| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC JC | REL606 | 1,619,834 | IS150 (–) +3 bp | intergenic (‑71/+139) | hokD ← / ← ECB_01533 | small toxic polypeptide/conserved hypothetical protein |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | REL606 | 664688 = | NA (NA) | 69 (0.900) | 50/96 | 0.2 | 98.5% | noncoding (1/1443 nt) | IS150 | repeat region |
| ? | REL606 | 1619834 = | 1 (0.010) | intergenic (‑71/+141) | hokD/ECB_01533 | small toxic polypeptide/conserved hypothetical protein | |||||
| * | ? | REL606 | = 666130 | NA (NA) | 55 (0.700) | 41/98 | 0.8 | 98.1% | noncoding (1443/1443 nt) | IS150 | repeat region |
| ? | REL606 | = 1619836 | 1 (0.010) | intergenic (‑73/+139) | hokD/ECB_01533 | small toxic polypeptide/conserved hypothetical protein | |||||
TATTAGGGGCTATTCCATTTCATCGTCCAACAAAATGGGTGCAGTACA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < REL606/664735‑664688‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑caGATTAATGTTAAGCGTCTTGCAGGACGCGTAATGTTAACTGGGGCTTTTC > REL606/1619834‑1619883 TATTAGGGGCTATTCCATTTCATCGTCCAACAAAATGGGTGCAGTACAGAT < 1:338451/51‑1TATTAGGGGCTATTCCATTTCATCGTCCAACAAAATGGGTGCAGTACAGAT < 1:759715/51‑1TATTAGGGGCTATTCCATTTCATCGTCCAACAAAATGGGTGCAGTACAGAT < 1:2130003/51‑1TATTAGGGGCTATTCCATTTCATCGTCCAACAAAATGGGTGCAGTACAGAT > 1:4023052/1‑51TATTAGGGGCTATTCCATTTCATCGTCCAACAAAATGGGTGCAGTACAGAT > 1:5036659/1‑51 ATTAGGGGCTATTCCATTTCATCGTCCAACAAAATGGGTGCAGTACAGATT < 1:7075695/51‑1 TTAGGGGCTATTCCATTTCATCGTCCAACAAAATGGGTGCAGTACAGATTA < 1:5938098/51‑1 TTAGGGGCTATTCCATTTCATCGTCCAACAAAATGGGTGCAGTACAGATTA > 1:1899332/1‑51 TAGGGGCTATTCCATTTCATCGTCCAACAAAATGGGTGCAGTACAGATTAA < 1:2828136/51‑1 TAGGGGCTATTCCATTTCATCGTCCAACAAAATGGGTGCAGTACAGATTAA > 1:5548680/1‑51 AGGGGCTATTCCATTTCATCGTCCAACAAAATGGGTGCAGTACAGATTAAT > 1:5430397/1‑51 AGGGGCTATTCCATTTCATCGTCCAACAAAATGGGTGCAGTACAGATTAAT < 1:1687859/51‑1 GGGGCTATTCCATTTCATCGTCCAACAAAATGGGTGCAGTACAGATTAATG > 1:6512432/1‑51 GGGCTATTCCATTTCATCGTCCAACAAAATGGGTGCAGTACAGATTAATGT < 1:6703232/51‑1 GGGCTATTCCATTTCATCGTCCAACAAAATGGGTGCAGTACAGATTAATGT > 1:2325707/1‑51 GGGCTATTCCATTTCATCGTCCAACAAAATGGGTGCAGTACAGATTAATGT < 1:2541686/51‑1 GGCTATTCCATTTCATCGTCCAACAAAATGGGTGCAGTACAGATTAATGTT < 1:5034805/51‑1 GGCTATTCCATTTCATCGTCCAACAAAATGGGTGCAGTACAGATTAATGTT < 1:6794423/51‑1 CTATTCCATTTCATCGTCCAACAAAATGGGTGCAGTACAGATTAATGTTAA > 1:2588975/1‑51 CTATTCCATTTCATCGTCCAACAAAATGGGTGCAGTACAGATTAATGTTAA < 1:4803740/51‑1 TATTCCATTTCATCGTCCAACAAAATGGGTGCAGTACAGATTAATGTTAAG > 1:504034/1‑51 TATTCCATTTCATCGTCCAACAAAATGGGTGCAGTACAGATTAATGTTAAG < 1:7017918/51‑1 TATTCCATTTCATCGTCCAACAAAATGGGTGCAGTACAGATTAATGTTAAG > 1:6107717/1‑51 ATTCCATTTCATCGTCCAACAAAATGGGTGCAGTACAGATTAATGTTAAGC > 1:6550882/1‑51 ATTCCATTTCATCGTCCAACAAAATGGGTGCAGTACAGATTAATGTTAAGC < 1:1088839/51‑1 ATTCCATTTCATCGTCCAACAAAATGGGTGCAGTACAGATTAATGTTAAGC > 1:2600955/1‑51 ATTCCATTTCATCGTCCAACAAAATGGGTGCAGTACAGATTAATGTTAAGC > 1:3632523/1‑51 TTCCATTTCATCGTCCAACAAAATGGGTGCAGTACAGATTAATGTTAAGCG < 1:4648882/51‑1 TCCATTTCATCGTCCAACAAAATGGGTGCAGTACAGATTAATGTTAAGCGT > 1:4291940/1‑51 TCCATTTCATCGTCCAACAAAATGGGTGCAGTACAGATTAATGTTAAGCGT < 1:348767/51‑1 TCCATTTCATCGTCCAACAAAATGGGTGCAGTACAGATTAATGTTAAGCGT < 1:2122696/51‑1 CATTTCATCGTCCAACAAAATGGGTGCAGTACAGATTAATGTTAAGCGTCT > 1:6128211/1‑51 TTTCATCGTCCAACAAAATGGGTGCAGTACAGATTAATGTTAAGCGTCTcg < 1:841355/51‑3 TTTCATCGTCCAACAAAATGGGTGCAGTACAGATTAATGTTAAGCGTCTTG < 1:3284285/51‑1 TTTCATCGTCCAACAAAATGGGTGCAGTACAGATTAATGTTAAGCGTCTTG < 1:841352/51‑1 TTCATCGTCCAACAAAATGGGTGCAGTACAGATTAATGTTAAGCGTCTTGC > 1:556478/1‑51 TCATCGTCCAACAAAATGGGTGCAGTACAGATTAATGTTAAGCGTCTTGCA < 1:5356306/51‑1 TCATCGTCCAACAAAATGGGTGCAGTACAGATTAATGTTAAGCGTCTTGCA > 1:2036526/1‑51 TCGTCCAACAAAATGGGTGCAGTACAGATTAATGTTAAGCGTCTTGCAGGA > 1:6903668/1‑51 CGTCCAACAAAATGGGTGCAGTACAGATTAATGTTAAGCGTCTTGCAGGAC < 1:6832334/51‑1 CGTCCAACAAAATGGGTGCAGTACAGATTAATGTTAAGCGTCTTGCAGGAC < 1:1524180/51‑1 GTCCAACAAAATGGGTGCAGTACAGATTAATGTTAAGCGTCTTGCAGGACG > 1:6654599/1‑51 TCCAACAAAATGGGTGCAGTACAGATTAATGTTAAGCGTCTTGCAGGACGC < 1:275603/51‑1 CCAACAAAATGGGTGCAGTACAGATTAATGTTAAGCGTCTTGCAGGACGCG > 1:2870235/1‑51 CCAACAAAATGGGTGCAGTACAGATTAATGTTAAGCGTCTTGCAGGACGCG > 1:4324500/1‑51 CCAACAAAATGGGTGCAGTACAGATTAATGTTAAGCGTCTTGCAGGACGCG > 1:2668670/1‑51 CCAACAAAATGGGTGCAGTACAGATTAATGTTAAGCGTCTTGCAGGACGCG > 1:1727298/1‑51 CCAACAAAATGGGTGCAGTACAGATTAATGTTAAGCGTCTTGCAGGACGCG > 1:6047622/1‑51 CAACAAAATGGGTGCAGTACAGATTAATGTTAAGCGTCTTGCAGGACGCGT > 1:1715683/1‑51 AACAAAATGGGTGCAGTACAGATTAATGTTAAGCGTCTTGCAGGACGCGTA > 1:3710480/1‑51 ACAAAATGGGTGCAGTACAGATTAATGTTAAGCGTCTTGCAGGACGCGTAA < 1:814547/51‑1 ACAAAATGGGTGCAGTACAGATTAATGTTAAGCGTCTTGCAGGACGCGTAA < 1:140435/51‑1 CAAAATGGGTGCAGTACAGATTAATGTTAAGCGTCTTGCAGGACGCGTAAT > 1:1947064/1‑51 AAAATGGGTGCAGTACAGATTAATGTTAAGCGTCTTGCAGGACGCGTAATG > 1:6730843/1‑51 AAATGGGTGCAGTACAGATTAATGTTAAGCGTCTTGCAGGACGCGTAATGT > 1:3859638/1‑51 AATGGGTGCAGTACAGATTAATGTTAAGCGTCTTGCAGGACGCGTAATGTT > 1:5517093/1‑51 AATGGGTGCAGTACAGATTAATGTTAAGCGTCTTGCAGGACGCGTAATGTT > 1:2160512/1‑51 ATGGGTGCAGTACAGATTAATGTTAAGCGTCTTGCAGGACGCGTAATGTTA > 1:795468/1‑51 ATGGGTGCAGTACAGATTAATGTTAAGCGTCTTGCAGGACGCGTAATGTTA > 1:110710/1‑51 GGGTGCAGTACAGATTAATGTTAAGCGTCTTGCAGGACGCATAATGTTAAC < 1:4839231/51‑1 GTGCAGTACAGATTAATGTTAAGCGTCTTGCAGGACGCGTAATGTTAACTG < 1:6220568/51‑1 GTGCAGTACAGACTAATGTTAAGCGTCTTGCAGGACGCGTAATGTTAACTG > 1:4883731/1‑51 TGCAGTACAGATTAATGTTAAGCGTCTTGCAGGACGCGTAATGTTAACTGG > 1:4255298/1‑51 TGCAGTACAGATTAATGTTAAGCGTCTTGCAGGACGCGTAATGTTAACTGG < 1:3041899/51‑1 GCAGTACAGATTAATGTTAAGCGTCTTGCAGGACGCGTAATGTTAACTGGG < 1:5560495/51‑1 GCAGTACAGATTAATGTTAAGCGTCTTGCAGGACGCGTAATGTTAACTGGG > 1:6278666/1‑51 GTACAGATTAATGTTAAGCGTCTTGCAGGACGCGTAATGTTAACTGGGGCT < 1:3188326/51‑1 ACAGATTAATGTTAAGCGTCTTGCAGGACGCGTAATGTTAACTGGGGCTTT > 1:1781609/1‑51 ACAGATTAATGTTAAGCGTCTTGCAGGACGCGTAATGTTAACTGGGGCTTT < 1:3207371/51‑1 CAGATTAATGTTAAGCGTCTTGCAGGACGCGTAATGTTAACTGGGGCTTNT < 1:1836241/51‑1 AGATTAATGTTAAGCGTCTTGCAGGACGCGTAATGTTAACTGGGGCTTTTC > 1:4718452/1‑51 AGATTAATGTTAAGCGTCTTGCAGGACGCGTAATGTTAACTGGGGCTTTTC < 1:331475/51‑1 AGATTAATGTTAAGCGTCTTGCAGGACGCGTAATGTTAACTGGGGCTTTTC > 1:2924773/1‑51 TATTAGGGGCTATTCCATTTCATCGTCCAACAAAATGGGTGCAGTACA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < REL606/664735‑664688‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑caGATTAATGTTAAGCGTCTTGCAGGACGCGTAATGTTAACTGGGGCTTTTC > REL606/1619834‑1619883 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |