| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| MC JC | REL606 | 4,205,069 | Δ5 bp | 100% | coding (2311‑2315/3684 nt) | metH → | B12‑dependent methionine synthase |
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
| * | * | ÷ | REL606 | 4205069 | 4205073 | 5 | 37 [0] | [0] 37 | metH | B12‑dependent methionine synthase |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | REL606 | = 4205068 | 0 (0.000) | 30 (1.140) | 20/274 | NT | 100% | coding (2310/3684 nt) | metH | B12‑dependent methionine synthase |
| ? | REL606 | 4205074 = | 0 (0.000) | coding (2316/3684 nt) | metH | B12‑dependent methionine synthase | |||||
CGTCATGAAACAGGCGGTGGCCTACCTCGAACCGTTTATTGAAGCCAGCAAAGAGCAGGGCAAAACCAACGGCAAGATGGTGATCGCCACCGTGAAGGGCGACGTCCACGACATCGGTAAAAATATCGTTGGTGTGGTGCTGCAATGTAACAACTACGAAATTGTCGATCTCGGCGTTATGGTGCCTGCGGAAAAAATTCTCCGTACCGCTAAAGAAGTGAATGCTGATCTGATTGGCCTTTCGGGGCTTATCACGCCGTCGCTGGACGAGATGGTTAACGTGGCGAAAGA > REL606/4204927‑4205217 | gcgcgcgtcatgaaacaggcggtggcctacctcgtaccgtttattgaagccagcaaagagcagggcaaaaccaacggcaagatggtgatcgccaccgtgaagggcgacgtccacgacatcggtaaaaatatcgttggtgtggtgctgTaa < 1:361245‑M2/3‑1 (MQ=255)gcgcgcgtcatgaaacaggcggtggcctacctcgaaccgtttattgaagccagcaaagagcagggcaaaaccaacggcaagatggtgatcgccaccgtgaagggcgacgtccacgacatcggtaaaaatatcgttggtgtggtgctgTaa < 2:563268‑M2/3‑1 (MQ=255)gagacagtcatgaaacaggcggtggcctacctcgaaccgtttattgaagccagcaaagagcagggcaaaaccatcggcaagatggtgatcgccaccgtgaagggcgacgtccacgacatcggtaaaaatatcgttggtgtggtgctgTaa < 1:285310‑M2/3‑1 (MQ=255) cgtcatgaaacaggcggtggcctacctcgaaccgtttattgaagccagcaaagagcagggcaaaaccaacggcaagatggtgatcgccaccgtgaagggcgacgtccacgacatcggtaaaaatatcgttggtgtggtgctgTAACAACt < 1:121744‑M2/8‑1 (MQ=255) cgtcatgaaacaggcggtggcctacctcgaaccgtttattgaagccagcaaagagcagggcaaaaccaacggcaagatggtgatcgccaccgtgaagggcgacgtccacgacatcggtaaaaatatcgttggtgtggtgctgTAACAACt > 2:180074‑M2/143‑150 (MQ=255) tcatgaaacaggcggtggcctacctcgaaccgtttattgaagccagcaaagagcagggcaaaaccaacggcaagatggtgatcgccaccgtgaagggcgacgtccacgacatcggtaaaaatatcgttggtgtggtgctgtaactgtctc > 2:286124‑M2/141‑144 (MQ=255) tcatgaaacaggcggtggcctacctcgaaccgtttattgaagccagcaaagagcagggcaaaaccaacggcaagatggtgatcgccaccgtgaagggcgacgtccacgacatcggtaaaaatatcgttggtgtggtgctgTAACAACTAc > 2:40180‑M2/141‑150 (MQ=255) ggcctacctcgaaccgtttattgaagccagcaaagagcagggcaaaaccaacggcaagatggtgatcgccaccgtgaagggcgacgtccacgacatcggtaaaaatatcgttggtgtggtgctgTAACAACTACGAAATTGTCGATCTCg > 2:269583‑M2/125‑150 (MQ=255) ggcctacctcgaaccgtttattgaagccagcaaagagcagggcaaaaccaacggcaagatggtgatcgccaccgtgaagggcgacgtccacgacatcggtaaaaatatcgttggtgtggtgctgTAACAACTACGAAATTGTCGATCTCg > 2:73479‑M2/125‑150 (MQ=255) ggcctacctcgaaccgtttattgaagccagcaaagagcagggcaaaaccaacggcaagatggtgatcgccaccgtgaagggcgacgtccacgacatcggtaaaaatatcgttggtgtggtgctgTAACAACTACGAAATTGTCGATCTCg > 2:197789‑M2/125‑150 (MQ=255) ggcctacctcgaaccgtttattgaagccagcaaagagcagggcaaaaccaacggcaagatggtgatcgccaccgtgaagggcgacgtccacgacatcggtaaaaatatcgttggtgtggtgctgTAACAACTACGAAATTGTCGATCTCg > 2:288923‑M2/125‑150 (MQ=255) ggcctacctcgaaccgtttattgaagccagcaaagagcagggcaaaaccaacggcaagatggtgatcgccaccgtgaagggcgacgtccacgacatcggtaaaaatatcgttggtgtggtgctgTAACAACTACGAAATTGTCGATCTCg > 2:291666‑M2/125‑150 (MQ=255) cgaaccgtttattgaagccagcaaagagcagggcaaaaccaacggcaagatggtgatcgccaccgtgaagggcgacgtccacgacatcggtaaaaatatcgttggtgtggtgctgTAACAACTACGAAATTGTCGATCTCGGCGTTATgg < 2:433487‑M2/35‑1 (MQ=255) cgaaccgtttattgaagccagcaaagagcagggcaaaaccaacggcaagatggtgatcgccaccgtgaagggcgacgtccacgacatcggtaaaaatatcgttggtgtggtgctgTAACAACTACGAAATTGTCGATCTCGGCGTTATgg < 1:40058‑M2/35‑1 (MQ=255) ccgtttattgaagccagcaaagagcagggcaaaaccaacggcaagatggtgatcgccaccgtgaagggcgacgtccacgacatcggtaaaaatatcgttggtgtggtgctgTAACAACTACGAAATTGTCGATCTCGGCGTTATGGTGcc < 2:303473‑M2/39‑1 (MQ=255) agccagcaaagagcagggcaaaaccaacggcaagatggtgatcgccaccgtgaagggcgacgtccacgacatcggtaaaaatatcgttggtgtggtgctgTAACAACTACGAAATTGTCGATCTCGGCGTTATGGTGCCTGCGGaaaaaa > 2:223369‑M2/101‑150 (MQ=255) gcaaagagcagggcaaaaccaacggcaagatggtgatcgccaccgtgaagggcgacgtccacgacatcggtaaaaatatcgttggtgtggtgctgTAACAACTACGAAATTGTCGATCTCGGCGTTATGGTGCCTGCGGAAAAAATtctc > 1:195704‑M2/96‑150 (MQ=255) gagcagggcaaaaccaacggcaagatggtgatcgccaccgtgaagggcgacgtccacgacatcggtaaaaatatcgttggtgtggtgctgTAACAACTACGAAATTGTCGATCTCGGCGTTATGGTGCCTGCGGAAAAAATTCTCCGTAc > 2:33047‑M2/91‑150 (MQ=255) gggcaaaaccaacggcaagatggtgatcgccaccgtgaagggcgacgtccacgacatcggtaaaaatatcgttggtgtggtgctgTAACAACTACGAAATTGTCGATCTCGGCGTTATGGTGCCTGCGGAAAAAATTCTCCGTACCGCTa > 1:145220‑M2/86‑150 (MQ=255) gggcaaaaccaacggcaagatggtgatcgccaccgtgaagggcgacgtccacgacatcggtaaaaatatcgttggtgtggtgctgTAACAACTACGAAATTGTCGATCTCGGCGTTATGGTGCCTGCGGAAAAAATTCTCCGTACCGCTa > 1:14395‑M2/86‑150 (MQ=255) aaccaacggcaagatggtgatcgccaccgtgaagggcgacgtccacgacatcggtaaaaatatcgttggtgtggtgctgTAACAACTACGAAATTGTCGATCTCGGCGTTATGGTGCCTGCGGAAAAAATTCTCCGTACCGCTAaagaag < 1:179564‑M2/71‑1 (MQ=255) gcaagatggtgatcgccaccgtgaagggcgacgtccacgacatcggtaaaactatcgttggtgtggtgctgTGACAACTACGAAATTGTCGATCTCGGCGTTATGGTGCCGGCGGAAAAAATTCGCCGTACCGCTAAAGAAGAGAATGct > 1:290470‑M2/72‑150 (MQ=255) gaagggcgacgtccacgacatcggtaaaaatatcgttggtgtggtgctgTAACAACTACGAAATTGTCGATCTCGGCGTTATGGTGCCTGCGGAAAAAATTCTCCGTACCGCTAAAGAAGTGAATGCTGATCTGATTGGCCTTTCGGGGc < 1:24185‑M2/101‑1 (MQ=255) gaagggcgacgtccacgacatcggtaaaaatatcgttggtgtggtgctgTAACAACTACGAAATTGTCGATCTCGGCGTTATGGTGCCTGCGGAAAAAATTCTCCGTACCGCTAAAGAAGTGAATGCTGATCTGATTGGCCTTTCGGGGc < 1:306686‑M2/101‑1 (MQ=255) gcgacgtccacgacatcggtaaaaatatcgttggtgtggtgctgTAACAACTACGAAATTGTCGATCTCGGCGTTATGGTGCCTGCGGAAAAAATTCTCCGTACCGCTAAAGAAGTGAATGCTGATCTGATTGGCCTTTCGGGGCTTATc < 1:73263‑M2/106‑1 (MQ=255) gtccacgacatcggtaaaaatatcgttggtgtggtgctgTAACAACTACGAAATTGTCGATCTCGGCGTTATGGTGCCTGCGGAAAAAATTCTCCGTACCGCTAAAGAAGTGAATGCTGATCTGATTGGCCTTTCGGGGCTTATCACGcc > 1:563670‑M2/40‑150 (MQ=255) gtccacgacatcggtaaaaatatcgttggtgtggtgctgTAACAACTACGAAATTGTCGATCTCGGCGTTATGGTGCCTGCGGAAAAAATTCTCAGTACCGCTAAAGAAGTGAATGCTGATCTGATTGGCCTGTCGGGCCTTATCACGcc > 1:296388‑M2/40‑150 (MQ=255) aatatcgttggtgtggtgctgTAACAACTACGAAATTGTCGATCTCGGCGTTATGGTGCCTGCGGAAAAAATTCTCCGTACCGCTAAAGAAGTGAATGCTGATCTGATTGGCCTTTCGGGGCTTATCACGCCGTCGCTGGACGAGATGGt < 1:290838‑M2/129‑1 (MQ=255) tatcgttggtgtggtgctgTAACAACTACGAAATTGTCGATCTCGGCGTTATGGTGCCTGCGGAAAAAATTCTCCGTACCGCTAAAGAAGTGAATGCTGATCTGATTGGCCTTTCGGGGCTTATCACGCCGTCGCTGGACGAGATGGTTa < 2:78613‑M2/131‑1 (MQ=255) tatcgttggtgtggtgctgTAACAACTACGAAATTGTCGATCTCGGCGTTATGGTGCCTGCGGAAAAAATTCTCCGTACCGCTAAAGAAGTGAATGCTGATCTGATTGGCCTTTCGGGGCTTATCACGCCGTCGCTGGACGAGATGGTTa < 2:145636‑M2/131‑1 (MQ=255) tcgttggtgtggtgctgTAACAACTACGAAATTGTCGATCTCGGCGTTATGGTGCCTGCGGAAAAAATTCTCCGTACCGCTAAAGAAGTGAATGCTGATCTGATTGGCCTTTCGGGGCTTATCACGCCGTCGCTGGACGAGATGGTTAAc > 1:39766‑M2/18‑150 (MQ=255) ggtgtggtgctgTAACAACTACGAAATTGTCGATCTCGGCGTTATGGTGCCTGCGGAAAAAATTCTCCGTACCGCTCAAGAAGTGAATGCTGATCTGATTGGCATTTCGGGGCTTATCACGCCGTCGCTGGACGAGATGGTTAacgttgg > 1:535511‑M2/13‑147 (MQ=255) ggtgtggtgctgTAACAACTACGAAATTGTCGATCTCGGCGTTATGGTGCCTGCGGAAAAAATTCTCCGTACCGCTAAAGAAGTGAATGCTGATCTGATTGGCCTTTCGGGGCTTATCACGCCGTCGCTGGACGAGATAGTTAACGTGGc > 1:484008‑M2/13‑150 (MQ=255) gtgtggtgctgTAACAACTACGAAATTGTCGATCTCGGCGTTATGGTGCCTGCGGAAAAAATTCTCCGTACCGCTAAAGAAGTGAATGCTGATCTGATTGGCCTTTCGGGGCTTATCACGCCGTCGCTGGACGAGATGGTTAACGTGGCg > 2:568222‑M2/12‑150 (MQ=255) ggtgctgTAACAACTACGAAATTGTCGATCTCGGCGTTATGGTGCCTGCGGAAAAAATTCTCCGTACCGCTAAAGAAGTGAATGCTGATCTGATTGGCCTTTCGGGGCTTATCACGCCGTCGCTGGACGAGATGGTTAACGTGGCGAAag < 1:520931‑M2/143‑1 (MQ=255) gtgctgTAACAACTACGAAATTGTCGATCTCGGCGTTATGGTGCCTGCGGAAAAAATTCTCCGTACCGCTAAAGAAGTGAATGCTGATCTGATTGGCCTTTCGGGGCTTATCACGCCGTCGCTGGACGAGATGGTTAACGTGGCGAaagc > 2:522431‑M2/7‑149 (MQ=255) gtgctgTAACAACTACGAAATTGTCGATCTCGGCGTTATGGTGCCTGCGGAAAAAATTCTCCGTACCGCTAAAGAAGTGAATGCTGATCTGATTGGCCTTTCGGGGCTTATCACGCCGTCGCTGGACGAGATGGTTAACGTGGCGAAaga > 2:506552‑M2/7‑150 (MQ=255) | CGTCATGAAACAGGCGGTGGCCTACCTCGAACCGTTTATTGAAGCCAGCAAAGAGCAGGGCAAAACCAACGGCAAGATGGTGATCGCCACCGTGAAGGGCGACGTCCACGACATCGGTAAAAATATCGTTGGTGTGGTGCTGCAATGTAACAACTACGAAATTGTCGATCTCGGCGTTATGGTGCCTGCGGAAAAAATTCTCCGTACCGCTAAAGAAGTGAATGCTGATCTGATTGGCCTTTCGGGGCTTATCACGCCGTCGCTGGACGAGATGGTTAACGTGGCGAAAGA > REL606/4204927‑4205217 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |