| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| MC JC | REL606 | 4,205,069 | Δ5 bp | 100% | coding (2311‑2315/3684 nt) | metH → | B12‑dependent methionine synthase |
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
| * | * | ÷ | REL606 | 4205069 | 4205073 | 5 | 127 [0] | [0] 127 | metH | B12‑dependent methionine synthase |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | REL606 | = 4205068 | 0 (0.000) | 95 (1.050) | 54/76 | NT | 100% | coding (2310/3684 nt) | metH | B12‑dependent methionine synthase |
| ? | REL606 | 4205074 = | 0 (0.000) | coding (2316/3684 nt) | metH | B12‑dependent methionine synthase | |||||
Only 100 of 127 total aligned reads displayed.
GTGAAGGGCGACGTCCACGACATCGGTAAAAATATCGTTGGTGTGGTGCTGCAATGTAACAACTACGAAATTGTCGATCTCGGCGTTATGGTGCCTGCGGA > REL606/4205018‑4205118 | gTGAAGGGCGACGTCCACGACATCGGTAAAAATATCGTTGGTGTGGTGCTG < 1:9005641‑M1/51‑1 (MQ=255)gTGAAGGGCGACGTCCACGACATCGGTAAAAATATCGTTGGTGTGGTGCTG > 1:604‑M1/1‑51 (MQ=255) tGAAGGGCGACGTCCACGACATCGGTAAAAATATCGTTGGTGTGGTGCTGt > 1:1561482‑M1/1‑50 (MQ=255) tGAAGGGCGACGTCCACGACATCGGTAAAAATATCGTTGGTGTGGTGCTGt > 1:4636019‑M1/1‑50 (MQ=255) tGAAGGGCGACGTCCACGACATCGGTAAAAATATCGTTGGTGTGGTGCTGt < 1:6022572‑M1/51‑2 (MQ=255) gAAGGGCGACGTCCACGACATCGGTAAAAATATCGTTGGTGTGGTGCTGta < 1:762320‑M1/51‑3 (MQ=255) gAAGGGCGACGTCCACGACATCGGTAAAAATATCGTTGGTGTGGTGCTGta < 1:1962508‑M1/51‑3 (MQ=255) gAAGGGCGACGTCCACGACATCGGTAAAAATATCGTTGGTGTGGTGCTGta > 1:5246396‑M1/1‑49 (MQ=255) aaGGGCGACGTCCACGACATCGGTAAAAATATCGTTGGTGTGGTGCTGtaa < 1:9352377‑M1/51‑4 (MQ=255) aGGGCGACGTCCACGACATCGGTAAAAATATCGTTGGTGTGGTGCTGtaac < 1:2588665‑M1/51‑5 (MQ=255) aGGGCGACGTCCACGACATCGGTAAAAATATCGTTGGTGTGGTGCTGtaac < 1:8713532‑M1/51‑5 (MQ=255) gggCGACGTCCACGACATCGGTAAAAATATCGTTGGTGTGGTGCTGtaaca > 1:3612646‑M1/1‑46 (MQ=255) ggCGACGTCCACGACATCGGTAAAAATATCGTTGGTGTGGTGCTGtaacaa < 1:8767842‑M1/51‑7 (MQ=255) ggCGACGTCCACGACATCGGTAAAAATATCGTTGGTGTGGTGCTGtaacaa < 1:5903713‑M1/51‑7 (MQ=255) gCGACGTCCACGACATCGGTAAAAATATCGTTGGTGTGGTGCTGtaacaac < 1:6716749‑M1/51‑8 (MQ=255) gCGACGTCCACGACATCGGTAAAAATATCGTTGGTGTGGTGCTGtaacaac < 1:10244921‑M1/51‑8 (MQ=255) gCGACGTCCACGACATCGGTAAAAATATCGTTGGTGTGGTGCTGtaacaac < 1:2374485‑M1/51‑8 (MQ=255) cGACGTCCACGACATCGGTAAAAATATCGTTGGTGTGGTGCTGtaacaact < 1:3429069‑M1/51‑9 (MQ=255) cGACGTCCACGACATCGGTAAAAATATCGTTGGTGTGGTGCTGtaacaact < 1:6160930‑M1/51‑9 (MQ=255) gACGTCCACGACATCGGTAAAAATATCGTTGGTGTGGTGCTGtaacaacta > 1:8456038‑M1/1‑42 (MQ=255) aCGTCCACGACATGGGTAAAAATATCGTTGGTGTGGTGCTGt < 1:6374668‑M1/42‑2 (MQ=255) aCGTCCACGACATCGGTAAAAATATCGTTGGTGTGGTGCTGtaacaactac < 1:10763439‑M1/51‑11 (MQ=255) aCGTCCACGACATCGGTAAAAATATCGTTGGTGTGGTGCTGtaacaactac > 1:1373335‑M1/1‑41 (MQ=255) 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aaaaTATCGTTGGTGTGGTGCTGtaacaactacgaaattgtcgatctcggc < 1:4985300‑M1/51‑29 (MQ=255) aaaTATCGTTGGTGTGGTGCTGtaacaactacgaaattgtcgatctcggcg > 1:3311502‑M1/1‑22 (MQ=255) atatCGTTGGTGTGGTGCTGtaacaactacgaaattgtcgatctcggcgtt < 1:4444899‑M1/51‑32 (MQ=255) tatCGTTGGTGTGGTGCTGtaacaactacgaaattgtcgatctcggcgtta < 1:8082548‑M1/51‑33 (MQ=255) tatCGTTGGTGTGGTGCTGtaacaactacgaaattgtcgatctcggcgtta > 1:9169570‑M1/1‑19 (MQ=255) atCGTTGGTGTGGTGCTGtaacaactacgaaattgtcgatctcggcgtta < 1:9909290‑M1/50‑33 (MQ=255) tCGTTGGTGTGGTGCTGtaacaactacgaaattgtcgatctcggcgttatg < 1:337530‑M1/51‑35 (MQ=255) cGTTGGTGTGGTGCTGtaacaactacgaaattgtcgatctcggcgttatgg > 1:4683197‑M1/1‑16 (MQ=255) cGTTGGTGTGGTGCTGtaacaactacgaaattgtcgatctcggcgttatgg > 1:6443899‑M1/1‑16 (MQ=255) gTTGGTGTGGTGCTGtaacaactacgaaattgtcgatctcggcgttatggt > 1:9002870‑M1/1‑15 (MQ=255) gTTGGTGTGGTGCTGtaacaactacgaaattgtcgatctcggcgttatggt > 1:9406482‑M1/1‑15 (MQ=255) gTTGGTGTGGTGCTGtaacaactacgaaattgtcgatctcggcgttatggt < 1:9656696‑M1/51‑37 (MQ=255) gTTGGTGTGGTGCTGtaacaactacgaaattgtcgatctcggcgttatgg > 1:9222524‑M1/1‑15 (MQ=255) ttGGTGTGGTGCTGtaacaactacgaaattgtcgatctcggcgttatggtg > 1:8396859‑M1/1‑14 (MQ=255) ttGGTGTGGTGCTGtaacaactacgaaattgtcgatctcggcgttatggtg < 1:1028747‑M1/51‑38 (MQ=255) ttGGTGTGGTGCTGtaacaactacgaaattgtcgatctcggcgtta > 1:333278‑M1/1‑14 (MQ=255) tggtgtggtgCTGtaacaactacgaaattgtcgatctcggcgttatggtgc > 1:7053918‑M1/1‑13 (MQ=255) ggtgtggtgCTGtaacaactacgaaattgtcgatctcggcgttatggtgcc > 1:1141004‑M1/1‑12 (MQ=255) gtgtggtgCTGtaacaactacgaaattgtcgatctcggcgttatggtgcct < 1:5306763‑M1/51‑41 (MQ=255) gtgtggtgCTGtaacaactacgaaattgtcgatctcggcgttatggtgcct < 1:4441460‑M1/51‑41 (MQ=255) gtgtggtgCTGtaacaactacgaaattgtcgatctcggcgttatggtgcct > 1:6263258‑M1/1‑11 (MQ=255) tgtggtgCTGtaacaactacgaaattgtcgatctcggcgttatggtgcctg < 1:7296591‑M1/51‑42 (MQ=255) tgtggtgCTGtaacaactacgaaattgtcgatctcggcgttatggtgcctg > 1:6232795‑M1/1‑10 (MQ=255) tgtggtgCTGtaacaactacgaaattgtcgatctcggcgttatggtgcctg < 1:10809980‑M1/51‑42 (MQ=255) tgtggtgCTGtaacaactacgaaattgtcgatctcggcgttatggtgcctg < 1:4117505‑M1/51‑42 (MQ=255) tgtggtgCTGtaacaactacgaaattgtcgatctcggcgttatggtgcctg > 1:7493023‑M1/1‑10 (MQ=255) tgtggtgCTGtaacaactacgaaattgtcgatctcggcgttatggtgcctg > 1:1877426‑M1/1‑10 (MQ=255) gtggtgCTGtaacaactacgaaattgtcgatctcggcgttatggtgcctgc < 1:1179346‑M1/51‑43 (MQ=255) gtggtgCTGtaacaactacgaaattgtcgatctcggcgttatggtgcctgc > 1:1696213‑M1/1‑9 (MQ=255) gtggtgCTGtaacaactacgaaattgtcgatctcggcgttatggtgcctgc > 1:2763003‑M1/1‑9 (MQ=255) tggtgCTGtaacaactacgaaattgtcgatctcggcgttatggtgcctgcg < 1:8171119‑M1/51‑44 (MQ=255) ggtgCTGtaacaactacgaaattgtcgatctcggcgttatggtgcctgcgg > 1:10385557‑M1/1‑7 (MQ=255) ggtgCTGtaacaactacgaaattgtcgatctcggcgttatggtgcctgcgg > 1:5533124‑M1/1‑7 (MQ=255) gtgCTGtaacaactacgaaattgtcgatctcggcgttatggtgcctgcgga < 1:4553195‑M1/51‑46 (MQ=255) tgCTGtaacaactacgaaattgtcgatctcggcgttatggtgcctgcggaa < 1:10120187‑M1/51‑47 (MQ=255) tgCTGtaacaactacgaaattgtcgatctcggcgttatggtgcctgcggaa > 1:9528507‑M1/1‑5 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |