| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| MC JC | REL606 | 4,205,069 | Δ5 bp | 100% | coding (2311‑2315/3684 nt) | metH → | B12‑dependent methionine synthase |
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
| * | * | ÷ | REL606 | 4205069 | 4205073 | 5 | 127 [0] | [0] 127 | metH | B12‑dependent methionine synthase |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | REL606 | = 4205068 | 0 (0.000) | 95 (1.050) | 54/76 | NT | 100% | coding (2310/3684 nt) | metH | B12‑dependent methionine synthase |
| ? | REL606 | 4205074 = | 0 (0.000) | coding (2316/3684 nt) | metH | B12‑dependent methionine synthase | |||||
Only 100 of 127 total aligned reads displayed.
GGCGACGTCCACGACATCGGTAAAAATATCGTTGGTGTGGTGCTGCAATGTAACAACTACGAAATTGTCGATCTCGGCGTTATGGTGCCTGCGGAAAAAAT > REL606/4205024‑4205124 | tgaagggcgacgtccacgacatcggtaaaaatatcgttggtgtggtgctgt > 1:1561482‑M2/51‑51 (MQ=255)tgaagggcgacgtccacgacatcggtaaaaatatcgttggtgtggtgctgt < 1:6022572‑M2/1‑1 (MQ=255)tgaagggcgacgtccacgacatcggtaaaaatatcgttggtgtggtgctgt > 1:4636019‑M2/51‑51 (MQ=255) gaagggcgacgtccacgacatcggtaaaaatatcgttggtgtggtgctgTa > 1:5939149‑M2/50‑51 (MQ=255) gaagggcgacgtccacgacatcggtaaaaatatcgttggtgtggtgctgTa < 1:1962508‑M2/2‑1 (MQ=255) gaagggcgacgtccacgacatcggtaaaaatatcgttggtgtggtgctgTa > 1:5246396‑M2/50‑51 (MQ=255) aagggcgacgtccacgacatcggtaaaaatatcgttggtgtggtgctgTaa < 1:9352377‑M2/3‑1 (MQ=255) agggcgacgtccacgacatcggtaaaaatatcgttggtgtggtgctgTaac < 1:8713532‑M2/4‑1 (MQ=255) agggcgacgtccacgacatcggtaaaaatatcgttggtgtggtgctgTaac < 1:2588665‑M2/4‑1 (MQ=255) gggcgacgtccacgacatcggtaaaaatatcgttggtgtggtgctgTaaca > 1:3612646‑M2/47‑51 (MQ=255) ggcgacgtccacgacatcggtaaaaatatcgttggtgtggtgctgTaacaa < 1:8767842‑M2/6‑1 (MQ=255) gcgacgtccacgacatcggtaaaaatatcgttggtgtggtgctgTaacaac < 1:2374485‑M2/7‑1 (MQ=255) gcgacgtccacgacatcggtaaaaatatcgttggtgtggtgctgTaacaac < 1:10244921‑M2/7‑1 (MQ=255) gcgacgtccacgacatcggtaaaaatatcgttggtgtggtgctgTaacaac < 1:6716749‑M2/7‑1 (MQ=255) cgacgtccacgacatcggtaaaaatatcgttggtgtggtgctgTAACAACt < 1:6160930‑M2/8‑1 (MQ=255) cgacgtccacgacatcggtaaaaatatcgttggtgtggtgctgTAACAACt < 1:3429069‑M2/8‑1 (MQ=255) acgtccacgacatgggtaaaaatatcgttggtgtggtgctgt < 1:6374668‑M2/1‑1 (MQ=255) acgtccacgacatcggtaaaaatatcgttggtgtggtgctgTAACAACTAc > 1:1373335‑M2/42‑51 (MQ=255) acgtccacgacatcggtaaaaatatcgttggtgtggtgctgTAACAACTAc < 1:9549014‑M2/10‑1 (MQ=255) acgtccacgacatcggtaaaaatatcgttggtgtggtgctgTAACAACTAc < 1:10433784‑M2/10‑1 (MQ=255) acgtccacgacatcggtaaaaatatcgttggtgtggtgctgTAACAACTAc > 1:7698408‑M2/42‑51 (MQ=255) acgtccacgacatcggtaaaaatatcgttggtgtggtgctgTAACAACTAc < 1:10763439‑M2/10‑1 (MQ=255) acgtccacgacatcggtaaaaatatcgttggtgtggtgctgTAACAACTAc < 1:1501316‑M2/10‑1 (MQ=255) cgtccacgacatcggtaaaaatatcgttggtgtggtgctgTaa < 1:4236305‑M2/3‑1 (MQ=255) cgtccacgacatcggtaaaaatatcgttggtgtggtgctgTAACAACTACg > 1:486075‑M2/41‑51 (MQ=255) gtccacgacatcggtaaaaatatcgttggtgtggtgctgTTACAACTACGa > 1:6593047‑M2/40‑51 (MQ=255) gtccacgacatcggtaaaaatatcgttggtgtggtgctgTAACAACTACGa > 1:4553038‑M2/40‑51 (MQ=255) gtccacgacatcggtaaaaatatcgttggtgtggtgctgTAACAACTACGa < 1:6046052‑M2/12‑1 (MQ=255) tccacgacatcggtaaaaatatcgttggtgtggtgctgTAACAACTACGaa < 1:1335677‑M2/13‑1 (MQ=255) ccacgacatcggtaaaaatatcgttggtgtggtgctgTAACAACTACGaaa > 1:5215757‑M2/38‑51 (MQ=255) ccacgacatcggtaaaaatatcgttggtgtggtgctgTAACAACTACGaaa > 1:8545705‑M2/38‑51 (MQ=255) cacgacatcggtaaaaatatcgttggtgtggtgctgTAACAACTACGAAAt < 1:5810641‑M2/15‑1 (MQ=255) cacgacatcggtaaaaatatcgttggtgtggtgctgTAACAACTACGAAAt > 1:9104040‑M2/37‑51 (MQ=255) acgacatcggtaaaaatatcgttggtgtggtgctgTAACAACTACGAAAtt < 1:4739221‑M2/16‑1 (MQ=255) cgacatcggtaaaaatatcgttggtgtggtgctgTAACAACTACGAAATTg < 1:2649487‑M2/17‑1 (MQ=255) gacatcggtaaaaatatcgttggtgtggtgctgTAACAACTACGAAATTGt > 1:9659177‑M2/34‑51 (MQ=255) acatcggtaaaaatatcgttggtgtggtgctgTAACAACTACGAAATTGTc < 1:3093725‑M2/19‑1 (MQ=255) catcggtaaaaatatcgttggtgtggtgctgTAACAACTACGAAATTGTCg < 1:435042‑M2/20‑1 (MQ=255) catcggtaaaaatatcgttggtgtggtgctgTAACAACTACGAAATTGTCg < 1:8784907‑M2/20‑1 (MQ=255) atcggtaaaaatatcgttggtgtggtgctgTAACAACTACGAAATTGTCGa > 1:2518651‑M2/31‑51 (MQ=255) atcggtaaaaatatcgttggtgtggtgctgTAACAACTACGAAATTGTCGa > 1:2584785‑M2/31‑51 (MQ=255) tcggtaaaaatatcgttggtgtggtgctgTAACAACTACGAAATTGTCGAt > 1:198381‑M2/30‑51 (MQ=255) tcggtaaaaatatcgttggtgtggtgctgTAACAACTACGAAATTGTCGAt < 1:323279‑M2/22‑1 (MQ=255) ggtaaaaatatcgttggtgtggtgctgTAACAACTACGAAATTGTCGAtct > 1:1896616‑M2/28‑51 (MQ=255) ggtaaaaatatcgttggtgtggtgctgTAACAACTACGAAATTGTCGAtct > 1:4687148‑M2/28‑51 (MQ=255) gtaaaaatatcgttggtgtggtgctgTAACAACTACGAAATTGTCGAtctc < 1:9470378‑M2/25‑1 (MQ=255) gtaaaaatatcgttggtgtggtgctgTAACAACTACGAAATTGTCGAtctc > 1:6418414‑M2/27‑51 (MQ=255) gtaaaaatatcgttggtgtggtgctgTAACAACTACGAAATTGTCGAtctc > 1:2458588‑M2/27‑51 (MQ=255) taaaaatatcgttggtgtggtgctgTAACAACTACGAAATTGTCg > 1:753479‑M2/26‑45 (MQ=255) taaaaatatcgttggtgtggtgctgTAACAACTACGAAATTGTCg > 1:7946296‑M2/26‑45 (MQ=255) taaaaatatcgttggtgtggtgctgTAACAACTACGAAATTGTCg > 1:8381758‑M2/26‑45 (MQ=255) taaaaatatcgttggtgtggtgctgTAACAACTACGAAATTGTCGATCTCg < 1:6979705‑M2/26‑1 (MQ=255) taaaaatatcgttggtgtggtgctgTAACAACTACGAAATTGTCGATCTCg < 1:7012600‑M2/26‑1 (MQ=255) aaaaatatcgttggtgtggtgctgTAACAACTACGAAATTGTCGATCTCgg > 1:3676363‑M2/25‑51 (MQ=255) aaaaatatcgttggtgtggtgctgTAACAACTACGAAATTGTCGATCTCgg < 1:561602‑M2/27‑1 (MQ=255) aaaaatatcgttggtgtggtgctgTAACAACTACGAAATTGTCGATCTCgg < 1:4927100‑M2/27‑1 (MQ=255) aaaatatcgttggtgtggtgctgTAACAACTACGAAATTGTCGATCTCGGc < 1:8404645‑M2/28‑1 (MQ=255) aaatatcgttggtgtggtgctgTAACAACTACGAAATTGTCGATCTCGGCg > 1:3311502‑M2/23‑51 (MQ=255) aatatcgttggtgtggtgctgTAACAACTACGAAATTGTCGATCTCGGCGt > 1:6700715‑M2/22‑51 (MQ=255) tatcgttggtgtggtgctgTAACAACTACGAAATTGTCGATCTCGGCGTTa > 1:9169570‑M2/20‑51 (MQ=255) tatcgttggtgtggtgctgTAACAACTACGAAATTGTCGATCTCGGCGTTa < 1:8082548‑M2/32‑1 (MQ=255) atcgttggtgtggtgctgTAACAACTACGAAATTGTCGATCTCGGCGTTa < 1:9909290‑M2/32‑1 (MQ=255) tcgttggtgtggtgctgTAACAACTACGAAATTGTCGATCTCGGCGTTATg < 1:337530‑M2/34‑1 (MQ=255) cgttggtgtggtgctgTAACAACTACGAAATTGTCGATCTCGGCGTTATgg > 1:6443899‑M2/17‑51 (MQ=255) gttggtgtggtgctgTAACAACTACGAAATTGTCGATCTCGGCGTTATgg > 1:9222524‑M2/16‑50 (MQ=255) gttggtgtggtgctgTAACAACTACGAAATTGTCGATCTCGGCGTTATGGt > 1:9002870‑M2/16‑51 (MQ=255) gttggtgtggtgctgTAACAACTACGAAATTGTCGATCTCGGCGTTATGGt > 1:9406482‑M2/16‑51 (MQ=255) gttggtgtggtgctgTAACAACTACGAAATTGTCGATCTCGGCGTTATGGt < 1:9656696‑M2/36‑1 (MQ=255) ttggtgtggtgctgTAACAACTACGAAATTGTCGATCTCGGCGTTa > 1:333278‑M2/15‑46 (MQ=255) ttggtgtggtgctgTAACAACTACGAAATTGTCGATCTCGGCGTTATGGTg < 1:1028747‑M2/37‑1 (MQ=255) ttggtgtggtgctgTAACAACTACGAAATTGTCGATCTCGGCGTTATGGTg > 1:8887254‑M2/15‑51 (MQ=255) ttggtgtggtgctgTAACAACTACGAAATTGTCGATCTCGGCGTTATGGTg > 1:8396859‑M2/15‑51 (MQ=255) ggtgtggtgctgTAACAACTACGAAATTGTCGATCTCGGCGTTATGGTGcc > 1:1141004‑M2/13‑51 (MQ=255) ggtgtggtgctgTAACAACTACGAAATTGTCGATCTCGGCGTTATGGTGcc > 1:8299698‑M2/13‑51 (MQ=255) gtgtggtgctgTAACAACTACGAAATTGTCGATCTCGGCGTTATGGTGCCt < 1:5306763‑M2/40‑1 (MQ=255) gtgtggtgctgTAACAACTACGAAATTGTCGATCTCGGCGTTATGGTGCCt < 1:4441460‑M2/40‑1 (MQ=255) gtgtggtgctgTAACAACTACGAAATTGTCGATCTCGGCGTTATGGTGCCt > 1:6263258‑M2/12‑51 (MQ=255) tgtggtgctgTAACAACTACGAAATTGTCGATCTCGGCGTTATGGTGCCTg < 1:4117505‑M2/41‑1 (MQ=255) tgtggtgctgTAACAACTACGAAATTGTCGATCTCGGCGTTATGGTGCCTg < 1:10809980‑M2/41‑1 (MQ=255) tgtggtgctgTAACAACTACGAAATTGTCGATCTCGGCGTTATGGTGCCTg > 1:7493023‑M2/11‑51 (MQ=255) tgtggtgctgTAACAACTACGAAATTGTCGATCTCGGCGTTATGGTGCCTg < 1:7296591‑M2/41‑1 (MQ=255) tgtggtgctgTAACAACTACGAAATTGTCGATCTCGGCGTTATGGTGCCTg > 1:6232795‑M2/11‑51 (MQ=255) tgtggtgctgTAACAACTACGAAATTGTCGATCTCGGCGTTATGGTGCCTg > 1:1877426‑M2/11‑51 (MQ=255) gtggtgctgTAACAACTACGAAATTGTCGATCTCGGCGTTATGGTGCCTGc < 1:1179346‑M2/42‑1 (MQ=255) gtggtgctgTAACAACTACGAAATTGTCGATCTCGGCGTTATGGTGCCTGc > 1:2763003‑M2/10‑51 (MQ=255) gtggtgctgTAACAACTACGAAATTGTCGATCTCGGCGTTATGGTGCCTGc > 1:1696213‑M2/10‑51 (MQ=255) ggtgctgTAACAACTACGAAATTGTCGATCTCGGCGTTATGGTGCCTGCgg > 1:10385557‑M2/8‑51 (MQ=255) ggtgctgTAACAACTACGAAATTGTCGATCTCGGCGTTATGGTGCCTGCgg > 1:5533124‑M2/8‑51 (MQ=255) gtgctgTAACAACTACGAAATTGTCGATCTCGGCGTTATGGTGCCTGCGGa < 1:4553195‑M2/45‑1 (MQ=255) tgctgTAACAACTACGAAATTGTCGATCTCGGCGTTATGGTGCCTGCGGaa < 1:10120187‑M2/46‑1 (MQ=255) tgctgTAACAACTACGAAATTGTCGATCTCGGCGTTATGGTGCCTGCGGaa > 1:9528507‑M2/6‑51 (MQ=255) gctgTAACAACTACGAAATTGTCGATCTCGGCGTTATGGTGCCTGCGGaaa > 1:10170845‑M2/5‑51 (MQ=255) gctgTAACAACTACGAAATTGTCGATCTCGGCGTTATGGTGCCTGCGGaaa > 1:5991646‑M2/5‑51 (MQ=255) ctgTAACAACTACGAAATTGTCGATCTCGGCGTTATGGTGCCTGCGGaaa < 1:9157427‑M2/47‑1 (MQ=255) tgTAACAACTACGAAATTGTCGATCTCGGCGTTATGGTGCCTGCGGaaaaa < 1:4514334‑M2/49‑1 (MQ=255) gTAACAACTACGAAATTGTCGATCTCGGCGTTATGGTGCCTGCGGaaaaaa > 1:2513170‑M2/2‑51 (MQ=255) gTAACAACTACGAAATTGTCGATCTCGGCGTTATGGTGCCTGCGGaaaaaa < 1:5385309‑M2/50‑1 (MQ=255) gTAACAACTACGAAATTGTCGATCTCGGCGTTATGGTGCCTGCGGaaaaaa > 1:7291005‑M2/2‑51 (MQ=255) gTAACAACTACGAAATTGTCGATCTCGGCGTTATGGTGCCTGCGGaaaaaa < 1:312336‑M2/50‑1 (MQ=255) tAACAACTACGAAATTGTCGATCTCGGCGTTATGGTGCCTGCGGAAAAAAt < 1:4329636/51‑1 (MQ=255) | GGCGACGTCCACGACATCGGTAAAAATATCGTTGGTGTGGTGCTGCAATGTAACAACTACGAAATTGTCGATCTCGGCGTTATGGTGCCTGCGGAAAAAAT > REL606/4205024‑4205124 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |