Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
JC JC | REL606 | 2,522,900 | IS150 (–) +3 bp | coding (255‑257/2019 nt) | hyfB → | NADH dehydrogenase subunit N |
New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | REL606 | 2522900 = | 0 (0.000) | 72 (1.120) | 55/200 | 0.2 | 100% | coding (255/2019 nt) | hyfB | NADH dehydrogenase subunit N |
? | REL606 | 3651091 = | NA (NA) | noncoding (1/1443 nt) | IS150 | repeat region | |||||
* | ? | REL606 | = 2522902 | 0 (0.000) | 92 (1.430) | 65/200 | 0.0 | 100% | coding (257/2019 nt) | hyfB | NADH dehydrogenase subunit N |
? | REL606 | = 3894996 | NA (NA) | noncoding (1443/1443 nt) | IS150 | repeat region |
Only 100 of 165 total aligned reads displayed.
CAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTGCCACCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTGGTTATCTCCTTGCTGGTGGTGGTTTGTTCTCTCTATTCATTGACTTATATGCGCGAATACGAGGGCAAAGGCGCGGCGGCGATGGGCTTCTTTATGAA > REL606/2522802‑2523001 | cAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTGCCACCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCt > 1:270549/1‑101 (MQ=255) aaTTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTGCCACCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTt < 2:1284215‑M1/101‑2 (MQ=255) aaTTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTGCCACCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTt > 2:131468‑M1/1‑100 (MQ=255) aaTTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTGCCACCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTt > 1:100703‑M1/1‑100 (MQ=255) ttcacgacttcaaggcgcttttcaaaagggtattttggctttgacatattaggggctattccatttcatcgtccaacaaaatgggtgcagtacaGCTGGtt > 1:1161922‑M1/95‑101 (MQ=255) tACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTGCCACCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTtgta < 2:978225‑M1/101‑5 (MQ=255) tACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTGCCACCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTtgta > 2:477501‑M1/1‑97 (MQ=255) aCATGCTGGTGTACCTTTAGTCGCCCGTTTTGCCACCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTtgtac < 1:1260536‑M1/101‑6 (MQ=255) aCATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTGCCACCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTtgtac > 1:328648‑M1/1‑96 (MQ=255) acgacttcaaggcgcttttcaaaagggtattttggctttgacatattaggggctattccatttcatcgtccaacaaaatgggtgcagtacaGCTGGTTAtc > 2:554641‑M1/92‑101 (MQ=255) acgacttcaaggcgcttttcaaaagggaattttggctttgacatattaggggatattccatttcatcgtccaacaaaatgggtgcagaacaGCTGGTTAtc < 1:1233005‑M1/10‑1 (MQ=255) cgacttcaaggcgcttttcaaaagggtattttggctttgacatattaggggctattccatttcatcgtccaacaaaatgggtgcagtacaGCTGGTTAtct > 1:873684‑M1/91‑101 (MQ=255) gCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTGCCACCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTtgtactgac < 1:54132‑M1/101‑10 (MQ=255) gCTGGTCTAACTTTAGTCGCCCGTTTTGCCACCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTtgtactgac < 2:178149‑M1/101‑10 (MQ=255) tGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTGCCACCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTtgtactgaccc > 1:1137957‑M1/1‑90 (MQ=255) cttcgaggcgctgttcaaaagggaattttggctttgacatattaggggctattccttttcatcgtccaacaaaatgggggcagtacaGCTGGTTATCTCCt < 2:557136‑M1/14‑1 (MQ=255) cttcaaggcgcttttcaaaagggtattttggctttgacatattaggggctattccatttcatcgtccaacaaaatgggtgcagtacaGCTGGTTATCTCCt < 1:34426‑M1/14‑1 (MQ=255) tcaaggcgcttttcaaaagggtattttggctttgacatattaggggctattccatttcatcgtccaacaaaatgggtgcagtacaGCTGGTTATCTCCTTg < 2:347654‑M1/16‑1 (MQ=255) aaggcgcttttcaaaagggtattttggctttgacatattaggggctattccatttcatcgtccaacaaaatgggtgcagtacaGCTGGTTATCTCCTTGCt > 1:525617‑M1/84‑101 (MQ=255) aaCTTTAGTCGCCCGTTTTGCCACCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTtgtactgaccccaaaaa > 1:545946‑M1/1‑84 (MQ=255) ntttaGTCGCCCGTTTTGCCACCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTtgtactgacgccaaaaagt > 1:735645‑M1/2‑82 (MQ=255) cTTTAGTCGCCCGTTTTGCCACCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTtgtactgacagatcggaag > 2:1130861‑M1/1‑82 (MQ=255) cttttcaaaagggtattttggctttgacatattaggggctattccatttcatcgtccaacaaaatgggtgcagtacaGCTGGTTATCTCCTTGCtggtggt > 2:858141‑M1/78‑101 (MQ=255) cttttcaaaagggtattttggctttgacatattaggggctattccatttcatcgtccaacaaaatgggtgcagtacaGCTGGTTATCTCCTTGCtggtggt < 2:975137‑M1/24‑1 (MQ=255) ttttcaaaagggtattttggctttgacatattaggggctattccatttcatcgtccaacaaaatgggtgcagtacaGCTGGTTATCTCCTTGCtggtggtg > 1:434315‑M1/77‑101 (MQ=255) tAGTCGCCCGTTTTGCCACCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTtgtactgaccccaaaaagttgg < 2:278789‑M1/101‑23 (MQ=255) caaaagggtattttggctttgacatattaggggctattccatttcatcgtccaacaaaatgggtgcagtacaGCTGGTTATCTCCTTGCTGGTGGTGGttt > 1:491360‑M1/73‑101 (MQ=255) gCCCGTTTTGCCACCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTtgtactgaccccaaaaagttggacagt > 1:706427‑M1/1‑74 (MQ=255) aaaagggtattttggctttgacatattaggggctattccatttcatcgtccaacaaaatgggtgcagtacaGCTGGTTATCTCCTTGCTGGTGGTGGTTTg > 1:615972‑M1/72‑101 (MQ=255) gtattttggctttgacatattaggggctattccatttcatcgtccaacaaaatgggtgcagtacaGCTGGTTATCTCCTTGCTGGTGGTGGTTTGTtctct > 2:442259‑M1/66‑101 (MQ=255) ttGCCACCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTtgtactgaccccaaaaagttggacagttaaacac < 1:1113370‑M1/101‑35 (MQ=255) attttggctttgacatattaggggctattccatttcatcgtccaacaaaatgggtgcagtacaGCTGGTTATCTCCTTGCTGGTGGTGGTTTGTTctctct < 1:725284‑M1/38‑1 (MQ=255) attttggctttgacatattaggggctattccatttcatcgtccaacaaaatgggtgcagtacaGCTGGTTATCTCCTTGCTGGTGGTGGTTTGTTctctct < 1:1044829‑M1/38‑1 (MQ=255) attttggctttgacatattaggggctattccatttcatcgtccaacaaaatgggtgcagtacaGCTGGTTATCTCCTTGCTGGTGGTGGTTTGTTctctct < 2:1213579‑M1/38‑1 (MQ=255) ccACCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTtgtactgaccccaaaaagttggacagttaaacacgag > 2:806502‑M1/1‑64 (MQ=255) aCCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTtgtactgaccccaaaaagttggacagttaaacacgaggc > 2:1259295‑M1/1‑62 (MQ=255) ccccTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTtgtactgaccccaaaaagttggacagttaaacacgaggca < 1:878289‑M1/101‑41 (MQ=255) cTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCTAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTtgtactgtccccaaaaagttggacagttaaacacgaggcatat < 2:703751‑M1/101‑44 (MQ=255) tttGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTTTCGGCATTTATGGTGCTtgtactgaccccaaaaagttggacagttaaacacgaggcatatag < 1:982797‑M1/101‑46 (MQ=255) tttGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTtgtactgaccccaaaaagttggacagttaaacacgaggcatatag > 1:781891‑M1/1‑56 (MQ=255) gAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTtgtactgaccccaaaaagttggacagttaaacacgaggcatataggtc < 2:991740‑M1/101‑49 (MQ=255) gAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTtgtactgaccccaaaaagttggacagttaaacacgaggcatataggtc > 1:1192692‑M1/1‑53 (MQ=255) gAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTtgtactgaccccaaaaagttggacagttaaacacgaggcatataggtc < 2:1092526‑M1/101‑49 (MQ=255) atattaggggctattccatttcatcgtccaacaaaatgggtgcagtacaGCTGGTTATCTCCTTGCTGGTGGTTGTTTGTTCTCTCTATTCATTGACTtat < 2:645218‑M1/52‑1 (MQ=255) aaTTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTtgtactgaccccaaaaagttggacagttaaacacgaggcatataggtct < 2:1599929‑M1/101‑50 (MQ=255) aaTTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTtgtactgaccccaaaaagttggacagttaaacacgaggcatataggtct > 1:1352487‑M1/1‑52 (MQ=255) tattaggggctattccatttcatcgtccaacaaaatgggtgcagtacaGCTGGTTATCTCCTTGCTGGTGGTGGTTTGTTCTCTCTATTCATTGACTtata > 2:882151‑M1/49‑101 (MQ=255) tttGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTtgtactgaccccaaaaagttggacagttaaacacgaggcatataggtctga > 1:1595414‑M1/1‑50 (MQ=255) attaggggctattccatttcatcgtccaacaaaatgggtgcagtacaGCTGGTTATCTCCTTGCTGGTGGTGGTTTGTTCTCTCTATTCATTGACTTatat < 2:1053091‑M1/54‑1 (MQ=255) attaggggctattccatttcatcgtccaacaaaatgggtgcagtacaGCTGGTTATCTCCTTGCTGGTGGTGGTTTGTTCTCTCTATTCATTGACTTatat > 1:1716984‑M1/48‑101 (MQ=255) ttaggggctattccatttcatcgtccaacaaaatgggtgcagtacaGCTGGTTATCTCCTTGCTGGTGGTGGTTTGTTCTCTCTATTCATTGACTTATATg > 2:1014756‑M1/47‑101 (MQ=255) ttGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTtgtactgaccccaaaaagttggacagttaaacacgaggcatataggtctgat > 2:747675‑M1/1‑49 (MQ=255) taggggctattccatttcatcgtccaacaaaatgggtgcagtacaGCTGGTTATCTCCTTGCTGGTGGTGGTTTGTTCTCTCTATTCATTGACTTATATgc < 1:1685115‑M1/56‑1 (MQ=255) taggggctattccatttcatcgtccaacaaaatgggtgcagtacaGCTGGTTATCTCCTTGCTGGTGGTGGTTTGTTCTCTCTATTCATTGACTTATATgc > 2:1203799‑M1/46‑101 (MQ=255) gATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTtgtactgaccccaaaaagttggacagttaaacacgaggcatataggtctgattccga > 1:176394‑M1/1‑44 (MQ=255) ctattccatttcatcgtccaacaaaatgggtgcagtacaGCTGGTTATCTCCTTGCTGGTGGTGGTTTGTTCTCTCTATTCATTGACTTATATGCGCGAAt > 1:603352‑M1/40‑101 (MQ=255) ctattccatttcatcgtccaacaaaatgggtgcagtacaGCTGGTTATCTCCTTGCTGGTGGTGGTTTGTTCTCTCTATTCATTGACTTATATGCGCGAAt > 2:512625‑M1/40‑101 (MQ=255) ccatttcatcgtccaacaaaatgggtgcagtacaGCTGGTTATCTCCTTGCTGGTGGTGGTTTGTTCTCTCTATTCATTGACTTATATGCGCGAATACGAg > 1:347654‑M1/35‑101 (MQ=255) ccTGCGAATGGATAGCCTCTCGTCATTTATGGTGCTtgtactgaccccaaaaagttggacagttaaacacgaggcatataggtctgattccgatattcaat < 1:248443‑M1/101‑66 (MQ=255) ccTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTtgtactgaccccaaaaagttggacagttaaacacgaggcatataggtctgattccgatattcaat < 2:1156531‑M1/101‑66 (MQ=255) ccTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTtgtactgaccccaaaaagttggacagttaaacacgaggcatataggtctgattccgatattcaat < 2:278057‑M1/101‑66 (MQ=255) cTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTtgtactgaccccaaaaagttggccagttaaacacgaggcatataggtctgattccgatattcaatt < 2:168357‑M1/101‑67 (MQ=255) cTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTtgtactgaccccaaaaagttggacagttaaacacgaggcatataggtctgattccgatattcaatt < 1:518027‑M1/101‑67 (MQ=255) cTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTtgtactgaccccaaaaagttggacagttaaacacgaggcatataggtctgattccgatattcaatt > 2:1468364‑M1/1‑35 (MQ=255) tGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTtgtactgaccccaaaaagttggacagttaaactcgaggcatataggtctgattccgatattcaattg < 1:906422‑M1/101‑68 (MQ=255) gCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTtgtactgaccccaaaaagttggacagttaaacacgaggcatataggtctgattccgatattcaattgg < 1:1284853‑M1/101‑69 (MQ=255) tcatcgtccaacaaaatgggtgcagtacaGCTGGTTATCTCCTTGCTGGTGGTGGTTTGTTCTCTCTATTCATTGACTTATATGCGCGAATACGAGGGCaa < 1:1622658‑M1/72‑1 (MQ=255) gAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTtgtactgaccccaaaaagttggacagttaaacacgaggcatataggtctgattccgatattcaattggag > 2:1051451‑M1/1‑31 (MQ=255) catcgtccaacaaaatgggtgcagtacaGCTGGTTATCTCCTTGCTGGTGGTGGTTTGTTCTCTCTATTCATTGACTTATATGCGCGAATACGAGGGCaaa < 2:720731‑M1/73‑1 (MQ=255) atcgtccaacaaaatgggtgcagtacaGCTGGTTATCTCCTTGCTGGTGGTGGTTTGTTCTCTCTATTCATTGACTTATATGCGCGAATACGAGGGCAAAg < 1:1637609‑M1/74‑1 (MQ=255) atcgtccaacaaaatgggtgcagtacaGCTGGTTATCTCCTTGCTGGTGGTGGTTTGTTCTCTCTATTCATTGACTTATATGCGCGAATACGAGGGCAAAg < 2:221838‑M1/74‑1 (MQ=255) tGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTtgtactgaccccaaaaagttggacagttaaacacgaggcatataggtctgattccgatattcaattggagtca < 1:982700‑M1/101‑74 (MQ=255) ggATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTtgtactgaccccaaaaagttggacagttaaacacgaggcatataggtctgattccgatattcaattggagtcag < 1:1351114‑M1/101‑75 (MQ=255) gtaGTCTCTCGGCATTTATGGTGCTtgtactgaccccaaaaagttggacagttaaacacgaggcatatagggctgattccgatattcaattggagtcagac < 2:1387248‑M1/100‑77 (MQ=255) aTAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTtgtactgaccccaaaaagttggacagttaaacacgaggcatataggtctgattccgatattcaattggagtcagac > 2:667781‑M1/1‑25 (MQ=255) tAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTtgtactgaccccaaaaagttggacagttaaacacgaggcatataggtctgattccgatattcaattggagtcagact > 2:348455‑M1/1‑24 (MQ=255) tAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTtgtactgaccccaaaaagttggacagttaaacacgaggcatataggtctgattccgatattcaattggagtcagacc < 1:1525131‑M1/101‑78 (MQ=255) tAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTtgtactgaccccaaaaagttggacagttaaacacgaggcatataggtctgattccgatattcaattggagtcagacc < 1:1509515‑M1/101‑78 (MQ=255) tAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTtgtactgaccccaaaaagttggacagttaaacacgaggcatataggtctgattccgatattcaattggagtcagacc < 2:706422‑M1/101‑78 (MQ=255) tAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTtgtactgaccccaaaaagttggacagttaaacacgaggcatataggtctgattccgatattcaattggagtcagacc > 2:228061‑M1/1‑24 (MQ=255) aacaaaatgggtgcagtacaGCTGGTTATCTCCTTGCTGGTGGTGGTTTGTTCTCTCTATTCATTGACTTATATGCGCGAATACGAGGGCAAAGGCgcggc > 2:703231‑M1/21‑101 (MQ=255) acaaaatgggtgcagtacaGCTGGTTATCTCCTTGCTGGTGGTGGTTTGTTCTCTCTATTCATTGACTTATATGCGCGAATACGAGGGCAAAGGCgcggcg > 1:1394816‑M1/20‑101 (MQ=255) ctctCGGCATTTATGGTGCTtgtactgaccccaaaaagttggacagttaaacacgaggcatataggtctgattccgatattcaattggagtcagacctttt < 1:1602224‑M1/101‑82 (MQ=255) tctcGGCATTTATGGTGCTtgtactgaccccaaaaagttggacagttaaacacgaggcatataggtctgattccgatattcaattggagtcagacctttta > 1:516413‑M1/1‑19 (MQ=255) tcGGCATTTATGGTGCTtgtactgaccccaaaaagttggacagttaaacacgaggcatataggtctgattccgatattcaattggagtcagaccttttaat < 1:1088169‑M1/101‑85 (MQ=255) atgggtgcagtacaGCTGGTTATCTCCTTGCTGGTGGTGGTTTGTTCTCTCTATTCATTGACTTATATGCGCGAATACGAGGGCAAAGGCGCGGCGGCGAt > 2:906791‑M1/15‑101 (MQ=255) ggCATTTATGGTGCTtgtactgaccccaaaaagttggacagttaaacacgaggcatataggtctgattccgatattcaattggagtcagaccttttaattt < 2:735640‑M1/101‑87 (MQ=255) tttATGGTGCTtgtactgaccccaaaaagttggacagttaaacacgaggcatataggtctgattccgatattcaattggagtcagaccttttaatttcagg < 2:315263‑M1/101‑91 (MQ=255) gcagtacaGCTGGTTATCTCCTTGCTGGTGGTGGTTTGTTCTCTCTATTCATTGACTTATATGCGCGAATACGAGGGCAAAGGCGCGGCGGCGATGGGctt > 2:666300‑M1/9‑101 (MQ=255) ttATGGTGCTtgtactgaccccaaaaagttggacagttaaacacgaggcatataggtctgattccgatattcaattggagtcagaccttttaatttcaggc < 1:131468‑M1/101‑92 (MQ=255) cagtacaGCTGGTTATCTCCTTGCTGGTGGTGGTTTGTTCTCTCTATTCATTGACTTATATGCGCGAATACGAGGGCAAAGGCGCGGCGGCGATGGGcttc < 1:1133866‑M1/94‑1 (MQ=255) agtacaGCTGGTTATCTCCTTGCTGGTGGTGGTTTGTTCTCTCTATTCATTGACTTATATGCGCGAATACGAGGGCAAAGGCGCGGCGGCGATGGGcttct > 1:1226422‑M1/7‑101 (MQ=255) agtacaGCTGGTTATCTCCTTGCTGGTGGTGGTTTGTTCTCTCTATTCATTGACTTATATGCGCGAATACGAGGGCAAAGGCGCGGCGGCGATGGGcttct < 2:1462655‑M1/95‑1 (MQ=255) agtacaGCTGGTTATCTCCTTGCTGGTGGTGGTTTGTTCTCTCTATTCATTGACTTATATGCGCGAATACGAGGGCAAAGGCGCGGCGGCGATGGGcttct > 1:111261‑M1/7‑101 (MQ=255) gtacaGCTGGTTATCTCCTTGCTGGTGGTGGTTTGTTCTCTCTATTCATTGACTTATATGCGCGAATACGAGGGCAAAGGCGCGGCGGCGATGGGcttctt > 2:228801‑M1/6‑101 (MQ=255) aTGGTGCTtgtactgaccccaaaaagttggacagttaaacacgaggcatataggtctgattccgatattcaattggagtcagaccttttaatttcaggcta > 2:1178337‑M1/1‑8 (MQ=255) tacaGCTGGTTATCTCCTTGCTGGTGGTGGTTTGTTCTCTCTATTCATTGACTTATATGCGCGAATACGAGGGCAAAGGCGCGGCGGCGATGGGCTTCttt > 1:3606‑M1/5‑101 (MQ=255) tGCTtgtactgaccccaaaaagttggacagttaaacacgaggcatataggtctgattccgatattcaattggagtcagaccttttaatttcaggctaattc > 1:1552075‑M1/1‑4 (MQ=255) tGCTtgtactgaccccaaaaagttggacagttaaacacgaggcatataggtctgattccgatattcaattggagtcagaccttttaatttcaggctaattc > 1:288480‑M1/1‑4 (MQ=255) cTtgtactgaccccaaaaagttggacagttaaacacgaggcatataggtctgattccgatattcaattggagtcagaccttttaatttcaggctaattctt < 1:434480‑M1/101‑100 (MQ=255) | CAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTGCCACCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTGGTTATCTCCTTGCTGGTGGTGGTTTGTTCTCTCTATTCATTGACTTATATGCGCGAATACGAGGGCAAAGGCGCGGCGGCGATGGGCTTCTTTATGAA > REL606/2522802‑2523001 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 23 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |