| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC | REL606 | 3,947,872 | (TAATTGA)2→3 | intergenic (‑66/+620) | aslA ← / ← hemY | acrylsulfatase‑like enzyme/predicted protoheme IX synthesis protein |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | REL606 | 3947854 = | 18 (0.230) | 79 (1.310) | 47/76 | 0.0 | 92.1% | intergenic (‑48/+638) | aslA/hemY | acrylsulfatase‑like enzyme/predicted protoheme IX synthesis protein |
| ? | REL606 | = 3947860 | 0 (0.000) | intergenic (‑54/+632) | aslA/hemY | acrylsulfatase‑like enzyme/predicted protoheme IX synthesis protein | |||||
Only 100 of 238 total aligned reads displayed.
AAATGCTCCGGTTTCATGTCGTCAAAATGTTGACGTAATTAAGCATTGATAATTGATAATTGAGATCCCTCTCCCTGACAGGATGATTGCATAAATAATAG > REL606/3947810‑3947910 | ccggtttcatgtcgtcaaaatgttgacgtaattaagcattgataattgata > 1:534399‑M1/45‑51 (MQ=255)aaaTGCTCCGGTTTCATGTCGTCAAAATGTTGACGTAATTAAGCattgata > 1:4780041/1‑51 (MQ=255)aaaTGCTCCGGTTTCATGTCGTCAAAATGTTGACGTAATTAAGCattgata < 1:3434242/51‑1 (MQ=255) aaTGCTCCGGTTTCATGTCGTCAAAATGTTGACGTAATTAAGCATTGATAa > 1:3244142‑M2/1‑50 (MQ=255) tGCTCCGGTTTCATGTCGTCAAAATGTTGACGTAATTAAGCATTGATAatt < 1:5857661‑M2/51‑4 (MQ=255) tGCTCCGGTTTCATGTCGTCAAAATGTTGACGTAATTAAGCATTGATAatt < 1:6844814‑M2/51‑4 (MQ=255) gtttcatgtcgtcaaaatgttgacgtaattaagcattgataattgataatt > 1:3839737‑M1/42‑51 (MQ=255) tttcatgtcgtcaaaatgttgacgtaattaagcattgataattgataattg > 1:1008621‑M1/41‑51 (MQ=255) tttcatgtcgtcaaaatgttgacgtaattaagcattgataattgataattg > 1:1011682‑M1/41‑51 (MQ=255) tttcatgtcgtcaaaatgttgacgtaattaagcattgataattgataattg < 1:1839573‑M1/11‑1 (MQ=255) ttcatgtcgtcaaaatgttgacgtaattaagcattgataattgataattga < 1:1189390‑M1/12‑1 (MQ=255) ttcatgtcgtcaaaatgttgacgtaattaagcattgataattgataattga < 1:903543‑M1/12‑1 (MQ=255) tcatgtcgtcaaaatgttgacgtaattaagcattgataattgataattgat > 1:5957929‑M1/39‑51 (MQ=255) tcatgtcgtcaaaatgttgacgtaattaagcattgataattgataattgat < 1:1871346‑M1/13‑1 (MQ=255) tCCGGTTTCATGTCGTCAAAATGTTGACGTAATTAAGCATTGATAattgat < 1:5517504‑M2/51‑7 (MQ=255) tCCGGTTTCATGTCGTCAAAATGTTGACGTAATTAAGCATTGATAattgat > 1:6370814‑M2/1‑45 (MQ=255) ccGGTTTCATGTCGTCAAAATGTTGACGTAATTAAGCATTGATAattgata > 1:1072645‑M2/1‑44 (MQ=255) ccGGTTTCATGTCGTCAAAATGTTGACGTAATTAAGCATTGATAattgata > 1:6073871‑M2/1‑44 (MQ=255) ccGGTTTCATGTCGTCAAAATGTTGACGTAATTAAGCATTGATAattgata > 1:4718156‑M2/1‑44 (MQ=255) catgtcgtcaaaatgttgacgtaattaagcattgataatcgataattgata > 1:7127616‑M1/38‑51 (MQ=255) cGGTTTCATGTCGTCAAAATGTTGACGTAATTAAGCATTGATAattgataa < 1:2671723‑M2/51‑9 (MQ=255) atgtcgtcaaaatgttgacgtaattaagcattgataattgataattgataa > 1:3583164‑M1/37‑51 (MQ=255) ggTTTCATGTCGTCAAAATGTTGACGTAATTAAGCATTGATAattgataat > 1:6832522‑M2/1‑42 (MQ=255) ggTTTCATGTCGTCAAAATGTTGACGTAATTAAGCATTGATAattgataat < 1:5633567‑M2/51‑10 (MQ=255) ggTTTCATGTCGTCAAAATGTTGACGTAATTAAGCATTGATAattgataat > 1:288858‑M2/1‑42 (MQ=255) gTTTCATGTCGTCAAAATGTTGACGTAATTAAGCATTGATAattgataatt > 1:947183‑M2/1‑41 (MQ=255) ttCATGTCGTCAAAATGTTGACGTAATTAAGCATTGATAattgataattga < 1:2335221‑M2/51‑13 (MQ=255) ttCATGTCGTCAAAATGTTGACGTAATTAAGCATTGATAattgataattga < 1:1163449‑M2/51‑13 (MQ=255) cgtcaaaatgttgacgtaattaagcattgataattgataattgataattga > 1:5769630‑M1/33‑51 (MQ=255) cgtcaaaatgttgacgtaattaagcattgataattgataattgataattga < 1:4386515‑M1/19‑1 (MQ=255) tCATGTCGTCAAAATGTTGACGTAATTAAGCATTGATAattgataattgat < 1:1085742‑M2/51‑14 (MQ=255) gtcaaaatgttgacgtaattaagcattgataATTGATAATTGATAATTgag < 1:1557258‑M1/20‑1 (MQ=255) gtcaaaatgttgacgtaattaagcattgataATTGATAATTGATAATTgag < 1:3727239‑M1/20‑1 (MQ=255) tcaaaatgttgacgtaattaagcattgataATTGATAATTGATAATTgaga < 1:5044630‑M1/21‑1 (MQ=255) aTGTCGTCAAAATGTTGACGTAATTAAGCATTGATAattgataattgataa > 1:4928833‑M2/1‑36 (MQ=255) tGTCGTCAAAATGTTGACGTAATTAAGCATTGATAattgataattgataat > 1:2221661‑M2/1‑35 (MQ=255) tGTCGTCAAAATGTTGACGTAATTAAGCATTGATAattgataattgataat > 1:4837730‑M2/1‑35 (MQ=255) aaaatgttgacgtaattaagcattgataATTGATAATTGATAATTGAGATc > 1:6361775‑M1/29‑51 (MQ=255) aatgttgacgtaattaagcattgataATTGATAATTGATAATTGAGATccc < 1:3690837‑M1/25‑1 (MQ=255) aatgttgacgtaattaagcattgataATTGATAATTGATAATTGAGATccc < 1:491980‑M1/25‑1 (MQ=255) cgtcAAAATGTTGACGTAATTAAGCATTGATAattgataattgataattga < 1:268944‑M2/51‑20 (MQ=255) atgttgacgtaattaagcattgataATTGATAATTGATAATTGAGATCCct < 1:884084‑M1/26‑1 (MQ=255) atgttgacgtaattaagcattgataATTGATAATTGATAATTGAGATCCct > 1:5951141‑M1/26‑51 (MQ=255) tgttgacgtaattaagcattgataATTGATAATTGATAATTGAGATCCctc > 1:4891372‑M1/25‑51 (MQ=255) tgttgacgtaattaagcattgataATTGATAATTGATAATTGAGATCCctc > 1:2517983‑M1/25‑51 (MQ=255) tgttgacgtaattaagcattgataATTGATAATTGATAATTGAGATCCctc > 1:6931169‑M1/25‑51 (MQ=255) gtcAAAATGTTGACGTAATTAAGCATTGATAattgataattgataattgag > 1:7082444‑M2/1‑31 (MQ=255) tcAAAATGTTGACGTAATTAAGCATTGATAattgataattgataattgaga < 1:7294104‑M2/51‑22 (MQ=255) tcAAAATGTTGACGTAATTAAGCATTGATAattgataattgataattgaga < 1:354980‑M2/51‑22 (MQ=255) cAAAATGTTGACGTAATTAAGCATTGATAattgataattgataattgagat < 1:2528811‑M2/51‑23 (MQ=255) cAAAATGTTGACGTAATTAAGCATTGATAattgataattgataattgagat < 1:1174203‑M2/51‑23 (MQ=255) aaaaTGTTGACGTAATTAAGCATTGATAattgataattgataattg > 1:1934901‑M2/1‑28 (MQ=255) aaaTGTTGACGTAATTAAGCATTGATAattgataattgataattgagatcc < 1:3735324‑M2/51‑25 (MQ=255) acgtaattaagcattgataATTGATAATTGATAATTGAGATCCCTCTCCCt > 1:6889030‑M1/20‑51 (MQ=255) acgtaattaagcattgataATTGATAATTGATAATTGAGATCCCTCTCCCt > 1:5358904‑M1/20‑51 (MQ=255) aaTGTTGACGTAATTAAGCATTGATAattgataattgataattgagatccc < 1:3924053‑M2/51‑26 (MQ=255) aaTGTTGACGTAATTAAGCATTGATAattgataattgataattgagatccc < 1:4833742‑M2/51‑26 (MQ=255) aTGTTGACGTAATTAAGCATTGATAattgataattgataattgagatccct > 1:5167293‑M2/1‑25 (MQ=255) aTGTTGACGTAATTAAGCATTGATAattgataattgataattgagatccct < 1:968276‑M2/51‑27 (MQ=255) taattaagcattgataATTGATAATTGATAATTGAGATCCCTCTCCCTGAc > 1:6871999‑M1/17‑51 (MQ=255) taattaagcattgataATTGATAATTGATAATTGAGATCCCTCTCCCTGAc > 1:5753620‑M1/17‑51 (MQ=255) gTTGACGTAATTAAGCATTGATAattgataattgataattgagatccctct > 1:6157681‑M2/1‑23 (MQ=255) aattaagcattgataATTGATAATTGATAATTGAGATCCCTCTCCCTGACa < 1:4304070‑M1/36‑1 (MQ=255) aattaagcattgataATTGATAATTGATAATTGAGATCCCTCTCCCTGACa > 1:6296695‑M1/16‑51 (MQ=255) tGACGTAATTAAGCATTGATAattgataattgataattgagatccctctcc < 1:3872623‑M2/51‑31 (MQ=255) attaagcattgataATTGATAATTGATAATTGAGATCCCTCTCCCTGACAg > 1:5132616‑M1/15‑51 (MQ=255) taagcattgataATTGATAATTGATAATTGAGATCCCTCTCCCTGACAGga < 1:4963750‑M1/39‑1 (MQ=255) aCGTAATTAAGCATTGATAattgataattgataattgagatccctctccct < 1:47611‑M2/51‑33 (MQ=255) aCGTAATTAAGCATTGATAattgataattgataattgagatccctctccct < 1:6046401‑M2/51‑33 (MQ=255) cGTAATTAAGCATTGATAattgataattgataattgagatccctctccctg < 1:5281508‑M2/51‑34 (MQ=255) cGTAATTAAGCATTGATAattgataattgataattgagatccctctccctg > 1:3473540‑M2/1‑18 (MQ=255) aagcattgataATTGATAATTGATAATTGAGATCCCTCTCCCTGACAGgat > 1:4873604‑M1/12‑51 (MQ=255) gTAATTAAGCATTGATAattgataattgataattgagatccctctccctga < 1:3516723‑M2/51‑35 (MQ=255) tAATTAAGCATTGATAattgataattgataattgagatccctctccctgac < 1:6491005‑M2/51‑36 (MQ=255) gcattgataATTGATAATTGATAATTGAGATCCCTCTCCCTGACAGgatga > 1:2504371‑M1/10‑51 (MQ=255) cattgataATTGATAATTGATAATTGAGATCCCTCTCCCTGACAGgatgat > 1:1017112‑M1/9‑51 (MQ=255) attgataATTGATAATTGATAATTGAGATCCCTCTCCCTGACAGGATGAtt > 1:6708688‑M1/8‑51 (MQ=255) aTTAAGCATTGATAattgataattgataattgagatccctctccctgacag > 1:17649‑M2/1‑14 (MQ=255) ttgataATTGATAATTGATAATTGAGATCCATCTCCCTGACAGGATGATTg > 1:2116840‑M1/7‑51 (MQ=255) ttAAGCATTGATAattgataattgataattgagatccctctccctgacagg > 1:2387845‑M2/1‑13 (MQ=255) tgataATTGATAATTGATAATTGAGATCCCTCTCCCTGACAGGATGATTGc < 1:4515786‑M1/46‑1 (MQ=255) tgataATTGATAATTGATAATTGAGATCCCTCTCCCTGACAGGATGATTGc > 1:1155596‑M1/6‑51 (MQ=255) tgataATTGATAATTGATAATTGAGATCCCTCTCCCTGACAGGATGATTGc < 1:2655776‑M1/46‑1 (MQ=255) tAAGCATTGATAattgataattgataattgagatccctctccctgacagga > 1:6317375‑M2/1‑12 (MQ=255) aaGCATTGATAattgataattgataattgagatccctctccctgacaggat > 1:2742652‑M2/1‑11 (MQ=255) taATTGATAATTGATAATTGAGATCCCTCTCCCTGACAGGATGATTGCata < 1:7261406‑M1/49‑1 (MQ=255) gCATTGATAattgataattgataattgagatccctctccctgacaggatga < 1:5263668‑M2/51‑43 (MQ=255) aATTGATAATTGATAATTGAGATCCCTCTCCCTGACAGGATGATTGCataa > 1:626420‑M1/2‑51 (MQ=255) attgataattgataattgataattgagatccctctccctgacaggatgatt > 1:7032497‑M2/1‑7 (MQ=255) ttgataattgataattgataattgagatccctctccctgacaggatgattg < 1:5557299‑M2/51‑46 (MQ=255) ttgataattgataattgataattgagatccctctccctgacaggatgattg > 1:4971822‑M2/1‑6 (MQ=255) TTGATAATTGATAATTGAGATCCCTCTCCCTGACAGGATGATTGCataaat < 1:2865230‑M1/51‑1 (MQ=255) GATAATTGATAATTGAGATCCCTCTCCCTGACAGGATGATTGCataaataa > 1:2431415‑M1/1‑51 (MQ=255) ataattgataattgataattgagatccctctccctgacaggatgattgcat > 1:6451790‑M2/1‑3 (MQ=255) taattgataattgataattgagatccctctccctgacaggatgattgcata < 1:3795101‑M2/51‑50 (MQ=255) TAATTGATAATTGAGATCCCTCTCCCTGACAGGATGATTGCATAAataata > 1:1385351‑M1/1‑51 (MQ=255) aattgataattgataattgagatccctctccctgacaggatgattgcataa > 1:6935522‑M2/1‑1 (MQ=255) aattgataattgataattgagatccctctccctgacaggatgattgcataa > 1:3759438‑M2/1‑1 (MQ=255) aattgataattgataattgagatccctctccctgacaggatgattgcataa > 1:3941439‑M2/1‑1 (MQ=255) AATTGATAATTGAGATCCCTCTCCCTGACAGGATGATTGCATAAATAATAg > 1:3855347‑M1/1‑51 (MQ=255) | AAATGCTCCGGTTTCATGTCGTCAAAATGTTGACGTAATTAAGCATTGATAATTGATAATTGAGATCCCTCTCCCTGACAGGATGATTGCATAAATAATAG > REL606/3947810‑3947910 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |