| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC | 58 | 7,019 | Δ5 bp | intergenic (–/–) | – / – | –/– |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | 58 | = 7018 | 4 (0.060) | 69 (0.990) | 53/196 | 0.3 | 94.6% | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| ? | 58 | 7024 = | 4 (0.060) | intergenic (–/–) | –/– | –/– | |||||
CAGCAAAGAGCAGGGCAAAACCAACGGCAAGATGGTGATCGCCACCGTGAAGGGCGACGTCCACGACATCGGTAAAAATATCGTTGGTGTGGTGCTG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > 58/6922‑7018‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑tgTAACAACTACGAAATTGTCGATCTCGGCGTTATGGTGCCTGCGGAAAAAATTCTCCGTACCGCTAAAGAAGTGAATGCTGATCTGATTGGCCTTTCGGGG > 58/7024‑7123 CAGCAAAGAGCAGGGCAAAACCAACGGCAAGATGGTGATCGCCACCGTGAAGGGCGACGTCCACGACATCGGTAAAAATATCGTTGGTGTGGTGCTGTAAC < 1:58995/101‑1CAGCAAAGAGCAGGGCAAAACCAACGGCAAGATGGTGATCGCCACCGTGAAGGGCGACGTCCACGACATCGGTAAAAATATCGTTGGTGTGGTGCTGTAAC > 2:220780/1‑101 GCAAAGAGCAGGGCAAAACCAACGGCAAGATGGTGATCGCCACCGTGAAGGGCGACGTCCACGACATCGGTAAAAATATCGTTGGTGTGGTGCTGTAACAA < 2:72931/101‑1 CAAAGAGCAGGGCAAAACCAACGGCAAGATGGTGATCGCCACCGTGAAGGGCGACGTCCACGACATCGGTAAAAATATCGTTGGTGTGGTGCTGTAACAAC < 1:642696/101‑1 CAAAGAGCAGGGCAAAACCAACGGCAAGATGGTGATCGCCACCGTGAAGGGCGACGTCCACGACATCGGTAAAAATATCGTTGGTGTGGTGCTGTAACAAC < 1:981889/101‑1 AAAGAGCAGGGCAAAACCAACGGCAAGATGGTGATCGCCACCGTGAAGGGCGACGTCCACGACATCGGTAAAAATATCGTTGGTGTGGTGCTGTAACAACT > 1:231535/1‑101 AAAGAGCAGGGCAAAACCAACGGCAAAATGGTGCTCGCCACCGTGAAGGGCGACGTCAACGACATCGGTAAAAATATCGTTGGTGTGGTGCTGTAACAACT > 2:1473758/1‑101 AGAGCAGGGCAAAACNAAAGGCATNATGGTGATCGCCACCGTGAAGGGCGACGTCCACGACATCGGTAAAAATATCGTTGGTGTGGTGCCGTAACAACTAC < 2:1140997/101‑1 AAAACCAACGGCAAGATGGTGATCGCCACCGTGAAGGGCGACGTCCACGACATCGGTAAAAATATCGTTGGTGTGGTGCTGTAACAACTACGAAATTGTCG > 2:1455457/1‑101 AAAACCAACGGCAAGATGGTGATCGCCACCGTGAAGGGCGACGTCCACGACATCGGTAAAAATATCGTTGGTGTGGTGCTGTAACAACTACGAAATTGTCG > 1:909187/1‑101 AACCAACGGCAAGATGGTGATCGCCACCGTGAAGGGCGACGTCCACGACATCGGTAAAAATATCGTTGGTGTGGTGCTGTAACAACTACGAAATTGTCGAT < 1:1117120/101‑1 AACCAACGGCAAGATGGTGATCGCCACCGTGAAGGGCGACGTCCACGACATCGGTAAAAATATCGTTGGTGTGGTGCTGTAACAACTACGAAATTGTCGAT > 1:591771/1‑101 ACCAACGGCAAGATGGTGATCGCCACCGTGAAGGGCGACGTCCACGACATCGGTAAAAATATCGTTGGTGTGGTGCTGTAACAACTACGAAATTGTCGATC > 2:1648945/1‑101 ACCAACGGCAAGATGGTGATCGCCACCGTGAAGGGCGACGTCCACGACATCGGTAAAAATATCGTTCGTGTGGTGCTGTAACAACTACGAAATTGTCGATC > 2:111773/1‑101 CGGCAAGATGGTGATCGCCACCGTGAAGGGCGACGTCCACGACATCGGTAAAAATATCGTTGGTGTGGTGCTGTAACAACTACGAAATTGTCGATCTCGGC < 2:1087934/101‑1 GCAAGATGGTGATCGCCACCGTGAAGGGCGACGTCCACGACATCGGTAAAAATATCGTTGGTGTGGTGCTGTAACAACTACGAAATTGTCGATCTCGGCGT < 1:724514/101‑1 GCAAGATGGTGATCGCCACCGTGAAGGGCGACGTCCACGACATCGGTAAAAATATCGTTGGTGTGGTGCTGTAACAACTACGAAATTGTCGATCTCGGCGT > 1:641051/1‑101 AGATGGTGATCGCCACCGTGAAGGGCGACGTCCACGACATCGGTAAAAATATCGTTGGTGTGGTGCTGTAACAACTACGAAATTGTCGATCTCGGCGTTAT < 2:61268/101‑1 GATGGTGATCGCCACCGTGAAGGGCGACGTCCACGACATCGGTAAAAATATCGTTGGTGTGGTGCTGTAACAACTACGAAATTGTCGATCTCGGCGTTATG < 2:542674/101‑1 ATGGTGATCGCCACCGTGAAGGGCGACGTCCACGACATCGGTAAAAATATCGTTGGTGTGGTGCTGTAACAACTACGAAATTGTCGATCTCGGCGTTATGG < 1:220780/101‑1 ATGGTGATCGCCACCGTGAAGGGCGACGTCCACGACATCGGTAAAAATATCGTTGGTGTGGTGCTGTAACAACTACGAAATTGTCGATCTCGGCGTTATGG < 2:571949/101‑1 TGATCGCCACCGTGAAGGGCGACGTCCACGACATCGGTAAAAATATCGTTGGTGTGGAGCTGTAACAACTACGAAATTGTCGATCTCGGCGTTATGATGCC > 1:234962/1‑101 GATCGCCACCGTGAAGGGCGACGTCCACGACATCGGTAAAAATATCGTTGGTGTGGTGCTGTAACAACTACGAAATTGTCGATCTCGGCGTTATGGTGCCT > 2:312742/1‑101 GATCGCCACCGTGAAGGGCGACGTCCACGACATCGGTAAAAATATCGTTGGTGTGGTGCTGTAACAACTACGAAATTGTCGATCTCGGCGTTATGGTGCCT > 1:169597/1‑101 CGCCACCGTGAAGGGCGACGTCCACGACATCGGTAAAAATATCGTTGGTGTGGTGCTGTAACAACTACGAAATTGTCGATCTCGGCGTTATGGTGCCTGCG < 2:1473865/101‑1 GCCACCGTGAAGGGCGACGTCCACGACATCGGTAAAAATATCGTTGGTGTGGTGCTGTAACAACTACGAAATTGTCGATCTCGGCGTTATGGTGCCTGCGG > 1:892601/1‑101 ACCGTGAAGGGCGACGTCCACGACATCGGTAAAAATATCGTTGGTGTGGTGCTGTAACAACTACGAAATTGTCGATCTCGGCGTTATGGTGCCTGCGGAAA > 2:1672768/1‑101 CCGTGAAGGGCGACGTCCACGACATCGGTAAAAATATCGTTGGTGTGGTGCTGTAACAACTACGAAATTGTCGATCTCGGCGTTATGGTGCCTGCGGAAAA > 2:483889/1‑101 CGTGAAGGGCGACGTCCACGACATCGGTAAAAATATCGTTGGTGTGGTGCTGTAACAACTACGAAATTGTCGATCTCGGCGTTATGGTGCCTGCGGAAAAA > 2:286826/1‑101 GTGAAGGGCGACGTCCACGACATCGGTAAAAATATCGTTGGTGTGGTGCTGTAACAACTACGAAATTGTCGATCTCGGCGTTATGGTGCCTGCGGAAAAAA < 1:1566759/101‑1 TGAAGGGCGACGTCCACGACATCGGTAAAAATATCGTTGGTGTGGTGCTGTACCAACTACGAAATTGTCGCTGTCGGCGTTATGGGGCCTGCGTACAAAAT > 2:1114118/1‑101 TGAAGGGCGACGTCCACGACATCGGTAAAAATATCGTTGGTGTGGTGCTGTAACAACTACGAAATTGTCGATCTCGGCGTTATGGTGCCTGCGGAAAAAAT < 1:345269/101‑1 TGAAGGGCGACGTCCACGACATCGGTAAAAATATCGTTGGTGTGGTGCTGTAACAACTACGAAATTGTCGATCTCGGCGTTATGGTGCCTGCGGAAAAAAT > 1:87687/1‑101 GAAGGGCGACGTCCACGACATCGGTAAAAATATCGTTGGTGTGGTGCTGTAACAACTACGAAATTGTCGATCTCGGCGTTATGGTGCCTGCGGAAAAAATT < 2:892596/101‑1 GAAGGGCGACGTCCACGACATCGGTAAAAATATCGTTGGTGTGGTGCTGTAACAACTACGAAATTGTCGATCTCGGCGTTATGGTGCCTGCGGAAAAAATT < 2:33127/101‑1 AAGGGCGACGTCCACGACATCGGTAAAAATATCGTTGGTGTGGTGCTGTAACAACTACGAAATTGTCGATCTCGGCGTTATGGTGCCTGCGGAAAAAATTC > 1:595369/1‑101 AAGGGCGACGTCCACGACATCGGTAAAAATATCGTTGGTGTGGTGCTGTAACAACTACGAAATTGTCGATCTCGGCGTTATGGTGCCTGCGGAAAAAATTC > 2:1527942/1‑101 AGGGCGACGTCCACGACATCGGTAAAAATATCGTTGGTGTGGTGCTGTAACAACTACGAAATTGTCGATCTCGGCGTTATGGTGCCTGCGGAAAAAATTCT < 2:1371490/101‑1 GGCGACGTCCACGACATCGGTAAAAATATCGTTGGTGTGATGCTGTAACAACTACGAAATTGTCGATCTCGGCGTTATGGTGCCTGCGGAAAAAATTCTCC < 1:824990/101‑1 GCGACGTCCACGACATCGGTAAAAATATCGTTGGTGTGGTGCTGTAACAACTACGAAATTGTCGATCTCGGCGTTATGGTGCCTGCGGAAAAAATTCTCCG < 1:1492652/101‑1 GCGACGTCCACGACATCGGTAAAAATATCGTTGGTGTGGTGCTGTAACAACTACGAAATTGTCGATCTCGGCGTTATGGTGCCTGCGGAAAAAATTCTCCG < 2:801665/101‑1 CGACGTCCACGACATCGGTAAAAATATCGTTGGTGTGGTGCTGTAACAACTACGAAATTGTCGATCTCGGCGTTATGGTGCCTGCGGAAAAAATTCTCCGT > 2:252395/1‑101 CACGACATCGGTAAAAATATCGTTGGTGTGGTGCTGTAACAACTACGAAATTGTCGATCTCGGCGTTATGGTGCCTGCGGAAAAAATTCTCCGTACCGCTA > 1:214239/1‑101 ACGACATCGGTAAAAATATCGTTGGTGTGGTGCTGTAACAACTACGAAATTGTCGATCTCGGCGTTATGGTGCCTGCGGAAAAAATTCTCCGTACCGCTAA > 1:766752/1‑101 ACATCGGTAAAAATATCGTTGGTGTGGTGCTGTAACAACTACGAAATTGTCGATCTCGGCGTTATGGTGCCTGCGGAAAAAATTCTCCGTACCGCTAAAGA > 1:15844/1‑101 ACATCGGTAAAAATATCGTTGGTGTGGTGCTGTAACAACTACGAAATTGTCGATCTCGGCGTTATGGTGCCTGCGGAAAAAATTCTCCGTACCGCTAAAGA < 1:668395/101‑1 ATCGGTAAAAATATCGTTGGTGTGGTGCTGTAACAACTACGAAATTGTCGATCTCGGCGTTATGGTGCCTGCGGAAAAAATTCTCCGTACCGCTAAAGAAG < 1:1249955/101‑1 TCGGTAAAAATATCGTTGGTGTGGTGCTGTAACAACTACGAAATTGTCGATCTCGGCGTTATGGTGCCTGCGGAAAAAATTCTCCGTACCGCTAAAGAAGT < 2:803757/101‑1 TCGGTAAAAATATCGTTGGTGTGGTGCTGTAACAACTACGAAATTGTCGATCTCGGCGTTATGGTGCCTGCGGAAAAAATTCTCCGTACCGCTAAAGAAGT < 1:707939/101‑1 GGTAAAAATATCGTTGGTGTGGTGCTGTAACAACTACGAAATTGTCGATCTCGGCGTTATGGTGCCTGCGGAAAAAATTCTCCGTACCGCTAAAGAAGTGA > 1:1578001/1‑101 GGTAAAAATATCGTTGGTGTGGTGCTGTAACAACTACGAAATTGTCGATCTCGGCGTTATGGTGCCTGCGGAAAAAATTCTCCGTACCGCTAAAGAAGTGA < 2:1117110/101‑1 GTAAAAATATCGTTGGTGTGGTGCTGTAACAACTACGAAATTGTCGATCTCGGCGTTATGGTGCCTGCGGAAAAAATTCTCCGTACCGCTAAAGAAGTGAA > 1:1185361/1‑101 TAAAAATATCGTTGGTGTGGTGCTGTAACAACTACGAAATTGTCGATCTCGGCGTTATGGTGCCTGCGGAAAAAATTCTCCGTACCGCTAAAGAAGTGAAT < 1:1682595/101‑1 TAAAAATATCGTTGGTGTGGTGCTGTAACAACTACGAAATTGTCGATCTCGGCGTTATGGTGCCTGCGGAAAAAATTCTCCGTACCGCTAAAGAAGTGAAT < 1:998725/101‑1 TAAAAATATCGTTGGTGTGGTGCTGTAACAACTACGAAATTGTCGATCTCGGCGTTATGGTGCCTGCGGAAAAAATTCTCCGTACCGCTAAAGAAGTGAAT < 1:65926/101‑1 TAAAAATATCGTTGGTGTGGTGCTGTAACAACTACGAAATTGTCGATCTCGGCGTTATGGTGCCTGCGGAAAAAATTCTCCGTACCGCTAAAGAAGTGAAT < 2:1683484/101‑1 TAAAAATATCGTTGGTGTGGTGCTGTAACAACTACGAAATTGTCGATCTCGGCGTTATGGTGCCTGCGGAAAAAATTCTCCGTACCGCTAAAGAAGTGAAT < 2:169597/101‑1 AAAAATATCGTTGGTGTGGTGCTGTAACAACTACGAAATTGTCGATCTCGGCGTTATGGTGCCTGCGGAAAAAATTCTCCGTACCGCTAAAGAAGTGAATG > 2:238984/1‑101 AAAATATCGTTGGTGTGGTGCTGTAACAACTACGAAATTGTCGATCTCGGCGTTATGGTGCCTGCGGAAAAAATTCTCCGTACCGCTAAAGAAGTGAATGC < 2:231535/101‑1 AATATCGTTGGTGTGGTGCTGTAACAACTACGAAATTGTCGATCTCGGCGTTATGGTGCCTGCGGAAAAAATTCTCCGTACCGCTAAAGAAGTGAATGCTG > 2:1001429/1‑101 ATATCGTTGGTGTGGTGCTGTAACAACTACGAAATTGTCGATCTCGGCGTTATGGTGCCTGCGGAAAAAATTCTCCGTACCGCTAAAGAAGTGAATGCTGA > 1:834862/1‑101 CGTTGGTGTGGTGCTGTAACAACTACGAAATTGTCGATCTCGGCGTTATGGTGCCTGCGGAAAAAATTCTCCGTACCGCTAAAGAAGTGAATGCTGATCTG > 2:811397/1‑101 GTTGGTGTGGTGCTGTAACAACTACGAAATTGTCGATCTCGGCGTTATGGTGCCTGCGGAAAAAATTCTCCGTACCGCTAAAGAAGTGAATGCTGATCTGA > 1:1320546/1‑101 GTTGGTGTGGTGCTGTAACAACTACGAAATTGTCGATCTCGGCGTTATGGTGCCTGCGGAAAAAATTCTCCGTACCGCTAAAGAAGTGAATGCTGATCTGA > 2:1235335/1‑101 GTTGGTGTGGTGCTGTAACAACTACGAAATTGTCGATCTCGGCGTTATGGTGCCTGCGGAAAAAATTCTCCGTACCGCTAAAGAAGTGAATGCTGATCTGA < 2:1263667/101‑1 TTGGTGTGGTGCTGTACCAACTACGAAATTGTCGATCTCGGCGTTATGGTGCCTGCGGAAAAAATTCTCCGTACCGCTAAAGAAGTGAATGCTGATCTGAT < 1:1473764/101‑1 GGTGTGGTGCTGTAACAACTACGAAATTGTCGATCTCGGCGTTATGGTGCCTGCGGAAAAAATTCTCCGTACCGCTAAAGAAGTGAATGCTGATCTGATTG > 1:1569303/1‑101 TGGTGCTGTAACAACTACGAAATTGTCGATCTCGGCGTTATGGTGCCTGCGGAAAAAATTCTCCGTACCGCTAAAGAAGTGAATGCTGATCTGATTGGCCT > 1:1080383/1‑101 GGTGCTGTAACAACTACGAAATTGTCGATCTCGGCGTTATGGTGCCTGCGGAAAAAATTCTCCGTACCGCTAAAGAAGTGAATGCTGATCTGATTGGCCTT > 2:1278189/1‑101 TGTAACAACTACGAAATTGTCGATCTCGGCGTTATGGTGCCTGCGGAAAAAATTCTCCGTACCGCTAAAGAAGTGAATGCTGATCTGATTGGCCTTTCGGG < 1:111773/101‑1 TGTAACAACTACGAAATTGTCGATCTCGGCGTTATGGTGCCTGCGGAAAAAATTCTCCGTACCGCTAAAGAAGTGAATGCTGATCTGATTGGCCTTTCGGG > 1:1175297/1‑101 GTAACAACTACGAAATTGTCGATCTCGGCGTTATGGTGCCTGCGGAAAAAATTCTCCGTACCGCTAAAGAAGTGAATGCTGATCTGATTGGCCTTTCGGGG > 2:711987/1‑101 GTAACAACTACGAAATTGTCGATCTCGGCGTTATGGTGCCTGCGGAAAAAATTCTCCGTACCGCTAAAGAAGTGAATGCTGATCTGATTGGCCTTTCGGGG > 1:751539/1‑101 GTAACAACTACGAAATTGTCGATCTCGGCGTTATGGTGCCTGCGGAAAAAATTCTCCGTACCGCTAAAGAAGTGAATGCTGATCTGATTGGCCTTTCGGGG > 1:119244/1‑101 CAGCAAAGAGCAGGGCAAAACCAACGGCAAGATGGTGATCGCCACCGTGAAGGGCGACGTCCACGACATCGGTAAAAATATCGTTGGTGTGGTGCTG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > 58/6922‑7018‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑tgTAACAACTACGAAATTGTCGATCTCGGCGTTATGGTGCCTGCGGAAAAAATTCTCCGTACCGCTAAAGAAGTGAATGCTGATCTGATTGGCCTTTCGGGG > 58/7024‑7123 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |