Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
JC JC | REL606 | 2,448,493 | IS186 (–) +6 bp | intergenic (+24/+21) | nupC → / ← yfeA | nucleoside (except guanosine) transporter/predicted diguanylate cyclase |
New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | REL606 | 2448493 = | 0 (0.000) | 68 (1.090) | 55/194 | 0.1 | 100% | intergenic (+24/+26) | nupC/yfeA | nucleoside (except guanosine) transporter/predicted diguanylate cyclase |
? | REL606 | 2772854 = | NA (NA) | noncoding (1/1343 nt) | IS186 | repeat region | |||||
* | ? | REL606 | = 2448498 | 0 (0.000) | 58 (0.930) | 48/194 | 0.3 | 100% | intergenic (+29/+21) | nupC/yfeA | nucleoside (except guanosine) transporter/predicted diguanylate cyclase |
? | REL606 | = 2774196 | NA (NA) | noncoding (1343/1343 nt) | IS186 | repeat region |
GCTATTGCATAAGCTCGGGGTGCAATATCTGCAAGGGTATTTGATTGGTCGCCCGCAGCCATTAGCTGATTAACAGGCGTAAAAAAACCGGGGAATTATccc‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < REL606/2448591‑2448493 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCATATT > REL606/2772854‑2772955 GCTATTGCATAAGCTCGGGGTGCAATATCTGCAAGGGTATTTGATTGGTCGCCCGCAGCCATTAGCTGATTAACAGGCGTAAAAAAACCGGGGAATTATCC < 1:1238829/101‑1 TATTGCATAAGCTCGGGGTGCAATATCTGCAAGGGTATTTGATTGGTCGCCCGCAGCCATTAGCTGATTAACAGGCGTAAAAAAACCGGGGAATTATCCCA > 2:984443/1‑101 ATTGCATAAGCTCGGGGTGCAATATCTGCAAGGGTATTTGATTGGTCGCCCGCAGCCATTAGCTGATTAACAGGCGTAAAAAAACCGGGGAATTATCCCAT < 1:711752/101‑1 ATTGCATAAGCTCGGGGTGCAATATCTGCAAGGGTATTTGATTGGTCGCCCGCAGCCATTAGCTGATTAACAGGCGTAAAAAAACCGGGGAATTATCCCAT > 1:33020/1‑101 TTGCATAAGCTCGGGGTGCAATATCTGCAAGGGTATTTGATTGGTCGCCCGCAGCCATTAGCTGATTAACAGGCGTAAAAAAACCGGGGAATTATCCCATA > 2:868529/1‑101 GCATAAGCTCGGGGTGCAATATCTGCAAGGGTATTTGATTGGTCGCCCGCAGCCATTAGCTGATTAACAGGCGTAAAAAAACCGGGGAATTATCCCATAAG > 1:549025/1‑101 CATAAGCTCGGGGTGCAATATCTGCAAGGGTATTTGATTGGGCGCCCGCAGCCATTAGCTGATTAACAGGCGTAAAAAAACCGGGGAATTATCCCCTAAGa > 2:1057420/1‑100 ATAAGCTCGGGGTGCAATATCTGCAAGGGTATTTGATTGGTCGCCCGCAGCCATTAGCTGATTAACAGGCGTAAAAAAACCGGGGAATTATCCCATAAGCG > 2:447429/1‑101 TAAGCTCGGGGTGCAATATCTGCAAGGGTATTTGATTGGTCGCCCGCAGCCATTAGCTGATTAACAGGCGTAAAAAAACCGGGGAATTATCCCATAAGCGC > 1:35758/1‑101 AGCTCGGGGTGCAATATCTGCAAGGGTATTTGATTGGTCGCCCGCAGCCATTAGCTGATTAACAGGCGTAAAAAAACCGGGGAATTATCCCATAAGCGCTA < 2:1138626/101‑1 CTCGGGGTGCAATATCTGCAAGGGTATTTGATTGGTCGCCCGCAGCCATTAGCTGATTAACAGGCGTAAAAAAACCGGGGAATTATCCCATAAGCGCTAAC > 2:482934/1‑101 CTCGGGGTGCAATATCTGCAAGGGTATTTGATTGGTCGCCCGCAGCCATTAGCTGATTAACAGGCGTAAAAAAACCGGGGAATTATCCCATAAGCGCTAAC > 1:1533301/1‑101 GGTGCAATATCTGCAAGGGTATTTGATTGGTCGCCCGCAGCCATTAGCTGATTAACAGGCGTAAAAAAACCGGGGAATTATCCCATAAGCGCTAACTTAAG < 1:359983/101‑1 GGTGCAATATCTGCAAGGGTATTTGATTGGTCGCCCGCAGCCATTAGCTGATTAACAGGCGTAAAAAAACCGGGGAATTATCCCATAAGCGCTAACTTAAG > 1:324754/1‑101 GTGCAATATCTGCAAGGGTATTTGATTGGTCGCCCGCAGCCATTAGCTGATTAACAGGCGTAAAAAAACCGGGGAATTTTCCCATAAGAGCTAACTTAAGG > 2:1219813/1‑101 GTGCAATATCTGCAAGGGTATTTGATTGGTCGCCCGCAGCCATTAGCTGATTAACAGGCGTAAAAAAACCGGGGAATTATCCCATAAGCGCTAACTTAAGG > 2:1232542/1‑101 ATATCTGCAAGGGTATTTGATTGGTCGCCCGCAGCCATTAGCTGATTAACAGGCGTAAAAAAACCGGGGAATTATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGT < 2:1095171/101‑1 CTGCAAGGGTATTTGATTGGTCGCCCGCAGCCATTAGCTGATTAACAGGCGTAAAAAAACCGGGGAATTATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTA < 2:604936/101‑1 GTATTTGATTGGTCGCCCGCAGCCATTAGCTGATTAACAGGCGTAAAAAAACCGGGGAATTATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCT > 2:351579/1‑101 ATTTGATTGGTCGCCCGCAGCCATTAGCTGATTAACAGGCGTAAAAAAACCGGGGAATTATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGA > 2:150957/1‑101 TTTGATTGGTCGCCCGCAGCCATTAGCTGATTAACAGGCGTAAAAAAACCGGGGAATTATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGAT < 2:160119/101‑1 TTGGNCGCCCGCAGNCATTNGNTGATTAACAGGCGTAAAAAAACCGGGGAATTATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGAT < 2:689714/101‑1 GGTCGCCCGCAGCCATTAGCTGATTAACAGGCGTAAAAAAACCGGGGAATTATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTT > 2:626696/1‑101 GTCGCCCGCAGCCATTAGCTGATTAACAGGCGTAAAAAAACCGGGGAATTATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTA < 1:1421544/101‑1 GTCGCCCGCAGCCATTAGCTGATTAACAGGCGTAAAAAAACCGGGGAATTATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTA < 2:1571218/101‑1 CGCCCGCAGCCATTAGCTGATTAACAGGCGTAAAAAAACCGGGGAATTATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAAC > 2:1034706/1‑101 GCCCGCAGCCATTAGCTGATTAACAGGCGTAAAAAAACCGGGGAATTATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACG < 2:1197884/101‑1 CCCGCAGCCATTAGCTGATTAACAGGCGTAAAAAAACCGGGGAATTATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGT < 2:324754/101‑1 CCCGCAGCCATTAGCTGATTAACAGGCGTAAAAAAACCGGGGAATTATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGT < 2:500668/101‑1 CCGCAGCCATTAGCTGATTAACAGGCGTAAAAAAACCGGGGAATTATCCCAAAAACGCTTACTTAAGGGGTGGGGGATTACGGCTGATATGATTTAAactg > 1:338210/1‑97 CGCAGCCATTAGCTGATTTACAGGCGTAAAAAAACCGGGGAATTATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGC > 1:1637768/1‑101 GCAGCCATTAGCTGATTAACAGGCGTAAAAAAACCGGGGAATTATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCC > 1:783584/1‑101 CAGCCATTAGCTGATTAACAGGCGTAAAAAAACCGGGGAATTATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCG > 1:1591004/1‑101 AGCCATTAGCTGATTAACAGGCGTAAAAAAACCGGGGAATTATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGA > 1:210618/1‑101 GCCATTAACAGATTAACAGGTGTAAAAAAACCGGGGAATTATCGCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGAT < 1:1219818/101‑1 TTAGCTGATTAACAGGCGTAAAAAAACCGGGGAATTATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAAT < 1:259208/101‑1 TTAGCTGATTAACAGGCGTAAAAAAACCGGGGAATTATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAAT < 1:1094560/101‑1 TAGCTGATTAACAGGCGTAAAAAAACCGGGGAATTATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATT < 1:150957/101‑1 AGCTGATTAACAGGCGTAAAAAAACCGGGGAATTATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTA > 2:552747/1‑101 CTGATTAACAGGCGTAAAAAAACCGGGGAATTATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACT > 1:1364512/1‑101 TGATTAACAGGCGTAAAAAAACCGGGGAATTATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTC < 1:293096/101‑1 TGATTAACAGGCGTAAAAAAACCGGGGAATTATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTC > 1:1351327/1‑101 GATTAACAGGCGTAAAAAAACCGGGGAATTATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCT > 2:616511/1‑101 GATTAACAGGCGTAAAAAAACCGGGGAATTATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCT > 2:1462204/1‑101 ATTAACAGGCGTAAAAAAACCGGGGAATTATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTC < 2:1403842/101‑1 TAACAGGCGTAAAAAAACCGGGGAATTATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCAC > 2:1296969/1‑101 TAACAGGCGTAAAAAAACCGGGGAATTATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCAC < 1:1600064/101‑1 TAACAGGCGTAAAAAAACCGGGGAATTATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCAC < 2:35758/101‑1 TAACAGGCGTAAAAAAACCGGGGAATTATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCAC < 1:311448/101‑1 AACAGGCGTAAAAAAACCGGGGAATTATGCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACG > 2:1601076/1‑101 GGCGTAAAAAAACCGGGGAATTATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAA < 1:515993/101‑1 GCGTAAAAAAACCGGGGAATTATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAAC > 2:467424/1‑101 CGTAAAAAAACCGGGGAATTATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACT > 1:1488786/1‑101 CGTAAAAAAACCGGGGAATTATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACT < 1:247372/101‑1 GTAAAAAAACCGGGGAATTATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTG > 1:196987/1‑101 AAAAAAACCGGGGAATTATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGT > 2:646267/1‑101 AAAACCGGGGAATTATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAG < 2:549272/101‑1 AAACCGGGGAATTATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGTTCAGC > 2:112668/1‑101 AAACCGGGGAATTATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGC > 1:1039120/1‑101 CCGGGGAATTATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAAT < 1:1034711/101‑1 CCGGGGAATTATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAAT < 1:234206/101‑1 CGGGGAATTATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATT > 1:360671/1‑101 GGGGAATTATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTC > 1:226228/1‑101 GGGAATTATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCT < 2:549020/101‑1 ATTATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCC > 2:272909/1‑101 TTATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCC > 2:424661/1‑101 TATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCA > 1:1382076/1‑101 ATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCAT < 2:730253/101‑1 ATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCAT < 1:1436444/101‑1 CCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCATAT < 1:521354/101‑1 CCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCATAT > 1:697359/1‑101 CCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCATAT > 2:141194/1‑101 CCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCATAT < 1:20114/101‑1 CCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCATAT < 1:160496/101‑1 CCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCATAT < 1:1555031/101‑1 CCCATAAGCACTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCATAT < 1:363837/101‑1 CCCATAAGCACTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCATAT < 2:224254/101‑1 CCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCATATT > 1:256906/1‑101 CCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCATATT > 2:1031219/1‑101 GCTATTGCATAAGCTCGGGGTGCAATATCTGCAAGGGTATTTGATTGGTCGCCCGCAGCCATTAGCTGATTAACAGGCGTAAAAAAACCGGGGAATTATccc‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < REL606/2448591‑2448493 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCATATT > REL606/2772854‑2772955 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |