| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC JC | REL606 | 2,448,493 | IS186 (–) +6 bp | intergenic (+24/+21) | nupC → / ← yfeA | nucleoside (except guanosine) transporter/predicted diguanylate cyclase |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | REL606 | 2448493 = | 0 (0.000) | 99 (1.320) | 53/94 | 0.1 | 100% | intergenic (+24/+26) | nupC/yfeA | nucleoside (except guanosine) transporter/predicted diguanylate cyclase |
| ? | REL606 | 2772854 = | NA (NA) | noncoding (1/1343 nt) | IS186 | repeat region | |||||
| * | ? | REL606 | = 2448498 | 0 (0.000) | 90 (1.200) | 50/94 | 0.2 | 100% | intergenic (+29/+21) | nupC/yfeA | nucleoside (except guanosine) transporter/predicted diguanylate cyclase |
| ? | REL606 | = 2774196 | NA (NA) | noncoding (1343/1343 nt) | IS186 | repeat region | |||||
GAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGTTTTACCCCCGCGTGGTGGCTACTTCTTCGATTCGTAAGCGAGAACTGCC > REL606/2774147‑2774246 | gAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGt < 1:4312593/51‑1 (MQ=31)gAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGt < 1:3459724/51‑1 (MQ=31)gAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGt > 1:3611359/1‑51 (MQ=31)gAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGt > 1:388686/1‑51 (MQ=31) aGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGtt < 1:1488700/51‑1 (MQ=33) aGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGtt < 1:4734832/51‑1 (MQ=33) ggCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGttt < 1:1059419/51‑1 (MQ=35) ggCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGttt > 1:3229697/1‑51 (MQ=35) cGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGTTTTa < 1:6713008/51‑1 (MQ=40) cGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGTTTTa < 1:3817164/51‑1 (MQ=40) gTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGTTTTAc < 1:2621300/51‑1 (MQ=255) gTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGTTTTAc < 1:1288872/51‑1 (MQ=255) tCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTTTGGGTTTTAcc > 1:3337493/1‑51 (MQ=255) tCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGTTTTAcc > 1:5475476/1‑51 (MQ=255) cGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGTTTTAccc > 1:2708918/1‑51 (MQ=255) gCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGTTTTAcccc > 1:5519891/1‑51 (MQ=255) gCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGTTTTAcccc < 1:6976397/51‑1 (MQ=255) cATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGTTTTAccccc > 1:5792057/1‑51 (MQ=255) cATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGTTTTAccccc > 1:4868204/1‑51 (MQ=255) aTTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGTTTTACCCCcg > 1:6550023/1‑51 (MQ=255) aTTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGTTTTACCCCcg > 1:6542798/1‑51 (MQ=255) aTTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGTTTTACCCCcg < 1:290229/51‑1 (MQ=255) aTTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGTTTTACCCCcg > 1:5139125/1‑51 (MQ=255) ttcttcAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGTTTTACCCCcgc > 1:1558541/1‑51 (MQ=255) ttcttcAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGTTTTACCCCcgc > 1:4967890/1‑51 (MQ=255) tcttcAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGTTTTACCCCcgcg > 1:7151516/1‑51 (MQ=255) tcttcAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGTTTTACCCCcgcg < 1:670142/51‑1 (MQ=255) cttcAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGTTTTACCCCCGCgt < 1:6515223/51‑1 (MQ=255) ttcAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGTTTTACCCCCGCgtg < 1:3153883/51‑1 (MQ=255) tcAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGTTTTACCCCCGCgtgg < 1:7094431/51‑1 (MQ=255) aGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGTTTTACCCCCGCgtggtg < 1:1831634/51‑1 (MQ=255) aGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGTTTTACCCCCGCgtggtg < 1:3891472/51‑1 (MQ=255) aGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGTTTTACCCCCGCgtggtg < 1:1353871/51‑1 (MQ=255) aTGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGTTTTACCCCCGCGTGGTGGc < 1:1136514/51‑1 (MQ=255) tGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGTTTTACCCCCGCGTGGTGGCt < 1:476619/51‑1 (MQ=255) ggTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGTTTTACCCCCGCGTGGTGGCTa < 1:6920171/51‑1 (MQ=255) gTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGTTTTACCCCCGCGtggggg > 1:1474574/1‑47 (MQ=255) gTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGTTTTACCCCCGCGTGGTGGCTAc > 1:1086511/1‑51 (MQ=255) gTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGTTTTACCCCCGCGTGGTGGCTAc < 1:2343831/51‑1 (MQ=255) ttCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGTTTTACCCCCGCGTGGTGGCTAct < 1:1168147/51‑1 (MQ=255) ttCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGTTTTACCCCCGCGTGGTGGCTAct > 1:3859341/1‑51 (MQ=255) tCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGTTTTACCCCCGCGTGGTGGCTActt > 1:3578607/1‑51 (MQ=255) cAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGTTTTACCCCCGCGTGGTGGCTActtc < 1:4760866/51‑1 (MQ=255) aaCCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGTTTTACCCCCGCGtggtgg > 1:1112268/1‑43 (MQ=255) aaCCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGTTTTACCCCCGCGTGGTGGCTActtct < 1:2272263/51‑1 (MQ=255) aCCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGTTTTACCCCCGCGTGGTGGCTActtctt < 1:1696959/51‑1 (MQ=255) aCCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGTTTTACCCCCGCGTGGTGGCTActtctt < 1:2244666/51‑1 (MQ=255) aCCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGTTTTACCCCCGCGTGGTGACTActtctt > 1:6223827/1‑51 (MQ=255) cccTTAAGTTAGCGCTTATGGGTTTTACCCCCGCGTGGTGGCTActtc < 1:5230483/48‑1 (MQ=255) ccTTAAGTTAGCGCTTATGGGTTTTACCCCCGCGTGGTGGCTACTTCTTCg < 1:3845046/51‑1 (MQ=255) cTTAAGTTAGCGCTTATGGGTTTTACCCCCGCGTGGTGGCTACTTCTTCGa < 1:5135785/51‑1 (MQ=255) cTTAAGTTAGCGCTTATGGGTTTTACCCCCGCGTGGTGGCTACTTCTTCGa > 1:3516259/1‑51 (MQ=255) ttAAGTTAGCGCTTATGGGTTTTACCCCCGCGTGGTGGCTACTTCTTCGAt < 1:151823/51‑1 (MQ=255) ttAAGTTAGCGCTTATGGGTTTTACCCCCGCGTGGTGGCTACTTCTTCGAt > 1:5971445/1‑51 (MQ=255) tAAGTTAGCGCTTATGGGTTTTACCCCCGCGTGGTGGCTActtctt > 1:2495664/1‑46 (MQ=255) aaGTTAGCGCTTATGGGTTTTACCCCCGCGTGGTGGCTACTTCTTCGATTc < 1:4601307/51‑1 (MQ=255) aaGTTAGCGCTTATGGGTTTTACCCCCGCGTGGTGGCTACTTCTTCGATTc < 1:4391744/51‑1 (MQ=255) aaGTTAGCGCTTATGGGTTTTACCCCCGCGTGGTGGCTACTTCTTCGATTc < 1:3825844/51‑1 (MQ=255) aGTTAGCGCTTATGGGTTTTACCCCCGCGTGGTGGCTACTTCTTCGATTCg < 1:5287240/51‑1 (MQ=255) aGTTAGCGCTTATGGGTTTTACCCCCGCGTGGTGGCTACTTCTTCGATTCg > 1:6051901/1‑51 (MQ=255) gTTAGCGCTTATGGGTTTTACCCCCGCGTGGTGGCTACTTCTTCGATTCGt < 1:2763355/51‑1 (MQ=255) gTTAGCGCTTATGGGTTTTACCCCCGCGTGGTGGCTACTTCTTCGATTCGt < 1:1549540/51‑1 (MQ=255) ttAGCGCTTATGGGTTTTACCCCCGCGtggggg > 1:344925/1‑33 (MQ=255) ttAGCGCTTATGGGTTTTACCCCCGCGTGGTGGCTACTTCTTCGATTCGTa < 1:5480904/51‑1 (MQ=255) ttAGCGCTTATGGGTTTTACCCCCGCGTGGTGGCTACTTCTTCGATTCGTa > 1:3152027/1‑51 (MQ=255) tAGCGCTTATGGGTTTTACCCCCGCGTGGTGGCTACTTCTTCGATTCGTaa < 1:1724169/51‑1 (MQ=255) tAGCGCTTATGGGTTTTACCCCCGCGTGGTGGCTACTTCTTCGATTCGTaa < 1:6781466/51‑1 (MQ=255) tAGCGCTTATGGGTTTTACCCCCGCGTGGTGGCTACTTCTTCGATTCGTaa > 1:3895050/1‑51 (MQ=255) tAGCGCTTATGGGTTTTACCCCCGCGTGGTGGCTACTTCTTCGATTCGTaa < 1:1386332/51‑1 (MQ=255) tAGCGCTTATGGGTTTTACCCCCGCGTGGTGGCTACTTCTTCGATTCGTaa < 1:6721668/51‑1 (MQ=255) aGCGCTTATGGGTTTTACCCCCGCGTGGTGGCTACTTCTTCGATTCGTAAg < 1:5656551/51‑1 (MQ=255) gcgcTTATGGGTTTTACCCCCGCGTGGTGGCTACTTCTTCGATTCGTAAGc < 1:2809580/51‑1 (MQ=255) cgcTTATGGGTTTTACCCCCGCGTGGTGGCTACTTCTTCGATTCGTAAGCg < 1:171929/51‑1 (MQ=255) cgcTTATGGGTTTTACCCCCGCGTGGTGGCTACTTCTTCGATTCGTAAGCg > 1:5531250/1‑51 (MQ=255) cgcTTATGGGTTTTACCCCCGCGTGGTGGCTACTTCTTCGATTCGTAAGCg > 1:2181049/1‑51 (MQ=255) cgcTTATGGGTTTTACCCCCGCGTGGTGGCTACTTCTTCGATTCGTAAGCg > 1:4121838/1‑51 (MQ=255) gcTTATGGGTTTTACCCCCGCGTGGTGGCTACTTCTTCGATTCGTAAGCga > 1:3766013/1‑51 (MQ=255) gcTTATGGGTTTTACCCCCGCGTGGTGGCTACTTCTTCGATTCGTAAGCga > 1:6070590/1‑51 (MQ=255) cTTATGGGTTTTACCCCCGCGTGGTGGCTACTTCTTCGATTCGTAAGCgag > 1:5083025/1‑51 (MQ=255) ttATGGGTTTTACCCCCGCGTGGTGGCTACTTCTTCGATTCGTAAGCgaga > 1:3971931/1‑51 (MQ=255) tATGGGTTTTACCCCCGCGTGGTGGCTACTTCTTCGATTCGTAAGCGAGaa < 1:3006446/51‑1 (MQ=255) tATGGGTTTTACCCCCGCGTGGTGGCTACTTCTTCGATTCGTAAGCGAGaa < 1:3784175/51‑1 (MQ=255) aTGGGTTTTACCCCCGCGTGGTGGCTACTTCTTCGATTCGTAAGCGAGAAc > 1:5967697/1‑51 (MQ=255) aTGGGTTTTACCCCCGCGTGGTGGCTACTTCTTCGATTCGTAAGCGAGAAc < 1:3628388/51‑1 (MQ=255) tGGGTTTTACCCCCGCGTGGTGGCTACTTCTTCGATTCGTAAGCGAGaaat < 1:1901387/51‑3 (MQ=255) tGGGTTTTACCCCCGCGTGGTGGCTACTTCTTCGATTCGTAAGCGAGAACt < 1:1086840/51‑1 (MQ=255) tGGGTTTTACCCCCGCGTGGTGGCTACTTCTTCGATTCGTAAGCGAGAACt < 1:234424/51‑1 (MQ=255) gggTTTTACCCCCGCGTGGTGGCTACTTCTTCGATTTGTAAg > 1:3287351/1‑42 (MQ=255) gggTTTTACCCCCGCGTGGTGGCTACTTCTTCGATTCGTAAGCGAGAACTg > 1:5642848/1‑51 (MQ=255) gTTTTACCCCCGCGTGGTGGCTACTTCTTCGCTTCGTAAGCGAGAACTGcc > 1:4967159/1‑51 (MQ=255) | GAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGTTTTACCCCCGCGTGGTGGCTACTTCTTCGATTCGTAAGCGAGAACTGCC > REL606/2774147‑2774246 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 28 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |