Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
JC JC | REL606 | 1,916,224 | IS1 (–) +9 bp | [pykA] | [pykA] |
New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | REL606 | 1916224 = | 1 (0.020) | 62 (0.960) | 50/200 | 0.3 | 98.3% | intergenic (+127/‑1) | yebK/pykA | predicted DNA‑binding transcriptional regulator/pyruvate kinase |
? | REL606 | 1973272 = | NA (NA) | noncoding (1/768 nt) | IS1 | repeat region | |||||
* | ? | REL606 | = 1916232 | 1 (0.020) | 68 (1.060) | 53/200 | 0.2 | 98.4% | coding (8/1443 nt) | pykA | pyruvate kinase |
? | REL606 | 2034326 = | NA (NA) | noncoding (768/768 nt) | IS1 | repeat region |
CGAATGAGATTAATTTATCGCCATCGCGGCGTTATTTCATTCGGATTTCATGTTCAAGCAACACCTGGTTGTTTCAGTCAACGGAGTATTACATGTCCAG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > REL606/1916133‑1916232 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTC > REL606/2034326‑2034422 CGAATGAGATTAATTTATCGCCATCGCGGCGTTATTTCATTCGGATTTCATGTTCAAGCAACACCTGGTTGTTTCAGTCAACGGAGTATTACATGTCCAGG < 2:1391381/101‑1 ATGAGATTAATTTATCGCCATCGCGGCGTTATTTCATTCGGATTTCATGTTCAAGCAACACCTGGTTGTTTCAGTCAACGGAGTATTACATGTCCAGGGTA > 2:270651/1‑101 GAGATTAATTTATCGCCATCGCGGCGTTATTTCATTCGGATTTCATGTTCAAGCAACACCTGGTTGTTTCAGTCAACGGAGTATTACATGTCCAGGGTAAT < 1:1284143/101‑1 AGATTAATTTATCGCCATCGCGGCGTTATTTCATTCGGATTTCATGTTCAAGCAACACCTGGTTGTTTCAGTCAACGGAGTATTACATGTCCAGGGTAATG < 2:223047/101‑1 AGATTAATTTATCGCCATCGCGGCGTTATTTCATTCGGATTTCATGTTCAAGCAACACCTGGTTGTTTCAGTCAACGGAGTATTACATGTCCAGGGTAATG < 1:737185/101‑1 ATTAATTTATCGCCATCGCGGCGTTATTTCATTCGGATTTCATGTTCAAGCAACACCTGGTTGTTTCAGTCAACGGAGTATTACATGTCCAGGGTAATGAC > 2:414037/1‑101 TTAATTTATCGCCATCGCGGCGTTATTTCATTCGGATTTCATGTTCAAGCAACACCTGGTTGTTTCAGTCAACGGAGTATTACATGTCCAGGGTAATGACT < 1:1362287/101‑1 ATTTATCGCCATCGCGGCGTTATTTCATTCGGATTTCATGTTCAAGCAACACCTGGTTGTTTCAGTCAACGGAGTATTACATGTCCAGGGTAATGACTCCA > 1:1685939/1‑101 ATTTATCGCCATCGCGGCGTTATTTCATTCGGATTTCATGTTCAAGCAACACCTGGTTGTTTCAGTCAACGGAGTATTACATGTCCAGGGTAATGACTCCA < 2:359175/101‑1 TATCGCCATCGCGGCGTTATTTCATTCGGATTTCATGTTCAAGCAACACCTGGTTGCTTCAGTCAACGGAGCATTACATGTCCAGGGTAATGACTCCAACT > 1:536063/1‑101 ATCGCCATCGCGGCGTTATTTCATTCGGATTTCATGTTCAAGCAACACCTGGTTGTTTCAGTCAACGGAGTATTACATGTCCAGGGTAATGACTCCAACTT < 1:1022995/101‑1 ATCGCCATCGCGGCGTTATTTCATTCGGATTTCATGTTCAAGCAACACCTGGTTGTTTCAGTCAACGGAGTATTACATGTCCAGGGTAATGACTCCAACTT < 1:683270/101‑1 CGCCATCGCGGCGTTATTTCATTCGGATTTCATGTTCAAGCAACACCTGGTTGTTTCAGTCAACGGAGTATTACATGTCCAGGGTAATGACTCCAACTTAT < 2:1360787/101‑1 CCATCGCGGCGTTATTTCATTCGGATTTCATGTTCAAGCAACACCTGGTTGTTTCAGTCAACGGAGTATTACATGTCCAGGGTAATGACTCCAACTTATTG > 2:1623402/1‑101 ATCGCGGCGTTATTTCATTCGGATTTCATGTTCAAGCAACACCTGGTTGTTTCAGTCAACGGAGTATTACATGTCCAGGGTAATGACTCCAACTTATTGAT < 1:1534517/101‑1 ATCGCGGCGTTATTTCATTCGGATTTCATGTTCAAGCAACACCTGGTTGTTTCAGTCAACGGAGTATTACATGTCCAGGGTAATGACTCCAACTTATTGAT > 1:1186948/1‑101 CGCGGCGTTATTTCATTCGGATTTCATGTTCAAGCAACACCTGGTTGTTTCAGTCAACGGAGTATTACATGTCCAGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAG > 2:357033/1‑101 CGGCGTTATTTCATTCGGATTTCATGTTCAAGCAACACCTGGTTGTTTCAGTCAACGGAGTATTACATGTCCAGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTG > 1:26921/1‑101 CGGCGTTATTTCATTCGGATTTCATGTTCAAGCAACACCTGGTTGTTTCAGTCAACGGAGTATTACATGTCCAGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTG < 2:1516975/101‑1 GGCGTTATTTCATTCGGATTTCATGTTCAAGCAACACCTGGTTGTTTCAGTCAACGGAGTATTACATGTCCAGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGT < 2:1505882/101‑1 GCGTTATTTCATTCGGATTTCATGTTCAAGCAACACCTGGTTGTTTCAGTCAACGGAGTATTACATGTCCAGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTT > 2:763482/1‑101 CGTTATTTCATTCGGATTTCATGTTCAAGCAACACCTGGTTGTTTCAGTCAACGGAGTATTACATGTCCAGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTT > 2:829603/1‑101 CGTTATTTCATTCGGATTTCATGTTCAAGCAACACCTGGTTGTTTCAGTCAACGGAGTATTACATGTCCAGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTT > 2:739787/1‑101 CGTTATTTCATTCGGATTTCATGTTCAAGCAACACCTGGTTGTTTCAGTCAACGGAGTATTACATGTCCAGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTT > 1:1685287/1‑101 TTATTTCATTCGGATTTCATGTTCAAGCAACACCTGGTTGTTTCAGTCAACGGAGTATTACATGTCCAGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTA > 2:127607/1‑101 TTATTTCATTCGGATTTCATGTTCAAGCAACACCTGGTTGTTTCAGTCAACGGAGTATTACATGTCCAGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTA > 1:921806/1‑101 TATTTCATTCGGATTTCATGTTCAAGCAACACCTGGTTGTTTCAGTCAACGGAGTATTACATGTCCAGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTAT > 2:526911/1‑101 TATTTCATTCGGATTTCATGTTCAAGCAACACCTGGTTGTTTCAGTCAACGGAGTATTACATGTCCAGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTAT > 2:760001/1‑101 TCATTCGGATTTCATGTTCAAGCAACACCTGGTTGTTTCAGTCAACGGAGTATTACATGTCCAGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTC < 1:815830/101‑1 ATTCGGATTTCATGTTCAAGCAACACCTGGTTGTTTCAGTCAACGGAGTATTACATGTCCAGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAG > 2:1025758/1‑101 GATTTCATGTTCAAGCAACACCTGGTTGTTTCAGTCAACGGAGTATTACATGTCCAGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAAT < 1:1576541/101‑1 GATTTCATGTTCAAGCAACACCTGGTTGTTTCAGTCAACGGAGTATTACATGTCCAGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAAT < 1:636817/101‑1 ATTTCATGTTCAAGCAACACCTGGTTGTTTCAGTCAACGGAGTATTACATGTCCAGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATG > 1:257494/1‑101 ATTTCATGCTCAAGCAACACCTGGTTGTTTCAGTCAACGGCGTATTACATGTCCAGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATG > 2:773256/1‑101 TTTCATGTTCAAGCAACACCTGGTTGTTTCAGTCAACGGAGTATTACATGTCCAGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGC < 1:1242181/101‑1 TTCATGTTCAAGCAACACCTGGTTGTTTCAGTCAACGGAGTATTACATGTCCAGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCC < 1:723178/101‑1 TCATGTTCAAGCAACACCTGGTTGTTTCAGTCAACGGAGTATTACATGTCCAGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCC < 2:1678336/101‑1 CATGTTCAAGCAACACCTGGTTGTTTCAGTCAACGGAGTATTACATGTCCAGGGTAATGACTCAAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCG > 1:1111833/1‑101 ATGTTCAAGCAACACCTGGTTGTTTCAGTCAACGGAGTATTACATGTCCAGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGA > 2:314396/1‑101 GTTCAAGCAACACCTGGTTGTTTCAGTCAACGGAGTATTACATGTCCAGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATG < 2:580460/101‑1 AGCAACACCTGGTTGTTTCAGTCAACGGAGTATTACATGTCCAGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTT < 2:1650767/101‑1 CAACACCTGGTTGTTTCAGTCAACGGAGTATTACATGTCCAGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGT > 2:678497/1‑101 AACACCTGGTTGTTTCAGTCAACGGAGTATTACATGTCCAGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTC < 1:1228140/101‑1 AACACCTGGTTGTTTCAGTCAACGGAGTATTACATGTCCAGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTC < 2:833152/101‑1 ACACCTGGTTGTTTCAGTCAACGGAGTATTACATGTCCAGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCA > 2:902363/1‑101 CACCTGGTTGTTTCAGTCAACGGAGTATTACATGTCCAGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCAT < 1:964343/101‑1 CACCTGGTTGTTTCAGTCAACGGAGTATTACATGTCCAGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATCCCCGATGACTTTGTCAT < 2:1685933/101‑1 CCTGGTTGTTTCAGTCAACGGAGTATTACATGTCCAGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGC > 2:238153/1‑101 CTGGTTGTTTCAGTCAACGGAGTATTACATGTCCAGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCA > 2:1221045/1‑101 TGGTTGTTTCAGTCAACGGAGTATTACATGTCCAGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAG < 2:956150/101‑1 GTTGTTTCAGTCAACGGAGTATTACATGTCCAGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCT > 1:23523/1‑101 AGTCAACGGAGTATTACATGTCCAGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGAT < 1:829608/101‑1 CAACGGAGTATTACATGTCCAGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTT > 2:463809/1‑101 AACGGAGTATTACATGTCCAGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTG > 1:777013/1‑101 CGGAGTATTACATGTCCAGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAG > 2:519648/1‑101 GAGTATTACATGTCCAGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAA > 1:501499/1‑101 GTATTACATGTCCAGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACG > 1:1570377/1‑101 GTATTACATGTCCAGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACG > 1:489643/1‑101 GTATTACATGTCCAGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACG > 1:1142037/1‑101 GTATTACATGTCCAGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACG > 1:742872/1‑101 GTATTACATGTCCAGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACG > 1:992493/1‑101 GTATTACATGGCCAGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCAGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACG > 2:1385870/1‑101 TATTACATGTCCAGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGA > 2:580596/1‑101 TTACATGTCCAGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACA < 1:357033/101‑1 TGTCCAGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGAC < 2:992488/101‑1 TGTCCAGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGAC > 1:1621110/1‑101 GTCCAGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACT > 2:1043576/1‑101 CCAGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTC < 1:739792/101‑1 CGAATGAGATTAATTTATCGCCATCGCGGCGTTATTTCATTCGGATTTCATGTTCAAGCAACACCTGGTTGTTTCAGTCAACGGAGTATTACATGTCCAG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > REL606/1916133‑1916232 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTC > REL606/2034326‑2034422 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |