Predicted mutation
evidence seq id position mutation annotation gene description
JC REL606 3,947,872 (TAATTGA)2→3 intergenic (‑66/+620) aslA ← / ← hemY acrylsulfatase‑like enzyme/predicted protoheme IX synthesis protein

New junction evidence
  seq id position reads (cov) reads (cov) score skew freq annotation gene product
* ? REL606 3947854 =18 (0.230)79 (1.310) 47/76 0.0 92.1% intergenic (‑48/+638) aslA/hemY acrylsulfatase‑like enzyme/predicted protoheme IX synthesis protein
?REL606 = 3947860 0 (0.000)intergenic (‑54/+632) aslA/hemY acrylsulfatase‑like enzyme/predicted protoheme IX synthesis protein

Only 100 of 231 total aligned reads displayed.

CATGCAAAATGCTCCGGTTTCATGTCGTCAAAATGTTGACGTAATTAAGCATTGATAATTGATAATTGAGATCCCTCTCCCTGACAGGATGATTGCATAAA  >  REL606/3947804‑3947904
                                                  |                                                  
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aatgctccggtttcatgtcgtcaaaatgttgacgtaattaagcattgataa                                                    >  1:3244142‑M1/51‑51 (MQ=255)
 aTGCAAAATGCTCCGGTTTCATGTCGTCAAAATGTTGACGTAATTAAGCat                                                   <  1:3942104/51‑1 (MQ=255)
 aTGCAAAATGCTCCGGTTTCATGTCGTCAAAATGTTGACGTAATTAAGCat                                                   <  1:7140858/51‑1 (MQ=255)
  tgctccggtttcatgtcgtcaaaatgttgacgtaattaagcattgataatt                                                  <  1:5857661‑M1/3‑1 (MQ=255)
  tgctccggtttcatgtcgtcaaaatgttgacgtaattaagcattgataatt                                                  <  1:6844814‑M1/3‑1 (MQ=255)
  tGCAAAATGCTCCGGTTTCATGTCGTCAAAATGTTGACGTAATTAAGCatt                                                  >  1:3818360/1‑51 (MQ=255)
  tGCAAAATGCTCCGGTTTCATGTCGTCAAAATGTTGACGTAATTAAGCatt                                                  <  1:2768840/51‑1 (MQ=255)
   gctccggtttcatgtcgtcaaaatgttgacgtaattaagcattgataattg                                                 >  1:3495586‑M1/48‑51 (MQ=255)
   gCAAAATGCTCCGGTTTCATGTCGTCAAAATGTTGACGTAATTAAGCattg                                                 >  1:5354044/1‑51 (MQ=255)
    cAAAATGCTCCGGTTTCATGTCGTCAAAATGTTGACGTAATTAAGCattga                                                >  1:5442252/1‑51 (MQ=255)
     tccggtttcatgtcgtcaaaatgttgacgtaattaagcattgataattgat                                               >  1:6370814‑M1/46‑51 (MQ=255)
     tccggtttcatgtcgtcaaaatgttgacgtaattaagcattgataattgat                                               <  1:6836851‑M1/6‑1 (MQ=255)
     tccggtttcatgtcgtcaaaatgttgacgtaattaagcattgataattgat                                               <  1:3896538‑M1/6‑1 (MQ=255)
      ccggtttcatgtcgtcaaaatgttgacgtaattaagcattgataattgata                                              >  1:534399‑M1/45‑51 (MQ=255)
      ccggtttcatgtcgtcaaaatgttgacgtaattaagcattgataattgata                                              >  1:4718156‑M1/45‑51 (MQ=255)
      ccggtttcatgtcgtcaaaatgttgacgtaattaagcattgataattgata                                              >  1:1072645‑M1/45‑51 (MQ=255)
      aaaTGCTCCGGTTTCATGTCGTCAAAATGTTGACGTAATTAAGCattgata                                              >  1:4780041/1‑51 (MQ=255)
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       aaTGCTCCGGTTTCATGTCGTCAAAATGTTGACGTAATTAAGCATTGATAa                                             >  1:5648958‑M2/1‑50 (MQ=255)
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        ggtttcatgtcgtcaaaatgttgacgtaattaagcattgataattgataat                                            <  1:4864078‑M1/9‑1 (MQ=255)
        ggtttcatgtcgtcaaaatgttgacgtaattaagcattgataattgataat                                            >  1:6832522‑M1/43‑51 (MQ=255)
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          tttcatgtcgtcaaaatgttgacgtaattaagcattgataattgataattg                                          >  1:1008621‑M1/41‑51 (MQ=255)
          tttcatgtcgtcaaaatgttgacgtaattaagcattgataattgataattg                                          >  1:1011682‑M1/41‑51 (MQ=255)
          tttcatgtcgtcaaaatgttgacgtaattaagcattgataattgataattg                                          <  1:1839573‑M1/11‑1 (MQ=255)
           ttcatgtcgtcaaaatgttgacgtaattaagcattgataattgataattga                                         <  1:2335221‑M1/12‑1 (MQ=255)
           ttcatgtcgtcaaaatgttgacgtaattaagcattgataattgataattga                                         <  1:1163449‑M1/12‑1 (MQ=255)
           ttcatgtcgtcaaaatgttgacgtaattaagcattgataattgataattga                                         <  1:1189390‑M1/12‑1 (MQ=255)
            tcatgtcgtcaaaatgttgacgtaattaagcattgataattgataattgat                                        <  1:1871346‑M1/13‑1 (MQ=255)
            tcatgtcgtcaaaatgttgacgtaattaagcattgataattgataattgat                                        >  1:5957929‑M1/39‑51 (MQ=255)
            tCCGGTTTCATGTCGTCAAAATGTTGACGTAATTAAGCATTGATAattgat                                        <  1:3838873‑M2/51‑7 (MQ=255)
            tCCGGTTTCATGTCGTCAAAATGTTGACGTAATTAAGCATTGATAattgat                                        <  1:5517504‑M2/51‑7 (MQ=255)
             ccGGTTTCATGTCGTCAAAATGTTGACGTAATTAAGCATTGATAattgata                                       >  1:6073871‑M2/1‑44 (MQ=255)
             catgtcgtcaaaatgttgacgtaattaagcattgataattgataattgata                                       <  1:5902205‑M1/14‑1 (MQ=255)
              cGGTTTCATGTCGTCAAAATGTTGACGTAATTAAGCATTGATAattgataa                                      <  1:2671723‑M2/51‑9 (MQ=255)
              cGGTTTCATGTCGTCAAAATGTTGACGTAATTAAGCATTGATAattgataa                                      >  1:4761714‑M2/1‑43 (MQ=255)
              atgtcgtcaaaatgttgacgtaattaagcattgataattgataattgataa                                      >  1:3583164‑M1/37‑51 (MQ=255)
               tgtcgtcaaaatgttgacgtaattaagcattgataattgataattgataat                                     >  1:2221661‑M1/36‑51 (MQ=255)
               ggTTTCATGTCGTCAAAATGTTGACGTAATTAAGCATTGATAattgataat                                     <  1:5633567‑M2/51‑10 (MQ=255)
                gTTTCATGTCGTCAAAATGTTGACGTAATTAAGCATTGATAattgataatt                                    >  1:947183‑M2/1‑41 (MQ=255)
                  ttCATGTCGTCAAAATGTTGACGTAATTAAGCATTGATAattgataattga                                  <  1:903543‑M2/51‑13 (MQ=255)
                  cgtcaaaatgttgacgtaattaagcattgataattgataattgataattga                                  >  1:5297400‑M1/33‑51 (MQ=255)
                  cgtcaaaatgttgacgtaattaagcattgataattgataattgataattga                                  <  1:4386515‑M1/19‑1 (MQ=255)
                   tCATGTCGTCAAAATGTTGACGTAATTAAGCATTGATAattgataattgat                                 <  1:1085742‑M2/51‑14 (MQ=255)
                   gtcaaaatgttgacgtaattaagcattgataATTGATAATTGATAATTgag                                 <  1:1557258‑M1/20‑1 (MQ=255)
                    tcaaaatgttgacgtaattaagcattgataATTGATAATTGATAATTgaga                                <  1:7294104‑M1/21‑1 (MQ=255)
                    tcaaaatgttgacgtaattaagcattgataATTGATAATTGATAATTgaga                                <  1:5044630‑M1/21‑1 (MQ=255)
                     caaaatgttgacgtaattaagcattgataATTGATAATTGATAATTGAGAt                               <  1:1174203‑M1/22‑1 (MQ=255)
                     aTGTCGTCAAAATGTTGACGTAATTAAGCATTGATAattgataattgataa                               >  1:4928833‑M2/1‑36 (MQ=255)
                        aatgttgacgtaattaagcattgataATTGATAATTGATAATTGAGATccc                            <  1:3924053‑M1/25‑1 (MQ=255)
                         cgtcAAAATGTTGACGTAATTAAGCATTGATAattgataattgataattga                           <  1:268944‑M2/51‑20 (MQ=255)
                         atgttgacgtaattaagcattgataATTGATAATTGATAATTGAGATCCct                           <  1:884084‑M1/26‑1 (MQ=255)
                         atgttgacgtaattaagcattgataATTGATAATTGATAATTGAGATCCct                           >  1:5951141‑M1/26‑51 (MQ=255)
                          tgttgacgtaattaagcattgataATTGATAATTGATAATTGAGATCCctc                          >  1:4891372‑M1/25‑51 (MQ=255)
                          gtcAAAATGTTGACGTAATTAAGCATTGATAattgataattgataattgag                          <  1:3727239‑M2/51‑21 (MQ=255)
                          gtcAAAATGTTGACGTAATTAAGCATTGATAattgataattgataattgag                          >  1:7082444‑M2/1‑31 (MQ=255)
                           tcAAAATGTTGACGTAATTAAGCATTGATAattgataattgataattgaga                         <  1:354980‑M2/51‑22 (MQ=255)
                             tgacgtaattaagcattgataATTGATAATTGATAATTGAGATCCCTCTcc                       <  1:3872623‑M1/30‑1 (MQ=255)
                             aaaaTGTTGACGTAATTAAGCATTGATAattgataattgataattg                            >  1:1934901‑M2/1‑28 (MQ=255)
                              aaaTGTTGACGTAATTAAGCATTGATAattgataattgataattgagatcc                      <  1:3735324‑M2/51‑25 (MQ=255)
                               acgtaattaagcattgataATTGATAATTGATAATTGAGATCCCTCTCCCt                     <  1:47611‑M1/32‑1 (MQ=255)
                               aaTGTTGACGTAATTAAGCATTGATAattgataattgataattgagatccc                     <  1:3690837‑M2/51‑26 (MQ=255)
                               aaTGTTGACGTAATTAAGCATTGATAattgataattgataattgagatccc                     <  1:4833742‑M2/51‑26 (MQ=255)
                               aaTGTTGACGTAATTAAGCATTGATAattgataattgataattgagatccc                     <  1:2424988‑M2/51‑26 (MQ=255)
                               aaTGTTGACGTAATTAAGCATTGATAattgataattgataattgagatccc                     <  1:491980‑M2/51‑26 (MQ=255)
                                cgtaattaagcattgataATTGATAATTGATAATTGAGATCCCTCTCCCTg                    >  1:3473540‑M1/19‑51 (MQ=255)
                                aTGTTGACGTAATTAAGCATTGATAattgataattgataattgagatccct                    <  1:968276‑M2/51‑27 (MQ=255)
                                aTGTTGACGTAATTAAGCATTGATAattgataattgataattgagatccct                    >  1:5167293‑M2/1‑25 (MQ=255)
                                 tGTTGACGTAATTAAGCATTGATAattgataattgataattgagatccctc                   >  1:2517983‑M2/1‑24 (MQ=255)
                                  gTTGACGTAATTAAGCATTGATAattgataattgataattgagatccctct                  >  1:6157681‑M2/1‑23 (MQ=255)
                                    tGACGTAATTAAGCATTGATAattgataattgataattgagatccctctcc                <  1:6847772‑M2/51‑31 (MQ=255)
                                     ttaagcattgataATTGATAATTGATAATTGAGATCCCTCTCCCTGACAgg               >  1:2387845‑M1/14‑51 (MQ=255)
                                     gACGTAATTAAGCATTGATAattgataattgataattgagatccctctccc               <  1:2783612‑M2/51‑32 (MQ=255)
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                                      aCGTAATTAAGCATTGATAattgataattgataattgagatccctctccct              <  1:6046401‑M2/51‑33 (MQ=255)
                                       aagcattgataATTGATAATTGATAATTGAGATCCCTCTCCCTGACAGgat             >  1:4873604‑M1/12‑51 (MQ=255)
                                        gTAATTAAGCATTGATAattgataattgataattgagatccctctccctga            <  1:3516723‑M2/51‑35 (MQ=255)
                                         tAATTAAGCATTGATAattgataattgataattgagatccctctccctgac           >  1:5753620‑M2/1‑16 (MQ=255)
                                         tAATTAAGCATTGATAattgataattgataattgagatccctctccctgac           >  1:6871999‑M2/1‑16 (MQ=255)
                                         tAATTAAGCATTGATAattgataattgataattgagatccctctccctgac           <  1:6491005‑M2/51‑36 (MQ=255)
                                          cattgataATTGATAATTGATAATTGAGATCCCTCTCCCTGACAGgatgat          >  1:1017112‑M1/9‑51 (MQ=255)
                                          aaTTAAGCATTGATAattgataattgataattgagatccctctccctgaca          >  1:4066010‑M2/1‑15 (MQ=255)
                                          aaTTAAGCATTGATAattgataattgataattgagatccctctccctgaca          <  1:4304070‑M2/51‑37 (MQ=255)
                                          aaTTAAGCATTGATAattgataattgataattgagatccctctccctgaca          >  1:6296695‑M2/1‑15 (MQ=255)
                                           attgataATTGATAATTGATAATTGAGATCCCTCTCCCTGACAGGATGAtt         >  1:6708688‑M1/8‑51 (MQ=255)
                                           aTTAAGCATTGATAattgataattgataattgagatccctctccctgacag         >  1:17649‑M2/1‑14 (MQ=255)
                                           aTTAAGCATTGATAattgataattgataattgagatccctctccctgacag         >  1:5132616‑M2/1‑14 (MQ=255)
                                             tgataATTGATAATTGATAATTGAGATCCCTCTCCCTGACAGGATGATTGc       <  1:4515786‑M1/46‑1 (MQ=255)
                                             tgataATTGATAATTGATAATTGAGATCCCTCTCCCTGACAGGATGATTGc       <  1:2655776‑M1/46‑1 (MQ=255)
                                             tAAGCATTGATAattgataattgataattgagatccctctccctgacagga       <  1:4963750‑M2/51‑40 (MQ=255)
                                             tAAGCATTGATAattgataattgataattgagatccctctccctgacagga       >  1:6317375‑M2/1‑12 (MQ=255)
                                               ataATTGATAATTGATAATTGAGATCCCTCTCCCTGACAGGATGATTGCat     >  1:6451790‑M1/4‑51 (MQ=255)
                                                gCATTGATAattgataattgataattgagatccctctccctgacaggatga    <  1:5263668‑M2/51‑43 (MQ=255)
                                                gCATTGATAattgataattgataattgagatccctctccctgacaggatga    >  1:2504371‑M2/1‑9 (MQ=255)
                                                 aATTGATAATTGATAATTGAGATCCCTCTCCCTGACAGGATGATTGCataa   >  1:6935522‑M1/2‑51 (MQ=255)
                                                 aATTGATAATTGATAATTGAGATCCCTCTCCCTGACAGGATGATTGCataa   >  1:626420‑M1/2‑51 (MQ=255)
                                                  attgataattgataattgataattgagatccctctccctgacaggatgatt  >  1:7032497‑M2/1‑7 (MQ=255)
                                                  |                                                  
CATGCAAAATGCTCCGGTTTCATGTCGTCAAAATGTTGACGTAATTAAGCATTGATAATTGATAATTGAGATCCCTCTCCCTGACAGGATGATTGCATAAA  >  REL606/3947804‑3947904

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap:     Deleted base: 
Reads not counted as support for junction
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint.
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication.