Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
JC JC | REL606 | 2,448,493 | IS186 (–) +6 bp | intergenic (+24/+21) | nupC → / ← yfeA | nucleoside (except guanosine) transporter/predicted diguanylate cyclase |
New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | REL606 | 2448493 = | 0 (0.000) | 68 (1.090) | 55/194 | 0.1 | 100% | intergenic (+24/+26) | nupC/yfeA | nucleoside (except guanosine) transporter/predicted diguanylate cyclase |
? | REL606 | 2772854 = | NA (NA) | noncoding (1/1343 nt) | IS186 | repeat region | |||||
* | ? | REL606 | = 2448498 | 0 (0.000) | 58 (0.930) | 48/194 | 0.3 | 100% | intergenic (+29/+21) | nupC/yfeA | nucleoside (except guanosine) transporter/predicted diguanylate cyclase |
? | REL606 | = 2774196 | NA (NA) | noncoding (1343/1343 nt) | IS186 | repeat region |
Only 100 of 104 total aligned reads displayed.
CGCTGGCGCGGGGAACACAGCTGGGCGAAATTTTGATTCATCGTGATGACCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACCCTGAACGGTGGGGAAAAACCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCC > REL606/2772755‑2772949 | cGCTGGCGCGGGGAACACAGCTGGGCGAAATTTTGATTCATCGTGATGACCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACCCTGAACGGTGGGGAAAAAccc > 1:51046/1‑101 (MQ=255) cgcgGGGAACACAGCTGGGCGAAATTTTGATTCATCGTGATGACCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACCCTGAACGGTGGGGAAAAACCCCATAAg < 1:216539/101‑1 (MQ=255) cgcgGGGAACACAGCTGGGCGAAATTTTGATTCATCGTGATGACCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACCCTGAACGGTGGGGAAAAACCCCATAAg < 1:109508/101‑1 (MQ=255) ggggAACACAGCTGGGCGAAATTTTGATTCATCGTGATGACCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACCCTGAACGGTGGGGAAAAACCCCATAAgcgc > 1:1233153/1‑101 (MQ=255) ggggAACACAGCTGGGCGAAATTTTGATTCATCGTGATGACCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACCCTGAACGGCGGGGAACAACCCCATAAgcgc > 1:1006695/1‑101 (MQ=255) aaCACAGCTGGGCGAAATTTTGATTCATCGTGATGACCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACCCTGAACGGTGGGGAAAAACCCCATAAGCGCTAAc < 1:905895/101‑1 (MQ=255) acacAGCTGGGCGAAATTTTGATTCATCGTGATGACCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACCCTGAACGGTGGGGAAAAACCCCATAAGCGCTAACt > 1:772785/1‑101 (MQ=255) caGCTGGGCGAAATTTTGATTCATCGTGATGACCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACCCTGAACGGTGGGGAAGAACCCCCTAAGCGCTAACTTaa > 2:318159/1‑101 (MQ=255) caGCTGGGCGAAATTTTGATTCATCGTGATGACCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACCCTGAACGGTGGGGAAAAACCCCATAAGCGCTAACTTaa < 2:82491/101‑1 (MQ=255) aGCTGGGCGAAATTTTGATTCATCGTGATGACCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACCCTGAACGGTGGGGAAAAACCCCATAAGCGCTAACTTAAg < 2:809207/101‑1 (MQ=255) aGCTGGGCGAAATTTTGATTCATCGTGATGACCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACCCTGAACGGTGGGGAAAAACCCCATAAGCGCTAACTTAAg < 2:1605955/101‑1 (MQ=255) cTGAGCGAAATTTTGATTCATCGTGATGACCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGGAGACCCTGAACGGGGGGGAAAAAACCCATAAACGCTAACTTAAagg > 2:1088792/1‑101 (MQ=255) tGGGCGAAATTTTGATTCATCGTGATGACCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACCCTGAACGGTGGGGAAAAACCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGt > 2:384254/1‑101 (MQ=255) ggCGAAATTTTGATTCATCGTGATGACCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACCCTGAACGGTGGGGAAAAACCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTtg < 2:1294404/101‑1 (MQ=255) gCGAAATTTTGATTCATCGTGATGACCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACCCTGAACGGTGGGGAAAAACCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTtgt < 2:1480109/101‑1 (MQ=255) gCGAAATTTTGATTCATCGTGATGACCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACCCTGAACGGTGGGGAAAAACCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTtgt < 2:608084/101‑1 (MQ=255) gCGAAATTTTGATTCATCGTGATGACCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACCCTGAACGGTGGGGAAAAACCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTtgt < 2:377306/101‑1 (MQ=255) cGAAATTTTGATTCATCGTGATGACCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACCCTGAACGGTGGGGAAAAACCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTtgtg > 2:508345/1‑101 (MQ=255) gAAATTTTGATTCATCGTGATGACCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACCCTGAACGGTGGGGAAAAACCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTgg < 2:1266465/101‑1 (MQ=255) gAAATTTTGATTCATCGTGATGACCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACCCTGAACGGTGGGGAAAAACCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTgg < 2:154478/101‑1 (MQ=255) aTTTTGATTCATCGTGATGACCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACCCTGAACGGTGGGGAAAAACCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTAt < 2:1475328/101‑1 (MQ=255) aTTTTGATTCATCGTGATGACCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACCCTGAACGGTGGGGAAAAACCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTAt < 2:20627/101‑1 (MQ=255) ttttGATTCATCGTGATGACCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACCCTGAACGGTGGGGAAAAACCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTAtt < 2:275773/101‑1 (MQ=255) ttttGATTCATCGTGATGACCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACCCTGAACGGTGGGGAAAAACCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTAtt < 2:1475945/101‑1 (MQ=255) ttttGATTCATCGTGATGACCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACCCTGAACGGTGGGGAAAAACCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTAtt > 2:689635/1‑101 (MQ=255) ttGATTCATCGTGATGACCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACCCTGAACGGTGGGGAAAAACCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTAc < 2:952095/101‑1 (MQ=255) tGATTCATCGTGATGACCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACCCTGAACGGTGGGGAAAAACCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACg > 1:914245/1‑101 (MQ=255) aTTCATCGTGATGACCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACCCTGAACGGTGGGGAAAAACCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGcc < 2:595555/101‑1 (MQ=255) tCATCGTGATGACCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACCCTGAACGGTGGGGAAAAACCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTg < 1:678572/101‑1 (MQ=255) cATCGCGATGACCGGTTTATCCCCGCTGGAGCGGGGCACACCCTGAACGGAGGGGATAAACCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATCACGCCTGa > 2:820510/1‑101 (MQ=25) aTCGTGATGACCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACCCTGAACGGTGGGGAAAAACCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGat > 2:1236590/1‑101 (MQ=255) aTCGTGATGACCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACCCTGAACGGTGGGGAAAAACCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGat < 2:1085178/101‑1 (MQ=255) gTGATGACCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACCCTGAACGGTGGGGAAAAACCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATg > 2:1355920/1‑101 (MQ=255) gTGATGACCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACCCTGAACGGTGGGGAAAAACCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATg > 1:663611/1‑101 (MQ=255) gTGATGACCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACCCTGAACGGTGGGGAAAAACCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATg > 2:1570196/1‑101 (MQ=255) tgatgaCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACCCTGAACGGTGGGGAAAAACCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGa > 1:1520267/1‑101 (MQ=255) tgatgaCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACCCTGAACGGTGGAGAAAAACCCCATAAGCGCTAACTTAACAGGTGTGGTATTACGCCTGTAATGa > 2:256411/1‑101 (MQ=37) gatgaCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACCCTGAACGGTGGGGAAAAACCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGAt < 1:1201888/101‑1 (MQ=255) atgaCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACCCTGAACGGTGGGGAAAAACCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGAtt < 2:400957/101‑1 (MQ=255) atgaCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACCCTGAACGGTGGGGAAAAACCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGAtt < 1:1113360/101‑1 (MQ=255) tgaCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACCCTGAACGGTGGGGAAAAACCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGAttt < 1:686046/101‑1 (MQ=255) tgaCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACCCTGAACGGTGGGGAAAAACCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGAttt > 1:106995/1‑101 (MQ=255) gaCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACCCTGAACGGTGGGGAAAAACCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTa > 2:1080673/1‑101 (MQ=255) aCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACCCTGAACGGTGGGGAAAAACCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTaa > 2:513184/1‑101 (MQ=255) aCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACCCTGAACGGTGGGGAAAAACCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTaa < 1:1691916/101‑1 (MQ=255) aCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACCCTGAACGGTGGGGAAAAACCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTaa > 2:18989/1‑101 (MQ=255) ccGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACCCTGAACGGTGGGGAAAAACCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAAc < 1:946102/101‑1 (MQ=255) ccGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACCCTGAACGGTGGGGAAAAACCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAAc > 2:1384901/1‑101 (MQ=255) ggTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACCCTGAACGGTGGGGAAAAACCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGt < 1:1130068/101‑1 (MQ=255) ggTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACCCTGAACGGTGGGGAAAAACCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGt < 2:1297678/101‑1 (MQ=255) gTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACCCTGAACGGTGGGGAAAAACCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTg > 2:566654/1‑101 (MQ=255) tttATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACCCTGAACGGTGGGGAAAAACCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGc < 1:1720388/101‑1 (MQ=255) ttATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACCCTGAACGGTGGGGAAAAACCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGcc > 2:404259/1‑101 (MQ=255) tATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACCCTGAACGGTGGGGAAAAACCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCg > 1:1530623/1‑101 (MQ=255) tATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACCCTGAACGGTGGGGAAAAACCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCg > 2:502901/1‑101 (MQ=255) ccccGCTGGCGCGGGGAACACCCTGAACGGTGGGGAAAAACCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATg > 1:41212/1‑101 (MQ=255) cccGCTGGCGCGGGGAACACCCTGAACGGTGGGGAAAAACCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGa < 1:243667/101‑1 (MQ=255) ccGCTGGCGCGGGGAACACCCTGAACGGTGGGGAAAAACCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGaa < 1:170002/101‑1 (MQ=255) ccGCTGGCGCGGGGAACACCCTGAACGGTGGGGAAAAACCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGaa < 1:1291212/101‑1 (MQ=255) ccGCTGGCGCGGGGAACACCCTGAACGGTGGGGAAAAACCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGaa > 1:117843/1‑101 (MQ=255) gCTGGCGCGGGGAACACCCTGAACGGTGGGGAAAAACCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAAtt < 1:513189/101‑1 (MQ=255) ntGGCGCGGGGAACACCCTGAACGGTGGGGAAAAACCCCATAAGCGCTAACTTAAGGNTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTa > 1:1279910/2‑101 (MQ=255) gcgGGGAACACCCTGAACGGTGGGGAAAAACCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACtctc < 1:1570202/101‑1 (MQ=255) ggggAACACCCTGAACGGTGGGGAAAAACCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCAc > 2:1451353/1‑101 (MQ=255) ggggAACACCCTGAACGGTGGGGAAAAACCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCAc > 1:780485/1‑101 (MQ=255) ggggAACACCCTGAACGGTGGGGAAAAACCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCAc < 2:1519745/101‑1 (MQ=255) gAACACCCTGAACGGTGGGGAAAAACCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGAt > 1:309636/1‑101 (MQ=255) gAACACCCTGAACGGTGGGGAAAAACCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGAt > 2:1089408/1‑101 (MQ=255) aaCACCCTGAACGGTGGGGAAAAACCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATa > 1:753289/1‑101 (MQ=255) cacCCTGAACGGTGGGGAAAAACCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAAc > 2:29116/1‑101 (MQ=255) acCCTGAACGGTGGGGAAAAACCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACt > 1:237727/1‑101 (MQ=255) acCCTGAACGGTGGGGAAAAACCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACt < 1:596643/101‑1 (MQ=255) acCCTGAACGGTGGGGAAAAACCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACt < 2:1267604/101‑1 (MQ=255) cccTGAACGGTGGGGAAAAACCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTg > 1:756838/1‑101 (MQ=255) cTGAACGGTGGGGAAAAACCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGt < 2:212250/101‑1 (MQ=255) cTGAACGGTGGGGAAAAACCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGt < 1:365465/101‑1 (MQ=255) tGAACGGTGGGGAAAAACCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTc < 2:847246/101‑1 (MQ=255) tGAACGGTGGGGAAAAACCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTc < 1:1384907/101‑1 (MQ=255) tGAACGGTGGGGAAAAACCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTc > 2:1478980/1‑101 (MQ=255) gAACGGTGGGGAAAAACCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCa < 1:391307/101‑1 (MQ=255) gAACGGTGGGGAAAAACCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCa < 2:499879/101‑1 (MQ=255) aaCGGTGGGGAAAAACCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAg > 1:1508390/1‑101 (MQ=255) cGGTGGGGAAAAACCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCa > 2:513632/1‑101 (MQ=40) cGGTGGGGAAAAACCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCa > 2:1530130/1‑101 (MQ=40) cGGTGGGGAAAAACCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCa < 2:57212/101‑1 (MQ=40) gTGGGGAAAAACCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAAt < 2:772780/101‑1 (MQ=38) gTGGGGAAAAACCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAAt > 1:1089783/1‑101 (MQ=38) tGGGGAAAAACCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCTAtt < 1:5877/101‑1 (MQ=38) tGGGGAAAAACCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAAtt < 1:5878/101‑1 (MQ=38) gggAAAAACCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCt > 2:1446266/1‑101 (MQ=35) gggAAAAACCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCt < 1:1355926/101‑1 (MQ=35) gggAAAAACCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCt < 1:77022/101‑1 (MQ=35) ggAAAAACCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTg > 2:896341/1‑101 (MQ=33) ggAAAAACCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTg > 2:147131/1‑101 (MQ=33) ggAAAAACCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTg < 2:1431572/101‑1 (MQ=33) gAAAAACCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTgg < 1:1359989/101‑1 (MQ=32) gAAAAACCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTgg < 2:41212/101‑1 (MQ=32) aaaaaCCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGc < 1:508350/101‑1 (MQ=31) aaaaaCCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGc > 2:576226/1‑101 (MQ=31) aaaaCCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGcc > 2:1356264/1‑101 (MQ=11) | CGCTGGCGCGGGGAACACAGCTGGGCGAAATTTTGATTCATCGTGATGACCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACCCTGAACGGTGGGGAAAAACCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCC > REL606/2772755‑2772949 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |