| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC | 58 | 7,019 | Δ5 bp | intergenic (–/–) | – / – | –/– |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | 58 | = 7018 | 4 (0.060) | 69 (0.990) | 53/196 | 0.3 | 94.6% | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| ? | 58 | 7024 = | 4 (0.060) | intergenic (–/–) | –/– | –/– | |||||
CAGCAAAGAGCAGGGCAAAACCAACGGCAAGATGGTGATCGCCACCGTGAAGGGCGACGTCCACGACATCGGTAAAAATATCGTTGGTGTGGTGCTGCAATGTAACAACTACGAAATTGTCGATCTCGGCGTTATGGTGCCTGCGGAAAAAATTCTCCGTACCGCTAAAGAAGTGAATGCTGATCTGATTGGCCTTT > 58/6922‑7118 | cAGCAAAGAGCAGGGCAAAACCAACGGCAAGATGGTGATCGCCACCGTGAAGGGCGACGTCCACGACATCGGTAAAAATATCGTTGGTGTGGTGCTGtaac > 2:220780‑M1/1‑97 (MQ=255)cAGCAAAGAGCAGGGCAAAACCAACGGCAAGATGGTGATCGCCACCGTGAAGGGCGACGTCCACGACATCGGTAAAAATATCGTTGGTGTGGTGCTGtaac < 1:58995‑M1/101‑5 (MQ=255) gCAAAGAGCAGGGCAAAACCAACGGCAAGATGGTGATCGCCACCGTGAAGGGCGACGTCCACGACATCGGTAAAAATATCGTTGGTGTGGTGCTGtaacaa < 2:72931‑M1/101‑7 (MQ=255) cAAAGAGCAGGGCAAAACCAACGGCAAGATGGTGATCGCCACCGTGAAGGGCGACGTCCACGACATCGGTAAAAATATCGTTGGTGTGGTGCTGtaacaac < 1:642696‑M1/101‑8 (MQ=255) cAAAGAGCAGGGCAAAACCAACGGCAAGATGGTGATCGCCACCGTGAAGGGCGACGTCCACGACATCGGTAAAAATATCGTTGGTGTGGTGCTGtaacaac < 1:981889‑M1/101‑8 (MQ=255) aaaGAGCAGGGCAAAACCAACGGCAAGATGGTGATCGCCACCGTGAAGGGCGACGTCCACGACATCGGTAAAAATATCGTTGGTGTGGTGCTGtaacaact > 1:231535‑M1/1‑93 (MQ=255) aaaGAGCAGGGCAAAACCAACGGCAAAATGGTGCTCGCCACCGTGAAGGGCGACGTCAACGACATCGGTAAAAATATCGTTGGTGTGGTGCTGtaacaact > 2:1473758‑M1/1‑93 (MQ=255) agagCAGGGCAAAACNAAAGGCATNATGGTGATCGCCACCGTGAAGGGCGACGTCCACGACATCGGTAAAAATATCGTTGGTGTGGTGCCGtaacaactac < 2:1140997‑M1/101‑11 (MQ=255) aaaaCCAACGGCAAGATGGTGATCGCCACCGTGAAGGGCGACGTCCACGACATCGGTAAAAATATCGTTGGTGTGGTGCTGtaacaactacgaaattgtcg > 2:1455457‑M1/1‑81 (MQ=255) aaaaCCAACGGCAAGATGGTGATCGCCACCGTGAAGGGCGACGTCCACGACATCGGTAAAAATATCGTTGGTGTGGTGCTGtaacaactacgaaattgtcg > 1:909187‑M1/1‑81 (MQ=255) aaCCAACGGCAAGATGGTGATCGCCACCGTGAAGGGCGACGTCCACGACATCGGTAAAAATATCGTTGGTGTGGTGCTGtaacaactacgaaattgtcgat > 1:591771‑M1/1‑79 (MQ=255) aaCCAACGGCAAGATGGTGATCGCCACCGTGAAGGGCGACGTCCACGACATCGGTAAAAATATCGTTGGTGTGGTGCTGtaacaactacgaaattgtcgat < 1:1117120‑M1/101‑23 (MQ=255) aCCAACGGCAAGATGGTGATCGCCACCGTGAAGGGCGACGTCCACGACATCGGTAAAAATATCGTTGGTGTGGTGCTGtaacaactacgaaattgtcgatc > 2:1648945‑M1/1‑78 (MQ=255) aCCAACGGCAAGATGGTGATCGCCACCGTGAAGGGCGACGTCCACGACATCGGTAAAAATATCGTTCGTGTGGTGCTGtaacaactacgaaattgtcgatc > 2:111773‑M1/1‑78 (MQ=255) cGGCAAGATGGTGATCGCCACCGTGAAGGGCGACGTCCACGACATCGGTAAAAATATCGTTGGTGTGGTGCTGtaacaactacgaaattgtcgatctcggc < 2:1087934‑M1/101‑29 (MQ=255) gCAAGATGGTGATCGCCACCGTGAAGGGCGACGTCCACGACATCGGTAAAAATATCGTTGGTGTGGTGCTGtaacaactacgaaattgtcgatctcggcgt > 1:641051‑M1/1‑71 (MQ=255) gCAAGATGGTGATCGCCACCGTGAAGGGCGACGTCCACGACATCGGTAAAAATATCGTTGGTGTGGTGCTGtaacaactacgaaattgtcgatctcggcgt < 1:724514‑M1/101‑31 (MQ=255) aGATGGTGATCGCCACCGTGAAGGGCGACGTCCACGACATCGGTAAAAATATCGTTGGTGTGGTGCTGtaacaactacgaaattgtcgatctcggcgttat < 2:61268‑M1/101‑34 (MQ=255) gATGGTGATCGCCACCGTGAAGGGCGACGTCCACGACATCGGTAAAAATATCGTTGGTGTGGTGCTGtaacaactacgaaattgtcgatctcggcgttatg < 2:542674‑M1/101‑35 (MQ=255) aTGGTGATCGCCACCGTGAAGGGCGACGTCCACGACATCGGTAAAAATATCGTTGGTGTGGTGCTGtaacaactacgaaattgtcgatctcggcgttatgg < 1:220780‑M1/101‑36 (MQ=255) aTGGTGATCGCCACCGTGAAGGGCGACGTCCACGACATCGGTAAAAATATCGTTGGTGTGGTGCTGtaacaactacgaaattgtcgatctcggcgttatgg < 2:571949‑M1/101‑36 (MQ=255) tGGTGATCGCCACCGGGAAGGGCGACCTCCACGAGATCGGTAAAAATATCGTTGGGGTGGTGC‑‑‑‑‑TGTAACAACTAAGAAATTGTCGATCTCGGCGTTATGGt > 2:1477807/1‑101 (MQ=255) tGATCGCCACCGTGAAGGGCGACGTCCACGACATCGGTAAAAATATCGTTGGTGTGGAGCTGtaacaactacgaaattgtcgatctcggcgttatgatgcc > 1:234962‑M1/1‑62 (MQ=255) gATCGCCACCGTGAAGGGCGACGTCCACGACATCGGTAAAAATATCGTTGGTGTGGTGCTGtaacaactacgaaattgtcgatctcggcgttatggtgcct > 1:169597‑M1/1‑61 (MQ=255) gATCGCCACCGTGAAGGGCGACGTCCACGACATCGGTAAAAATATCGTTGGTGTGGTGCTGtaacaactacgaaattgtcgatctcggcgttatggtgcct > 2:312742‑M1/1‑61 (MQ=255) cGCCACCGTGAAGGGCGACGTCCACGACATCGGTAAAAATATCGTTGGTGTGGTGCTGtaacaactacgaaattgtcgatctcggcgttatggtgcctgcg < 2:1473865‑M1/101‑44 (MQ=255) gCCACCGTGAAGGGCGACGTCCACGACATCGGTAAAAATATCGTTGGTGTGGTGCTGtaacaactacgaaattgtcgatctcggcgttatggtgcctgcgg > 1:892601‑M1/1‑57 (MQ=255) aCCGTGAAGGGCGACGTCCACGACATCGGTAAAAATATCGTTGGTGTGGTGCTGtaacaactacgaaattgtcgatctcggcgttatggtgcctgcggaaa > 2:1672768‑M1/1‑54 (MQ=255) ccGTGAAGGGCGACGTCCACGACATCGGTAAAAATATCGTTGGTGTGGTGCTGtaacaactacgaaattgtcgatctcggcgttatggtgcctgcggaaaa > 2:483889‑M1/1‑53 (MQ=255) cGTGAAGGGCGACGTCCACGACATCGGTAAAAATATCGTTGGTGTGGTGCTGtaacaactacgaaattgtcgatctcggcgttatggtgcctgcggaaaaa > 2:286826‑M1/1‑52 (MQ=255) gTGAAGGGCGACGTCCACGACATCGGTAAAAATATCGTTGGTGTGGTGCTGtaacaactacgaaattgtcgatctcggcgttatggtgcctgcggaaaaaa < 1:1566759‑M1/101‑51 (MQ=255) tGAAGGGCGACGTCCACGACATCGGTAAAAATATCGTTGGTGTGGTGCTGtaccaactacgaaattgtcgctgtcggcgttatggggcctgcgtacaaaat > 2:1114118‑M1/1‑50 (MQ=255) tGAAGGGCGACGTCCACGACATCGGTAAAAATATCGTTGGTGTGGTGCTGtaacaactacgaaattgtcgatctcggcgttatggtgcctgcggaaaaaat < 1:345269‑M1/101‑52 (MQ=255) tGAAGGGCGACGTCCACGACATCGGTAAAAATATCGTTGGTGTGGTGCTGtaacaactacgaaattgtcgatctcggcgttatggtgcctgcggaaaaaat > 1:87687‑M1/1‑50 (MQ=255) gAAGGGCGACGTCCACGACATCGGTAAAAATATCGTTGGTGTGGTGCTGtaacaactacgaaattgtcgatctcggcgttatggtgcctgcggaaaaaatt < 2:33127‑M1/101‑53 (MQ=255) gAAGGGCGACGTCCACGACATCGGTAAAAATATCGTTGGTGTGGTGCTGtaacaactacgaaattgtcgatctcggcgttatggtgcctgcggaaaaaatt < 2:892596‑M1/101‑53 (MQ=255) aaGGGCGACGTCCACGACATCGGTAAAAATATCGTTGGTGTGGTGCTGtaacaactacgaaattgtcgatctcggcgttatggtgcctgcggaaaaaattc > 1:595369‑M1/1‑48 (MQ=255) aaGGGCGACGTCCACGACATCGGTAAAAATATCGTTGGTGTGGTGCTGtaacaactacgaaattgtcgatctcggcgttatggtgcctgcggaaaaaattc > 2:1527942‑M1/1‑48 (MQ=255) aGGGCGACGTCCACGACATCGGTAAAAATATCGTTGGTGTGGTGCTGtaacaactacgaaattgtcgatctcggcgttatggtgcctgcggaaaaaattct < 2:1371490‑M1/101‑55 (MQ=255) aGGGCGACGTCCACGACATCGGTAAAAATATCGTTGGTGTGGTGCTGCAATGTAACAACTACGAAATTGTCGATCTCGGCGTTATGGTGCCTGCGGaaaaa > 2:734472/1‑101 (MQ=255) ggCGACGTCCACGACATCGGTAAAAATATCGTTGGTGTGATGCTGtaacaactacgaaattgtcgatctcggcgttatggtgcctgcggaaaaaattctcc < 1:824990‑M1/101‑57 (MQ=255) gCGACGTCCACGACATCGGTAAAAATATCGTTGGTGTGGTGCTGtaacaactacgaaattgtcgatctcggcgttatggtgcctgcggaaaaaattctccg < 2:801665‑M1/101‑58 (MQ=255) gCGACGTCCACGACATCGGTAAAAATATCGTTGGTGTGGTGCTGtaacaactacgaaattgtcgatctcggcgttatggtgcctgcggaaaaaattctccg < 1:1492652‑M1/101‑58 (MQ=255) cGACGTCCACGACATCGGTAAAAATATCGTTGGTGTGGTGCTGtaacaactacgaaattgtcgatctcggcgttatggtgcctgcggaaaaaattctccgt > 2:252395‑M1/1‑43 (MQ=255) agTCCACGACATCGGTAAAAATATCGTTGGTGTGGTGCTGCAATGTAACAACTACGAAATTGTCGATCTCGGCGTTATGGTGCCTGCGGAAAAAATTCTcc < 2:938144/100‑1 (MQ=255) gTCCACGACATCGGTAAAAATATCGTTGGTGTGGTGCTGCAATGTAACAACTACGAAATTGTCGATCTCGGCGTTATGGTGCCTGCGGAAAAAATTCTCCg > 2:1600544/1‑101 (MQ=255) cACGACATCGGTAAAAATATCGTTGGTGTGGTGCTGtaacaactacgaaattgtcgatctcggcgttatggtgcctgcggaaaaaattctccgtaccgcta > 1:214239‑M1/1‑36 (MQ=255) aCGACATCGGTAAAAATATCGTTGGTGTGGTGCTGtaacaactacgaaattgtcgatctcggcgttatggtgcctgcggaaaaaattctccgtaccgctaa > 1:766752‑M1/1‑35 (MQ=255) aCATCGGTAAAAATATCGTTGGTGTGGTGCTGtaacaactacgaaattgtcgatctcggcgttatggtgcctgcggaaaaaattctccgtaccgctaaaga < 1:668395‑M1/101‑70 (MQ=255) aCATCGGTAAAAATATCGTTGGTGTGGTGCTGtaacaactacgaaattgtcgatctcggcgttatggtgcctgcggaaaaaattctccgtaccgctaaaga > 1:15844‑M1/1‑32 (MQ=255) aTCGGTAAAAATATCGTTGGTGTGGTGCTGtaacaactacgaaattgtcgatctcggcgttatggtgcctgcggaaaaaattctccgtaccgctaaagaag < 1:1249955‑M1/101‑72 (MQ=255) tCGGTAAAAATATCGTTGGTGTGGTGCTGtaacaactacgaaattgtcgatctcggcgttatggtgcctgcggaaaaaattctccgtaccgctaaagaagt < 2:803757‑M1/101‑73 (MQ=255) tCGGTAAAAATATCGTTGGTGTGGTGCTGtaacaactacgaaattgtcgatctcggcgttatggtgcctgcggaaaaaattctccgtaccgctaaagaagt < 1:707939‑M1/101‑73 (MQ=255) ggTAAAAATATCGTTGGTGTGGTGCTGtaacaactacgaaattgtcgatctcggcgttatggtgcctgcggaaaaaattctccgtaccgctaaagaagtga > 1:1578001‑M1/1‑27 (MQ=255) ggTAAAAATATCGTTGGTGTGGTGCTGtaacaactacgaaattgtcgatctcggcgttatggtgcctgcggaaaaaattctccgtaccgctaaagaagtga < 2:1117110‑M1/101‑75 (MQ=255) gTAAAAATATCGTTGGTGTGGTGCTGtaacaactacgaaattgtcgatctcggcgttatggtgcctgcggaaaaaattctccgtaccgctaaagaagtgaa > 1:1185361‑M1/1‑26 (MQ=255) tAAAAATATCGTTGGTGTGGTGCTGtaacaactacgaaattgtcgatctcggcgttatggtgcctgcggaaaaaattctccgtaccgctaaagaagtgaat < 1:65926‑M1/101‑77 (MQ=255) tAAAAATATCGTTGGTGTGGTGCTGtaacaactacgaaattgtcgatctcggcgttatggtgcctgcggaaaaaattctccgtaccgctaaagaagtgaat < 2:1683484‑M1/101‑77 (MQ=255) tAAAAATATCGTTGGTGTGGTGCTGtaacaactacgaaattgtcgatctcggcgttatggtgcctgcggaaaaaattctccgtaccgctaaagaagtgaat < 2:169597‑M1/101‑77 (MQ=255) tAAAAATATCGTTGGTGTGGTGCTGtaacaactacgaaattgtcgatctcggcgttatggtgcctgcggaaaaaattctccgtaccgctaaagaagtgaat < 1:1682595‑M1/101‑77 (MQ=255) tAAAAATATCGTTGGTGTGGTGCTGtaacaactacgaaattgtcgatctcggcgttatggtgcctgcggaaaaaattctccgtaccgctaaagaagtgaat < 1:998725‑M1/101‑77 (MQ=255) aaaaaTATCGTTGGTGTGGTGCTGtaacaactacgaaattgtcgatctcggcgttatggtgcctgcggaaaaaattctccgtaccgctaaagaagtgaatg > 2:238984‑M1/1‑24 (MQ=255) aaaaTATCGTTGGTGTGGTGCTGtaacaactacgaaattgtcgatctcggcgttatggtgcctgcggaaaaaattctccgtaccgctaaagaagtgaatgc < 2:231535‑M1/101‑79 (MQ=255) aaTATCGTTGGTGTGGTGCTGtaacaactacgaaattgtcgatctcggcgttatggtgcctgcggaaaaaattctccgtaccgctaaagaagtgaatgctg > 2:1001429‑M1/1‑21 (MQ=255) atatCGTTGGTGTGGTGCTGtaacaactacgaaattgtcgatctcggcgttatggtgcctgcggaaaaaattctccgtaccgctaaagaagtgaatgctga > 1:834862‑M1/1‑20 (MQ=255) cGTTGGTGTGGTGCTGtaacaactacgaaattgtcgatctcggcgttatggtgcctgcggaaaaaattctccgtaccgctaaagaagtgaatgctgatctg > 2:811397‑M1/1‑16 (MQ=255) gTTGGTGTGGTGCTGtaacaactacgaaattgtcgatctcggcgttatggtgcctgcggaaaaaattctccgtaccgctaaagaagtgaatgctgatctga < 2:1263667‑M1/101‑87 (MQ=255) gTTGGTGTGGTGCTGtaacaactacgaaattgtcgatctcggcgttatggtgcctgcggaaaaaattctccgtaccgctaaagaagtgaatgctgatctga > 2:1235335‑M1/1‑15 (MQ=255) gTTGGTGTGGTGCTGtaacaactacgaaattgtcgatctcggcgttatggtgcctgcggaaaaaattctccgtaccgctaaagaagtgaatgctgatctga > 1:1320546‑M1/1‑15 (MQ=255) ttGGTGTGGTGCTGtaccaactacgaaattgtcgatctcggcgttatggtgcctgcggaaaaaattctccgtaccgctaaagaagtgaatgctgatctgat < 1:1473764‑M1/101‑88 (MQ=255) ggtgtggtgCTGtaacaactacgaaattgtcgatctcggcgttatggtgcctgcggaaaaaattctccgtaccgctaaagaagtgaatgctgatctgattg > 1:1569303‑M1/1‑12 (MQ=255) tggtgCTGtaacaactacgaaattgtcgatctcggcgttatggtgcctgcggaaaaaattctccgtaccgctaaagaagtgaatgctgatctgattggcct > 1:1080383‑M1/1‑8 (MQ=255) ggtgCTGtaacaactacgaaattgtcgatctcggcgttatggtgcctgcggaaaaaattctccgtaccgctaaagaagtgaatgctgatctgattggcctt > 2:1278189‑M1/1‑7 (MQ=255) tGtaacaactacgaaattgtcgatctcggcgttatggtgcctgcggaaaaaattctccgtaccgctaaagaagtgaatgctgatctgattggcctttcggg > 1:1175297‑M1/1‑2 (MQ=255) tGtaacaactacgaaattgtcgatctcggcgttatggtgcctgcggaaaaaattctccgtaccgctaaagaagtgaatgctgatctgattggcctttcggg < 1:111773‑M1/101‑100 (MQ=255) gtaacaactacgaaattgtcgatctcggcgttatggtgcctgcggaaaaaattctccgtaccgctaaagaagtgaatgctgatctgattggcctttcgggg > 1:119244‑M1/1‑1 (MQ=255) gtaacaactacgaaattgtcgatctcggcgttatggtgcctgcggaaaaaattctccgtaccgctaaagaagtgaatgctgatctgattggcctttcgggg > 1:751539‑M1/1‑1 (MQ=255) gtaacaactacgaaattgtcgatctcggcgttatggtgcctgcggaaaaaattctccgtaccgctaaagaagtgaatgctgatctgattggcctttcgggg > 2:711987‑M1/1‑1 (MQ=255) | CAGCAAAGAGCAGGGCAAAACCAACGGCAAGATGGTGATCGCCACCGTGAAGGGCGACGTCCACGACATCGGTAAAAATATCGTTGGTGTGGTGCTGCAATGTAACAACTACGAAATTGTCGATCTCGGCGTTATGGTGCCTGCGGAAAAAATTCTCCGTACCGCTAAAGAAGTGAATGCTGATCTGATTGGCCTTT > 58/6922‑7118 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |