| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC JC | REL606 | 2,448,493 | IS186 (–) +6 bp | intergenic (+24/+21) | nupC → / ← yfeA | nucleoside (except guanosine) transporter/predicted diguanylate cyclase |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | REL606 | 2448493 = | 0 (0.000) | 68 (1.090) | 55/194 | 0.1 | 100% | intergenic (+24/+26) | nupC/yfeA | nucleoside (except guanosine) transporter/predicted diguanylate cyclase |
| ? | REL606 | 2772854 = | NA (NA) | noncoding (1/1343 nt) | IS186 | repeat region | |||||
| * | ? | REL606 | = 2448498 | 0 (0.000) | 58 (0.930) | 48/194 | 0.3 | 100% | intergenic (+29/+21) | nupC/yfeA | nucleoside (except guanosine) transporter/predicted diguanylate cyclase |
| ? | REL606 | = 2774196 | NA (NA) | noncoding (1343/1343 nt) | IS186 | repeat region | |||||
Only 100 of 126 total aligned reads displayed.
TTCGGTCTGAAGCTGGTTTACGGCTCTACCCTGGTGAGTGTGCTGTCTGCGTCAATCGCAGCACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCCGGTTTTTTTACGCCTGTTAATCAGCTAATGGCTGCGGGCGACCAATCAAATACCCTTGCAGATATTGCACCCCGAGCTTATGCAATAGC > REL606/2448395‑2448591 | tgggccagaattgctgaccagttatcgtgagagtaattcatcggcacgttaaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatgggATa > 1:1382076‑M1/99‑101 (MQ=255) gggccagaattgctgaccagttatcgtgagagtaattcatcggcacgttaaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatgggATaa > 2:424661‑M1/98‑101 (MQ=255) ggccagaattgctgaccagttatcgtgagagtaattcatcggcacgttaaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatgggATAAt > 2:272909‑M1/97‑101 (MQ=255) cGGTCTGAAGCTGGTTTACGGCTCTACCCTGGTGAGTGTGCTGTCTGCGTCAATCGCAGCACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAAt < 2:924442/101‑1 (MQ=255) ggTCTGAAGCTGGTTTACGGCTCTACCCTGGTGAGTGTGCTGTCTGCGTCAATCGCAGCACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAAtt < 1:49052/101‑1 (MQ=255) cTGAAGCTGGTTTACGGCTCTACCCTGGTGAGTGTGCTGTCTGCGTCAATCGCAGCACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTccc > 2:34202‑M1/1‑98 (MQ=255) cTGAAGCTGGTTTACGGCTCTACCCTGGTGAGTGTGCTGTCTGCGTCAATCGCAGCACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTccc < 2:1306692‑M1/101‑4 (MQ=255) agaattgctgaccagttatcgtgagagtaattcatcggcacgttaaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatgggATAATTccc < 2:549020‑M1/9‑1 (MQ=255) tGAAGCTGGTTTACGGCTCTACCCTGGTGAGTGTGCTGTCTGCGTCAATCGCAGCACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTccca > 1:242112‑M1/1‑97 (MQ=255) aattgctgaccagttatcgtgagagtaattcatcggcacgttaaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatgggATAATTCCCCg > 1:360671‑M1/91‑101 (MQ=255) attgctgaccagttatcgtgagagtaattcatcggcacgttaaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatgggATAATTCCCCgg < 1:1034711‑M1/12‑1 (MQ=255) attgctgaccagttatcgtgagagtaattcatcggcacgttaaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatgggATAATTCCCCgg < 1:234206‑M1/12‑1 (MQ=255) aaGCTGGTTTACGGCTCTACCCTGGTGAGTGTGCTGTCTGCGTCAATCGCAGCACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTcccata > 1:780958‑M1/1‑95 (MQ=255) aaGCTGGTTTACGGCTCTACCCTGGTGAGTGTGCTGTCTGCGTCAATCGCAGCACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTcccata > 2:1415242‑M1/1‑95 (MQ=255) gCTGGTTTACGGCTCTACCCTGGTGAGTGTGCTGTCTGCGTCAATCGCAGCACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTcccataag < 1:1592017‑M1/101‑9 (MQ=255) gctgaccagttatcgtgagagtaattcatcggcacgttaaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatgggATAATTCCCCGGttt > 1:1039120‑M1/87‑101 (MQ=255) gctgaacagttatcgtgagagtaattcatcggcacgttaaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatgggATAATTCCCCGGttt > 2:112668‑M1/87‑101 (MQ=255) tGGTTTACGGCTCTACCCTGGTGAGTGTGCTGTCTGCGTCAATCGCAGCACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTcccataagcg < 1:584313‑M1/101‑11 (MQ=255) ctgaccagttatcgtgagagtaattcatcggcacgttaaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatgggATAATTCCCCGGtttt < 2:549272‑M1/16‑1 (MQ=255) gTTTACGGCTCTACCCTGGTGAGTGTGCTGTCTGCGTCAATCGCAGCACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTcccataagcgct < 1:290052‑M1/101‑13 (MQ=255) tACGGCTCTACCCTGGTGAGTGTGCTGTCTGCGTCAATCGCAGCACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTcccataagcgctaac < 1:739947‑M1/101‑16 (MQ=255) cagttatcgtgagagtaattcatcggcacgttaaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatgggATAATTCCCCGGTTTTTTTAc > 1:196987‑M1/81‑101 (MQ=255) agttatcgtgagagtaattcatcggcacgttaaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatgggATAATTCCCCGGTTTTTTTACg > 1:1488786‑M1/80‑101 (MQ=255) agttatcgtgagagtaattcatcggcacgttaaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatgggATAATTCCCCGGTTTTTTTACg < 1:247372‑M1/22‑1 (MQ=255) gttatcgtgagagtaattcatcggcacgttaaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatgggATAATTCCCCGGTTTTTTTACGc > 2:467424‑M1/79‑101 (MQ=255) ttatcgtgagagtaattcatcggcacgttaaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatgggATAATTCCCCGGTTTTTTTACGcc < 1:515993‑M1/24‑1 (MQ=255) tctACCCTGGTGAGTGTGCTGTCTGCGTCAATCGCAGCACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTcccataagcgctaacttaagg < 2:601600‑M1/101‑22 (MQ=255) cgtgagagtaattcatcggcacgttaaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatggcATAATTCCCCGGTTTTTTTACGCCTGtt > 2:1601076‑M1/74‑101 (MQ=255) gtgagagtaattcatcggcacgttaaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatgggATAATTCCCCGGTTTTTTTACGCCTGTTa < 1:1600064‑M1/29‑1 (MQ=255) gtgagagtaattcatcggcacgttaaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatgggATAATTCCCCGGTTTTTTTACGCCTGTTa > 2:1296969‑M1/73‑101 (MQ=255) gagagtaattcatcggcacgttaaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatgggATAATTCCCCGGTTTTTTTACGCCTGTTAAt < 2:1403842‑M1/31‑1 (MQ=255) agagtaattcatcggcacgttaaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatgggATAATTCCCCGGTTTTTTTACGCCTGTTAATc > 2:616511‑M1/70‑101 (MQ=255) agagtaattcatcggcacgttaaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatgggATAATTCCCCGGTTTTTTTACGCCTGTTAATc > 2:1462204‑M1/70‑101 (MQ=255) gagtaattcatcggcacgttaaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatgggATAATTCCCCGGTTTTTTTACGCCTGTTAATCa < 1:293096‑M1/33‑1 (MQ=255) agtaattcatcggcacgttaaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatgggATAATTCCCCGGTTTTTTTACGCCTGTTAATCAg > 1:1364512‑M1/68‑101 (MQ=255) taattcatcggcacgttaaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatgggATAATTCCCCGGTTTTTTTACGCCTGTTAATCAGCt > 2:552747‑M1/66‑101 (MQ=255) tGAGTGTGCTGTCTGCGTCAATCGCAGCACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTcccataagcgctaacttaagggttgaaccat < 2:822585‑M1/101‑32 (MQ=255) aattcatcggcacgttaaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatgggATAATTCCCCGGTTTTTTTACGCCTGTTAATCAGCTa < 1:150957‑M1/37‑1 (MQ=255) attcatcggcacgttaaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatgggATAATTCCCCGGTTTTTTTACGCCTGTTAATCAGCTaa < 1:1094560‑M1/38‑1 (MQ=255) aGTGTGCTGTCTGCGTCAATCGCAGCACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTcccataagcgctaacttaagggttgaaccatct < 2:1068045‑M1/101‑34 (MQ=255) gtgCTGTCTGCGTCAATCGCAGCACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTcccataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaa > 1:296073‑M1/1‑65 (MQ=255) gtgCTGTCTGCGTCAATCGCAGCACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTcccataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaa > 1:158078‑M1/1‑65 (MQ=255) atcggcacgttaaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatgcgATAATTCCCCGGTTTTTTTACACCTGTTAATCTGTTAATGGc < 1:1219818‑M1/42‑1 (MQ=255) tcggcacgttaaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatgggATAATTCCCCGGTTTTTTTACGCCTGTTAATCAGCTAATGGCt > 1:210618‑M1/59‑101 (MQ=255) cggcacgttaaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatgggATAATTCCCCGGTTTTTTTACGCCTGTTAATCAGCTAATGGCTg > 1:1591004‑M1/58‑101 (MQ=255) ggcacgttaaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatgggATAATTCCCCGGTTTTTTTACGCCTGTTAATCAGCTAATGGCTGc > 1:783584‑M1/57‑101 (MQ=255) cTGTCTGCGTCAATCGCAGCACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTcccataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaagaa < 2:158078‑M1/101‑40 (MQ=255) tGTCTGCGTCAATCGCAGCACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTcccataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaagaat < 2:1680333‑M1/101‑41 (MQ=255) tGTCTGCGTCAATCGCAGCACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTcccataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaagaat < 1:294111‑M1/101‑41 (MQ=255) gcacgttaaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatgggATAATTCCCCGGTTTTTTTACGCCTGTAAATCAGCTAATGGCTGCg > 1:1637768‑M1/56‑101 (MQ=255) cagtttaaatcatatcagccgtaatcccccaccccttaagtaagcgtttttgggATAATTCCCCGGTTTTTTTACGCCTGTTAATCAGCTAATGGCTGCgg > 1:338210‑M1/55‑101 (MQ=255) acgttaaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatgggATAATTCCCCGGTTTTTTTACGCCTGTTAATCAGCTAATGGCTGCggg < 2:324754‑M1/48‑1 (MQ=255) cgttaaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatgggATAATTCCCCGGTTTTTTTACGCCTGTTAATCAGCTAATGGCTGCGGGc < 2:1197884‑M1/49‑1 (MQ=255) tGCGTCAATCGCAGCACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTcccataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaagaatgcga > 2:658037‑M1/1‑57 (MQ=255) gttaaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatgggATAATTCCCCGGTTTTTTTACGCCTGTTAATCAGCTAATGGCTGCGGGCg > 2:1034706‑M1/52‑101 (MQ=255) gCGTCAATCGCAGCACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTcccataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaagaatgcgac < 1:34202‑M1/101‑46 (MQ=255) taaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatgggATAATTCCCCGGTTTTTTTACGCCTGTTAATCAGCTAATGGCTGCGGGCGAc < 2:1571218‑M1/52‑1 (MQ=255) taaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatgggATAATTCCCCGGTTTTTTTACGCCTGTTAATCAGCTAATGGCTGCGGGCGAc < 1:1421544‑M1/52‑1 (MQ=255) cGTCAATCGCAGCACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTcccataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaagaatgcgacg < 1:1184578‑M1/101‑47 (MQ=255) cGTCAATCGCAGCACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTcccataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaagaatgcgacg < 1:826890‑M1/101‑47 (MQ=255) gTCAATCGCAGCACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTcccataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaagaatgcgacgc > 1:749053‑M1/1‑54 (MQ=255) aaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatgggATAATTCCCCGGTTTTTTTACGCCTGTTAATCAGCTAATGGCTGCGGGCGAcc > 2:626696‑M1/49‑101 (MQ=255) cAATCGCAGCACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTcccataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaagaatgcgacgcct > 1:600457‑M1/1‑52 (MQ=255) atcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatgggATAATTCCCCGGTTTTTTTACGCCTGTTAATCANCNAATGNCTGCGGGCGNCCaa < 2:689714‑M1/55‑1 (MQ=255) aaTCGCAGCACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTcccataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaagaatgcgacgcctc > 1:1719881‑M1/1‑51 (MQ=255) gcagcaCTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTcccataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaagaatgcgacgcctcggtg < 1:1274776‑M1/101‑55 (MQ=255) gcagcaCTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTcccataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaagaatgcgacgcctcggtg > 1:1667597‑M1/1‑47 (MQ=255) agcaCTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTcccataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaagaatgcgacgcctcggtgcc < 2:1484323‑M1/101‑57 (MQ=255) aggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatgggATAATTCCCCGGTTTTTTTACGCCTGTTAATCAGCTAATGGCTGCGGGCGACCAATCAAATAc > 2:351579‑M1/39‑101 (MQ=255) aCTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTcccataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaagaatgcgacgcctcggtgactcg > 2:814643‑M1/1‑42 (MQ=255) cTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTcccataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaagaatgcgacgcctcggtgcctcgt < 1:1391308‑M1/101‑61 (MQ=255) tGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTcccataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaagaatgcgacgcctcggtgcctcgtt > 2:1171647‑M1/1‑40 (MQ=255) tGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTcccataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaagaatgcgacgcctcggtgcctcgttaag > 1:582116‑M1/1‑37 (MQ=255) taccacaacccttaagttagcgcttatgggATAATTCCCCGGTTTTTTTACGCCTGTTAATCAGCTAATGGCTGCGGGCGACCAATCAAATACCCTTGCAg < 2:604936‑M1/71‑1 (MQ=255) cTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTcccataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaagaatgcgacgcctcggtgcctcgttaagac < 2:512987‑M1/101‑67 (MQ=255) tAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTcccataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaagaatgcgacgcctcggtgcctcgttaagacgat < 2:296073‑M1/101‑70 (MQ=255) 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aaaaGCCGGGGATAATTcccataagtgctaacttaagggttgaaccatctgaagaatgcgatgcctcggtgcctcgttaagacgaggcctcgcgatcttca < 2:737421‑M1/101‑85 (MQ=255) aaaaGCCGGGGATAATTcccataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaagaatgcgacgcctcggtgcctcgttaagacgatgcctcgcgttcttca > 1:1132253‑M1/1‑17 (MQ=255) cgcttatgggATAATTCCCCGGTTTTTTTACGCCTGTTAATCAGCTAATGGCTGCGGGCGACCAATCAAATACCCTTGCAGATATTGCACCCCGAGCTTAt > 2:447429‑M1/11‑101 (MQ=255) tcttaggggATAATTCCCCGGTTTTTTTACGCCTGTTAATCAGCTAATGGCTGCGGGCGCCCAATCAAATACCCTTGCAGATATTGCACCCCGAGCTTATg > 2:1057420‑M1/10‑101 (MQ=255) tatgggATAATTCCCCGGTTTTTTTACGCCTGTTAATCAGCTAATGGCTGCGGGCGACCAATCAAATACCCTTGCAGATATTGCACCCCGAGCTTATGCaa > 2:868529‑M1/7‑101 (MQ=255) atgggATAATTCCCCGGTTTTTTTACGCCTGTTAATCAGCTAATGGCTGCGGGCGACCAATCAAATACCCTTGCAGATATTGCACCCCGAGCTTATGCAAt > 1:33020‑M1/6‑101 (MQ=255) atgggATAATTCCCCGGTTTTTTTACGCCTGTTAATCAGCTAATGGCTGCGGGCGACCAATCAAATACCCTTGCAGATATTGCACCCCGAGCTTATGCAAt < 1:711752‑M1/96‑1 (MQ=255) gggATAATTcccataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaagaatgcgacgcctcggtgcctcgttaagacgatgcctcgcgttcttcaattgcgtt > 2:955018‑M1/1‑9 (MQ=255) ggATAATTcccataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaagaatgcgacgcctcggtgcctcgttaagacgatgcctcgcgttcttcaattgcgttt < 2:823183‑M1/101‑94 (MQ=255) ggATAATTCCCCGGTTTTTTTACGCCTGTTAATCAGCTAATGGCTGCGGGCGACCAATCAAATACCCTTGCAGATATTGCACCCCGAGCTTATGCAATAgc < 1:1238829‑M1/99‑1 (MQ=255) | TTCGGTCTGAAGCTGGTTTACGGCTCTACCCTGGTGAGTGTGCTGTCTGCGTCAATCGCAGCACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCCGGTTTTTTTACGCCTGTTAATCAGCTAATGGCTGCGGGCGACCAATCAAATACCCTTGCAGATATTGCACCCCGAGCTTATGCAATAGC > REL606/2448395‑2448591 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |