Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
JC JC | REL606 | 2,522,900 | IS150 (–) +3 bp | coding (255‑257/2019 nt) | hyfB → | NADH dehydrogenase subunit N |
New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | REL606 | 2522900 = | 0 (0.000) | 72 (1.120) | 55/200 | 0.2 | 100% | coding (255/2019 nt) | hyfB | NADH dehydrogenase subunit N |
? | REL606 | 3651091 = | NA (NA) | noncoding (1/1443 nt) | IS150 | repeat region | |||||
* | ? | REL606 | = 2522902 | 0 (0.000) | 92 (1.430) | 65/200 | 0.0 | 100% | coding (257/2019 nt) | hyfB | NADH dehydrogenase subunit N |
? | REL606 | = 3894996 | NA (NA) | noncoding (1443/1443 nt) | IS150 | repeat region |
AATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTGCCACCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > REL606/2522803‑2522902 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TGTACTGACCCCAAAAAGTTGGACAGTTAAACACGAGGCATATAGGTCTGATTCCGATATTCAATTGGAGTCAGACCTTTTAATTTCAGGCTAATTCTT < REL606/3894996‑3894898 AATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTGCCACCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTT > 1:100703/1‑101 AATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTGCCACCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTT > 2:131468/1‑101 AATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTGCCACCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTT < 2:1284215/101‑1 ATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTGCCACCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTTG > 2:982695/1‑101 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GCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTGCCACCCCTTTTGAATGTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTTGTACTGAC < 1:1376329/101‑1 GCTGGTCTAACTTTAGTCGCCCGTTTTGCCACCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTTGTACTGAC < 2:178149/101‑1 TGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTGCCACCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTTGTACTGACCC > 1:1137957/1‑101 AACTTTAGTCGCCCGTTTTGCCACCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTTGTACTGACCCCAAAAA > 1:545946/1‑101 nTTTAGTCGCCCGTTTTGCCACCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTTGTACTGACGCCAAAAAGT > 1:735645/2‑101 CTTTAGTCGCCCGTTTTGCCACCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTTGTACTGACagatcggaag > 2:1130861/1‑91 TAGTCGCCCGTTTTGCCACCTCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTTGTGCTGACCCCAAAAAGTTGG < 2:233360/101‑1 TAGTCGCCCGTTTTGCCACCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTTGTACTGACCCCAAAAAGTTGG < 2:278789/101‑1 GCCCGTTTTGCCACCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTTGTACTGACCCCAAAAAGTTGGACAGT > 1:706427/1‑101 TTGCCACCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTTGTACTGACCCCAAAAAGTTGGACAGTTAAACAC < 1:1113370/101‑1 TTGCCACCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTTGTACTGACCCCAAAAAGTTGGACAGTTAAACAC < 2:1255746/101‑1 CCACCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTTGTACTGACCCCAAAAAGTTGGACAGTTAAACACGAG > 2:806502/1‑101 CACCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTTGTACTGACCCCAAAAAGTTGGACAGTTAAACACGAGG > 2:72359/1‑101 ACCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTTGTACTGACCCCAAAAAGTTGGACAGTTAAACAgcgaag < 2:292853/101‑7 ACCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTTGTACTGACCCCAAAAAGTTGGACAGTTAAACACGAGGC > 2:1259295/1‑101 CCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTTGTACTGACCCCAAAAAGTTGGACAGTTAAACACGAGGCA < 1:878289/101‑1 CCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTTGTACTGACCCCAAAAAGTTGGACAGTTAAACACGAGGCAT > 2:703292/1‑101 CCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTTGTACTGACCCCAAAAAGTTGGACAGTTAAACACGAGGCAT < 1:1566927/101‑1 CTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCTAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTTGTACTGTCCCCAAAAAGTTGGACAGTTAAACACGAGGCATAT < 2:703751/101‑1 TTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTTGTACTGACCCCAAAAAGTTGGACAGTTAAACACGAGGCATATA < 2:809666/101‑1 TTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTTTCGGCATTTATGGTGCTTGTACTGACCCCAAAAAGTTGGACAGTTAAACACGAGGCATATAG < 1:982797/101‑1 TTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTTGTACTGACCCCAAAAAGTTGGACAGTTAAACACGAGGCATATAG > 1:781891/1‑101 GAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTTGTACTGACCCCAAAAAGTTGGACAGTTAAACACGAGGCATATAGGTC < 2:991740/101‑1 GAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTTGTACTGACCCCAAAAAGTTGGACAGTTAAACACGAGGCATATAGGTC > 1:1192692/1‑101 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CCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTTGTACTGACCCCAAAAAGTTGGACAGTTAAACACGAGGCATATAGGTCTGATTCC < 1:1341724/101‑1 CGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTTGTACTGACCCCAAAAAGTTGGACAGTTAAACACGAGGCATATAGGTCTGATTCCG > 1:1637911/1‑101 GATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTTGTACTGACCCCAAAAAGTTGGACAGTTAAACACGAGGCATATAGGTCTGATTCCGA > 1:176394/1‑101 ACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTTGTACTGACCCCAAAAAGTTGGACAGTTAAACACGAGGCATATAGGTCTGATTCCGATATTCA < 1:303271/101‑1 CCTGCGAATGGATAGCCTCTCGTCATTTATGGTGCTTGTACTGACCCCAAAAAGTTGGACAGTTAAACACGAGGCATATAGGTCTGATTCCGATATTCAAT < 1:248443/101‑1 CCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTTGTACTGACCCCAAAAAGTTGGACAGTTAAACACGAGGCATATAGGTCTGATTCCGATATTCAAT < 2:278057/101‑1 CCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTTGTACTGACCCCAAAAAGTTGGACAGTTAAACACGAGGCATATAGGTCTGATTCCGATATTCAAT < 2:1156531/101‑1 CTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTTGTACTGACCCCAAAAAGTTGGCCAGTTAAACACGAGGCATATAGGTCTGATTCCGATATTCAATT < 2:168357/101‑1 CTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTTGTACTGACCCCAAAAAGTTGGACAGTTAAACACGAGGCATATAGGTCTGATTCCGATATTCAATT > 2:350711/1‑101 CTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTTGTACTGACCCCAAAAAGTTGGACAGTTAAACACGAGGCATATAGGTCTGATTCCGATATTCAATT < 1:1185079/101‑1 CTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTTGTACTGACCCCAAAAAGTTGGACAGTTAAACACGAGGCATATAGGTCTGATTCCGATATTCAATT > 2:1468364/1‑101 CTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTTGTACTGACCCCAAAAAGTTGGACAGTTAAACACGAGGCATATAGGTCTGATTCCGATATTCAATT < 1:518027/101‑1 TGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTTGTACTGACCCCAAAAAGTTGGACAGTTAAACTCGAGGCATATAGGTCTGATTCCGATATTCAATTG < 1:906422/101‑1 GCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTTGTACTGACCCCAAAAAGTTGGACAGTTAAACACGAGGCATATAGGTCTGATTCCGATATTCAATTGG < 1:1284853/101‑1 CGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTTGTACTGACCCCAAAAAGTTGGACAGTTAAACACGAGGCATATAGGTCTGATTCCGATATTCAATTGGA > 2:539643/1‑101 GAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTTGTACTGACCCCAAAAAGTTGGACAGTTAAACACGAGGCATATAGGTCTGATTCCGATATTCAATTGGAG > 2:1051451/1‑101 GAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTTGTACTGACCCCAAAAAGTTGGACAGTTAAACACGAGGCATATAGGTCTGATTCCGATATTCAATTGGAG > 2:1040689/1‑101 TGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTTGTACTGACCCCAAAAAGTTGGACAGTTAAACACGAGGCATATAGGTCTGATTCCGATATTCAATTGGAGTCA < 1:982700/101‑1 GGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTTGTACTGACCCCAAAAAGTTGGACAGTTAAACACGAGGCATATAGGTCTGATTCCGATATTCAATTGGAGTCAG < 1:1351114/101‑1 gTAGTCTCTCGGCATTTATGGTGCTTGTACTGACCCCAAAAAGTTGGACAGTTAAACACGAGGCATATAGGGCTGATTCCGATATTCAATTGGAGTCAGAC < 2:1387248/100‑1 ATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTTGTACTGACCCCAAAAAGTTGGACAGTTAAACACGAGGCATATAGGTCTGATTCCGATATTCAATTGGAGTCAGAC > 2:667781/1‑101 TAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTTGTACTGACCCCAAAAAGTTGGACAGTTAAACACGAGGCATATAGGTCTGATTCCGATATTCAATTGGAGTCAGACt > 2:348455/1‑100 TAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTTGTACTGACCCCAAAAAGTTGGACAGTTAAACACGAGGCATATAGGTCTGATTCCGATATTCAATTGGAGTCAGACC < 2:706422/101‑1 TAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTTGTACTGACCCCAAAAAGTTGGACAGTTAAACACGAGGCATATAGGTCTGATTCCGATATTCAATTGGAGTCAGACC < 1:1509515/101‑1 TAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTTGTACTGACCCCAAAAAGTTGGACAGTTAAACACGAGGCATATAGGTCTGATTCCGATATTCAATTGGAGTCAGACC < 1:1525131/101‑1 TAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTTGTACTGACCCCAAAAAGTTGGACAGTTAAACACGAGGCATATAGGTCTGATTCCGATATTCAATTGGAGTCAGACC > 2:228061/1‑101 CTCTCGGCATTTATGGTGCTTGTACTGACCCCAAAAAGTTGGACAGTTAAACACGAGGCATATAGGTCTGATTCCGATATTCAATTGGAGTCAGACCTTTT < 1:1602224/101‑1 CTCTCGGCATTTATGGTGCTTGTACTGACCCCAAAAAGTTGGACAGTTAAACACGAGGCATATAGGTCTGATTCCGATATTCAATTGGAGTCAGACCTTTT < 2:657036/101‑1 TCTCGGCATTTATGGTGCTTGTACTGACCCCAAAAAGTTGGACAGTTAAACACGAGGCATATAGGTCTGATTCCGATATTCAATTGGAGTCAGACCTTTTA > 1:516413/1‑101 TCGGCATTTATGGTGCTTGTACTGACCCCAAAAAGTTGGACAGTTAAACACGAGGCATATAGGTCTGATTCCGATATTCAATTGGAGTCAGACCTTTTAAT < 1:1088169/101‑1 CGGCATTTATGGTGCTTGTACTGACCCCAAAAAGTTGGACAGTTAAACACGAGGCATATAGGTCTGATTCCGATATTCAATTGGAGTCAGACCTTTTAATT > 2:1474840/1‑101 CGGCATTTATGGTGCTTGTACTGACCCCAAAAAGTTGGACAGTTAAACACGAGGCATATAGGTCTGATTCCGATATTCAATTGGAGTCAGACCTTTTAATT < 1:72359/101‑1 GGCATTTATGGTGCTTGTACTGACCCCAAAAAGTTGGACAGTTAAACACGAGGCATATAGGTCTGATTCCGATATTCAATTGGAGTCAGACCTTTTAATTT < 2:735640/101‑1 ATTTATGGTGCTTGTACTGACCCCAAAAAGTTGGACAGTTAAACACGAGGCATATAGGTCTGATTCCGATATTCAATTGGAGTCAGACCTTTTAATTTCAG < 1:508561/101‑1 ATTTATGGTGCTTGTACTGACCCCAAAAAGTTGGACAGTTAAACACGAGGCATATAGGTCTGATTCCGATATTCAATTGGAGTCAGACCTTTTAATTTCAG > 1:1231169/1‑101 TTTATGGTGCTTGTACTGACCCCAAAAAGTTGGACAGTTAAACACGAGGCATATAGGTCTGATTCCGATATTCAATTGGAGTCAGACCTTTTAATTTCAGG < 2:315263/101‑1 TTATGGTGCTTGTACTGACCCCAAAAAGTTGGACAGTTAAACACGAGGCATATAGGTCTGATTCCGATATTCAATTGGAGTCAGACCTTTTAATTTCAGGC < 1:131468/101‑1 TATGGTGCTTGTACTGACCCCAAAAAGTTGGACAGTTAAACACGAGGCATATAGGTCTGATTCCGATATTCAATTGGAGTCAGACCTTTTAATTTCAGGCT < 2:1467177/101‑1 TATGGTGCTTGTACTGACCCCAAAAAGTTGGACAGTTAAACACGAGGCATATAGGTCTGATTCCGATATTCAATTGGAGTCAGACCTTTTAATTTCAGGCT > 1:926859/1‑101 TATGGTGCTTGTACTGACCCCAAAAAGTTGGACAGTTAAACACGAGGCATATAGGTCTGATTCCGATATTCAATTGGAGTCAGACCTTTTAATTTCAGGCT > 1:554930/1‑101 TATGGTGCTTGTACTGACCCCAAAAAGTTGGACAGTTAAACACGAGGCATATAGGTCTGATTCCGATATTCAATTGGAGTCAGACCTTTTAATTTCAGGCT < 1:154721/101‑1 ATGGTGCTTGTACTGACCCCAAAAAGTTGGACAGTTAAACACGAGGCATATAGGTCTGATTCCGATATTCAATTGGAGTCAGACCTTTTAATTTCAGGCTA > 2:1178337/1‑101 ATGGTGCTTGTACTGACCCCAAAAAGTTGGACAGTTAAACACGAGGCATATAGGTCTGATTCCGATATTCAATTGGAGTCAGACCTTTTAATTTCAGGCTA > 1:471486/1‑101 TGCTTGTACTGACCCCAAAAAGTTGGACAGTTAAACACGAGGCATATAGGTCTGATTCCGATATTCAATTGGAGTCAGACCTTTTAATTTCAGGCTAATTC > 1:288480/1‑101 TGCTTGTACTGACCCCAAAAAGTTGGACAGTTAAACACGAGGCATATAGGTCTGATTCCGATATTCAATTGGAGTCAGACCTTTTAATTTCAGGCTAATTC > 1:1552075/1‑101 GCTTGTACTGACCCCAAAAAGTTGGACAGTTAAACACGAGGCATATAGGTCTGATTCCGATATTCAATTGGAGTCAGACCTTTTAATTTCAGGCTAATTCT < 2:1177413/101‑1 CTTGTACTGACCCCAAAAAGTTGGACAGTTAAACACGAGGCATATAGGTCTGATTCCGATATTCAATTGGAGTCAGACCTTTTAATTTCAGGCTAATTCTT < 1:1716232/101‑1 CTTGTACTGACCCCAAAAAGTTGGACAGTTAAACACGAGGCATATAGGTCTGATTCCGATATTCAATTGGAGTCAGACCTTTTAATTTCAGGCTAATTCTT < 1:434480/101‑1 AATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTGCCACCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > REL606/2522803‑2522902 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TGTACTGACCCCAAAAAGTTGGACAGTTAAACACGAGGCATATAGGTCTGATTCCGATATTCAATTGGAGTCAGACCTTTTAATTTCAGGCTAATTCTT < REL606/3894996‑3894898 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 23 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |