| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| MC JC | REL606 | 4,205,069 | Δ5 bp | 100% | coding (2311‑2315/3684 nt) | metH → | B12‑dependent methionine synthase |
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
| * | * | ÷ | REL606 | 4205069 | 4205073 | 5 | 37 [0] | [0] 37 | metH | B12‑dependent methionine synthase |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | REL606 | = 4205068 | 0 (0.000) | 30 (1.140) | 20/274 | NT | 100% | coding (2310/3684 nt) | metH | B12‑dependent methionine synthase |
| ? | REL606 | 4205074 = | 0 (0.000) | coding (2316/3684 nt) | metH | B12‑dependent methionine synthase | |||||
GCGCGCGTCATGAAACAGGCGGTGGCCTACCTCGAACCGTTTATTGAAGCCAGCAAAGAGCAGGGCAAAACCAACGGCAAGATGGTGATCGCCACCGTGAAGGGCGACGTCCACGACATCGGTAAAAATATCGTTGGTGTGGTGCTG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > REL606/4204922‑4205068‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑tgTAACAACTACGAAATTGTCGATCTCGGCGTTATGGTGCCTGCGGAAAAAATTCTCCGTACCGCTAAAGAAGTGAATGCTGATCTGATTGGCCTTTCGGGGCTTATCACGCCGTCGCTGGACGAGATGGTTAACGTGGCGAAAGA > REL606/4205074‑4205217 gagacaGTCATGAAACAGGCGGTGGCCTACCTCGAACCGTTTATTGAAGCCAGCAAAGAGCAGGGCAAAACCATCGGCAAGATGGTGATCGCCACCGTGAAGGGCGACGTCCACGACATCGGTAAAAATATCGTTGGTGTGGTGCTGTAA < 1:285310/144‑1GCGCGCGTCATGAAACAGGCGGTGGCCTACCTCGTACCGTTTATTGAAGCCAGCAAAGAGCAGGGCAAAACCAACGGCAAGATGGTGATCGCCACCGTGAAGGGCGACGTCCACGACATCGGTAAAAATATCGTTGGTGTGGTGCTGTAA < 1:361245/150‑1GCGCGCGTCATGAAACAGGCGGTGGCCTACCTCGAACCGTTTATTGAAGCCAGCAAAGAGCAGGGCAAAACCAACGGCAAGATGGTGATCGCCACCGTGAAGGGCGACGTCCACGACATCGGTAAAAATATCGTTGGTGTGGTGCTGTAA < 2:563268/150‑1 CGTCATGAAACAGGCGGTGGCCTACCTCGAACCGTTTATTGAAGCCAGCAAAGAGCAGGGCAAAACCAACGGCAAGATGGTGATCGCCACCGTGAAGGGCGACGTCCACGACATCGGTAAAAATATCGTTGGTGTGGTGCTGTAACAACT < 1:121744/150‑1 CGTCATGAAACAGGCGGTGGCCTACCTCGAACCGTTTATTGAAGCCAGCAAAGAGCAGGGCAAAACCAACGGCAAGATGGTGATCGCCACCGTGAAGGGCGACGTCCACGACATCGGTAAAAATATCGTTGGTGTGGTGCTGTAACAACT > 2:180074/1‑150 TCATGAAACAGGCGGTGGCCTACCTCGAACCGTTTATTGAAGCCAGCAAAGAGCAGGGCAAAACCAACGGCAAGATGGTGATCGCCACCGTGAAGGGCGACGTCCACGACATCGGTAAAAATATCGTTGGTGTGGTGCTGTAACtgtctc > 2:286124/1‑144 TCATGAAACAGGCGGTGGCCTACCTCGAACCGTTTATTGAAGCCAGCAAAGAGCAGGGCAAAACCAACGGCAAGATGGTGATCGCCACCGTGAAGGGCGACGTCCACGACATCGGTAAAAATATCGTTGGTGTGGTGCTGTAACAACTAC > 2:40180/1‑150 GGCCTACCTCGAACCGTTTATTGAAGCCAGCAAAGAGCAGGGCAAAACCAACGGCAAGATGGTGATCGCCACCGTGAAGGGCGACGTCCACGACATCGGTAAAAATATCGTTGGTGTGGTGCTGTAACAACTACGAAATTGTCGATCTCG > 2:269583/1‑150 GGCCTACCTCGAACCGTTTATTGAAGCCAGCAAAGAGCAGGGCAAAACCAACGGCAAGATGGTGATCGCCACCGTGAAGGGCGACGTCCACGACATCGGTAAAAATATCGTTGGTGTGGTGCTGTAACAACTACGAAATTGTCGATCTCG > 2:73479/1‑150 GGCCTACCTCGAACCGTTTATTGAAGCCAGCAAAGAGCAGGGCAAAACCAACGGCAAGATGGTGATCGCCACCGTGAAGGGCGACGTCCACGACATCGGTAAAAATATCGTTGGTGTGGTGCTGTAACAACTACGAAATTGTCGATCTCG > 2:197789/1‑150 GGCCTACCTCGAACCGTTTATTGAAGCCAGCAAAGAGCAGGGCAAAACCAACGGCAAGATGGTGATCGCCACCGTGAAGGGCGACGTCCACGACATCGGTAAAAATATCGTTGGTGTGGTGCTGTAACAACTACGAAATTGTCGATCTCG > 2:288923/1‑150 GGCCTACCTCGAACCGTTTATTGAAGCCAGCAAAGAGCAGGGCAAAACCAACGGCAAGATGGTGATCGCCACCGTGAAGGGCGACGTCCACGACATCGGTAAAAATATCGTTGGTGTGGTGCTGTAACAACTACGAAATTGTCGATCTCG > 2:291666/1‑150 CGAACCGTTTATTGAAGCCAGCAAAGAGCAGGGCAAAACCAACGGCAAGATGGTGATCGCCACCGTGAAGGGCGACGTCCACGACATCGGTAAAAATATCGTTGGTGTGGTGCTGTAACAACTACGAAATTGTCGATCTCGGCGTTATGG < 2:433487/150‑1 CGAACCGTTTATTGAAGCCAGCAAAGAGCAGGGCAAAACCAACGGCAAGATGGTGATCGCCACCGTGAAGGGCGACGTCCACGACATCGGTAAAAATATCGTTGGTGTGGTGCTGTAACAACTACGAAATTGTCGATCTCGGCGTTATGG < 1:40058/150‑1 CCGTTTATTGAAGCCAGCAAAGAGCAGGGCAAAACCAACGGCAAGATGGTGATCGCCACCGTGAAGGGCGACGTCCACGACATCGGTAAAAATATCGTTGGTGTGGTGCTGTAACAACTACGAAATTGTCGATCTCGGCGTTATGGTGCC < 2:303473/150‑1 AGCCAGCAAAGAGCAGGGCAAAACCAACGGCAAGATGGTGATCGCCACCGTGAAGGGCGACGTCCACGACATCGGTAAAAATATCGTTGGTGTGGTGCTGTAACAACTACGAAATTGTCGATCTCGGCGTTATGGTGCCTGCGGAAAAAA > 2:223369/1‑150 GCAAAGAGCAGGGCAAAACCAACGGCAAGATGGTGATCGCCACCGTGAAGGGCGACGTCCACGACATCGGTAAAAATATCGTTGGTGTGGTGCTGTAACAACTACGAAATTGTCGATCTCGGCGTTATGGTGCCTGCGGAAAAAATTCTC > 1:195704/1‑150 GAGCAGGGCAAAACCAACGGCAAGATGGTGATCGCCACCGTGAAGGGCGACGTCCACGACATCGGTAAAAATATCGTTGGTGTGGTGCTGTAACAACTACGAAATTGTCGATCTCGGCGTTATGGTGCCTGCGGAAAAAATTCTCCGTAC > 2:33047/1‑150 GGGCAAAACCAACGGCAAGATGGTGATCGCCACCGTGAAGGGCGACGTCCACGACATCGGTAAAAATATCGTTGGTGTGGTGCTGTAACAACTACGAAATTGTCGATCTCGGCGTTATGGTGCCTGCGGAAAAAATTCTCCGTACCGCTA > 1:145220/1‑150 GGGCAAAACCAACGGCAAGATGGTGATCGCCACCGTGAAGGGCGACGTCCACGACATCGGTAAAAATATCGTTGGTGTGGTGCTGTAACAACTACGAAATTGTCGATCTCGGCGTTATGGTGCCTGCGGAAAAAATTCTCCGTACCGCTA > 1:14395/1‑150 AACCAACGGCAAGATGGTGATCGCCACCGTGAAGGGCGACGTCCACGACATCGGTAAAAATATCGTTGGTGTGGTGCTGTAACAACTACGAAATTGTCGATCTCGGCGTTATGGTGCCTGCGGAAAAAATTCTCCGTACCGCTAAAGAAG < 1:179564/150‑1 GCAAGATGGTGATCGCCACCGTGAAGGGCGACGTCCACGACATCGGTAAAACTATCGTTGGTGTGGTGCTGTGACAACTACGAAATTGTCGATCTCGGCGTTATGGTGCCGGCGGAAAAAATTCGCCGTACCGCTAAAGAAGAGAATGCT > 1:290470/1‑150 GAAGGGCGACGTCCACGACATCGGTAAAAATATCGTTGGTGTGGTGCTGTAACAACTACGAAATTGTCGATCTCGGCGTTATGGTGCCTGCGGAAAAAATTCTCCGTACCGCTAAAGAAGTGAATGCTGATCTGATTGGCCTTTCGGGGC < 1:24185/150‑1 GAAGGGCGACGTCCACGACATCGGTAAAAATATCGTTGGTGTGGTGCTGTAACAACTACGAAATTGTCGATCTCGGCGTTATGGTGCCTGCGGAAAAAATTCTCCGTACCGCTAAAGAAGTGAATGCTGATCTGATTGGCCTTTCGGGGC < 1:306686/150‑1 GCGACGTCCACGACATCGGTAAAAATATCGTTGGTGTGGTGCTGTAACAACTACGAAATTGTCGATCTCGGCGTTATGGTGCCTGCGGAAAAAATTCTCCGTACCGCTAAAGAAGTGAATGCTGATCTGATTGGCCTTTCGGGGCTTATC < 1:73263/150‑1 GTCCACGACATCGGTAAAAATATCGTTGGTGTGGTGCTGTAACAACTACGAAATTGTCGATCTCGGCGTTATGGTGCCTGCGGAAAAAATTCTCCGTACCGCTAAAGAAGTGAATGCTGATCTGATTGGCCTTTCGGGGCTTATCACGCC > 1:563670/1‑150 GTCCACGACATCGGTAAAAATATCGTTGGTGTGGTGCTGTAACAACTACGAAATTGTCGATCTCGGCGTTATGGTGCCTGCGGAAAAAATTCTCAGTACCGCTAAAGAAGTGAATGCTGATCTGATTGGCCTGTCGGGCCTTATCACGCC > 1:296388/1‑150 AATATCGTTGGTGTGGTGCTGTAACAACTACGAAATTGTCGATCTCGGCGTTATGGTGCCTGCGGAAAAAATTCTCCGTACCGCTAAAGAAGTGAATGCTGATCTGATTGGCCTTTCGGGGCTTATCACGCCGTCGCTGGACGAGATGGT < 1:290838/150‑1 TATCGTTGGTGTGGTGCTGTAACAACTACGAAATTGTCGATCTCGGCGTTATGGTGCCTGCGGAAAAAATTCTCCGTACCGCTAAAGAAGTGAATGCTGATCTGATTGGCCTTTCGGGGCTTATCACGCCGTCGCTGGACGAGATGGTTA < 2:78613/150‑1 TATCGTTGGTGTGGTGCTGTAACAACTACGAAATTGTCGATCTCGGCGTTATGGTGCCTGCGGAAAAAATTCTCCGTACCGCTAAAGAAGTGAATGCTGATCTGATTGGCCTTTCGGGGCTTATCACGCCGTCGCTGGACGAGATGGTTA < 2:145636/150‑1 TCGTTGGTGTGGTGCTGTAACAACTACGAAATTGTCGATCTCGGCGTTATGGTGCCTGCGGAAAAAATTCTCCGTACCGCTAAAGAAGTGAATGCTGATCTGATTGGCCTTTCGGGGCTTATCACGCCGTCGCTGGACGAGATGGTTAAC > 1:39766/1‑150 GGTGTGGTGCTGTAACAACTACGAAATTGTCGATCTCGGCGTTATGGTGCCTGCGGAAAAAATTCTCCGTACCGCTCAAGAAGTGAATGCTGATCTGATTGGCATTTCGGGGCTTATCACGCCGTCGCTGGACGAGATGGTTAACGTtgg > 1:535511/1‑147 GGTGTGGTGCTGTAACAACTACGAAATTGTCGATCTCGGCGTTATGGTGCCTGCGGAAAAAATTCTCCGTACCGCTAAAGAAGTGAATGCTGATCTGATTGGCCTTTCGGGGCTTATCACGCCGTCGCTGGACGAGATAGTTAACGTGGC > 1:484008/1‑150 GTGTGGTGCTGTAACAACTACGAAATTGTCGATCTCGGCGTTATGGTGCCTGCGGAAAAAATTCTCCGTACCGCTAAAGAAGTGAATGCTGATCTGATTGGCCTTTCGGGGCTTATCACGCCGTCGCTGGACGAGATGGTTAACGTGGCG > 2:568222/1‑150 GGTGCTGTAACAACTACGAAATTGTCGATCTCGGCGTTATGGTGCCTGCGGAAAAAATTCTCCGTACCGCTAAAGAAGTGAATGCTGATCTGATTGGCCTTTCGGGGCTTATCACGCCGTCGCTGGACGAGATGGTTAACGTGGCGAAAG < 1:520931/150‑1 GTGCTGTAACAACTACGAAATTGTCGATCTCGGCGTTATGGTGCCTGCGGAAAAAATTCTCCGTACCGCTAAAGAAGTGAATGCTGATCTGATTGGCCTTTCGGGGCTTATCACGCCGTCGCTGGACGAGATGGTTAACGTGGCGAAAGc > 2:522431/1‑149 GTGCTGTAACAACTACGAAATTGTCGATCTCGGCGTTATGGTGCCTGCGGAAAAAATTCTCCGTACCGCTAAAGAAGTGAATGCTGATCTGATTGGCCTTTCGGGGCTTATCACGCCGTCGCTGGACGAGATGGTTAACGTGGCGAAAGA > 2:506552/1‑150 GCGCGCGTCATGAAACAGGCGGTGGCCTACCTCGAACCGTTTATTGAAGCCAGCAAAGAGCAGGGCAAAACCAACGGCAAGATGGTGATCGCCACCGTGAAGGGCGACGTCCACGACATCGGTAAAAATATCGTTGGTGTGGTGCTG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > REL606/4204922‑4205068‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑tgTAACAACTACGAAATTGTCGATCTCGGCGTTATGGTGCCTGCGGAAAAAATTCTCCGTACCGCTAAAGAAGTGAATGCTGATCTGATTGGCCTTTCGGGGCTTATCACGCCGTCGCTGGACGAGATGGTTAACGTGGCGAAAGA > REL606/4205074‑4205217 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |