| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC JC | REL606 | 4,092,861 | IS150 (+) +3 bp | coding (87‑89/429 nt) | yiiT → | stress‑induced protein |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | REL606 | 3893554 = | NA (NA) | 67 (0.880) | 52/96 | 0.2 | 100% | noncoding (1/1443 nt) | IS150 | repeat region |
| ? | REL606 | = 4092863 | 0 (0.000) | coding (89/429 nt) | yiiT | stress‑induced protein | |||||
| * | ? | REL606 | = 3894996 | NA (NA) | 84 (1.120) | 54/94 | 0.1 | 100% | noncoding (1443/1443 nt) | IS150 | repeat region |
| ? | REL606 | 4092861 = | 0 (0.000) | coding (87/429 nt) | yiiT | stress‑induced protein | |||||
Only 100 of 171 total aligned reads displayed.
AATGAAGAAGATGCCTTACTGGTGAATAAAGCCCTGGAGCTCGCCAGACATAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGATGATGGCTTAAGCGAGTT > REL606/4092811‑4092911 | aTGAAGAAGATGCCTTACTGGTGAATAAAGCCCTGGAGCTCGCCAGACATa < 1:7282465/51‑1 (MQ=255) gacctatatgcctcgtgtttaactgtccaactttttggggtcagtacaTaa < 1:4830304‑M2/3‑1 (MQ=255) gacctatatgcctcgtgtttaactgtccaactttttggggtcagtacaTaa < 1:5280168‑M2/3‑1 (MQ=255) gacctatatgcctcgtgtttaactgtccaactttttggggtcagtacaTaa < 1:4150417‑M2/3‑1 (MQ=255) acctatatgcctcgtgtttaactgtccaactttttggggtcagtacaTAAt < 1:5529143‑M2/4‑1 (MQ=255) cctatatgcctcgtgtttaactgtccaactttttggggtcagtacaTAATg < 1:4751741‑M2/5‑1 (MQ=255) cctatatgcctcgtgtttaactgtccaactttttggggtcagtacaTAATg > 1:3186373‑M2/47‑51 (MQ=255) cctatatgcctcgtgtttaactgtccaactttttggggtcagtacaTAATg > 1:3083224‑M2/47‑51 (MQ=255) aagaagATGCCTTACTGGTGAATAAAGCCCTGGAGCTCGCCAGACATAAtg > 1:93168‑M2/1‑49 (MQ=255) ctatatgcctcgtgtttaactgtccaactttttggggtcagtacaTaa < 1:968910‑M2/3‑1 (MQ=255) agaagaTGCCTTACTGGTGAATAAAGCCCTGGAGCTCGCCAGACATAAtgt < 1:6508643‑M2/51‑4 (MQ=255) agaagaTGCCTTACTGGTGAATAAAGCCCTGGAGCTCGCCAGACATAAtgt < 1:6321282‑M2/51‑4 (MQ=255) gaagaTGCCTTACTGGTGAATAAAGCCCTGGAGCTCGCCAGACATAAtgta < 1:4458585‑M2/51‑5 (MQ=255) atatgcctcgtgtttaactgtccaactttttggggtcagtacaTAATGACg > 1:1433624‑M2/44‑51 (MQ=255) atatgcctcgtgtttaactgtccaactttttggggtcagtacaTAATGACg < 1:6431661‑M2/8‑1 (MQ=255) aagaTGCCTTACTGGTGAATAAAGCCCTGGAGCTCGCCAGACATAAtgtac < 1:4187683‑M2/51‑6 (MQ=255) tatgcctcgtgtttaactgtccaactttttggggtcagtacaTAATGACGc > 1:2036150‑M2/43‑51 (MQ=255) tatgcctcgtgtttaactgtccaactttttggggtcagtacaTAATGACGc > 1:4806930‑M2/43‑51 (MQ=255) agaTGCCTTACTGGTGAATAAAGCCCTGGAGCTCGCCAGACATAAtgtact > 1:6632078‑M2/1‑45 (MQ=255) gaTGCCTTACTGGTGAATAAAGCCCTGGAGCTCGCCAGACATAAtgtactg > 1:3382930‑M2/1‑44 (MQ=255) aTGCCTTACTGGTGAATAAAGCCCTGGAGCTCGCCAGACATAAtgtactgc < 1:4324185‑M2/51‑9 (MQ=255) tGCCTTACTGGTGAATAAAGCCCTGGAGCTCGCCAGACATAAtgtactgca > 1:4238366‑M2/1‑42 (MQ=255) tGCCTTACTGGTGAATAAAGCCCTGGAGCTCGCCAGACATAAtgtactgca > 1:3310428‑M2/1‑42 (MQ=255) tGCCTTACTGGTGAATAAAGCCCTGGAGCTCGCCAGACATAAtgtactgca > 1:5952633‑M2/1‑42 (MQ=255) cctcgtgtttaactgtccaactttttggggtcagtacaTAATGACGCTCAc < 1:2079824‑M2/13‑1 (MQ=255) ctcgtgtttaactgtccaactttttggggtcagtacaTAATGACGCTCAcc < 1:29001‑M2/14‑1 (MQ=255) ccTTACTGGTGAATAAAGCCCTGGAGCTCGCCAGACATAAtgtactgcacc < 1:5738474‑M2/51‑12 (MQ=255) cTTACTGGTGAATAAAGCCCTGGAGCTCGCCAGACATAAtgtactgcaccc < 1:4897014‑M2/51‑13 (MQ=255) cgtgtttaactgtccaactttttggggtcagtacaTAATGACGCTCACCTg > 1:3987593‑M2/36‑51 (MQ=255) tgtttaactgtccaactttttggggtcagtacaTAATGACGCTCACCTGAc < 1:5686899‑M2/18‑1 (MQ=255) aCTGGTGAATAAAGCCCTGGAGCTCGCCAGACATAAtgtactgcacccatt < 1:2350863‑M2/51‑16 (MQ=255) gtttaactgtccaactttttggggtcagtacaTAATGACGCTCACCTGACg > 1:1757410‑M2/33‑51 (MQ=255) cTGGTGAATAAAGCCCTGGAGCTCGCCAGACATAAtgtactgcacccattt > 1:3298499‑M2/1‑35 (MQ=255) cTGGTGAATAAAGCCCTGGAGCTCGCCAGACATAAtgtactgcacccattt < 1:1674999‑M2/51‑17 (MQ=255) cTGGTGAATAAAGCCCTGGAGCTCGCCAGACATAAtgtactgcacccattt > 1:6459898‑M2/1‑35 (MQ=255) 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tAAAGCCCTGGAGCTCGCCAGACATAAtgtactgcacccattttgttggac > 1:4119133‑M2/1‑27 (MQ=255) gtccaactttttggggtcagtacaTAATGACGCTCACCTGACGTTACTTc > 1:5086312‑M2/25‑50 (MQ=255) gtccaactttttggggtcagtacaTAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCa > 1:6805289‑M2/25‑51 (MQ=255) aaaGCCCTGGAGCTCGCCAGACATAAtgtactgcacccattttgttggacg < 1:3580051‑M2/51‑26 (MQ=255) ccaactttttggggtcagtacaTAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCata < 1:4673013‑M2/29‑1 (MQ=255) aaGCCCTGGAGCTCGCCAGACATAAtgtactgcacccattttgttggacga < 1:6610772‑M2/51‑27 (MQ=255) caactttttggggtcagtacaTAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCatat < 1:2025386‑M2/30‑1 (MQ=255) gCCCTGGAGCTCGCCAGACATAAtgtactgcacccattttgttggacgatg > 1:2846750‑M2/1‑23 (MQ=255) gCCCTGGAGCTCGCCAGACATAAtgtactgcacccattttgttggacgatg > 1:4117595‑M2/1‑23 (MQ=255) aactttttggggtcagtacaTAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATAtt < 1:6571164‑M2/31‑1 (MQ=255) aactttttggggtcagtacaTAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATAtt < 1:2576096‑M2/31‑1 (MQ=255) aactttttggggtcagtacaTAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATAtt > 1:6340898‑M2/21‑51 (MQ=255) cccTGGAGCTCGCCAGACATAAtgtactgcacccattttgttggacgatga > 1:6014195‑M2/1‑22 (MQ=255) cccTGGAGCTCGCCAGACATAAtgtactgcacccattttgttggacgat > 1:3058316‑M2/1‑22 (MQ=255) ccTGGAGCTCGCCAGACATAAtgtactgcacccattttgttggacgatgaa > 1:3408784‑M2/1‑21 (MQ=255) tttttggggtcagtacaTAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATtgat < 1:4600926‑M2/34‑1 (MQ=255) tttttggggtcagtacaTAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATtgat > 1:6320054‑M2/18‑51 (MQ=255) tttttggggtcagtacaTAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATtgat > 1:6769648‑M2/18‑51 (MQ=255) cTGGAGCTCGCCAGACATAAtgtactgcacccattttgttggacgatgaaa > 1:2823935‑M2/1‑20 (MQ=255) ttttggggtcagtacaTAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATtgatg < 1:3111243‑M2/35‑1 (MQ=255) ttttggggtcagtacaTAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATtgatg > 1:5662157‑M2/17‑51 (MQ=255) tGGAGCTCGCCAGACATAAtgtactgcacccattttgttggacgatgaaat > 1:6164605‑M2/1‑19 (MQ=255) tGGAGCTCGCCAGACATAAtgtactgcacccattttgttggacgatgaaat < 1:1876639‑M2/51‑33 (MQ=255) tGGAGCTCGCCAGACATAAtgtactgcacccattttgttggacgatgaaat < 1:3808735‑M2/51‑33 (MQ=255) tGGAGCTCGCCAGACATAAtgtactgcacccattttgttggacgatgaaat > 1:3490963‑M2/1‑19 (MQ=255) tttggggtcagtacaTAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATtgatga > 1:5715580‑M2/16‑51 (MQ=255) tttggggtcagtacaTAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATtgatga > 1:2561803‑M2/16‑51 (MQ=255) ttggggtcagtacaTAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTgatgat < 1:5896782‑M2/37‑1 (MQ=255) ttggggtcagtacaTAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTgatgat < 1:1267096‑M2/37‑1 (MQ=255) gAGCTCGCCAGACATAAtgtactgcacccattttgttggacgatgaaatgg < 1:363281‑M2/51‑35 (MQ=255) tggggtcagtacaTAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGatgatg > 1:3675301‑M2/14‑51 (MQ=255) ggggtcagtacaTAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGATGATgg < 1:5992804‑M2/39‑1 (MQ=255) gCTCGCCAGACATAAtgtactgcacccattttgttggacgatgaaatggaa > 1:6102769‑M2/1‑15 (MQ=255) gCTCGCCAGACATAAtgtactgcacccattttgttggacgatgaaatggaa > 1:1013206‑M2/1‑15 (MQ=255) cTCGCCAGACATAAtgtactgcacccattttgttggacgatgaaatggaat > 1:5245902‑M2/1‑14 (MQ=255) cTCGCCAGACATAAtgtactgcacccattttgttggacgatgaaatggaat < 1:6680198‑M2/51‑38 (MQ=255) 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aTAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGATGATGGCTTAAGCGAGt > 1:4960940‑M2/2‑51 (MQ=255) tAAtgtactgcacccattttgttggacgatgaaatggaatagcccctaata > 1:3237263‑M2/1‑3 (MQ=255) tAAtgtactgcacccattttgttggacgatgaaatggaatagcccctaata < 1:1015200‑M2/51‑49 (MQ=255) tAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGATGATGGCTTAAGCGAGtt < 1:4723284/51‑1 (MQ=255) tAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGATGATGGCTTAAGCGAGtt > 1:4419339/1‑51 (MQ=255) | AATGAAGAAGATGCCTTACTGGTGAATAAAGCCCTGGAGCTCGCCAGACATAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGATGATGGCTTAAGCGAGTT > REL606/4092811‑4092911 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |