Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
JC | REL606 | 3,947,872 | (TAATTGA)2→3 | intergenic (‑66/+620) | aslA ← / ← hemY | acrylsulfatase‑like enzyme/predicted protoheme IX synthesis protein |
New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | REL606 | 3947854 = | 18 (0.230) | 79 (1.310) | 47/76 | 0.0 | 92.1% | intergenic (‑48/+638) | aslA/hemY | acrylsulfatase‑like enzyme/predicted protoheme IX synthesis protein |
? | REL606 | = 3947860 | 0 (0.000) | intergenic (‑54/+632) | aslA/hemY | acrylsulfatase‑like enzyme/predicted protoheme IX synthesis protein |
Only 100 of 231 total aligned reads displayed.
CATGCAAAATGCTCCGGTTTCATGTCGTCAAAATGTTGACGTAATTAAGCATTGATAATTGATAATTGAGATCCCTCTCCCTGACAGGATGATTGCATAAA > REL606/3947804‑3947904 | cATGCAAAATGCTCCGGTTTCATGTCGTCAAAATGTTGACGTAATTAAGCa < 1:1417415/51‑1 (MQ=255) aatgctccggtttcatgtcgtcaaaatgttgacgtaattaagcattgataa > 1:3244142‑M1/51‑51 (MQ=255) aTGCAAAATGCTCCGGTTTCATGTCGTCAAAATGTTGACGTAATTAAGCat < 1:3942104/51‑1 (MQ=255) aTGCAAAATGCTCCGGTTTCATGTCGTCAAAATGTTGACGTAATTAAGCat < 1:7140858/51‑1 (MQ=255) tgctccggtttcatgtcgtcaaaatgttgacgtaattaagcattgataatt < 1:5857661‑M1/3‑1 (MQ=255) tgctccggtttcatgtcgtcaaaatgttgacgtaattaagcattgataatt < 1:6844814‑M1/3‑1 (MQ=255) tGCAAAATGCTCCGGTTTCATGTCGTCAAAATGTTGACGTAATTAAGCatt > 1:3818360/1‑51 (MQ=255) tGCAAAATGCTCCGGTTTCATGTCGTCAAAATGTTGACGTAATTAAGCatt < 1:2768840/51‑1 (MQ=255) gctccggtttcatgtcgtcaaaatgttgacgtaattaagcattgataattg > 1:3495586‑M1/48‑51 (MQ=255) gCAAAATGCTCCGGTTTCATGTCGTCAAAATGTTGACGTAATTAAGCattg > 1:5354044/1‑51 (MQ=255) cAAAATGCTCCGGTTTCATGTCGTCAAAATGTTGACGTAATTAAGCattga > 1:5442252/1‑51 (MQ=255) tccggtttcatgtcgtcaaaatgttgacgtaattaagcattgataattgat > 1:6370814‑M1/46‑51 (MQ=255) tccggtttcatgtcgtcaaaatgttgacgtaattaagcattgataattgat < 1:6836851‑M1/6‑1 (MQ=255) tccggtttcatgtcgtcaaaatgttgacgtaattaagcattgataattgat < 1:3896538‑M1/6‑1 (MQ=255) ccggtttcatgtcgtcaaaatgttgacgtaattaagcattgataattgata > 1:534399‑M1/45‑51 (MQ=255) ccggtttcatgtcgtcaaaatgttgacgtaattaagcattgataattgata > 1:4718156‑M1/45‑51 (MQ=255) ccggtttcatgtcgtcaaaatgttgacgtaattaagcattgataattgata > 1:1072645‑M1/45‑51 (MQ=255) aaaTGCTCCGGTTTCATGTCGTCAAAATGTTGACGTAATTAAGCattgata > 1:4780041/1‑51 (MQ=255) aaaTGCTCCGGTTTCATGTCGTCAAAATGTTGACGTAATTAAGCattgata > 1:3427546/1‑51 (MQ=255) aaTGCTCCGGTTTCATGTCGTCAAAATGTTGACGTAATTAAGCATTGATAa > 1:5648958‑M2/1‑50 (MQ=255) ggtttcatgtcgtcaaaatgttgacgtaattaagcattgataattgataat > 1:288858‑M1/43‑51 (MQ=255) ggtttcatgtcgtcaaaatgttgacgtaattaagcattgataattgataat < 1:4864078‑M1/9‑1 (MQ=255) ggtttcatgtcgtcaaaatgttgacgtaattaagcattgataattgataat > 1:6832522‑M1/43‑51 (MQ=255) aTGCTCCGGTTTCATGTCGTCAAAATGTTGACGTAATTAAGCATTGATAat < 1:382373‑M2/51‑3 (MQ=255) tGCTCCGGTTTCATGTCGTCAAAATGTTGACGTAATTAAGCATTGATAatt > 1:5448528‑M2/1‑48 (MQ=255) tttcatgtcgtcaaaatgttgacgtaattaagcattgataattgataattg > 1:1008621‑M1/41‑51 (MQ=255) tttcatgtcgtcaaaatgttgacgtaattaagcattgataattgataattg > 1:1011682‑M1/41‑51 (MQ=255) tttcatgtcgtcaaaatgttgacgtaattaagcattgataattgataattg < 1:1839573‑M1/11‑1 (MQ=255) ttcatgtcgtcaaaatgttgacgtaattaagcattgataattgataattga < 1:2335221‑M1/12‑1 (MQ=255) ttcatgtcgtcaaaatgttgacgtaattaagcattgataattgataattga < 1:1163449‑M1/12‑1 (MQ=255) ttcatgtcgtcaaaatgttgacgtaattaagcattgataattgataattga < 1:1189390‑M1/12‑1 (MQ=255) tcatgtcgtcaaaatgttgacgtaattaagcattgataattgataattgat < 1:1871346‑M1/13‑1 (MQ=255) tcatgtcgtcaaaatgttgacgtaattaagcattgataattgataattgat > 1:5957929‑M1/39‑51 (MQ=255) tCCGGTTTCATGTCGTCAAAATGTTGACGTAATTAAGCATTGATAattgat < 1:3838873‑M2/51‑7 (MQ=255) tCCGGTTTCATGTCGTCAAAATGTTGACGTAATTAAGCATTGATAattgat < 1:5517504‑M2/51‑7 (MQ=255) ccGGTTTCATGTCGTCAAAATGTTGACGTAATTAAGCATTGATAattgata > 1:6073871‑M2/1‑44 (MQ=255) catgtcgtcaaaatgttgacgtaattaagcattgataattgataattgata < 1:5902205‑M1/14‑1 (MQ=255) cGGTTTCATGTCGTCAAAATGTTGACGTAATTAAGCATTGATAattgataa < 1:2671723‑M2/51‑9 (MQ=255) cGGTTTCATGTCGTCAAAATGTTGACGTAATTAAGCATTGATAattgataa > 1:4761714‑M2/1‑43 (MQ=255) atgtcgtcaaaatgttgacgtaattaagcattgataattgataattgataa > 1:3583164‑M1/37‑51 (MQ=255) tgtcgtcaaaatgttgacgtaattaagcattgataattgataattgataat > 1:2221661‑M1/36‑51 (MQ=255) ggTTTCATGTCGTCAAAATGTTGACGTAATTAAGCATTGATAattgataat < 1:5633567‑M2/51‑10 (MQ=255) gTTTCATGTCGTCAAAATGTTGACGTAATTAAGCATTGATAattgataatt > 1:947183‑M2/1‑41 (MQ=255) ttCATGTCGTCAAAATGTTGACGTAATTAAGCATTGATAattgataattga < 1:903543‑M2/51‑13 (MQ=255) cgtcaaaatgttgacgtaattaagcattgataattgataattgataattga > 1:5297400‑M1/33‑51 (MQ=255) cgtcaaaatgttgacgtaattaagcattgataattgataattgataattga < 1:4386515‑M1/19‑1 (MQ=255) tCATGTCGTCAAAATGTTGACGTAATTAAGCATTGATAattgataattgat < 1:1085742‑M2/51‑14 (MQ=255) gtcaaaatgttgacgtaattaagcattgataATTGATAATTGATAATTgag < 1:1557258‑M1/20‑1 (MQ=255) tcaaaatgttgacgtaattaagcattgataATTGATAATTGATAATTgaga < 1:7294104‑M1/21‑1 (MQ=255) tcaaaatgttgacgtaattaagcattgataATTGATAATTGATAATTgaga < 1:5044630‑M1/21‑1 (MQ=255) caaaatgttgacgtaattaagcattgataATTGATAATTGATAATTGAGAt < 1:1174203‑M1/22‑1 (MQ=255) aTGTCGTCAAAATGTTGACGTAATTAAGCATTGATAattgataattgataa > 1:4928833‑M2/1‑36 (MQ=255) aatgttgacgtaattaagcattgataATTGATAATTGATAATTGAGATccc < 1:3924053‑M1/25‑1 (MQ=255) cgtcAAAATGTTGACGTAATTAAGCATTGATAattgataattgataattga < 1:268944‑M2/51‑20 (MQ=255) atgttgacgtaattaagcattgataATTGATAATTGATAATTGAGATCCct < 1:884084‑M1/26‑1 (MQ=255) atgttgacgtaattaagcattgataATTGATAATTGATAATTGAGATCCct > 1:5951141‑M1/26‑51 (MQ=255) tgttgacgtaattaagcattgataATTGATAATTGATAATTGAGATCCctc > 1:4891372‑M1/25‑51 (MQ=255) gtcAAAATGTTGACGTAATTAAGCATTGATAattgataattgataattgag < 1:3727239‑M2/51‑21 (MQ=255) gtcAAAATGTTGACGTAATTAAGCATTGATAattgataattgataattgag > 1:7082444‑M2/1‑31 (MQ=255) tcAAAATGTTGACGTAATTAAGCATTGATAattgataattgataattgaga < 1:354980‑M2/51‑22 (MQ=255) tgacgtaattaagcattgataATTGATAATTGATAATTGAGATCCCTCTcc < 1:3872623‑M1/30‑1 (MQ=255) aaaaTGTTGACGTAATTAAGCATTGATAattgataattgataattg > 1:1934901‑M2/1‑28 (MQ=255) aaaTGTTGACGTAATTAAGCATTGATAattgataattgataattgagatcc < 1:3735324‑M2/51‑25 (MQ=255) acgtaattaagcattgataATTGATAATTGATAATTGAGATCCCTCTCCCt < 1:47611‑M1/32‑1 (MQ=255) aaTGTTGACGTAATTAAGCATTGATAattgataattgataattgagatccc < 1:3690837‑M2/51‑26 (MQ=255) aaTGTTGACGTAATTAAGCATTGATAattgataattgataattgagatccc < 1:4833742‑M2/51‑26 (MQ=255) aaTGTTGACGTAATTAAGCATTGATAattgataattgataattgagatccc < 1:2424988‑M2/51‑26 (MQ=255) aaTGTTGACGTAATTAAGCATTGATAattgataattgataattgagatccc < 1:491980‑M2/51‑26 (MQ=255) cgtaattaagcattgataATTGATAATTGATAATTGAGATCCCTCTCCCTg > 1:3473540‑M1/19‑51 (MQ=255) aTGTTGACGTAATTAAGCATTGATAattgataattgataattgagatccct < 1:968276‑M2/51‑27 (MQ=255) aTGTTGACGTAATTAAGCATTGATAattgataattgataattgagatccct > 1:5167293‑M2/1‑25 (MQ=255) tGTTGACGTAATTAAGCATTGATAattgataattgataattgagatccctc > 1:2517983‑M2/1‑24 (MQ=255) gTTGACGTAATTAAGCATTGATAattgataattgataattgagatccctct > 1:6157681‑M2/1‑23 (MQ=255) tGACGTAATTAAGCATTGATAattgataattgataattgagatccctctcc < 1:6847772‑M2/51‑31 (MQ=255) ttaagcattgataATTGATAATTGATAATTGAGATCCCTCTCCCTGACAgg > 1:2387845‑M1/14‑51 (MQ=255) gACGTAATTAAGCATTGATAattgataattgataattgagatccctctccc < 1:2783612‑M2/51‑32 (MQ=255) aCGTAATTAAGCATTGATAattgataattgataattgagatccctctccct > 1:6889030‑M2/1‑19 (MQ=255) aCGTAATTAAGCATTGATAattgataattgataattgagatccctctccct < 1:6046401‑M2/51‑33 (MQ=255) aagcattgataATTGATAATTGATAATTGAGATCCCTCTCCCTGACAGgat > 1:4873604‑M1/12‑51 (MQ=255) gTAATTAAGCATTGATAattgataattgataattgagatccctctccctga < 1:3516723‑M2/51‑35 (MQ=255) tAATTAAGCATTGATAattgataattgataattgagatccctctccctgac > 1:5753620‑M2/1‑16 (MQ=255) tAATTAAGCATTGATAattgataattgataattgagatccctctccctgac > 1:6871999‑M2/1‑16 (MQ=255) tAATTAAGCATTGATAattgataattgataattgagatccctctccctgac < 1:6491005‑M2/51‑36 (MQ=255) cattgataATTGATAATTGATAATTGAGATCCCTCTCCCTGACAGgatgat > 1:1017112‑M1/9‑51 (MQ=255) aaTTAAGCATTGATAattgataattgataattgagatccctctccctgaca > 1:4066010‑M2/1‑15 (MQ=255) aaTTAAGCATTGATAattgataattgataattgagatccctctccctgaca < 1:4304070‑M2/51‑37 (MQ=255) aaTTAAGCATTGATAattgataattgataattgagatccctctccctgaca > 1:6296695‑M2/1‑15 (MQ=255) attgataATTGATAATTGATAATTGAGATCCCTCTCCCTGACAGGATGAtt > 1:6708688‑M1/8‑51 (MQ=255) aTTAAGCATTGATAattgataattgataattgagatccctctccctgacag > 1:17649‑M2/1‑14 (MQ=255) aTTAAGCATTGATAattgataattgataattgagatccctctccctgacag > 1:5132616‑M2/1‑14 (MQ=255) tgataATTGATAATTGATAATTGAGATCCCTCTCCCTGACAGGATGATTGc < 1:4515786‑M1/46‑1 (MQ=255) tgataATTGATAATTGATAATTGAGATCCCTCTCCCTGACAGGATGATTGc < 1:2655776‑M1/46‑1 (MQ=255) tAAGCATTGATAattgataattgataattgagatccctctccctgacagga < 1:4963750‑M2/51‑40 (MQ=255) tAAGCATTGATAattgataattgataattgagatccctctccctgacagga > 1:6317375‑M2/1‑12 (MQ=255) ataATTGATAATTGATAATTGAGATCCCTCTCCCTGACAGGATGATTGCat > 1:6451790‑M1/4‑51 (MQ=255) gCATTGATAattgataattgataattgagatccctctccctgacaggatga < 1:5263668‑M2/51‑43 (MQ=255) gCATTGATAattgataattgataattgagatccctctccctgacaggatga > 1:2504371‑M2/1‑9 (MQ=255) aATTGATAATTGATAATTGAGATCCCTCTCCCTGACAGGATGATTGCataa > 1:6935522‑M1/2‑51 (MQ=255) aATTGATAATTGATAATTGAGATCCCTCTCCCTGACAGGATGATTGCataa > 1:626420‑M1/2‑51 (MQ=255) attgataattgataattgataattgagatccctctccctgacaggatgatt > 1:7032497‑M2/1‑7 (MQ=255) | CATGCAAAATGCTCCGGTTTCATGTCGTCAAAATGTTGACGTAATTAAGCATTGATAATTGATAATTGAGATCCCTCTCCCTGACAGGATGATTGCATAAA > REL606/3947804‑3947904 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |