| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC JC | REL606 | 4,092,861 | IS150 (+) +3 bp | coding (87‑89/429 nt) | yiiT → | stress‑induced protein |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | REL606 | 3893554 = | NA (NA) | 67 (0.880) | 52/96 | 0.2 | 100% | noncoding (1/1443 nt) | IS150 | repeat region |
| ? | REL606 | = 4092863 | 0 (0.000) | coding (89/429 nt) | yiiT | stress‑induced protein | |||||
| * | ? | REL606 | = 3894996 | NA (NA) | 84 (1.120) | 54/94 | 0.1 | 100% | noncoding (1443/1443 nt) | IS150 | repeat region |
| ? | REL606 | 4092861 = | 0 (0.000) | coding (87/429 nt) | yiiT | stress‑induced protein | |||||
Only 100 of 169 total aligned reads displayed.
AATCAGACCTATATGCCTCGTGTTTAACTGTCCAACTTTTTGGGGTCAGTACA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > REL606/3894944‑3894996‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑acaTAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGATGATGGCTTAAGCGAGT > REL606/4092861‑4092910 AATCAGACCTATATGCCTCGTGTTTAACTGTCCAACTTTTTGGGGTCAGTA < 1:101409/51‑1AATCAGACCTATATGCCTCGTGTTTAACTGTCCAACTTTTTGGGGTCAGTA < 1:861819/51‑1AATCAGACCTATATGCCTCGTGTTTAACTGTCCAACTTTTTGGGGTCAGTA < 1:7283603/51‑1AATCAGACCTATATGCCTCGTGTTTAACTGTCCAACTTTTTGGGGTCAGTA < 1:1295286/51‑1AATCAGACCTATATGCCTCGTGTTTAACTGTCCAACTTTTTGGGGTCAGTA < 1:7083526/51‑1AATCAGACCTATATGCCTCGTGTTTAACTGTCCAACTTTTTGGGGTCAGTA > 1:6962668/1‑51AATCAGACCTATATGCCTCGTGTTTAACTGTCCAACTTTTTGGGGTCAGTA < 1:6939109/51‑1AATCAGACCTATATGCCTCGTGTTTAACTGTCCAACTTTTTGGGGTCAGTA > 1:1512653/1‑51AATCAGACCTATATGCCTCGTGTTTAACTGTCCAACTTTTTGGGGTCAGTA < 1:6881612/51‑1AATCAGACCTATATGCCTCGTGTTTAACTGTCCAACTTTTTGGGGTCAGTA < 1:1706368/51‑1AATCAGACCTATATGCCTCGTGTTTAACTGTCCAACTTTTTGGGGTCAGTA < 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1:3301189/1‑51AATCAGACCTATATGCCTCGTGTTTAACTGTCCAACTTTTTGGGGTCAGTA > 1:3770815/1‑51AATCAGACCTATATGCCTCGTGTTTAACTGTCCAACTTTTTGGGGTCAGTA < 1:3516772/51‑1AATCAGACCTATATGCCTCGTGTTTAACTGTCCAACTTTTTGGGGTCAGTA < 1:3563791/51‑1AATCAGACCTATATGCCTCGTGTTTAACTGTCCAACTTTTTGGGGTCAGTA < 1:4613409/51‑1AATCAGACCTATATGCCTCGTGTTTAACTGTCCAACTTTTTGGGGTCAGTA < 1:3636567/51‑1AATCAGACCTATATGCCTCGTGTTTAACTGTCCAACTTTTTGGGCTCAGTA > 1:3317555/1‑51 GACCTATATGCCTCGTGTTTAACTGTCCAACTTTTTGGGGTCAGTACATAA < 1:4150417/51‑1 ACCTATATGCCTCGTGTTTAACTGTCCAACTTTTTGGGGTCAGTACATAAT < 1:5529143/51‑1 CCTATATGCCTCGTGTTTAACTGTCCAACTTTTTGGGGTCAGTACATAATG > 1:3186373/1‑51 CCTATATGCCTCGTGTTTAACTGTCCAACTTTTTGGGGTCAGTACATAATG > 1:6211160/1‑51 CTATATGCCTCGTGTTTAACTGTCCAACTTTTTGGGGTCAGTACATAA < 1:968910/48‑1 ATATGCCTCGTGTTTAACTGTCCAACTTTTTGGGGTCAGTACATAATGACG < 1:6431661/51‑1 TATGCCTCGTGTTTAACTGTCCAACTTTTTGGGGTCAGTACATAATGACGC < 1:5309693/51‑1 TATGCCTCGTGTTTAACTGTCCAACTTTTTGGGGTCAGTACATAATGACGC > 1:4806930/1‑51 ATGCCTCGTGTTTAACTGTCCAACTTTTTGGGGTCAGTACATAATGACGCT > 1:700826/1‑51 ATGCCTCGTGTTTAACTGTCCAACTTTTTGGGGTCAGTACATAATGACGCT > 1:2978638/1‑51 GCCTCGTGTTTAACTGTCCAACTTTTTGGGGTCAGTACATAATGACGCTCA > 1:1311549/1‑51 CCTCGTGTTTAACTGTCCAACTTTTTGGGGTCAGTACATAATGACGCTCAC < 1:2079824/51‑1 CGTGTTTAACTGTCCAACTTTTTGGGGTCAGTACATAATGACGCTCACCTG > 1:3987593/1‑51 GTGTTTAACTGTCCAACTTTTTGGGGTCAGTACATAATGACGCTCACCTGA < 1:2254275/51‑1 TGTTTAACTGTCCAACTTTTTGGGGTCAGTACATAATGACGCTCACCTGAC < 1:5721127/51‑1 GTTTAACTGTCCAACTTTTTGGGGTCAGTACATAATGACGCTCACCTGACG > 1:3078687/1‑51 TTAACTGTCCAACTTTTTGGGGTCAGTACATAATGACGCTCACCTGACGTT > 1:2063577/1‑51 TAACTGTCCAACTTTTTGGGGTCAGTACATAATGACGCTCACCTGACGTTA > 1:2845861/1‑51 AACTGTCCAACTTTTTGGGGTCAGTACATAATGACGCTCACCTGACGTTAA < 1:5253/51‑1 AACTGTCCAACTTTTTGGGGTCAGTACATAATGACGCTCACCTGACGTTAA > 1:2378057/1‑51 ACTGTCCAACTTTTTGGGGTCAGTACATAATGACGCTCACCTGACGTTAAT < 1:1821937/51‑1 ACTGTCCAACTTTTTGGGGTCAGTACATAATGACGCTCACCTGACGTTAAT > 1:1492060/1‑51 ACTGTCCAACTTTTTGGGGTCAGTACATAATGACGCTCACCTGACGTTAAT < 1:7022249/51‑1 ACTGTCCAACTTTTTGGGGTCAGTACATAATGACGCTCACCTGACGTTAAT < 1:810982/51‑1 GTCCAACTTTTTGGGGTCAGTACATAATGACGCTCACCTGACGTTACTTC > 1:5086312/1‑50 GTCCAACTTTTTGGGGTCAGTACATAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCA > 1:5802123/1‑51 CCAACTTTTTGGGGTCAGTACATAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATA < 1:4673013/51‑1 CAACTTTTTGGGGTCAGTACATAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATAT < 1:2025386/51‑1 AACTTTTTGGGGTCAGTACATAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATT > 1:6340898/1‑51 TTTTTGGGGTCAGTACATAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGAT > 1:3206545/1‑51 TTTTTGGGGTCAGTACATAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGAT < 1:4600926/51‑1 TTTTTGGGGTCAGTACATAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGAT > 1:2625370/1‑51 TTTTTGGGGTCAGTACATAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGAT > 1:6769648/1‑51 TTTTTGGGGTCAGTACATAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGAT > 1:6320054/1‑51 TTTTGGGGTCAGTACATAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGATG < 1:3111243/51‑1 TTTTGGGGTCAGTACATAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGATG > 1:5662157/1‑51 TTTTGGGGTCAGTACATAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGATG > 1:1530178/1‑51 TTTGGGGTCAGTACATAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGATGA > 1:2561803/1‑51 TTTGGGGTCAGTACATAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGATGA > 1:5715580/1‑51 TTGGGGTCAGTACATAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGATGAT > 1:5994739/1‑51 TTGGGGTCAGTACATAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGATGAT > 1:6412700/1‑51 TCAGTACATAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGATGATGGCTTA < 1:1074327/51‑1 TCAGTACATAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGATGATGGCTTA > 1:7233933/1‑51 CAGTACATAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGATGATGGCTTAA < 1:946113/51‑1 GTACATAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGATGACGGCTTAAGC < 1:3594428/51‑1 ACATAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGATGATGGCTTAAGCGA > 1:1402455/1‑51 ACATAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGATGATGGCTTAAGCGA < 1:5154711/51‑1 CATAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGATGATGGCTTAAGCGAG > 1:6654627/1‑51 CATAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGATGATGGCTTAAGCGAG < 1:4911410/51‑1 CATAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGATGATGGCTTAAGCGAG < 1:7237393/51‑1 CATAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGATGATGGCTTAAGCGAG > 1:1229143/1‑51 CATAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGATGATGGCTTAAGCGAG > 1:5958298/1‑51 ATAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGATGATGGCTTAAGCGAGT > 1:4731477/1‑51 ATAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGATGATGGCTTAAGCGAGT < 1:5661749/51‑1 ATAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGATGATGGCTTAAGCGAGT > 1:4324331/1‑51 AATCAGACCTATATGCCTCGTGTTTAACTGTCCAACTTTTTGGGGTCAGTACA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > REL606/3894944‑3894996‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑acaTAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGATGATGGCTTAAGCGAGT > REL606/4092861‑4092910 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |