Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
JC JC | REL606 | 4,092,861 | IS150 (+) +3 bp | 100% | coding (87‑89/429 nt) | yiiT → | stress‑induced protein |
New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | REL606 | 3893554 = | NA (NA) | 96 (1.070) | 55/76 | NT | 100% | noncoding (1/1443 nt) | IS150 | repeat region |
? | REL606 | = 4092863 | 0 (0.000) | coding (89/429 nt) | yiiT | stress‑induced protein | |||||
* | ? | REL606 | = 3894996 | NA (NA) | 90 (1.030) | 53/74 | NT | 100% | noncoding (1443/1443 nt) | IS150 | repeat region |
? | REL606 | 4092861 = | 0 (0.000) | coding (87/429 nt) | yiiT | stress‑induced protein |
Only 100 of 133 total aligned reads displayed.
CAGACCTATATGCCTCGTGTTTAACTGTCCAACTTTTTGGGGTCAGTACA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > REL606/3894947‑3894996 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑acaTAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGATGATGGCTTAAGCGAGT > REL606/4092861‑4092910 CAGACCTATATGCCTCGTGTTTAACTGTCCAACTTTTTGGGGTCAGTACng < 1:5476071/51‑3 GACCTATATGCCTCGTGTTTAACTGTCCAACTTTTTGGGGTCAGTACATAA < 1:4150417/51‑1 GACCTATATGCCTCGTGTTTAACTGTCCAACTTTTTGGGGTCAGTACATAA < 1:9176520/51‑1 GACCTATATGCCTCGTGTTTAACTGTCCAACTTTTTGGGGTCAGTACATAA > 1:7336920/1‑51 GACCTATATGCCTCGTGTTTAACTGTCCAACTTTTTGGGGTCAGTACATAA < 1:5280168/51‑1 GACCTATATGCCTCGTGTTTAACTGTCCAACTTTTTGGGGTCAGTACATAA < 1:4830304/51‑1 ACCTATATGCCTCGTGTTTAACTGTCCAACTTTTTGGGGTCAGTACATAAT < 1:5529143/51‑1 CCTATATGCCTCGTGTTTAACTGTCCAACTTTTTGGGGTCAGTACATAATG > 1:6211160/1‑51 CCTATATGCCTCGTGTTTAACTGTCCAACTTTTTGGGGTCAGTACATAATG > 1:3083224/1‑51 CCTATATGCCTCGTGTTTAACTGTCCAACTTTTTGGGGTCAGTACATAATG < 1:4751741/51‑1 CTATATGCCTCGTGTTTAACTGTCCAACTTTTTGGGGTCAGTACATAATGA > 1:3401500/1‑51 CTATATGCCTCGTGTTTAACTGTCCAACTTTTTGGGGTCAGTACATAA < 1:968910/48‑1 TATATGCCTCGTGTTTAACTGTCCAACTTTTTGGGGTCAGTACATAATGAC < 1:10757695/51‑1 ATATGCCTCGTGTTTAACTGTCCAACTTTTTGGGGTCAGTACATAATGACG < 1:8303196/51‑1 ATATGCCTCGTGTTTAACTGTCCAACTTTTTGGGGTCAGTACATAATGACG < 1:6431661/51‑1 ATATGCCTCGTGTTTAACTGTCCAACTTTTTGGGGTCAGTACATAATGACG > 1:1433624/1‑51 TATGCCTCGTGTTTAACTGTCCAACTTTTTGGGGTCAGTACATAATGACGC > 1:2036150/1‑51 ATGCCTCGTGTTTAACTGTCCAACTTTTTGGGGTCAGTACATAATGACGCT > 1:700826/1‑51 ATGCCTCGTGTTTAACTGTCCAACTTTTTGGGGTCAGTACATAATGACGCT < 1:6754763/51‑1 TGCCTCGTGTTTAACTGTCCAACTTTTTGGGGTCAGTACATAATGACGCTC > 1:10329019/1‑51 TGCCTCGTGTTTAACTGTCCAACTTTTTGGGGTCAGTACATAATGACGCTC > 1:3825693/1‑51 GCCTCGTGTTTAACTGTCCAACTTTTTGGGGTCAGTACATAATGACGCTCA > 1:7245349/1‑51 CCTCGTGTTTAACTGTCCAACTTTTTGGGGTCAGTACATAATGACGCTCAC < 1:8019676/51‑1 CCTCGTGTTTAACTGTCCAACTTTTTGGGGTCAGTACATAATGACGCTCAC < 1:2079824/51‑1 CTCGTGTTTAACTGTCCAACTTTTTGGGGTCAGTACATAATGACGCTCACC < 1:29001/51‑1 CTCGTGTTTAACTGTCCAACTTTTTGGGGTCAGTACATAATGACGCTCACC > 1:2549596/1‑51 TCGTGTTTAACTGTCCAACTTTTTGGGGTCAGTACATAATGACGCTCACCT < 1:1151069/51‑1 GTGTTTAACTGTCCAACTTTTTGGGGTCAGTACATAATGACGCTCACCTGA > 1:7746523/1‑51 GTGTTTAACTGTCCAACTTTTTGGGGTCAGTACATAATGACGCTCACCTGA < 1:2254275/51‑1 TGTTTAACTGTCCAACTTTTTGGGGTCAGTACATAATGACGCTCACCTGAC < 1:5721127/51‑1 TGTTTAACTGTCCAACTTTTTGGGGTCAGTACATAATGACGCTCACCTGAC < 1:5686899/51‑1 GTTTAACTGTCCAACTTTTTGGGGTCAGTACATAATGACGCTCACCTGACG > 1:3078687/1‑51 GTTTAACTGTCCAACTTTTTGGGGTCAGTACATAATGACGCTCACCTGACG > 1:1757410/1‑51 TTTAACTGTCCAACTTTTTGGGGTCAGTACATAATGACGCTCACCTGACGT > 1:9569814/1‑51 TTAACTGTCCAACTTTTTGGGGTCAGTACATAATGACGCTCACCTGACGTT > 1:8393629/1‑51 TTAACTGTCCAACTTTTTGGGGTCAGTACATAATGACGCTCACCTGACGTT > 1:2063577/1‑51 TTAACTGTCCAACTTTTTGGGGTCAGTACATAATGACGCTCACCTGACGTT > 1:10136528/1‑51 TTAACTGTCCAACTTTTTGGGGTCAGTACATAATGACGCTCACCTGACGTT > 1:2226194/1‑51 TTAACTGTCCAACTTTTTGGGGTCAGTACATAATGACGCTCACCTG < 1:8749536/46‑1 TTAACTGTCCAACTTTTTGGGGTCAGTACATAATGACGCTCACCTG < 1:7744183/46‑1 TAACTGTCCAACTTTTTGGGGTCAGTACATAATGACGCTCACCTGACGTTA > 1:9441944/1‑51 TAACTGTCCAACTTTTTGGGGTCAGTACATAATGACGCTCACCTGACGTTA > 1:2845861/1‑51 atCTGTCCAACTTTTTGGGGTCAGTACATAATGACGCTCACCTGACGTTAA > 1:10822284/3‑51 AACTGTCCAACTTTTTGGGGTCAGTACATAATGACGCTCACCTGACGTTAA < 1:10023957/51‑1 AACTGTCCAACTTTTTGGGGTCAGTACATAATGACGCTCACCTGACGTTAA < 1:5253/51‑1 ACTGTCCAACTTTTTGGGGTCAGTACATAATGACGCTCACCTGACGTTAAT < 1:1821937/51‑1 ACTGTCCAACTTTTTGGGGTCAGTACATAATGACGCTCACCTGACGTTAAT < 1:810982/51‑1 ACTGTCCAACTTTTTGGGGTCAGTACATAATGACGCTCACCTGACGTTAAT < 1:7022249/51‑1 TGTCCAACTTTTTGGGGTCAGTACATAATGACGCTCACCTGACGTTAATTC > 1:1373213/1‑51 TGTCCAACTTTTTGGGGTCAGTACATAATGACGCTCACCTGACGTTAATTC < 1:4125308/51‑1 CCAACTTTTTGGGGTCAGTACATAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATA > 1:323969/1‑51 CCAACTTTTTGGGGTCAGTACATAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATA < 1:4161080/51‑1 CCAACTTTTTGGGGTCAGTACATAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATA < 1:4673013/51‑1 CAACTTTTTGGGGTCAGTACATAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATAT < 1:7856067/51‑1 CAACTTTTTGGGGTCAGTACATAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATAT < 1:2025386/51‑1 AACTTTTTGGGGTCAGTACATAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATT > 1:2414780/1‑51 TTTTTGGGGTCAGTACATAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGAT > 1:3206545/1‑51 TTTTTGGGGTCAGTACATAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGAT > 1:6320054/1‑51 TTTTTGGGGTCAGTACATAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGAT > 1:6769648/1‑51 TTTTTGGGGTCAGTACATAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGAT > 1:2625370/1‑51 TTTTTGGGGTCAGTACATAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGAT < 1:4600926/51‑1 TTTTGGGGTCAGTACATAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGATG > 1:1530178/1‑51 TTTTGGGGTCAGTACATAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGATG < 1:8989551/51‑1 TTTTGGGGTCAGTACATAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGATG < 1:3111243/51‑1 TTTGGGGTCAGTACATAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGATGA > 1:2561803/1‑51 TTTGGGGTCAGTACATAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGATGA > 1:5715580/1‑51 TTGGGGTCAGTACATAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGATGAT < 1:5896782/51‑1 TTGGGGTCAGTACATAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGATGAT > 1:6412700/1‑51 TTGGGGTCAGTACATAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGATGAT < 1:1267096/51‑1 TGGGGTCAGTACATAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGATGATG > 1:3675301/1‑51 TGGGGTCAGTACATAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGATGATG < 1:10118855/51‑1 TGGGGTCAGTACATAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGATGATG > 1:7430199/1‑51 GGGGTCAGTACATAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGATGATGG < 1:5992804/51‑1 GGGTCAGTACATAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGATGATGGC < 1:6495023/51‑1 GGGCCAGTACATAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGATGATGGC > 1:611621/1‑51 TCAGTACATAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGATGATGGCTTA < 1:6953807/51‑1 TCAGTACATAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGATGATGGCTTA > 1:7233933/1‑51 TCAGTACATAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGATGATGGCTTA < 1:10009079/51‑1 TCAGTACATAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGATGATGGCTTA > 1:8026719/1‑51 TCAGTACATAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGATGATGGCTTA < 1:9703739/51‑1 TCAGTACATAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGATGATGGCTTA < 1:1074327/51‑1 CAGTACATAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGATGATGGCTTAA > 1:10483422/1‑51 CAGTACATAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGATGATGGCTTAA > 1:448615/1‑51 CAGTACATAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGATGATGGCTTAA < 1:946113/51‑1 AGTACATAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGATGATGGCTTAAG < 1:742169/51‑1 AGTACATAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGATGATGGCTTAAG > 1:10577963/1‑51 GTACATAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGATGATGGCTTAAGC < 1:9012669/51‑1 GTACATAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGATGACGGCTTAAGC < 1:3594428/51‑1 TACATAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGATGATGGCTTAAGCG > 1:8598867/1‑51 ACATAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGATGATGGCTTAAGCGA < 1:5154711/51‑1 ACATAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGATGATGGCTTAAGCGA > 1:1402455/1‑51 CATAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGATGATGGCTTAAGCGAG < 1:4911410/51‑1 CATAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGATGATGGCTTAAGCGAG > 1:1229143/1‑51 CATAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGATGATGGCTTAAGCGAG < 1:7237393/51‑1 CATAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGATGATGGCTTAAGCGAG > 1:6654627/1‑51 CATAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGATGATGGCTTAAGCGAG > 1:5958298/1‑51 ATAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGATGATGGCTTAAGCGAGT < 1:5661749/51‑1 ATAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGATGATGGCTTAAGCGAGT > 1:4960940/1‑51 ATAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGATGATGGCTTAAGCGAGT > 1:4731477/1‑51 ATAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGATGATGGCTTAAGCGAGT > 1:4324331/1‑51 CAGACCTATATGCCTCGTGTTTAACTGTCCAACTTTTTGGGGTCAGTACA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > REL606/3894947‑3894996 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑acaTAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGATGATGGCTTAAGCGAGT > REL606/4092861‑4092910 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |