| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| MC JC | REL606 | 4,205,069 | Δ5 bp | 100% | coding (2311‑2315/3684 nt) | metH → | B12‑dependent methionine synthase |
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
| * | * | ÷ | REL606 | 4205069 | 4205073 | 5 | 37 [0] | [0] 37 | metH | B12‑dependent methionine synthase |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | REL606 | = 4205068 | 0 (0.000) | 30 (1.140) | 20/274 | NT | 100% | coding (2310/3684 nt) | metH | B12‑dependent methionine synthase |
| ? | REL606 | 4205074 = | 0 (0.000) | coding (2316/3684 nt) | metH | B12‑dependent methionine synthase | |||||
GCGCGCGTCATGAAACAGGCGGTGGCCTACCTCGAACCGTTTATTGAAGCCAGCAAAGAGCAGGGCAAAACCAACGGCAAGATGGTGATCGCCACCGTGAAGGGCGACGTCCACGACATCGGTAAAAATATCGTTGGTGTGGTGCTGCAATGTAACAACTACGAAATTGTCGATCTCGGCGTTATGGTGCCTGCGGAAAAAATTCTCCGTACCGCTAAAGAAGTGAATGCTGATCTGATTGGCCTTTCGGGGCTTATCACGCCGTCGCTGGACGAGATGGTTAACGTGGCG > REL606/4204922‑4205212 | gcgcgcGTCATGAAACAGGCGGTGGCCTACCTCGTACCGTTTATTGAAGCCAGCAAAGAGCAGGGCAAAACCAACGGCAAGATGGTGATCGCCACCGTGAAGGGCGACGTCCACGACATCGGTAAAAATATCGTTGGTGTGGTGCTGtaa < 1:361245‑M1/150‑4 (MQ=255)gcgcgcGTCATGAAACAGGCGGTGGCCTACCTCGAACCGTTTATTGAAGCCAGCAAAGAGCAGGGCAAAACCAACGGCAAGATGGTGATCGCCACCGTGAAGGGCGACGTCCACGACATCGGTAAAAATATCGTTGGTGTGGTGCTGtaa < 2:563268‑M1/150‑4 (MQ=255)gagacagtcatgaAACAGGCGGTGGCCTACCTCGAACCGTTTATTGAAGCCAGCAAAGAGCAGGGCAAAACCATCGGCAAGATGGTGATCGCCACCGTGAAGGGCGACGTCCACGACATCGGTAAAAATATCGTTGGTGTGGTGCTGtaa < 1:285310‑M1/144‑4 (MQ=255) cgTCATGAAACAGGCGGTGGCCTACCTCGAACCGTTTATTGAAGCCAGCAAAGAGCAGGGCAAAACCAACGGCAAGATGGTGATCGCCACCGTGAAGGGCGACGTCCACGACATCGGTAAAAATATCGTTGGTGTGGTGCTGtaacaact < 1:121744‑M1/150‑9 (MQ=255) cgTCATGAAACAGGCGGTGGCCTACCTCGAACCGTTTATTGAAGCCAGCAAAGAGCAGGGCAAAACCAACGGCAAGATGGTGATCGCCACCGTGAAGGGCGACGTCCACGACATCGGTAAAAATATCGTTGGTGTGGTGCTGtaacaact > 2:180074‑M1/1‑142 (MQ=255) tCATGAAACAGGCGGTGGCCTACCTCGAACCGTTTATTGAAGCCAGCAAAGAGCAGGGCAAAACCAACGGCAAGATGGTGATCGCCACCGTGAAGGGCGACGTCCACGACATCGGTAAAAATATCGTTGGTGTGGTGCTGtaactgtctc > 2:286124‑M1/1‑140 (MQ=255) tCATGAAACAGGCGGTGGCCTACCTCGAACCGTTTATTGAAGCCAGCAAAGAGCAGGGCAAAACCAACGGCAAGATGGTGATCGCCACCGTGAAGGGCGACGTCCACGACATCGGTAAAAATATCGTTGGTGTGGTGCTGtaacaactac > 2:40180‑M1/1‑140 (MQ=255) ggCCTACCTCGAACCGTTTATTGAAGCCAGCAAAGAGCAGGGCAAAACCAACGGCAAGATGGTGATCGCCACCGTGAAGGGCGACGTCCACGACATCGGTAAAAATATCGTTGGTGTGGTGCTGtaacaactacgaaattgtcgatctcg > 2:269583‑M1/1‑124 (MQ=255) ggCCTACCTCGAACCGTTTATTGAAGCCAGCAAAGAGCAGGGCAAAACCAACGGCAAGATGGTGATCGCCACCGTGAAGGGCGACGTCCACGACATCGGTAAAAATATCGTTGGTGTGGTGCTGtaacaactacgaaattgtcgatctcg > 2:73479‑M1/1‑124 (MQ=255) ggCCTACCTCGAACCGTTTATTGAAGCCAGCAAAGAGCAGGGCAAAACCAACGGCAAGATGGTGATCGCCACCGTGAAGGGCGACGTCCACGACATCGGTAAAAATATCGTTGGTGTGGTGCTGtaacaactacgaaattgtcgatctcg > 2:197789‑M1/1‑124 (MQ=255) ggCCTACCTCGAACCGTTTATTGAAGCCAGCAAAGAGCAGGGCAAAACCAACGGCAAGATGGTGATCGCCACCGTGAAGGGCGACGTCCACGACATCGGTAAAAATATCGTTGGTGTGGTGCTGtaacaactacgaaattgtcgatctcg > 2:288923‑M1/1‑124 (MQ=255) ggCCTACCTCGAACCGTTTATTGAAGCCAGCAAAGAGCAGGGCAAAACCAACGGCAAGATGGTGATCGCCACCGTGAAGGGCGACGTCCACGACATCGGTAAAAATATCGTTGGTGTGGTGCTGtaacaactacgaaattgtcgatctcg > 2:291666‑M1/1‑124 (MQ=255) cGAACCGTTTATTGAAGCCAGCAAAGAGCAGGGCAAAACCAACGGCAAGATGGTGATCGCCACCGTGAAGGGCGACGTCCACGACATCGGTAAAAATATCGTTGGTGTGGTGCTGtaacaactacgaaattgtcgatctcggcgttatgg < 2:433487‑M1/150‑36 (MQ=255) cGAACCGTTTATTGAAGCCAGCAAAGAGCAGGGCAAAACCAACGGCAAGATGGTGATCGCCACCGTGAAGGGCGACGTCCACGACATCGGTAAAAATATCGTTGGTGTGGTGCTGtaacaactacgaaattgtcgatctcggcgttatgg < 1:40058‑M1/150‑36 (MQ=255) ccGTTTATTGAAGCCAGCAAAGAGCAGGGCAAAACCAACGGCAAGATGGTGATCGCCACCGTGAAGGGCGACGTCCACGACATCGGTAAAAATATCGTTGGTGTGGTGCTGtaacaactacgaaattgtcgatctcggcgttatggtgcc < 2:303473‑M1/150‑40 (MQ=255) aGCCAGCAAAGAGCAGGGCAAAACCAACGGCAAGATGGTGATCGCCACCGTGAAGGGCGACGTCCACGACATCGGTAAAAATATCGTTGGTGTGGTGCTGtaacaactacgaaattgtcgatctcggcgttatggtgcctgcggaaaaaa > 2:223369‑M1/1‑100 (MQ=255) gCAAAGAGCAGGGCAAAACCAACGGCAAGATGGTGATCGCCACCGTGAAGGGCGACGTCCACGACATCGGTAAAAATATCGTTGGTGTGGTGCTGtaacaactacgaaattgtcgatctcggcgttatggtgcctgcggaaaaaattctc > 1:195704‑M1/1‑95 (MQ=255) gagCAGGGCAAAACCAACGGCAAGATGGTGATCGCCACCGTGAAGGGCGACGTCCACGACATCGGTAAAAATATCGTTGGTGTGGTGCTGtaacaactacgaaattgtcgatctcggcgttatggtgcctgcggaaaaaattctccgtac > 2:33047‑M1/1‑90 (MQ=255) gggCAAAACCAACGGCAAGATGGTGATCGCCACCGTGAAGGGCGACGTCCACGACATCGGTAAAAATATCGTTGGTGTGGTGCTGtaacaactacgaaattgtcgatctcggcgttatggtgcctgcggaaaaaattctccgtaccgcta > 1:145220‑M1/1‑85 (MQ=255) gggCAAAACCAACGGCAAGATGGTGATCGCCACCGTGAAGGGCGACGTCCACGACATCGGTAAAAATATCGTTGGTGTGGTGCTGtaacaactacgaaattgtcgatctcggcgttatggtgcctgcggaaaaaattctccgtaccgcta > 1:14395‑M1/1‑85 (MQ=255) aaCCAACGGCAAGATGGTGATCGCCACCGTGAAGGGCGACGTCCACGACATCGGTAAAAATATCGTTGGTGTGGTGCTGtaacaactacgaaattgtcgatctcggcgttatggtgcctgcggaaaaaattctccgtaccgctaaagaag < 1:179564‑M1/150‑72 (MQ=255) gCAAGATGGTGATCGCCACCGTGAAGGGCGACGTCCACGACATCGGTAAAACTATCGTTGGTGTGGTGCTGtgacaactacgaaattgtcgatctcggcgttatggtgccggcggaaaaaattcgccgtaccgctaaagaagagaatgct > 1:290470‑M1/1‑71 (MQ=255) gAAGGGCGACGTCCACGACATCGGTAAAAATATCGTTGGTGTGGTGCTGtaacaactacgaaattgtcgatctcggcgttatggtgcctgcggaaaaaattctccgtaccgctaaagaagtgaatgctgatctgattggcctttcggggc < 1:24185‑M1/150‑102 (MQ=255) gAAGGGCGACGTCCACGACATCGGTAAAAATATCGTTGGTGTGGTGCTGtaacaactacgaaattgtcgatctcggcgttatggtgcctgcggaaaaaattctccgtaccgctaaagaagtgaatgctgatctgattggcctttcggggc < 1:306686‑M1/150‑102 (MQ=255) gCGACGTCCACGACATCGGTAAAAATATCGTTGGTGTGGTGCTGtaacaactacgaaattgtcgatctcggcgttatggtgcctgcggaaaaaattctccgtaccgctaaagaagtgaatgctgatctgattggcctttcggggcttatc < 1:73263‑M1/150‑107 (MQ=255) gTCCACGACATCGGTAAAAATATCGTTGGTGTGGTGCTGtaacaactacgaaattgtcgatctcggcgttatggtgcctgcggaaaaaattctccgtaccgctaaagaagtgaatgctgatctgattggcctttcggggcttatcacgcc > 1:563670‑M1/1‑39 (MQ=255) gTCCACGACATCGGTAAAAATATCGTTGGTGTGGTGCTGtaacaactacgaaattgtcgatctcggcgttatggtgcctgcggaaaaaattctcagtaccgctaaagaagtgaatgctgatctgattggcctgtcgggccttatcacgcc > 1:296388‑M1/1‑39 (MQ=255) aaTATCGTTGGTGTGGTGCTGtaacaactacgaaattgtcgatctcggcgttatggtgcctgcggaaaaaattctccgtaccgctaaagaagtgaatgctgatctgattggcctttcggggcttatcacgccgtcgctggacgagatggt < 1:290838‑M1/150‑130 (MQ=255) tatCGTTGGTGTGGTGCTGtaacaactacgaaattgtcgatctcggcgttatggtgcctgcggaaaaaattctccgtaccgctaaagaagtgaatgctgatctgattggcctttcggggcttatcacgccgtcgctggacgagatggtta < 2:78613‑M1/150‑132 (MQ=255) tatCGTTGGTGTGGTGCTGtaacaactacgaaattgtcgatctcggcgttatggtgcctgcggaaaaaattctccgtaccgctaaagaagtgaatgctgatctgattggcctttcggggcttatcacgccgtcgctggacgagatggtta < 2:145636‑M1/150‑132 (MQ=255) tCGTTGGTGTGGTGCTGtaacaactacgaaattgtcgatctcggcgttatggtgcctgcggaaaaaattctccgtaccgctaaagaagtgaatgctgatctgattggcctttcggggcttatcacgccgtcgctggacgagatggttaac > 1:39766‑M1/1‑17 (MQ=255) ggtgtggtgCTGtaacaactacgaaattgtcgatctcggcgttatggtgcctgcggaaaaaattctccgtaccgctcaagaagtgaatgctgatctgattggcatttcggggcttatcacgccgtcgctggacgagatggttaacgttgg > 1:535511‑M1/1‑12 (MQ=255) ggtgtggtgCTGtaacaactacgaaattgtcgatctcggcgttatggtgcctgcggaaaaaattctccgtaccgctaaagaagtgaatgctgatctgattggcctttcggggcttatcacgccgtcgctggacgagatagttaacgtggc > 1:484008‑M1/1‑12 (MQ=255) gtgtggtgCTGtaacaactacgaaattgtcgatctcggcgttatggtgcctgcggaaaaaattctccgtaccgctaaagaagtgaatgctgatctgattggcctttcggggcttatcacgccgtcgctggacgagatggttaacgtggcg > 2:568222‑M1/1‑11 (MQ=255) ggtgCTGtaacaactacgaaattgtcgatctcggcgttatggtgcctgcggaaaaaattctccgtaccgctaaagaagtgaatgctgatctgattggcctttcggggcttatcacgccgtcgctggacgagatggttaacgtggcgaaag < 1:520931‑M1/150‑144 (MQ=255) gtgCTGtaacaactacgaaattgtcgatctcggcgttatggtgcctgcggaaaaaattctccgtaccgctaaagaagtgaatgctgatctgattggcctttcggggcttatcacgccgtcgctggacgagatggttaacgtggcgaaagc > 2:522431‑M1/1‑6 (MQ=255) gtgCTGtaacaactacgaaattgtcgatctcggcgttatggtgcctgcggaaaaaattctccgtaccgctaaagaagtgaatgctgatctgattggcctttcggggcttatcacgccgtcgctggacgagatggttaacgtggcgaaaga > 2:506552‑M1/1‑6 (MQ=255) | GCGCGCGTCATGAAACAGGCGGTGGCCTACCTCGAACCGTTTATTGAAGCCAGCAAAGAGCAGGGCAAAACCAACGGCAAGATGGTGATCGCCACCGTGAAGGGCGACGTCCACGACATCGGTAAAAATATCGTTGGTGTGGTGCTGCAATGTAACAACTACGAAATTGTCGATCTCGGCGTTATGGTGCCTGCGGAAAAAATTCTCCGTACCGCTAAAGAAGTGAATGCTGATCTGATTGGCCTTTCGGGGCTTATCACGCCGTCGCTGGACGAGATGGTTAACGTGGCG > REL606/4204922‑4205212 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |