| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC JC | REL606 | 1,619,834 | IS150 (–) +3 bp | intergenic (‑71/+139) | hokD ← / ← ECB_01533 | small toxic polypeptide/conserved hypothetical protein |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | REL606 | 664688 = | NA (NA) | 69 (0.900) | 50/96 | 0.2 | 98.5% | noncoding (1/1443 nt) | IS150 | repeat region |
| ? | REL606 | 1619834 = | 1 (0.010) | intergenic (‑71/+141) | hokD/ECB_01533 | small toxic polypeptide/conserved hypothetical protein | |||||
| * | ? | REL606 | = 666130 | NA (NA) | 55 (0.700) | 41/98 | 0.8 | 98.1% | noncoding (1443/1443 nt) | IS150 | repeat region |
| ? | REL606 | = 1619836 | 1 (0.010) | intergenic (‑73/+139) | hokD/ECB_01533 | small toxic polypeptide/conserved hypothetical protein | |||||
Only 100 of 136 total aligned reads displayed.
GGCACGTAAGAGGCTAACCTACATGTGTCTAGCATGAAATTGGCCTCAGATTAATGTTAAGCGTCTTGCAGGACGCGTAATGTTAACTGGGGCTTTTCTCT > REL606/1619786‑1619886 | tattaggggctattccatttcatcgtccaacaaaatgggtgcagtacaGAt > 1:4023052‑M2/49‑51 (MQ=255)tattaggggctattccatttcatcgtccaacaaaatgggtgcagtacaGAt < 1:759715‑M2/3‑1 (MQ=255)tattaggggctattccatttcatcgtccaacaaaatgggtgcagtacaGAt < 1:338451‑M2/3‑1 (MQ=255)tattaggggctattccatttcatcgtccaacaaaatgggtgcagtacaGAt > 1:5036659‑M2/49‑51 (MQ=255)ggCACGTAAGAGGCTAACCTACATGTGTCTAGCATGAAATTGGCCTCAGAt > 1:4576483/1‑51 (MQ=255) attaggggctattccatttcatcgtccaacaaaatgggtgcagtacaGAtt < 1:7075695‑M2/4‑1 (MQ=255) ttaggggctattccatttcatcgtccaacaaaatgggtgcagtacaGATTa > 1:1899332‑M2/47‑51 (MQ=255) ttaggggctattccatttcatcgtccaacaaaatgggtgcagtacaGATTa < 1:5938098‑M2/5‑1 (MQ=255) cACGTAAGAGGCTAACCTACATGTGTCTAGCATGAAATTGGCCTCAGATtg < 1:1209593‑M2/51‑3 (MQ=255) aCGTAAGAGGCTAACCTACATGTGTCTAGCATGAAATTGGCCTCAGATtgt < 1:527311‑M2/51‑4 (MQ=255) aCGTAAGAGGCTAACCTACATGTGTCTAGCATGAAATTGGCCTCAGATtgt < 1:4497626‑M2/51‑4 (MQ=255) aggggctattccatttcatcgtccaacaaaatgggtgcagtacaGATTAAt > 1:5430397‑M2/45‑51 (MQ=255) aggggctattccatttcatcgtccaacaaaatgggtgcagtacaGATTAAt < 1:1687859‑M2/7‑1 (MQ=255) ggggctattccatttcatcgtccaacaaaatgggtgcagtacaGATTAATg > 1:6512432‑M2/44‑51 (MQ=255) gTAAGAGGCTAACCTACATGTGTCTAGCATGAAATTGGCCTCAGATtgtac < 1:2207637‑M2/51‑6 (MQ=255) tAAGAGGCTAACCTACATGTGTCTAGCATGAAATTGGCCTCAGATtgtact < 1:979821‑M2/51‑7 (MQ=255) tAAGAGGCTAACCTACATGTGTCTAGCATGAAATTGGCCTCAGATtgtact < 1:6413200‑M2/51‑7 (MQ=255) gggctattccatttcatcgtccaacaaaatgggtgcagtacaGATTAATGt > 1:2325707‑M2/43‑51 (MQ=255) gggctattccatttcatcgtccaacaaaatgggtgcagtacaGATTAATGt < 1:2541686‑M2/9‑1 (MQ=255) ggctattccatttcatcgtccaacaaaatgggtgcagtacaGATTAATGtt < 1:5034805‑M2/10‑1 (MQ=255) aaGAGGCTAACCTACATGTGTCTAGCATGAAATTGGCCTCAGATtgtactg < 1:4726845‑M2/51‑8 (MQ=255) aaGAGGCTAACCTACATGTGTCTAGCATGAAATTGGCCTCAGATtgtactg < 1:2021877‑M2/51‑8 (MQ=255) ctattccatttcatcgtccaacaaaatgggtgcagtacaGATTAATGTTaa > 1:2588975‑M2/40‑51 (MQ=255) attccatttcatcgtccaacaaaatgggtgcagtacaGATTAATGTTAAGc > 1:6550882‑M2/38‑51 (MQ=255) attccatttcatcgtccaacaaaatgggtgcagtacaGATTAATGTTAAGc < 1:1088839‑M2/14‑1 (MQ=255) attccatttcatcgtccaacaaaatgggtgcagtacaGATTAATGTTAAGc > 1:3632523‑M2/38‑51 (MQ=255) attccatttcatcgtccaacaaaatgggtgcagtacaGATTAATGTTAAGc > 1:2600955‑M2/38‑51 (MQ=255) tccatttcatcgtccaacaaaatgggtgcagtacaGATTAATGTTAAGCGt < 1:2122696‑M2/16‑1 (MQ=255) cTAACCTACATGTGTCTAGCATGAAATTGGCCTCAGATtgtactgacccca < 1:4357701‑M2/51‑14 (MQ=255) tAACCTACATGTGTCTAGCATGAAATTGGCCTCAGATtgtactgaccccaa < 1:2261414‑M2/51‑15 (MQ=255) catttcatcgtccaacaaaatgggtgcagtacaGATTAATGTTAAGCGTCt > 1:6128211‑M2/34‑51 (MQ=255) anCCTACATGTGTCTAGCATGAAATTGGCCTCAGATtgtactgaccccaaa < 1:1402841‑M2/51‑16 (MQ=255) aaCCTACATGTGTCTAGCATGAAATTGGCCTCAGATtgtactgaccccaaa < 1:3816440‑M2/51‑16 (MQ=255) tttcatcgtccaacaaaatgggtgcagtacaGATTAATGTTAAGCGtctcg < 1:841355‑M2/20‑3 (MQ=255) tttcatcgtccaacaaaatgggtgcagtacaGATTAATGTTAAGCGTCTTg < 1:841352‑M2/20‑1 (MQ=255) ttcatcgtccaacaaaatgggtgcagtacaGATTAATGTTAAGCGTCTTGc > 1:556478‑M2/31‑51 (MQ=255) cTACATGTGTCTAGCATGAAATTGGCCTCAGATtgtactgaccccaaaaag < 1:1599320‑M2/51‑19 (MQ=255) tcatcgtccaacaaaatgggtgcagtacaGATTAATGTTAAGCGTCTTGCa > 1:2036526‑M2/30‑51 (MQ=255) tcatcgtccaacaaaatgggtgcagtacaGATTAATGTTAAGCGTCTTGCa < 1:5356306‑M2/22‑1 (MQ=255) aCATGTGTCTAGCATGAAATTGGCCTCAGATtgtactgaccccaaaaagtt > 1:960686‑M2/1‑31 (MQ=255) cATGTGTCTAGCATGAAATTGGCCTCAGATtgtactgaccccaaaaagttg < 1:4072633‑M2/51‑22 (MQ=255) tcgtccaacaaaatgggtgcagtacaGATTAATGTTAAGCGTCTTGCAGGa > 1:6903668‑M2/27‑51 (MQ=255) aTGTGTCTAGCATGAAATTGGCCTCAGATtgtactgaccccaaaaagttgg < 1:2764976‑M2/51‑23 (MQ=255) tgtgTCTAGCATGAAATTGGCCTCAGATtgtactgaccccaaaaagttgga < 1:5295488‑M2/51‑24 (MQ=255) cgtccaacaaaatgggtgcagtacaGATTAATGTTAAGCGTCTTGCAGGAc < 1:6832334‑M2/26‑1 (MQ=255) cgtccaacaaaatgggtgcagtacaGATTAATGTTAAGCGTCTTGCAGGAc < 1:1524180‑M2/26‑1 (MQ=255) gtgtCTAGCATGAAATTGGCCTCAGATtgtactgaccccaaaaagttggac < 1:1812606‑M2/51‑25 (MQ=255) gtgtCTAGCATGAAATTGGCCTCAGATtgtactgaccccaaaaagttggac > 1:3258502‑M2/1‑27 (MQ=255) gtccaacaaaatgggtgcagtacaGATTAATGTTAAGCGTCTTGCAGGAcg > 1:6654599‑M2/25‑51 (MQ=255) tccaacaaaatgggtgcagtacaGATTAATGTTAAGCGTCTTGCAGGAcgc < 1:275603‑M2/28‑1 (MQ=255) gtCTAGCATGAAATTGGCCTCAGATtgtactgaccccaaaaagttggacag < 1:643142‑M2/51‑27 (MQ=255) gtCTAGCATGAAATTGGCCTCAGATtgtactgaccccaaaaagttggacag > 1:1546594‑M2/1‑25 (MQ=255) ccaacaaaatgggtgcagtacaGATTAATGTTAAGCGTCTTGCAGGAcgcg > 1:4324500‑M2/23‑51 (MQ=255) ccaacaaaatgggtgcagtacaGATTAATGTTAAGCGTCTTGCAGGAcgcg > 1:1727298‑M2/23‑51 (MQ=255) ccaacaaaatgggtgcagtacaGATTAATGTTAAGCGTCTTGCAGGAcgcg > 1:2870235‑M2/23‑51 (MQ=255) ccaacaaaatgggtgcagtacaGATTAATGTTAAGCGTCTTGCAGGAcgcg > 1:6047622‑M2/23‑51 (MQ=255) ccaacaaaatgggtgcagtacaGATTAATGTTAAGCGTCTTGCAGGAcgcg > 1:2668670‑M2/23‑51 (MQ=255) tCTAGCATGAAATTGGCCTCAGATtgtactgaccccaaaaagttggacagt < 1:3429085‑M2/51‑28 (MQ=255) cTAGCATGAAATTGGCCTCAGATtgtactgaccccaaaaagttggacagtt > 1:2016978‑M2/1‑23 (MQ=255) aacaaaatgggtgcagtacaGATTAATGTTAAGCGTCTTGCAGGACGCGTa > 1:3710480‑M2/21‑51 (MQ=255) tAGCATGAAATTGGCCTCAGATtgtactgaccccaaaaagttggacagtta > 1:1004555‑M2/1‑22 (MQ=255) tAGCATGAAATTGGCCTCAGATtgtactgaccccaaaaagttggacagtta < 1:4792050‑M2/51‑30 (MQ=255) acaaaatgggtgcagtacaGATTAATGTTAAGCGTCTTGCAGGACGCGTaa < 1:814547‑M2/32‑1 (MQ=255) caaaatgggtgcagtacaGATTAATGTTAAGCGTCTTGCAGGACGCGTAAt > 1:1947064‑M2/19‑51 (MQ=255) aaaatgggtgcagtacaGATTAATGTTAAGCGTCTTGCAGGACGCGTAATg > 1:6730843‑M2/18‑51 (MQ=255) aatgggtgcagtacaGATTAATGTTAAGCGTCTTGCAGGACGCGTAATGtt > 1:5517093‑M2/16‑51 (MQ=255) aatgggtgcagtacaGATTAATGTTAAGCGTCTTGCAGGACGCGTAATGtt > 1:2160512‑M2/16‑51 (MQ=255) aTGAAATTGGCCTCAGATtgtactgaccccaaaaagttggacagttaaaca < 1:6108924‑M2/51‑34 (MQ=255) aTGAAATTGGCCTCAGATtgtactgaccccaaaaagttggacagttaaaca < 1:7255354‑M2/51‑34 (MQ=255) aTGAAATTGGCCTCAGATtgtactgaccccaaaaagttggacagttaaaca > 1:2877490‑M2/1‑18 (MQ=255) aTGAAATTGGCCTCAGATtgtactgaccccaaaaagttggacagttaaaca < 1:3559760‑M2/51‑34 (MQ=255) aTGAAATTGGCCTCAGATtgtactgaccccaaaaagttggacagttaaaca < 1:3852813‑M2/51‑34 (MQ=255) tGAAATTGGCCTCAGATtgtactgaccccaaaaagttggacagttaaacac < 1:2072990‑M2/51‑35 (MQ=255) atgggtgcagtacaGATTAATGTTAAGCGTCTTGCAGGACGCGTAATGTTa > 1:110710‑M2/15‑51 (MQ=255) gAAATTGGCCTCAGATtgtactgaccccaaaaagttggacagttaa < 1:4816583‑M2/46‑31 (MQ=255) gggtgcagtacaGATTAATGTTAAGCGTCTTGCAGGACGCATAATGTTAAc < 1:4839231‑M2/39‑1 (MQ=255) aaaTTGGCCTCAGATTAATGTTAAGCGTCTTGCAGGACGCGTAATGTTAAc > 1:6711313/1‑51 (MQ=255) gtgcagtacaGATTAATGTTAAGCGTCTTGCAGGACGCGTAATGTTAACTg < 1:6220568‑M2/41‑1 (MQ=255) gtgcagtacaGACTAATGTTAAGCGTCTTGCAGGACGCGTAATGTTAACTg > 1:4883731‑M2/11‑51 (MQ=255) tgcagtacaGATTAATGTTAAGCGTCTTGCAGGACGCGTAATGTTAACTgg > 1:4255298‑M2/10‑51 (MQ=255) tgcagtacaGATTAATGTTAAGCGTCTTGCAGGACGCGTAATGTTAACTgg < 1:3041899‑M2/42‑1 (MQ=255) tGGCCTCAGATtgtactgaccccaaaaagttggacagttaaacacgaggca > 1:595021‑M2/1‑11 (MQ=255) tGGCCTCAGATtgtactgaccccaaaaagttggacagttaaacacgaggca < 1:4391285‑M2/51‑41 (MQ=255) gcagtacaGATTAATGTTAAGCGTCTTGCAGGACGCGTAATGTTAACTggg > 1:6278666‑M2/9‑51 (MQ=255) gcagtacaGATTAATGTTAAGCGTCTTGCAGGACGCGTAATGTTAACTggg < 1:5560495‑M2/43‑1 (MQ=255) ccTCAGATtgtactgaccccaaaaagttggacagttaaacacgaggcatat > 1:3110213‑M2/1‑8 (MQ=255) cTCAGATtgtactgaccccaaaaagttggacagttaaacacgaggcatata > 1:507150‑M2/1‑7 (MQ=255) cTCAGATtgtactgaccccaaaaagttggacagttaaacacgaggcatata > 1:4368642‑M2/1‑7 (MQ=255) tCAGATtgtactgaccccaaaaagttggacagttaaacacgaggcatatag < 1:23054‑M2/51‑46 (MQ=255) tCAGATtgtactgaccccaaaaagttggacagttaaacacgaggcatatag > 1:1373116‑M2/1‑6 (MQ=255) acaGATTAATGTTAAGCGTCTTGCAGGACGCGTAATGTTAACTGGGGCttt < 1:3207371‑M2/48‑1 (MQ=255) acaGATTAATGTTAAGCGTCTTGCAGGACGCGTAATGTTAACTGGGGCttt > 1:1781609‑M2/4‑51 (MQ=255) caGATTAATGTTAAGCGTCTTGCAGGACGCGTAATGTTAACTGGGGCttnt < 1:1836241‑M2/49‑1 (MQ=255) aGATTAATGTTAAGCGTCTTGCAGGACGCGTAATGTTAACTGGGGCTTTTc < 1:331475‑M2/50‑1 (MQ=255) aGATTAATGTTAAGCGTCTTGCAGGACGCGTAATGTTAACTGGGGCTTTTc > 1:2924773‑M2/2‑51 (MQ=255) aGATTAATGTTAAGCGTCTTGCAGGACGCGTAATGTTAACTGGGGCTTTTc > 1:4718452‑M2/2‑51 (MQ=255) gATTAATGTTAAGCGTCTTGCAGGACGCGTAATGTTAACTGGGGCTTTtct > 1:6910528/1‑51 (MQ=255) gATTAATGTTAAGCGTCTTGCAGGACGCGTAATGTTAACTGGGGCTTTtct > 1:3209920/1‑51 (MQ=255) aTTAATGTTAAGCGTCTTGCAGGACGCGTAATGTTAACTGGGGCTTTtctc > 1:1645437/1‑51 (MQ=255) ttAATGTTAAGCGTCTTGCAGGACGCGTAATGTTAACTGGGGCTTTTctct < 1:1640588/51‑1 (MQ=255) | GGCACGTAAGAGGCTAACCTACATGTGTCTAGCATGAAATTGGCCTCAGATTAATGTTAAGCGTCTTGCAGGACGCGTAATGTTAACTGGGGCTTTTCTCT > REL606/1619786‑1619886 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |