| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC JC | REL606 | 1,916,224 | IS1 (–) +9 bp | [pykA] | [pykA] | |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | REL606 | 1916224 = | 1 (0.020) | 62 (0.960) | 50/200 | 0.3 | 98.3% | intergenic (+127/‑1) | yebK/pykA | predicted DNA‑binding transcriptional regulator/pyruvate kinase |
| ? | REL606 | 1973272 = | NA (NA) | noncoding (1/768 nt) | IS1 | repeat region | |||||
| * | ? | REL606 | = 1916232 | 1 (0.020) | 68 (1.060) | 53/200 | 0.2 | 98.4% | coding (8/1443 nt) | pykA | pyruvate kinase |
| ? | REL606 | 2034326 = | NA (NA) | noncoding (768/768 nt) | IS1 | repeat region | |||||
CAATGCCCGGCATACTCATGTCCATTAGCACCACGTCAACGGCATTTGCCCGACACCACTTAACGGCGTCTTCACCGCACGATGCCTCACCGACGACTTTGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACT > REL606/1973172‑1973368 | cAATGCCCGGCATACTCATGTCCATTAGCACCACGTCAACGGCATTTGCCCGACACCACTTAACGGCGTCTTCACCGCACGATGCCTCACCGACGACTTTg > 2:1356502/1‑101 (MQ=255) aaTTCCCGGCATACTCATGTCCATTAGCACCACGTCAACGGCATTTGCCCGACACCACTTAACGGCGTCTTCACCGCACGATGCCTCACCGACGACTTTgg < 2:853198/101‑1 (MQ=255) cccGGCATACTCATGTCCATTAGCACCACGTCAACGGCATTTGCCCGACACCACTTAACGGCGTCTTCACCGCACGATGCCTCACCGACGACTTTGGTGAt < 1:451068/101‑1 (MQ=255) ccGGCATGCTGATTGCCATTAGCACCACGTCAACGGCATTTGCCTGACGCCACTTAACGGTGTCTTCCGCGCTCGATTCCTTGCCGACGACTTTGGTGAtg < 2:824270/101‑1 (MQ=255) ccGGCATACTCATGTCCATTAGCACCACGTCAACGGCATTTGCCCGACACCACTTAACGGCGTCTTCACCGCACGATGCCTCACCGACGACTTTGGTGAtg < 2:208532/101‑1 (MQ=255) cGGCATACTCATGTCCATTAGCACCACGTCAACGGCATTTGCCCGACACCACTTAACGGCGTCTTCACCGCACGATGCCTCACCGACGACTTTGGTGAtgc < 1:900260/101‑1 (MQ=255) gCATACTCATGTCCATTAGCACCACGTCAACGGCATTTGCCCGACACCACTTAACGGCGTCTTCACCGCACGATGCCTCACCGACGACTTTGGTGAtgctg < 1:929186/101‑1 (MQ=255) aTACTCATGTCCATTAGCACCACGTCAACGGCATTTGCCCGACACCACTTAACGGCGTCTTCACCGCACGATGCCTCACCGACGACTTTGGTGATGCTGcc > 2:360737/1‑101 (MQ=255) tACTCATGTCCATTAGCACCACGTCAACGGCATTTGCCCGACACCACTTAACGGCGTCTTCACCGCACGATGCCTCACCGACGACTTTGGTGATGCTGCCa > 1:1343764/1‑101 (MQ=255) cTCATGTCCATTAGCACCACGTCAACGGCATTTGCCCGACACCACTTACCGGCGTCTTCACCGCACGATGCCTCACCGACGACTTTGGTGATGCTGCCAAc < 2:505730/101‑1 (MQ=255) cTCATGTCCATTAGCACCACGTCAACGGCATTTGCCCGACACCACTTAACGGCGTCTTCACCGCACGATGCCTCACCGACGACTTTGGTGATGCTGCCAAc < 1:1052917/101‑1 (MQ=255) cATGTCCATTAGCACCACGTCAACGGCATTTGCCCGACACCACTTAACGGCGTCTTCACCGCACGATGCCTCACCGACGACTTTGGTGATGCTGCCAACtt < 2:237266/101‑1 (MQ=255) aTGTCCATTAGCACCACGTCAACGGCATTTGCCCGACACCACTTAACGGCGTCTTCACCGCACGATGCCTCACCGACGACTTTGGTGATGCTGCCAACTTa > 2:502101/1‑101 (MQ=255) gTCCATTAGCACCACGTCAACGGCATTTGCCCGACACCACTTAACGGCGTCTTCACCGCACGATGCCTCACCGACGACTTTGGTGATGCTGCCAACTTACt < 1:1266360/101‑1 (MQ=255) tCCATTATCGCCACGTCAACGGCATTTGCCCGACACCTCTGAACGGCGTCTTCACCGCACGATTCCTCACCGACGACTTTGGTGATGCTGCCAACTTGCTg < 2:1536206/101‑1 (MQ=255) ccATTAGCACCACGTCAACGGCATTTGCCCGACACCACTTAACGGCGTCTTCACCGCACGATGCCTCACCGACGACTTTGGTGATGCTGCCAACTTACTGa > 1:338483/1‑101 (MQ=255) cATTAGCACCACGTCAACGGCATTTGCCCGACACCACTTAACGGCGTCTTCACCGCACGATGCCTCACCGACGACTTTGGTGATGCTGCCAACTTACTGAt < 1:60752/101‑1 (MQ=255) cATTAGCACCACGTCAACGGCATTTGCCCGACACCACTTAACGGCGTCTTCACCGCACGATGCCTCACCGACGACTTTGGTGATGCTGCCAACTTACTGAt > 2:1038034/1‑101 (MQ=255) ttAGCACCACGTCAACGGCATTTGCCCGACACCACTTAACGGCATCTTCACCGCACGATGCCTCACCGACGACTTTGGTGATGCTGCCAACTTACTGAttt < 2:425475/101‑1 (MQ=255) tAGCACCACGTCAACGGCATTTGCCCGACACCACTTAACGGCGTCTTCACCGCACGATGCCTCACCGACGACTTTGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTa < 1:884963/101‑1 (MQ=255) aGCACCACGTCAACGGCATTTGCCCGACACCACTTAACGGCGTCTTCACCGCACGATGCCTCACCGACGACTTTGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAg < 1:457110/101‑1 (MQ=255) gCACCACGTCAACGGCATTTGCCCGACACCACTTAACGGCGTCTTCACCGCACGATGCCTCACCGACGACTTTGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAgt < 2:341926/101‑1 (MQ=255) gCACCACGTCAACGGCATTTGCCCGACACCACTTAACGGCGTCTTCACCGCACGATGCCTCACCGACGACTTTGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAgt < 2:1404381/101‑1 (MQ=255) caccacGTCAACGGCATTTGCCCGACACCACTTAACGGCGTCTTCACCGCACGATGCCTCACCGACGACTTTGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAgtg > 1:1003163/1‑101 (MQ=255) accacGTCAACGGCATTTGCCCGACACCACTTAACGGCGTCTTCACCGCACGATGCCTCACCGACGACTTTGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAgtgt > 1:312659/1‑101 (MQ=255) cacGTCAACGGCATTTGCCCGACACCACTTAACGGCGTCTTCACCGCACGATGCCTCACCGACGACTTTGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTat > 2:229170/1‑101 (MQ=255) acGTCAACGGCATTTGCCCGACACCACTTAACGGCGTCTTCACCGCACGATGCCTCACCGACGACTTTGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTatg > 1:1025547/1‑101 (MQ=255) gTCAACGGCATTTGCCCGACACCACTTAACGGCGTCTTCACCGCACGATGCCTCACCGACGACTTTGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTatgat > 2:1368106/1‑101 (MQ=255) gTCAACGGCATTTGCCCGACACCACTTAACGGCGTCTTCACCGCACGATGCCTCACCGACGACTTTGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTatgat < 1:617754/101‑1 (MQ=255) cAACGGCATTTGCCCGACACCACTTAACGGCGTCTTCACCGCACGATGCCTCACCGACGACTTTGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATgg < 2:633815/101‑1 (MQ=255) aCGGCATTTGCCCGACACCACTTAACGGCGTCTTCACCGCACGATGCCTCACCGACGACTTTGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGgtg < 2:1592786/101‑1 (MQ=255) aTTTGCCCGACACCACTTAACGGCGTCTTCACCGCACGATGCCTCACCGACGACTTTGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGttttt > 1:712136/1‑101 (MQ=255) aTTTGCCCGACACCACTTAACGGCGTCTTCACCGCACGATGCCTCACCGACGACTTTGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGttttt < 1:252580/101‑1 (MQ=255) aTTTGCCCGACACCACTTAACGGCGTCTTCACCGCACGATGCCTCACCGACGACTTTGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGGGttttt > 1:357776/1‑101 (MQ=255) aTTTGCCCGACACCACTTAACGGCGTCTTCACCGCAAGATGCCTCACCGACGACTTTGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGttttt > 1:1697601/1‑101 (MQ=255) tttGCCCGACACCACTTAACGGCGTCTTCACCGCACGATGCCTCGCCGACGACTTTGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTg < 2:1626125/101‑1 (MQ=255) ccGACACCACTTAACGGCGTCTTCACCGCACGATGCCTCACCGACGACTTTGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTg < 1:1690759/101‑1 (MQ=255) gACACCACTTAACGGCGTCTTCACCGCACGATGCCTCACCGACGACTTTGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCt < 1:419967/101‑1 (MQ=255) acacCACTTAACGGCGTCTTCACCGCACGATGCCTCACCGACGACTTTGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTc > 2:265021/1‑101 (MQ=255) accacTTAACGGCGTCTTCACCGCACGATGCCTCACCGACGACTTTGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCa < 2:712131/101‑1 (MQ=255) accacTTAACGGCGTCTTCACCGCACGATGCCTCACCGACGACTTTGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCa > 1:471541/1‑101 (MQ=255) cTTAACGGCGTCTTCCCCGCACGATGCCTCACCGACGACTTTGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTgg < 1:360737/101‑1 (MQ=255) tAACGGCGTCTTCACCGCACGATGCCTCACCGACGACTTTGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCt < 1:846561/101‑1 (MQ=255) aaCGGCGTCTTCACCGCACGATGCCTCACCGACGACTTTGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCtt > 1:1202203/1‑101 (MQ=255) cGTCTTCACCGCACGATGCCTCACCGACGACTTTGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGtt > 2:898253/1‑101 (MQ=255) gTCTTCACCGCACGATGCCTCACCGACGACTTTGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGttt < 1:959890/101‑1 (MQ=255) gTCTTCACCGCACGATGCCTCACCGACGACTTTGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGttt > 1:281695/1‑101 (MQ=255) aCCGCACGATGCCTCACCGACGACTTTGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCa < 1:426757/101‑1 (MQ=255) aCCGCACGATGCCTCACCGACGACTTTGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCa < 1:883872/101‑1 (MQ=255) aCGATGCCTCACCGACGACTTTGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGt < 2:309918/101‑1 (MQ=255) tGCCTCACCGACGACTTTGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTTCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCcct > 2:1509167/1‑101 (MQ=255) tGCCTCACCGACGACTTTGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCcct > 1:524847/1‑101 (MQ=255) tGCCTCACCGACGACTTTGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCcct > 1:140381/1‑101 (MQ=255) gCCTCACCGACGACTTTGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCcctc < 2:785599/101‑1 (MQ=255) cTCACCGACGACTTTGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCcctcct > 1:520454/1‑101 (MQ=255) cTCACCGACGACTTTGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCcctcct > 2:785454/1‑101 (MQ=255) cTCACCGACGACTTTGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCcctcct > 2:177365/1‑101 (MQ=255) cTCACCGACGACTTTGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGATGTCcctccc > 2:14820/1‑100 (MQ=255) acgacTTTGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGc > 2:1184394/1‑101 (MQ=38) acTTTGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTAc > 2:49262/1‑101 (MQ=33) cTTTGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACt < 2:312659/101‑1 (MQ=32) | CAATGCCCGGCATACTCATGTCCATTAGCACCACGTCAACGGCATTTGCCCGACACCACTTAACGGCGTCTTCACCGCACGATGCCTCACCGACGACTTTGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACT > REL606/1973172‑1973368 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |