| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC JC | REL606 | 4,092,861 | IS150 (+) +3 bp | coding (87‑89/429 nt) | yiiT → | stress‑induced protein |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | REL606 | 3893554 = | NA (NA) | 67 (0.880) | 52/96 | 0.2 | 100% | noncoding (1/1443 nt) | IS150 | repeat region |
| ? | REL606 | = 4092863 | 0 (0.000) | coding (89/429 nt) | yiiT | stress‑induced protein | |||||
| * | ? | REL606 | = 3894996 | NA (NA) | 84 (1.120) | 54/94 | 0.1 | 100% | noncoding (1443/1443 nt) | IS150 | repeat region |
| ? | REL606 | 4092861 = | 0 (0.000) | coding (87/429 nt) | yiiT | stress‑induced protein | |||||
Only 100 of 174 total aligned reads displayed.
TGAAGAAGATGCCTTACTGGTGAATAAAGCCCTGGAGCTCGCCAGACATAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGATGATGGCTTAAGCGAGTTGT > REL606/4092813‑4092913 | tGAAGAAGATGCCTTACTGGTGAATAAAGCCCTGGAGCTCGCCAGACATaa > 1:502957/1‑51 (MQ=255)tGAAGAAGATGCCTTACTGGTGAATAAAGCCCTGGAGCTCGCCAGACATaa > 1:6912767/1‑51 (MQ=255)gacctatatgcctcgtgtttaactgtccaactttttggggtcagtacaTaa < 1:4150417‑M2/3‑1 (MQ=255) acctatatgcctcgtgtttaactgtccaactttttggggtcagtacaTAAt < 1:5529143‑M2/4‑1 (MQ=255) cctatatgcctcgtgtttaactgtccaactttttggggtcagtacaTAATg > 1:3083224‑M2/47‑51 (MQ=255) cctatatgcctcgtgtttaactgtccaactttttggggtcagtacaTAATg > 1:4302654‑M2/47‑51 (MQ=255) cctatatgcctcgtgtttaactgtccaactttttggggtcagtacaTAATg > 1:6211160‑M2/47‑51 (MQ=255) cctatatgcctcgtgtttaactgtccaactttttggggtcagtacaTAATg < 1:4751741‑M2/5‑1 (MQ=255) aagaagATGCCTTACTGGTGAATAAAGCCCTGGAGCTCGCCAGACATAAtg > 1:93168‑M2/1‑49 (MQ=255) ctatatgcctcgtgtttaactgtccaactttttggggtcagtacaTaa < 1:968910‑M2/3‑1 (MQ=255) ctatatgcctcgtgtttaactgtccaactttttggggtcagtacaTAATGa > 1:3401500‑M2/46‑51 (MQ=255) agaagaTGCCTTACTGGTGAATAAAGCCCTGGAGCTCGCCAGACATAAtgt < 1:6321282‑M2/51‑4 (MQ=255) agaagaTGCCTTACTGGTGAATAAAGCCCTGGAGCTCGCCAGACATAAtgt > 1:575741‑M2/1‑48 (MQ=255) agaagaTGCCTTACTGGTGAATAAAGCCCTGGAGCTCGCCAGACATAAtgt < 1:6508643‑M2/51‑4 (MQ=255) atatgcctcgtgtttaactgtccaactttttggggtcagtacaTAATGACg > 1:1433624‑M2/44‑51 (MQ=255) atatgcctcgtgtttaactgtccaactttttggggtcagtacaTAATGACg > 1:3557048‑M2/44‑51 (MQ=255) aagaTGCCTTACTGGTGAATAAAGCCCTGGAGCTCGCCAGACATAAtgtac < 1:4187683‑M2/51‑6 (MQ=255) tatgcctcgtgtttaactgtccaactttttggggtcagtacaTAATGACGc < 1:5309693‑M2/9‑1 (MQ=255) tatgcctcgtgtttaactgtccaactttttggggtcagtacaTAATGACGc > 1:2036150‑M2/43‑51 (MQ=255) tatgcctcgtgtttaactgtccaactttttggggtcagtacaTAATGACGc > 1:4806930‑M2/43‑51 (MQ=255) atgcctcgtgtttaactgtccaactttttggggtcagtacaTAATGACGCt < 1:6754763‑M2/10‑1 (MQ=255) atgcctcgtgtttaactgtccaactttttggggtcagtacaTAATGACGCt > 1:700826‑M2/42‑51 (MQ=255) atgcctcgtgtttaactgtccaactttttggggtcagtacaTAATGACGCt > 1:2978638‑M2/42‑51 (MQ=255) tgcctcgtgtttaactgtccaactttttggggtcagtacaTAATGACGCTc > 1:3825693‑M2/41‑51 (MQ=255) aTGCCTTACTGGTGAATAAAGCCCTGGAGCTCGCCAGACATAAtgtactgc < 1:4324185‑M2/51‑9 (MQ=255) tGCCTTACTGGTGAATAAAGCCCTGGAGCTCGCCAGACATAAtgtactgca > 1:5952633‑M2/1‑42 (MQ=255) cctcgtgtttaactgtccaactttttggggtcagtacaTAATGACGCTCAc < 1:2079824‑M2/13‑1 (MQ=255) cTTACTGGTGAATAAAGCCCTGGAGCTCGCCAGACATAAtgtactgcaccc < 1:4897014‑M2/51‑13 (MQ=255) ttACTGGTGAATAAAGCCCTGGAGCTCGCCAGACATAAtgtactgcaccca > 1:4714562‑M2/1‑38 (MQ=255) cgtgtttaactgtccaactttttggggtcagtacaTAATGACGCTCACCTg > 1:3987593‑M2/36‑51 (MQ=255) tACTGGTGAATAAAGCCCTGGAGCTCGCCAGACATAAtgtactgcacccat < 1:3184874‑M2/51‑15 (MQ=255) tgtttaactgtccaactttttggggtcagtacaTAATGACGCTCACCTGAc < 1:5721127‑M2/18‑1 (MQ=255) aCTGGTGAATAAAGCCCTGGAGCTCGCCAGACATAAtgtactgcacccatt < 1:2350863‑M2/51‑16 (MQ=255) gtttaactgtccaactttttggggtcagtacaTAATGACGCTCACCTGACg > 1:1757410‑M2/33‑51 (MQ=255) cTGGTGAATAAAGCCCTGGAGCTCGCCAGACATAAtgtactgcacccattt < 1:1674999‑M2/51‑17 (MQ=255) cTGGTGAATAAAGCCCTGGAGCTCGCCAGACATAAtgtactgcacccattt > 1:6459898‑M2/1‑35 (MQ=255) cTGGTGAATAAAGCCCTGGAGCTCGCCAGACATAAtgtactgcacccattt > 1:3298499‑M2/1‑35 (MQ=255) ttaactgtccaactttttggggtcagtacaTAATGACGCTCACCTGACGtt > 1:2226194‑M2/31‑51 (MQ=255) tGAATAAAGCCCTGGAGCTCGCCAGACATAAtgtactgcacccattttgtt > 1:2444182‑M2/1‑31 (MQ=255) aactgtccaactttttggggtcagtacaTAATGACGCTCACCTGACGTTaa < 1:5253‑M2/23‑1 (MQ=255) actgtccaactttttggggtcagtacaTAATGACGCTCACCTGACGTTAAt < 1:1821937‑M2/24‑1 (MQ=255) actgtccaactttttggggtcagtacaTAATGACGCTCACCTGACGTTAAt < 1:7022249‑M2/24‑1 (MQ=255) tgtccaactttttggggtcagtacaTAATGACGCTCACCTGACGTTAATTc > 1:1373213‑M2/26‑51 (MQ=255) aTAAAGCCCTGGAGCTCGCCAGACATAAtgtactgcacccattttgttgga < 1:614782‑M2/51‑24 (MQ=255) tAAAGCCCTGGAGCTCGCCAGACATAAtgtactgcacccattttgttggac > 1:4119133‑M2/1‑27 (MQ=255) gtccaactttttggggtcagtacaTAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCa > 1:5802123‑M2/25‑51 (MQ=255) ccaactttttggggtcagtacaTAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCata < 1:4673013‑M2/29‑1 (MQ=255) aaGCCCTGGAGCTCGCCAGACATAAtgtactgcacccattttgttggacga < 1:6610772‑M2/51‑27 (MQ=255) aaGCCCTGGAGCTCGCCAGACATAAtgtactgcacccattttgttggacga > 1:3364289‑M2/1‑25 (MQ=255) caactttttggggtcagtacaTAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCatat < 1:2025386‑M2/30‑1 (MQ=255) gCCCTGGAGCTCGCCAGACATAAtgtactgcacccattttgttggacgatg > 1:4117595‑M2/1‑23 (MQ=255) gCCCTGGAGCTCGCCAGACATAAtgtactgcacccattttgttggacgatg > 1:2846750‑M2/1‑23 (MQ=255) aactttttggggtcagtacaTAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATAtt < 1:6571164‑M2/31‑1 (MQ=255) aactttttggggtcagtacaTAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATAtt > 1:2414780‑M2/21‑51 (MQ=255) cccTGGAGCTCGCCAGACATAAtgtactgcacccattttgttggacgat > 1:3058316‑M2/1‑22 (MQ=255) ccTGGAGCTCGCCAGACATAAtgtactgcacccattttgttggacgatgaa > 1:3408784‑M2/1‑21 (MQ=255) ccTGGAGCTCGCCAGACATAAtgtactgcacccattttgttggacgatgaa > 1:2819069‑M2/1‑21 (MQ=255) tttttggggtcagtacaTAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATtgat < 1:4600926‑M2/34‑1 (MQ=255) tttttggggtcagtacaTAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATtgat > 1:3206545‑M2/18‑51 (MQ=255) tttttggggtcagtacaTAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATtgat > 1:6769648‑M2/18‑51 (MQ=255) tttttggggtcagtacaTAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATtgat > 1:2625370‑M2/18‑51 (MQ=255) cTGGAGCTCGCCAGACATAAtgtactgcacccattttgttggacgatgaaa > 1:2823935‑M2/1‑20 (MQ=255) ttttggggtcagtacaTAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATtgatg > 1:1530178‑M2/17‑51 (MQ=255) tGGAGCTCGCCAGACATAAtgtactgcacccattttgttggacgatgaaat < 1:1876639‑M2/51‑33 (MQ=255) tttggggtcagtacaTAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATtgatga > 1:5715580‑M2/16‑51 (MQ=255) tttggggtcagtacaTAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATtgatga > 1:2561803‑M2/16‑51 (MQ=255) ttggggtcagtacaTAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTgatgat < 1:1267096‑M2/37‑1 (MQ=255) ttggggtcagtacaTAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTgatgat > 1:6412700‑M2/15‑51 (MQ=255) ttggggtcagtacaTAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTgatgat > 1:5994739‑M2/15‑51 (MQ=255) tggggtcagtacaTAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGatgatg > 1:3675301‑M2/14‑51 (MQ=255) ggggtcagtacaTAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGATGATgg < 1:20795‑M2/39‑1 (MQ=255) gCTCGCCAGACATAAtgtactgcacccattttgttggacgatgaaatggaa > 1:1013206‑M2/1‑15 (MQ=255) gCTCGCCAGACATAAtgtactgcacccattttgttggacgatgaaatggaa > 1:6102769‑M2/1‑15 (MQ=255) gggccagtacaTAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGATGATGGc > 1:611621‑M2/12‑51 (MQ=255) cGCCAGACATAAtgtactgcacccattttgttggacgatgaaatggaatag > 1:6332815‑M2/1‑12 (MQ=255) tcagtacaTAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGATGATGGCTTa < 1:1074327‑M2/43‑1 (MQ=255) gCCAGACATAAtgtactgcacccattttgttggacgatgaaatggaatagc > 1:4330765‑M2/1‑11 (MQ=255) ccAGACATAAtgtactgcacccattttgttggacgatgaaatggaatagcc > 1:6848655‑M2/1‑10 (MQ=255) cagtacaTAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGATGATGGCTTaa > 1:448615‑M2/8‑51 (MQ=255) cAGACATAAtgtactgcacccattttgttggacgatgaaatggaatagccc < 1:5668271‑M2/51‑43 (MQ=255) agtacaTAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGATGATGGCTTAAg < 1:742169‑M2/45‑1 (MQ=255) gtacaTAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGATGACGGCTTAAGc < 1:3594428‑M2/46‑1 (MQ=255) gACATAAtgtactgcacccattttgttggacgatgaaatggaatagcccct > 1:4920471‑M2/1‑7 (MQ=255) gACATAAtgtactgcacccattttgttggacgatgaaatggaatagcccct > 1:4859498‑M2/1‑7 (MQ=255) acaTAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGATGATGGCTTAAGCGa < 1:1974473‑M2/48‑1 (MQ=255) acaTAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGATGATGGCTTAAGCGa < 1:5154711‑M2/48‑1 (MQ=255) caTAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGATGATGGCTTAAGCGAg < 1:7237393‑M2/49‑1 (MQ=255) caTAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGATGATGGCTTAAGCGAg > 1:6654627‑M2/3‑51 (MQ=255) caTAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGATGATGGCTTAAGCGAg > 1:5958298‑M2/3‑51 (MQ=255) caTAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGATGATGGCTTAAGCGAg > 1:1229143‑M2/3‑51 (MQ=255) cATAAtgtactgcacccattttgttggacgatgaaatggaatagcccctaa > 1:5233091‑M2/1‑5 (MQ=255) aTAAtgtactgcacccattttgttggacgatgaaatggaatagcccctaat > 1:5142717‑M2/1‑4 (MQ=255) aTAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGATGATGGCTTAAGCGAGt < 1:5661749‑M2/50‑1 (MQ=255) tAAtgtactgcacccattttgttggacgatgaaatggaatagcccctaata > 1:3237263‑M2/1‑3 (MQ=255) tAAtgtactgcacccattttgttggacgatgaaatggaatagcccctaata < 1:1015200‑M2/51‑49 (MQ=255) tAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGATGATGGCTTAAGCGAGtt > 1:4419339/1‑51 (MQ=255) tAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGATGATGGCTTAAGCGAGtt < 1:4723284/51‑1 (MQ=255) tAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGATGATGGCTTAAGCGAGtt > 1:3738704/1‑51 (MQ=255) aaTGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGATGATGGCTTAAGCg > 1:791925/1‑46 (MQ=255) aTGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGATGATGGCTTAAGCGAGTTGt > 1:717274/1‑51 (MQ=255) | TGAAGAAGATGCCTTACTGGTGAATAAAGCCCTGGAGCTCGCCAGACATAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGATGATGGCTTAAGCGAGTTGT > REL606/4092813‑4092913 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |