| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| MC JC | REL606 | 4,205,069 | Δ5 bp | 100% | coding (2311‑2315/3684 nt) | metH → | B12‑dependent methionine synthase |
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
| * | * | ÷ | REL606 | 4205069 | 4205073 | 5 | 127 [0] | [0] 127 | metH | B12‑dependent methionine synthase |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | REL606 | = 4205068 | 0 (0.000) | 95 (1.050) | 54/76 | NT | 100% | coding (2310/3684 nt) | metH | B12‑dependent methionine synthase |
| ? | REL606 | 4205074 = | 0 (0.000) | coding (2316/3684 nt) | metH | B12‑dependent methionine synthase | |||||
Only 100 of 128 total aligned reads displayed.
CGTGAAGGGCGACGTCCACGACATCGGTAAAAATATCGTTGGTGTGGTGCTG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > REL606/4205017‑4205068‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑tgTAACAACTACGAAATTGTCGATCTCGGCGTTATGGTGCCTGCGGAAAAAA > REL606/4205074‑4205123 CGTGAAGGGCGACGTCCACGACATCGGTAAAAATATCGTTGGTGTGGTGCT > 1:7092011/1‑51 GTGAAGGGCGACGTCCACGACATCGGTAAAAATATCGTTGGTGTGGTGCTG < 1:9005641/51‑1 TGAAGGGCGACGTCCACGACATCGGTAAAAATATCGTTGGTGTGGTGCTGT > 1:1561482/1‑51 TGAAGGGCGACGTCCACGACATCGGTAAAAATATCGTTGGTGTGGTGCTGT < 1:6022572/51‑1 GAAGGGCGACGTCCACGACATCGGTAAAAATATCGTTGGTGTGGTGCTGTA < 1:762320/51‑1 GAAGGGCGACGTCCACGACATCGGTAAAAATATCGTTGGTGTGGTGCTGTA < 1:1962508/51‑1 GAAGGGCGACGTCCACGACATCGGTAAAAATATCGTTGGTGTGGTGCTGTA > 1:5246396/1‑51 GAAGGGCGACGTCCACGACATCGGTAAAAATATCGTTGGTGTGGTGCTGTA > 1:5939149/1‑51 AAGGGCGACGTCCACGACATCGGTAAAAATATCGTTGGTGTGGTGCTGTAA < 1:9352377/51‑1 AGGGCGACGTCCACGACATCGGTAAAAATATCGTTGGTGTGGTGCTGTAAC < 1:2588665/51‑1 GGGCGACGTCCACGACATCGGTAAAAATATCGTTGGTGTGGTGCTGTAACA > 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |