGGCGTTATGGTGCCTGCg < 2:1473865‑M2/43‑1 (MQ=255) gccaccgtgaagggcgacgtccacgacatcggtaaaaatatcgttggtgtggtgctgTAACAACTACGAAATTGTCGATCTCGGCGTTATGGTGCCTGCgg > 1:892601‑M2/58‑101 (MQ=255) accgtgaagggcgacgtccacgacatcggtaaaaatatcgttggtgtggtgctgTAACAACTACGAAATTGTCGATCTCGGCGTTATGGTGCCTGCGGaaa > 2:1672768‑M2/55‑101 (MQ=255) ccgtgaagggcgacgtccacgacatcggtaaaaatatcgttggtgtggtgctgTAACAACTACGAAATTGTCGATCTCGGCGTTATGGTGCCTGCGGaaaa > 2:483889‑M2/54‑101 (MQ=255) cgtgaagggcgacgtccacgacatcggtaaaaatatcgttggtgtggtgctgTAACAACTACGAAATTGTCGATCTCGGCGTTATGGTGCCTGCGGaaaaa > 2:286826‑M2/53‑101 (MQ=255) aGGGCGACGTCCACGACATCGGTAAAAATATCGTTGGTGTGGTGCTGCAATGTAACAACTACGAAATTGTCGATCTCGGCGTTATGGTGCCTGCGGaaaaa > 2:734472/1‑101 (MQ=255) gtgaagggcgacgtccacgacatcggtaaaaatatcgttggtgtggtgctgTAACAACTACGAAATTGTCGATCTCGGCGTTATGGTGCCTGCGGaaaaaa < 1:1566759‑M2/50‑1 (MQ=255) tgaagggcgacgtccacgacatcggtaaaaatatcgttggtgtggtgctgTACCAACTACGAAATTGTCGCTGTCGGCGTTATGGGGCCTGCGTACAAAAt > 2:1114118‑M2/51‑101 (MQ=255) tgaagggcgacgtccacgacatcggtaaaaatatcgttggtgtggtgctgTAACAACTACGAAATTGTCGATCTCGGCGTTATGGTGCCTGCGGAAAAAAt < 1:345269‑M2/51‑1 (MQ=255) tgaagggcgacgtccacgacatcggtaaaaatatcgttggtgtggtgctgTAACAACTACGAAATTGTCGATCTCGGCGTTATGGTGCCTGCGGAAAAAAt > 1:87687‑M2/51‑101 (MQ=255) gaagggcgacgtccacgacatcggtaaaaatatcgttggtgtggtgctgTAACAACTACGAAATTGTCGATCTCGGCGTTATGGTGCCTGCGGAAAAAAtt < 2:892596‑M2/52‑1 (MQ=255) gaagggcgacgtccacgacatcggtaaaaatatcgttggtgtggtgctgTAACAACTACGAAATTGTCGATCTCGGCGTTATGGTGCCTGCGGAAAAAAtt < 2:33127‑M2/52‑1 (MQ=255) aagggcgacgtccacgacatcggtaaaaatatcgttggtgtggtgctgTAACAACTACGAAATTGTCGATCTCGGCGTTATGGTGCCTGCGGAAAAAATtc > 1:595369‑M2/49‑101 (MQ=255) aagggcgacgtccacgacatcggtaaaaatatcgttggtgtggtgctgTAACAACTACGAAATTGTCGATCTCGGCGTTATGGTGCCTGCGGAAAAAATtc > 2:1527942‑M2/49‑101 (MQ=255) agggcgacgtccacgacatcggtaaaaatatcgttggtgtggtgctgTAACAACTACGAAATTGTCGATCTCGGCGTTATGGTGCCTGCGGAAAAAATtct < 2:1371490‑M2/54‑1 (MQ=255) ggcgacgtccacgacatcggtaaaaatatcgttggtgtgatgctgTAACAACTACGAAATTGTCGATCTCGGCGTTATGGTGCCTGCGGAAAAAATTCTcc < 1:824990‑M2/56‑1 (MQ=255) agTCCACGACATCGGTAAAAATATCGTTGGTGTGGTGCTGCAATGTAACAACTACGAAATTGTCGATCTCGGCGTTATGGTGCCTGCGGAAAAAATTCTcc < 2:938144/100‑1 (MQ=255) gcgacgtccacgacatcggtaaaaatatcgttggtgtggtgctgTAACAACTACGAAATTGTCGATCTCGGCGTTATGGTGCCTGCGGAAAAAATTCTCCg < 2:801665‑M2/57‑1 (MQ=255) gcgacgtccacgacatcggtaaaaatatcgttggtgtggtgctgTAACAACTACGAAATTGTCGATCTCGGCGTTATGGTGCCTGCGGAAAAAATTCTCCg < 1:1492652‑M2/57‑1 (MQ=255) gTCCACGACATCGGTAAAAATATCGTTGGTGTGGTGCTGCAATGTAACAACTACGAAATTGTCGATCTCGGCGTTATGGTGCCTGCGGAAAAAATTCTCCg > 2:1600544/1‑101 (MQ=255) cgacgtccacgacatcggtaaaaatatcgttggtgtggtgctgTAACAACTACGAAATTGTCGATCTCGGCGTTATGGTGCCTGCGGAAAAAATTCTCCGt > 2:252395‑M2/44‑101 (MQ=255) cacgacatcggtaaaaatatcgttggtgtggtgctgTAACAACTACGAAATTGTCGATCTCGGCGTTATGGTGCCTGCGGAAAAAATTCTCCGTACCGCTa > 1:214239‑M2/37‑101 (MQ=255) acgacatcggtaaaaatatcgttggtgtggtgctgTAACAACTACGAAATTGTCGATCTCGGCGTTATGGTGCCTGCGGAAAAAATTCTCCGTACCGCTaa > 1:766752‑M2/36‑101 (MQ=255) acatcggtaaaaatatcgttggtgtggtgctgTAACAACTACGAAATTGTCGATCTCGGCGTTATGGTGCCTGCGGAAAAAATTCTCCGTACCGCTAaaga < 1:668395‑M2/69‑1 (MQ=255) acatcggtaaaaatatcgttggtgtggtgctgTAACAACTACGAAATTGTCGATCTCGGCGTTATGGTGCCTGCGGAAAAAATTCTCCGTACCGCTAaaga > 1:15844‑M2/33‑101 (MQ=255) atcggtaaaaatatcgttggtgtggtgctgTAACAACTACGAAATTGTCGATCTCGGCGTTATGGTGCCTGCGGAAAAAATTCTCCGTACCGCTAaagaag < 1:1249955‑M2/71‑1 (MQ=255) tcggtaaaaatatcgttggtgtggtgctgTAACAACTACGAAATTGTCGATCTCGGCGTTATGGTGCCTGCGGAAAAAATTCTCCGTACCGCTAAAGAAGt < 1:707939‑M2/72‑1 (MQ=255) tcggtaaaaatatcgttggtgtggtgctgTAACAACTACGAAATTGTCGATCTCGGCGTTATGGTGCCTGCGGAAAAAATTCTCCGTACCGCTAAAGAAGt < 2:803757‑M2/72‑1 (MQ=255) ggtaaaaatatcgttggtgtggtgctgTAACAACTACGAAATTGTCGATCTCGGCGTTATGGTGCCTGCGGAAAAAATTCTCCGTACCGCTAAAGAAGTGa > 1:1578001‑M2/28‑101 (MQ=255) ggtaaaaatatcgttggtgtggtgctgTAACAACTACGAAATTGTCGATCTCGGCGTTATGGTGCCTGCGGAAAAAATTCTCCGTACCGCTAAAGAAGTGa < 2:1117110‑M2/74‑1 (MQ=255) gtaaaaatatcgttggtgtggtgctgTAACAACTACGAAATTGTCGATCTCGGCGTTATGGTGCCTGCGGAAAAAATTCTCCGTACCGCTAAAGAAGTGaa > 1:1185361‑M2/27‑101 (MQ=255) taaaaatatcgttggtgtggtgctgTAACAACTACGAAATTGTCGATCTCGGCGTTATGGTGCCTGCGGAAAAAATTCTCCGTACCGCTAAAGAAGTGAAt < 1:65926‑M2/76‑1 (MQ=255) taaaaatatcgttggtgtggtgctgTAACAACTACGAAATTGTCGATCTCGGCGTTATGGTGCCTGCGGAAAAAATTCTCCGTACCGCTAAAGAAGTGAAt < 2:1683484‑M2/76‑1 (MQ=255) taaaaatatcgttggtgtggtgctgTAACAACTACGAAATTGTCGATCTCGGCGTTATGGTGCCTGCGGAAAAAATTCTCCGTACCGCTAAAGAAGTGAAt < 2:169597‑M2/76‑1 (MQ=255) taaaaatatcgttggtgtggtgctgTAACAACTACGAAATTGTCGATCTCGGCGTTATGGTGCCTGCGGAAAAAATTCTCCGTACCGCTAAAGAAGTGAAt < 1:1682595‑M2/76‑1 (MQ=255) taaaaatatcgttggtgtggtgctgTAACAACTACGAAATTGTCGATCTCGGCGTTATGGTGCCTGCGGAAAAAATTCTCCGTACCGCTAAAGAAGTGAAt < 1:998725‑M2/76‑1 (MQ=255) aaaaatatcgttggtgtggtgctgTAACAACTACGAAATTGTCGATCTCGGCGTTATGGTGCCTGCGGAAAAAATTCTCCGTACCGCTAAAGAAGTGAATg > 2:238984‑M2/25‑101 (MQ=255) aaaatatcgttggtgtggtgctgTAACAACTACGAAATTGTCGATCTCGGCGTTATGGTGCCTGCGGAAAAAATTCTCCGTACCGCTAAAGAAGTGAATGc < 2:231535‑M2/78‑1 (MQ=255) aatatcgttggtgtggtgctgTAACAACTACGAAATTGTCGATCTCGGCGTTATGGTGCCTGCGGAAAAAATTCTCCGTACCGCTAAAGAAGTGAATGctg > 2:1001429‑M2/22‑101 (MQ=255) atatcgttggtgtggtgctgTAACAACTACGAAATTGTCGATCTCGGCGTTATGGTGCCTGCGGAAAAAATTCTCCGTACCGCTAAAGAAGTGAATGctga > 1:834862‑M2/21‑101 (MQ=255) cgttggtgtggtgctgTAACAACTACGAAATTGTCGATCTCGGCGTTATGGTGCCTGCGGAAAAAATTCTCCGTACCGCTAAAGAAGTGAATGctgatctg > 2:811397‑M2/17‑101 (MQ=255) gttggtgtggtgctgTAACAACTACGAAATTGTCGATCTCGGCGTTATGGTGCCTGCGGAAAAAATTCTCCGTACCGCTAAAGAAGTGAATGctgatctga < 2:1263667‑M2/86‑1 (MQ=255) gttggtgtggtgctgTAACAACTACGAAATTGTCGATCTCGGCGTTATGGTGCCTGCGGAAAAAATTCTCCGTACCGCTAAAGAAGTGAATGctgatctga > 2:1235335‑M2/16‑101 (MQ=255) gttggtgtggtgctgTAACAACTACGAAATTGTCGATCTCGGCGTTATGGTGCCTGCGGAAAAAATTCTCCGTACCGCTAAAGAAGTGAATGctgatctga > 1:1320546‑M2/16‑101 (MQ=255) ttggtgtggtgctgTACCAACTACGAAATTGTCGATCTCGGCGTTATGGTGCCTGCGGAAAAAATTCTCCGTACCGCTAAAGAAGTGAATGctgatctgat < 1:1473764‑M2/87‑1 (MQ=255) ggtgtggtgctgTAACAACTACGAAATTGTCGATCTCGGCGTTATGGTGCCTGCGGAAAAAATTCTCCGTACCGCTAAAGAAGTGAATGCTGATCTGATTg > 1:1569303‑M2/13‑101 (MQ=255) tggtgctgTAACAACTACGAAATTGTCGATCTCGGCGTTATGGTGCCTGCGGAAAAAATTCTCCGTACCGCTAAAGAAGTGAATGCTGATCTGATTGGCCt > 1:1080383‑M2/9‑101 (MQ=255) ggtgctgTAACAACTACGAAATTGTCGATCTCGGCGTTATGGTGCCTGCGGAAAAAATTCTCCGTACCGCTAAAGAAGTGAATGCTGATCTGATTGGCCtt > 2:1278189‑M2/8‑101 (MQ=255) tgTAACAACTACGAAATTGTCGATCTCGGCGTTATGGTGCCTGCGGAAAAAATTCTCCGTACCGCTAAAGAAGTGAATGCTGATCTGATTGGCCTTTCggg > 1:1175297‑M2/3‑101 (MQ=255) tgTAACAACTACGAAATTGTCGATCTCGGCGTTATGGTGCCTGCGGAAAAAATTCTCCGTACCGCTAAAGAAGTGAATGCTGATCTGATTGGCCTTTCggg < 1:111773‑M2/99‑1 (MQ=255) gTAACAACTACGAAATTGTCGATCTCGGCGTTATGGTGCCTGCGGAAAAAATTCTCCGTACCGCTAAAGAAGTGAATGCTGATCTGATTGGCCTTTCgggg > 1:119244‑M2/2‑101 (MQ=255) gTAACAACTACGAAATTGTCGATCTCGGCGTTATGGTGCCTGCGGAAAAAATTCTCCGTACCGCTAAAGAAGTGAATGCTGATCTGATTGGCCTTTCgggg > 1:751539‑M2/2‑101 (MQ=255) gTAACAACTACGAAATTGTCGATCTCGGCGTTATGGTGCCTGCGGAAAAAATTCTCCGTACCGCTAAAGAAGTGAATGCTGATCTGATTGGCCTTTCgggg > 2:711987‑M2/2‑101 (MQ=255) | AAGAGCAGGGCAAAACCAACGGCAAGATGGTGATCGCCACCGTGAAGGGCGACGTCCACGACATCGGTAAAAATATCGTTGGTGTGGTGCTGCAATGTAACAACTACGAAATTGTCGATCTCGGCGTTATGGTGCCTGCGGAAAAAATTCTCCGTACCGCTAAAGAAGTGAATGCTGATCTGATTGGCCTTTCGGGG > 58/6927‑7123 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |