| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC JC | REL606 | 2,448,493 | IS186 (–) +6 bp | intergenic (+24/+21) | nupC → / ← yfeA | nucleoside (except guanosine) transporter/predicted diguanylate cyclase |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | REL606 | 2448493 = | 0 (0.000) | 99 (1.320) | 53/94 | 0.1 | 100% | intergenic (+24/+26) | nupC/yfeA | nucleoside (except guanosine) transporter/predicted diguanylate cyclase |
| ? | REL606 | 2772854 = | NA (NA) | noncoding (1/1343 nt) | IS186 | repeat region | |||||
| * | ? | REL606 | = 2448498 | 0 (0.000) | 90 (1.200) | 50/94 | 0.2 | 100% | intergenic (+29/+21) | nupC/yfeA | nucleoside (except guanosine) transporter/predicted diguanylate cyclase |
| ? | REL606 | = 2774196 | NA (NA) | noncoding (1343/1343 nt) | IS186 | repeat region | |||||
Only 100 of 129 total aligned reads displayed.
CGCCCGCAGCCATTAGCTGATTAACAGGCGTAAAAAAACCGGGGAATTATccc‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < REL606/2448542‑2448493‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGT > REL606/2772854‑2772906 CGCCCGCAGCCATTAGCTGATTAACAGGCGTAAAAAAACCGGGGAATTATC < 1:794360/51‑1 GCCCGCAGCCATTAGCTGATTAACAGGCGTAAAAAAACCGGGGAATTATCC > 1:1048717/1‑51 GCCCGCAGCCATTAGCTGATTAACAGGCGTAAAAAAACCGGGGAATTATCC < 1:7066607/51‑1 CCCGCAGCCATTAGCTGATTAACAGGCGTAAAAAAACCGGGGAATTATCCC < 1:2464604/51‑1 CCGCAGCCATTAGCTGATTAACAGGCGTAAAAAAACCGGGGAATTATCCCA > 1:6621827/1‑51 CGCAGCCATTAGCTGATTAACAGGCGTAAAAAAACCGGGGAATTATCCCAT > 1:3554494/1‑51 GCAGCCATTAGCTGATTAACAGGCGTAAAAAAACCGGGGAATTATCCCATA > 1:6346284/1‑51 GCAGCCATTAGCTGATTAACAGGCGTAAAAAAACCGGGGAATTATCCCATA < 1:32746/51‑1 GCAGCCATTAGCTGATTAACAGGCGTAAAAAAACCGGGGAATTATCCCATA < 1:5235088/51‑1 GCAGCCATTAGCTGATTAACAGGCGTAAAAAAACCGGGGAATTATCCCATA < 1:3728676/51‑1 CAGCCATTAGCTGATTAACAGGCGTAAAAAAACCGGGGAATTATCCCATAA < 1:4572807/51‑1 CAGCCATTAGCTGATTAACAGGCGTAAAAAAACCGGGGAATTATCCCATAA < 1:5606402/51‑1 AGCCATTAGCTGATTAACAGGCGTAAAAAAACCGGGGAATTATCCCATAAG > 1:1703816/1‑51 AGCCATTAGCTGATTAACAGGCGTAAAAAAACCGGGGAATTATCCCATAAG > 1:4537041/1‑51 AGCCATTAGCTGATTAACAGGCGTAAAAAAACCGGGGAATTATCCCATAAG > 1:6796266/1‑51 AGCCATTAGCTGATTAACAGGCGTAAAAAAACCGGGGAATTATCCCATAAG > 1:4275889/1‑51 AGCCATTAGCTGATTAACAGGCGTAAAAAAACCGGGGAATTATCCCATA > 1:4194610/1‑49 GCCATTAGCTGATTAACAGGCGTAAAAAAACCGGGGAATTATCCCATAAGC > 1:2063829/1‑51 CCATTAGCTGATTAACAGGCGTAAAAAAACCGGGGAATTATCCCATAAGCG > 1:2806838/1‑51 CCATTAGCTGATTAACAGGCGTAAAAAAACCGGGGAATTATCCCATAAGCG > 1:5873579/1‑51 ATTAGCTGATTAACAGGCGTAAAAAAACCGGGGAATTATCCCATAAGCGCT > 1:1068453/1‑51 TTAGCTGATTAACAGGCGTAAAAAAACCGGGGAATTATCCCATAAGCGCTA > 1:7066587/1‑51 TTAGCTGATTAACAGGCGTAAAAAAACCGGGGAATTATCCCATAAGCGCTA < 1:2421410/51‑1 TTAGCTGATTAACAGGCGTAAAAAAACCGGGGAATTATCCCATAAGCGCTA < 1:364359/51‑1 TTAGCTGATTAACAGGCGTAAAAAAACCGGGGAATTATCCCATAAGCGCTA > 1:1347207/1‑51 TAGCTGATTAACAGGCGTAAAAAAACCGGGGAATTATCCCATAAGCGCTAA < 1:6568143/51‑1 TAGCTGATTAACAGGCGTAAAAAAACCGGGGAATTATCCCATAAGCGCTAA > 1:3573058/1‑51 AGCTGATTAACAGGCGTAAAAAAACCGGGGAATTATCCCATAAGCGCTAAC < 1:6155562/51‑1 AGCTGATTAACAGGCGTAAAAAAACCGGGGAATTATCCCATAAGCGCTAAC < 1:3917770/51‑1 GCTGATTAACAGGCGTAAAAAAACCGGGGAATTATCCCATAAGCGCTAACT < 1:6018406/51‑1 GCTGATTAACAGGCGTAAAAAAACCGGGGAATTATCCCATAAGCGCTAACT < 1:4263285/51‑1 CTGATTAACAGGCGTAAAAAAACCGGGGAATTATCCCATAAGCGCTAACTT < 1:4032944/51‑1 TGATTAACAGGCGTAAAAAAACCGGGGAATTATCCCATAAGCGCTAACTTA > 1:7130305/1‑51 TGATTAACAGGCGTAAAAAAACCGGGGAATTATCCCATAAGCGCTAACTTA > 1:4763705/1‑51 TGATTAACAGGCGTAAAAAAACCGGGGAATTATCCCATAAGCGCTAACTTA < 1:1280667/51‑1 TGATTAACAGGCGTAAAAAAACCGGGGAATTATCCCATAAGCGCTAACTTA < 1:3784854/51‑1 TGATTAACAGGCGTAAAAAAACCGGGGAATTATCCCATAAGCGCTAACTTA < 1:4052070/51‑1 GATTAACAGGCGTAAAAAAACCGGGGAATTATCCCATAAGCGCTAACTTAA < 1:2585640/51‑1 GATTAACAGGCGTAAAAAAACCGGGGAATTATCCCATAAGCGCTAACTTAA < 1:5060831/51‑1 ATTAACAGGCGTAAAAAAACCGGGGAATTATCCCATAAGCGCTAACTTAAG > 1:6705379/1‑51 ATTAACAGGCGTAAAAAAACCGGGGAATTATCCCATAAGCGCTAACTTAAG < 1:7299215/51‑1 ATTAACAGGCGTAAAAAAACCGGGGAATTATCCCATAAGCGCTAACTTAAG < 1:1972033/51‑1 TAACAGGCGTAAAAAAACCGGGGAATTATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGG > 1:1822903/1‑51 ACAGGCGTAAAAAAACCGGGGAATTATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTT < 1:5160174/51‑1 ACAGGCGTAAAAAAACCGGGGAATTATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTT < 1:4642495/51‑1 ACAGGCGTAAAAAAACCGGGGAATTATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTT < 1:6654481/51‑1 ACAGGCGTAAAAAAACCGGGGAATTATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTT > 1:5782289/1‑51 CAGGCGTAAAAAAACCGGGGAATTATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTG > 1:1350287/1‑51 CAGGCGTAAAAAAACCGGGGAATTATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTG < 1:430758/51‑1 AGGCGTAAAAAAACCGGGGAATTATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGT < 1:5755556/51‑1 GGCGTAAAAAAACCGGGGAATTATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTG < 1:3853366/51‑1 GCGTAAAAAAACCGGGGAATTATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGG > 1:4068598/1‑51 CGTAAAAAAACCGGGGAATTATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGT > 1:7048663/1‑51 GTAAAAAAACCGGGGAATTATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTA > 1:2533703/1‑51 GTAAAAAAACCGGGGAATTATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTA < 1:5781479/51‑1 GTAAAAAAACCGGGGAATTATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTA > 1:6873501/1‑51 AAAAAAACCGGGGAATTATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATT > 1:2898902/1‑51 AAAAAAACCGGGGAATTATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATT > 1:4540437/1‑51 AAAAAAACCGGGGAATTATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATT > 1:5719184/1‑51 AAAAAAACCGGGGAATTATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATT > 1:2331116/1‑51 AAAAAAACCGGGGAATTATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATT > 1:465555/1‑51 AAAAAAACCGGGGAATTATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTAT > 1:4158600/1‑50 AAAAAACCGGGGAATTATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTA > 1:6273485/1‑51 AAAAACCGGGGAATTATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTAC < 1:340115/51‑1 AAAACCGGGGAATTATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACG < 1:6804193/51‑1 AACCGGGGAATTATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCC > 1:7056395/1‑51 ACCGGGGAATTATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCT < 1:2728595/51‑1 CGGGGAATTATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGA > 1:1326115/1‑51 CGGGGAATTATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGA < 1:4820673/51‑1 GGGGAATTATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGAT > 1:4206135/1‑51 GGAATTATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATAT < 1:275257/51‑1 ATTATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGAT > 1:1818859/1‑51 ATTATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGAT > 1:1295971/1‑51 TATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTT < 1:2629252/51‑1 ATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTA > 1:4039873/1‑51 TCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAA < 1:2638772/51‑1 TCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAA < 1:2747197/51‑1 TCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAA > 1:2838419/1‑51 TCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAA < 1:2145560/51‑1 TCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAA > 1:554942/1‑51 TCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAA < 1:2074600/51‑1 CCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAAC > 1:1578659/1‑51 CCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAAC > 1:818074/1‑51 CCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAAC > 1:213146/1‑51 CCCATAAGCACTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAAC > 1:720492/1‑51 CCCATAAGCACTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAAC < 1:217268/51‑1 CCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACG > 1:648921/1‑51 CCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACG < 1:1519330/51‑1 CCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACG < 1:7088784/51‑1 CCATAAGCACTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACG < 1:1644757/51‑1 CATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGT < 1:4297239/51‑1 CATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGT > 1:6954080/1‑51 CATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGT < 1:3584842/51‑1 CATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGT > 1:6486599/1‑51 CATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGT > 1:6922522/1‑51 CATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGT < 1:2058801/51‑1 CATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGT > 1:6814694/1‑51 CATAAGCACTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGT > 1:1608886/1‑51 CATAAGCACTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGT > 1:5566977/1‑51 CATAAGCACTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGT < 1:2691736/51‑1 CGCCCGCAGCCATTAGCTGATTAACAGGCGTAAAAAAACCGGGGAATTATccc‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < REL606/2448542‑2448493‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGT > REL606/2772854‑2772906 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |