| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC | REL606 | 3,947,872 | (TAATTGA)2→3 | intergenic (‑66/+620) | aslA ← / ← hemY | acrylsulfatase‑like enzyme/predicted protoheme IX synthesis protein |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | REL606 | 3947854 = | 18 (0.230) | 79 (1.310) | 47/76 | 0.0 | 92.1% | intergenic (‑48/+638) | aslA/hemY | acrylsulfatase‑like enzyme/predicted protoheme IX synthesis protein |
| ? | REL606 | = 3947860 | 0 (0.000) | intergenic (‑54/+632) | aslA/hemY | acrylsulfatase‑like enzyme/predicted protoheme IX synthesis protein | |||||
Only 100 of 151 total aligned reads displayed.
CATCACTATTATTTATGCAATCATCCTGTCAGGGAGAGGGATCTCAATTATCAATTATCAAT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < REL606/3947915‑3947854‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑tcaattatcaatTATCAATGCTTAATTACGTCAACATTTTGACGACATGAAACCGGAGCATT < REL606/3947860‑3947811 CATCACTATTATTTATGCAATCATCCTGTCAGGGAGAGGGATCTCAATTAT > 1:4402910/1‑51CATCACTATTATTTATGCAATCATCCTGTCAGGGAGAGGGATCTCAATTAT < 1:457483/51‑1CATCACTATTATTTATGCAATCATCCTGTCAGGGAGAGGGATCTCAATTAT > 1:4060764/1‑51CATCACTATTATTTATGCAATCATCCTGTCAGGGAGAGGGATCTCAATTAT > 1:2061528/1‑51 TCACTATTATTTATGCAATCATCCTGTCAGGGAGAGGGATCTCAATTATCA < 1:1005814/51‑1 TCACTATTATTTATGCAATCATCCTGTCAGGGAGAGGGATCTCAATTATCA > 1:4346830/1‑51 TCACTATTATTTATGCAATCATCCTGTCAGGGAGAGGGATCTCAATTATCA < 1:1166657/51‑1 TCACTATTATTTATGCAATCATCCTGTCAGGGAGAGGCATCTCAATTAT < 1:4698362/49‑1 CACTATTATTTATGCAATCATCCTGTCAGGGAGAGGGATCTCAATTATCAA > 1:4054963/1‑51 CACTATTATTTATGCAATCATCCTGTCAGGGAGAGGGATCTCAATTATCAA > 1:3913613/1‑51 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |