| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| JC JC | REL606 | 4,092,861 | IS150 (+) +3 bp | 100% | coding (87‑89/429 nt) | yiiT → | stress‑induced protein |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | REL606 | 3893554 = | NA (NA) | 96 (1.070) | 55/76 | NT | 100% | noncoding (1/1443 nt) | IS150 | repeat region |
| ? | REL606 | = 4092863 | 0 (0.000) | coding (89/429 nt) | yiiT | stress‑induced protein | |||||
| * | ? | REL606 | = 3894996 | NA (NA) | 90 (1.030) | 53/74 | NT | 100% | noncoding (1443/1443 nt) | IS150 | repeat region |
| ? | REL606 | 4092861 = | 0 (0.000) | coding (87/429 nt) | yiiT | stress‑induced protein | |||||
Only 100 of 264 total aligned reads displayed.
AATGAAGAAGATGCCTTACTGGTGAATAAAGCCCTGGAGCTCGCCAGACATAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGATGATGGCTTAAGCGAGTT > REL606/4092811‑4092911 | aaTGAAGAAGATGCCTTACTGGTGAATAAAGCCCTGGAGCTCGCCAGACAt < 1:8434460/51‑1 (MQ=255) aTGAAGAAGATGCCTTACTGGTGAATAAAGCCCTGGAGCTCGCCAGACATa < 1:7282465/51‑1 (MQ=255) tGAAGAAGATGCCTTACTGGTGAATAAAGCCCTGGAGCTCGCCAGACATaa > 1:6912767/1‑51 (MQ=255) tGAAGAAGATGCCTTACTGGTGAATAAAGCCCTGGAGCTCGCCAGACATaa < 1:9732405/51‑1 (MQ=255) tGAAGAAGATGCCTTACTGGTGAATAAAGCCCTGGAGCTCGCCAGACATaa > 1:502957/1‑51 (MQ=255) tGAAGAAGATGCCTTACTGGTGAATAAAGCCCTGGAGCTCGCCAGACATaa < 1:8505077/51‑1 (MQ=255) gacctatatgcctcgtgtttaactgtccaactttttggggtcagtacaTaa < 1:5280168‑M2/3‑1 (MQ=255) gacctatatgcctcgtgtttaactgtccaactttttggggtcagtacaTaa < 1:9176520‑M2/3‑1 (MQ=255) acctatatgcctcgtgtttaactgtccaactttttggggtcagtacaTAAt < 1:5529143‑M2/4‑1 (MQ=255) cctatatgcctcgtgtttaactgtccaactttttggggtcagtacaTAATg > 1:4302654‑M2/47‑51 (MQ=255) agaagaTGCCTTACTGGTGAATAAAGCCCTGGAGCTCGCCAGACATAAtgt < 1:6508643‑M2/51‑4 (MQ=255) agaagaTGCCTTACTGGTGAATAAAGCCCTGGAGCTCGCCAGACATAAtgt > 1:9024147‑M2/1‑48 (MQ=255) gaagaTGCCTTACTGGTGAATAAAGCCCTGGAGCTCGCCAGACATAAtgta > 1:1751498‑M2/1‑47 (MQ=255) atatgcctcgtgtttaactgtccaactttttggggtcagtacaTAATGACg < 1:8303196‑M2/8‑1 (MQ=255) atatgcctcgtgtttaactgtccaactttttggggtcagtacaTAATGACg < 1:6431661‑M2/8‑1 (MQ=255) tatgcctcgtgtttaactgtccaactttttggggtcagtacaTAATGACGc > 1:2036150‑M2/43‑51 (MQ=255) agaTGCCTTACTGGTGAATAAAGCCCTGGAGCTCGCCAGACATAAtgtact > 1:6632078‑M2/1‑45 (MQ=255) gaTGCCTTACTGGTGAATAAAGCCCTGGAGCTCGCCAGACATAAtgtactg > 1:3382930‑M2/1‑44 (MQ=255) atgcctcgtgtttaactgtccaactttttggggtcagtacaTAATGACGCt < 1:6754763‑M2/10‑1 (MQ=255) atgcctcgtgtttaactgtccaactttttggggtcagtacaTAATGACGCt > 1:2978638‑M2/42‑51 (MQ=255) tgcctcgtgtttaactgtccaactttttggggtcagtacaTAATGACGCTc > 1:3825693‑M2/41‑51 (MQ=255) tgcctcgtgtttaactgtccaactttttggggtcagtacaTAATGACGCTc > 1:10329019‑M2/41‑51 (MQ=255) ccTTACTGGTGAATAAAGCCCTGGAGCTCGCCAGACATAAtgtactgcacc < 1:4048260‑M2/51‑12 (MQ=255) ccTTACTGGTGAATAAAGCCCTGGAGCTCGCCAGACATAAtgtactgcacc < 1:5738474‑M2/51‑12 (MQ=255) tACTGGTGAATAAAGCCCTGGAGCTCGCCAGACATAAtgtactgcacccat < 1:7421379‑M2/51‑15 (MQ=255) tACTGGTGAATAAAGCCCTGGAGCTCGCCAGACATAAtgtactgcacccat < 1:3184874‑M2/51‑15 (MQ=255) gtttaactgtccaactttttggggtcagtacaTAATGACGCTCACCTGACg > 1:3078687‑M2/33‑51 (MQ=255) cTGGTGAATAAAGCCCTGGAGCTCGCCAGACATAAtgtactgcacccattt > 1:3298499‑M2/1‑35 (MQ=255) tttaactgtccaactttttggggtcagtacaTAATGACGCTCACCTGACGt > 1:9569814‑M2/32‑51 (MQ=255) tGGTGAATAAAGCCCTGGAGCTCGCCAGACATAAtgtactgcacccatttt > 1:8591284‑M2/1‑34 (MQ=255) tGGTGAATAAAGCCCTGGAGCTCGCCAGACATAAtgtactgcacccatttt > 1:7445092‑M2/1‑34 (MQ=255) ttaactgtccaactttttggggtcagtacaTAATGACGCTCACCTg < 1:7744183‑M2/16‑1 (MQ=255) ttaactgtccaactttttggggtcagtacaTAATGACGCTCACCTGACGtt > 1:2226194‑M2/31‑51 (MQ=255) ttaactgtccaactttttggggtcagtacaTAATGACGCTCACCTGACGtt > 1:8393629‑M2/31‑51 (MQ=255) ttaactgtccaactttttggggtcagtacaTAATGACGCTCACCTGACGtt > 1:10136528‑M2/31‑51 (MQ=255) ggTGAATAAAGCCCTGGAGCTCGCCAGACATAAtgtactgcacccattttg < 1:4678614‑M2/51‑19 (MQ=255) taactgtccaactttttggggtcagtacaTAATGACGCTCACCTGACGTTa > 1:2845861‑M2/30‑51 (MQ=255) taactgtccaactttttggggtcagtacaTAATGACGCTCACCTGACGTTa > 1:9441944‑M2/30‑51 (MQ=255) tGAATAAAGCCCTGGAGCTCGCCAGACATAAtgtactgcacccattttgtt > 1:2444182‑M2/1‑31 (MQ=255) tGAATAAAGCCCTGGAGCTCGCCAGACATAAtgtactgcacccattttgtt < 1:8721861‑M2/51‑21 (MQ=255) atctgtccaactttttggggtcagtacaTAATGACGCTCACCTGACGTTaa > 1:10822284‑M2/29‑51 (MQ=255) aactgtccaactttttggggtcagtacaTAATGACGCTCACCTGACGTTaa > 1:2378057‑M2/29‑51 (MQ=255) actgtccaactttttggggtcagtacaTAATGACGCTCACCTGACGTTAAt > 1:1492060‑M2/28‑51 (MQ=255) actgtccaactttttggggtcagtacaTAATGACGCTCACCTGACGTTAAt < 1:7022249‑M2/24‑1 (MQ=255) actgtccaactttttggggtcagtacaTAATGACGCTCACCTGACGTTAAt < 1:1821937‑M2/24‑1 (MQ=255) tgtccaactttttggggtcagtacaTAATGACGCTCACCTGACGTTAATTc > 1:1373213‑M2/26‑51 (MQ=255) tgtccaactttttggggtcagtacaTAATGACGCTCACCTGACGTTAATTc < 1:4125308‑M2/26‑1 (MQ=255) aTAAAGCCCTGGAGCTCGCCAGACATAAtgtactgcacccattttgttgga < 1:10556268‑M2/51‑24 (MQ=255) tAAAGCCCTGGAGCTCGCCAGACATAAtgtactgcacccattttgttggac > 1:10745303‑M2/1‑27 (MQ=255) tAAAGCCCTGGAGCTCGCCAGACATAAtgtactgcacccattttgttggac > 1:2024762‑M2/1‑27 (MQ=255) gtccaactttttggggtcagtacaTAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCa > 1:5802123‑M2/25‑51 (MQ=255) aaaGCCCTGGAGCTCGCCAGACATAAtgtactgcacccattttgttggacg > 1:8143475‑M2/1‑26 (MQ=255) aaaGCCCTGGAGCTCGCCAGACATAAtgtactgcacccattttgttggacg > 1:10394451‑M2/1‑26 (MQ=255) aaaGCCCTGGAGCTCGCCAGACATAAtgtactgcacccattttgttggacg < 1:3580051‑M2/51‑26 (MQ=255) ccaactttttggggtcagtacaTAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCata < 1:4161080‑M2/29‑1 (MQ=255) aactttttggggtcagtacaTAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATAtt > 1:6340898‑M2/21‑51 (MQ=255) aactttttggggtcagtacaTAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATAtt < 1:2576096‑M2/31‑1 (MQ=255) ccTGGAGCTCGCCAGACATAAtgtactgcacccattttgttggacgatgaa > 1:2819069‑M2/1‑21 (MQ=255) ccTGGAGCTCGCCAGACATAAtgtactgcacccattttgttggacgatgaa < 1:7844894‑M2/51‑31 (MQ=255) tttttggggtcagtacaTAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATtgat < 1:4600926‑M2/34‑1 (MQ=255) tttttggggtcagtacaTAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATtgat > 1:6320054‑M2/18‑51 (MQ=255) ttttggggtcagtacaTAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATtgatg > 1:5662157‑M2/17‑51 (MQ=255) tGGAGCTCGCCAGACATAAtgtactgcacccattttgttggacgatgaaat > 1:3490963‑M2/1‑19 (MQ=255) tGGAGCTCGCCAGACATAAtgtactgcacccattttgttggacgatgaaat > 1:6164605‑M2/1‑19 (MQ=255) tttggggtcagtacaTAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATtgatga > 1:5715580‑M2/16‑51 (MQ=255) tttggggtcagtacaTAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATtgatga < 1:10591460‑M2/36‑1 (MQ=255) ttggggtcagtacaTAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTgatgat > 1:5994739‑M2/15‑51 (MQ=255) ttggggtcagtacaTAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTgatgat < 1:1267096‑M2/37‑1 (MQ=255) tggggtcagtacaTAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGatgatg < 1:10118855‑M2/38‑1 (MQ=255) tggggtcagtacaTAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGatgatg > 1:3675301‑M2/14‑51 (MQ=255) ggggtcagtacaTAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGATGATgg < 1:20795‑M2/39‑1 (MQ=255) gggccagtacaTAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGATGATGGc > 1:611621‑M2/12‑51 (MQ=255) cTCGCCAGACATAAtgtactgcacccattttgttggacgatgaaatggaat > 1:10871907‑M2/1‑14 (MQ=255) tCGCCAGACATAAtgtactgcacccattttgttggacgatgaaatggaata < 1:8257849‑M2/51‑39 (MQ=255) ggtcagtacaTAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGATGATGGCt > 1:7638999‑M2/11‑51 (MQ=255) tcagtacaTAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGATGATGGCTTa < 1:10009079‑M2/43‑1 (MQ=255) tcagtacaTAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGATGATGGCTTa > 1:8026719‑M2/9‑51 (MQ=255) tcagtacaTAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGATGATGGCTTa < 1:9703739‑M2/43‑1 (MQ=255) gCCAGACATAAtgtactgcacccattttgttggacgatgaaatggaatagc > 1:4330765‑M2/1‑11 (MQ=255) ccAGACATAAtgtactgcacccattttgttggacgatgaaatggaatagcc < 1:7905798‑M2/51‑42 (MQ=255) ccAGACATAAtgtactgcacccattttgttggacgatgaaatggaatagcc > 1:6848655‑M2/1‑10 (MQ=255) cAGACATAAtgtactgcacccattttgttggacgatgaaatggaatagccc > 1:8793963‑M2/1‑9 (MQ=255) aGACATAAtgtactgcacccattttgttggacgatgaaatggaatagcccc > 1:8008728‑M2/1‑8 (MQ=255) tacaTAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGATGATGGCTTAAGCg > 1:8598867‑M2/5‑51 (MQ=255) gACATAAtgtactgcacccattttgttggacgatgaaatggaatagcccct < 1:10214276‑M2/51‑45 (MQ=255) gACATAAtgtactgcacccattttgttggacgatgaaatggaatagcccct > 1:10031456‑M2/1‑7 (MQ=255) gACATAAtgtactgcacccattttgttggacgatgaaatggaatagcccct > 1:4859498‑M2/1‑7 (MQ=255) acaTAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGATGATGGCTTAAGCGa < 1:5154711‑M2/48‑1 (MQ=255) aCATAAtgtactgcacccattttgttggacgatgaaatggaatagccccta > 1:8843322‑M2/1‑6 (MQ=255) aCATAAtgtactgcacccattttgttggacgatgaaatggaatagccccta > 1:4758407‑M2/1‑6 (MQ=255) caTAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGATGATGGCTTAAGCGAg < 1:4911410‑M2/49‑1 (MQ=255) caTAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGATGATGGCTTAAGCGAg < 1:7237393‑M2/49‑1 (MQ=255) caTAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGATGATGGCTTAAGCGAg > 1:5958298‑M2/3‑51 (MQ=255) cATAAtgtactgcacccattttgttggacgatgaaatggaatagcccctaa > 1:5233091‑M2/1‑5 (MQ=255) cATAAtgtactgcacccattttgttggacgatgaaatggaatagcccctaa < 1:6581135‑M2/51‑47 (MQ=255) tAAtgtactgcacccattttgttggacgatgaaatggaatagcccctaata < 1:9113882‑M2/51‑49 (MQ=255) tAAtgtactgcacccattttgttggacgatgaaatggaatagcccctaata < 1:1015200‑M2/51‑49 (MQ=255) tAAtgtactgcacccattttgttggacgatgaaatggaatagcccctaata > 1:3237263‑M2/1‑3 (MQ=255) tAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGATGATGGCTTAAGCGAGtt < 1:4723284/51‑1 (MQ=255) tAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGATGATGGCTTAAGCGAGtt > 1:4419339/1‑51 (MQ=255) | AATGAAGAAGATGCCTTACTGGTGAATAAAGCCCTGGAGCTCGCCAGACATAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGATGATGGCTTAAGCGAGTT > REL606/4092811‑4092911 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |