Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
JC JC | REL606 | 2,196,656 | IS150 (–) +3 bp | 100% | coding (1350‑1352/1992 nt) | cirA ← | ferric iron‑catecholate outer membrane transporter |
New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | REL606 | = 666130 | NA (NA) | 28 (1.060) | 21/276 | NT | 100% | noncoding (1443/1443 nt) | IS150 | repeat region |
? | REL606 | = 2196658 | 0 (0.000) | coding (1350/1992 nt) | cirA | ferric iron‑catecholate outer membrane transporter | |||||
* | ? | REL606 | 2196656 = | 0 (0.000) | 20 (0.750) | 13/278 | NT | 100% | coding (1352/1992 nt) | cirA | ferric iron‑catecholate outer membrane transporter |
? | REL606 | 3651091 = | NA (NA) | noncoding (1/1443 nt) | IS150 | repeat region |
GCCCGGTGCAGCGTTGACGTCAGACGTACGGCTGATGCTGATACGATCTTTCACATCGTTACGGAAAACGGTAACGCTGGATTCAACCCCTTCCAGCCAGCCTTCTTCACCCATGTAGTAAAGCCCCAGCTCCCAACTTTCGCTGGTTTCTGGTTTCAGATCCGGGCTACCCACAATCTTACATGCGCCACGGCAGGAATTGCTCGTCCAGTCAGGGCTAAGTTGCAACAGAGAAGGTGCTTTAAATGCCGTCGCCCAGCCCCCTTTCACCGTTACGGTGTCGGTGGCGTTATA > REL606/2196511‑2196804 | gCCCGGTGCAGCGTTGACGTCAGACGTACGGCTGATGCTGATACGATCTTTCACATCGTTACGGAAAACGGTAACGCTGGATTCAACCCCTTCCAGCCAGCCTTCTTCACCCATGTAGTAAAGCCCCAGCTCGCAACTTTCGCTGGTTtg < 1:435773‑M2/150‑3 (MQ=255) gCCCGGTGCAGCGTTGACGTCAGACGTACGGCTGATGCTGATACGATCTTTCACATCGTTACGGAAAACGGTAACGCTGGATTCAACCCCTTCCAGCCAGCCTTCTTCACCCATGTAGTAAAGCCCCAGCTCCCAACTTTCGCTGGTTtg < 2:647688‑M2/150‑3 (MQ=255) cGGTGCAGCGTTGACGTCAGACGTACGGCTGATGCTGATACGATCTTTCACATCGTTACGGAAAACGGTAACGCTGGATTCAACCCCTTCCAGCCAGCCTTCTTCACCCATGTAGTAAAGCCCCAGCTCCCAACTTTCGCTGGTTtgtac > 2:35228‑M2/1‑145 (MQ=255) cGGTGCAGCGTTGACGTCAGACGTACGGCTGATGCTGATACGATCTTTCACATCGTTACGGAAAACGGTAACGCTGGATTCAACCCCTTCCAGCCAGCCTTCTTCACCCATGTAGTAAAGCCCCAGCTCCCAACTTTCGCTGGTTtgtac > 2:101934‑M2/1‑145 (MQ=255) cGGTGCAGCGTTGACGTCAGACGTACGGCTGATGCTGATACGATCTTTCACATCGTTACGGAAAACGGTAACGCTGGATTCAACCCCTTCCAGCCAGCCTTCTTCACCCATGTAGTAAAGCCCCAGCTCCCAACTTTCGCTGGTTtgtac > 2:616532‑M2/1‑145 (MQ=255) cGGTGCAGCGTTGACGTCAGACGTACGGCTGATGCTGATACGATCTTTCACATCGTTACGGAAAACGGTAACGCTGGATTCAACCCCTTCCAGCCAGCCTTCTTCACCCATGTAGTAAAGCCCCAGCTCCCAACTTTCGCTGGTTtgtac > 2:295925‑M2/1‑145 (MQ=255) cGGTGCAGCGTGTACGTAAGACGTACGGCTTATGCTGATACGATCTTTCACTTCGTTACGGAAAACGGTAACGCTGGATTCAACCCCTTCCAGCCAGCCTTCTGCATCCATGTAGTAAGGCCCCAGCTCCCAACTTTCGCTGGTTtgtac > 1:203109‑M2/1‑145 (MQ=255) ggTGCAGCGTTGACGTCAGACGTACGGCTGATGCTGATACGATCTTTCACATCGTTACGGAAAACGGTAACGCTGGATTCAACCCCTTCCAGCCAGCCTTCTTCACCCATGTAGTAAAGCCCCAGCTCCCAACTTTCGCTGGTTtgtact > 2:199493‑M2/1‑144 (MQ=255) cgtgccgagatgatcctgtaaccatcatcagttgtgaagtagtgattcacgacttcaaggcgcttttcaaaagggtattttggctttgacatattaggggctattccatttcatcgtccaacaaaatgggtgcagtacagtttccggcac > 2:329469‑M1/140‑144 (MQ=255) cAGCGTTGACGTCAGACGTACGGCTGATGCTGATACGATCTTTCACATCGTTACGGAAAACGGTAACGCTGGATTCAACCCCTTCCAGCCAGCCTTCTTCACCCATGTAGTAAAGCCCCAGCTCCCAACTTTCGCTGGTTtgtactgacc > 2:537927‑M2/1‑140 (MQ=255) gatgatcctgtaaccatcatcagttgtgaagtagtgattcacgacttcaaggcgcttttcaaaagggtattttggctttgacatattaggggctattccatttcatcgtccaacaaaatgggtgcagtacaGTTTCTGGTTTCAGATCCg < 2:427893‑M1/19‑1 (MQ=255) aCGTCAGACGTACGGCTGATGCTGATACGATCTTTCACATCGTTACGGAAAACGGTAACGCTGGATTCAACCCCTTCCAGCCAGCCTTCTTCACCCATGTAGTAAAGCCCCAGCTCCCAACTTTCGCTGGTTtgtactgaccccaaaaag > 2:416138‑M2/1‑132 (MQ=255) tgtataagagacaggttgtgaagtagtgattcacgacttcaaggcgcttttcaaaagggtattttggctttgacatattaggggctattccatttcatcgtccaacaaaatgggtgcagtacaGTTTCTGGTTTCAGATCCGGGCTAccc > 2:340798‑M1/124‑150 (MQ=255) aCGTACGGCTGATGCTGATACGATCTTTCACATCGTTACGGAAAACGGTAACGCTGGATTCAACCCCTTCCAGCCAGCCTTCTTCACCCATGTAGTAAAGCCCCAGCTCCCAACTTTCGCTGGTTtgtactgaccccaaaaagttggaca < 1:558418‑M2/150‑26 (MQ=255) tgatgctgatACGATCTTTCACATCGTTACGGAAAACGGTAACGCTGGATTCAACCCCTTCCAGCCAGCCTTCTTCACCCATGTAGTAAAGCCCCAGCTCCCAACTTTCGCTGGTTtgtactgaccccaaaaagttggacagttaaacac > 2:634342‑M2/1‑116 (MQ=255) tgatgctgatACGATCTTTCACATCGTTACGGAAAACGGTAACGCTGGATTCAACCCCTTCCAGCCAGCCTTCTTCACCCATGTAGTAAAGCCCCAGCTCCCAACTTTCGCTGGTTtgtactgaccccaaaaagttggacagttaaacac > 2:550608‑M2/1‑116 (MQ=255) tgatgctgatACGATCTTTCACATCGTTACGGAAAACGGTAACGCTGGATTCAACCCCTTCCAGCCAGCCTTCTTCACCCATGTAGTAAAGCACCAGCTCCCAACTTTCGCTGGTTtgtactgtccccaaaaagttggacagttaaacac > 2:437013‑M2/1‑116 (MQ=255) cagttgtgaagtagtgattcacgacttcaaggcgcttttcaaaagggtattttggctttgacatattaggggctattccatttcatcgtccaacaaaatgggtgcagtacaGTTTCTGGTTTCAGATCCGGGCTACCCACAATCTTACAt > 2:569606‑M1/112‑150 (MQ=255) 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cTTTCACATCGTTACGGAAAACGGTAACGCTGGATTCAACCCCTTCCAGCCAGCCTTCTTCACCCATGTAGTAAAGCCCCAGCTCCCAACTTTCGCTGGTTttgtactgaccccaaaaagttggacagttaaacacgaggcatataggtc > 2:202350‑M2/1‑101 (MQ=255) cTTTCACATCGTTACGGAAAACGGTAACGCTGGATTCAACCCCTTCCAGCCAGCCTTCTTCACCCATGTAGTAAAGCCCCAGCTCCCAACTTTCGCTGGTTtgtactgaccccaaaaagttggacagttaaacacgaggcatataggtct < 2:487093‑M2/150‑50 (MQ=255) acttcaaggcgcttttcaaaagggtattttggctttgacatattaggggctattccatttcatcgtccaacaaaatgggtgcagtacaGTTTCTGGTTTCAGATCCGGGCTACCCACAATCTTACATGCGCCACGGCAGGAATTGCTCGt < 2:213145‑M1/62‑1 (MQ=255) cGTTAACGCTGGATTCAACCCCTTCCGGCCAGTCTTCTTCAACCATGTATTAAAGCCCCAGGTCCCAACTTTCGCTGGTTtgtactgaccccaaaaagttggacagttaaacacgaggcatataggtctgattccgatattcaattggag > 1:448575‑M2/1‑80 (MQ=255) tttcaaaagggtattttggctttgacatattaggggctattccatttcatcgtccaacaaaatgggtgcagtacaGTTTCTGGTTTCAGATCCGGGCTACCCACAATCTTACATGCGCCACGGCAGGAATTGCTCGTCCAGTCAGGGCTa < 2:366681‑M1/75‑1 (MQ=255) caaaagggtattttggctttgacatattaggggctattccatttcatcgtccaacaaaatgggtgcagtacaGTTTCTGGTTTCAGATCCGGGCTACCCACAATCTTACATGCGCCACGGCAGGAATTGCTCGTCCAGTCAGGGCTAAGt > 2:392261‑M1/73‑150 (MQ=255) caaaagggcattttagctttgacattataggggctattgcatttcatcgtccaacaaaatgggggcagtacaGTTTCTGGTTTCAGATCCGGGCTACCCCCCATCATACATACCCCACGGCAGGAATTGCTCGTCCAGTCAGGGCTAAGt > 1:209048‑M1/73‑150 (MQ=255) aTTCAACCCCTTCCAGCCAGCCTTCTTCACCCATGTAGTAAAGCCCCAGCTCCCAACTTTCGCTGGTTtgtactgaccccaaaaagttggacagttaaacacgaggcatataggtctgattccgatattcaattggagtcagacctttta < 2:497077‑M2/150‑83 (MQ=255) aTTCAACCCCTTCCAGCCAGCCTTCTTCACCCATGTAGTAAAGCCCCAGCTCCCAACTTTCGCTGGTTtgtactgaccccaaaaagttggacagttaaacacgaggcatataggtctgattccgatattcaattggagtcagacctttta < 2:78249‑M2/150‑83 (MQ=255) tattttggctttgacatattaggggctattccatttcatcgtccaacaaaatgggtgcagtacaGTTTCTGGTTTCAGATCCGGGCTACCCACAATCTTACATGCGCCACGGTAGGAATTGCTCGTCCAGTCAGGGCTAAGTTGCAACag > 1:365622‑M1/65‑150 (MQ=255) tattttggctttgacatattaggggctattccatttcatcgtccaacaaaatgggtgcagtacaGTTTCTGGTTTCAGATCCGGGCTACCCACAATCTTACATGCGCCACGGCAGGAATTGCTCGTCCAGTCAGGGCTAAGTTGCAACag > 2:9898‑M1/65‑150 (MQ=255) aaCCCCTTCCAGCCAGCCTTCTTCACCCATGTAGTAAAGCCCCAGCTCCCAACTTTCGCTGGTTtgtactgaccccaaaaagttggacagttaaacacgaggcatataggtctgattccgatattcaattggagtcagaccttttaattt > 2:38130‑M2/1‑64 (MQ=255) cTTCCAGCCAGCCTTCTTCACCCATGTAGTAAAGCCCCAGCTCCCAACTTTCGCTGGTTtgtactgaccccaaaaagttggacagttaaacacgaggcatataggtctgattccgatattcaattggagtcagaccttttaatttcaggc < 1:280807‑M2/150‑92 (MQ=255) tattaggggctattccatttcatcgtccaacaaaatgggtgcagtacaGTTTCTGGTTTCAGATCCGGGCTACCCACAATCTTACATGCGCCACGGCAGGAATTGCTCGTCCAGTCAGGGCTAAGTTGCAACAGAGAAGGTGCTTTAAAt > 1:426682‑M1/49‑150 (MQ=255) attaggggctattccatttcatcgtccaacaaaatgggtgcagtacaGTTTCTGGTTTCAGATCCGGGCTACCCACAATCTTACATGCGCCACGGCAGGAATTGCTCGTCCAGTCAGGGCTAAGTTGCAACAGAGAAGGTGCTTTAAATg < 2:453817‑M1/103‑1 (MQ=255) 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cccATGTAGTAAAGCCCCAGCTCCCAACTTTCGCTGGTTtgtactgaccccaaaaagttggacagttaaacacgaggcatataggtctgattccgatattcaattggagtcagaccttttaatttcaggctaattcttctgctgttgtag < 1:391917‑M2/150‑112 (MQ=255) cccATGTAGTAAAGCCCCAGCTCCCAACTTTCGCTGGTTtgtactgaccccaaaaagttggacagttaaacacgaggcatataggtctgattccgatattcaattggagtcagaccttttaatttcaggctaattcttctgctgttgtag < 2:137824‑M2/150‑112 (MQ=255) cccATGTAGTAAAGCCCCAGCTCCCAACTTTCGCTGGTTtgtactgaccccaaaaagttggacagttaaacacgaggcatataggtctgattccgatattcaattggagtcagaccttttaatttcaggctaattcttctgctgttgtag < 1:581687‑M2/150‑112 (MQ=255) ccatttcatcgtccaacaaaatgggtgcagtacaGTTTCTGGTTTCAGATCCGGGCTACCCACAATCTTACATGCGCCACGGCAGGAATTGCTCGTCCAGTCAGGGCTAAGTTGCAACAGAGAAGGTGCTTTAAATGCCGTCGCCCAGcc < 2:237085‑M1/116‑1 (MQ=255) cATGTAGTAAAGCCCCAGCTCCCAACTTTCGCTGGTTtgtactgactccaaaaagttggacagttaaacacgaggcatataggtctgattccgatattcaattggagtcagaccttttaatttcaggctaattcttctgctgttgtagta > 1:631854‑M2/1‑37 (MQ=255) agtaAAGCCCCAGCTCCCAACTTTCGCTGGTTtgtactgaccccaaaaagttggacagttaaacacgaggcatataggtctgattccgatattcaattggagtcagaccttttaatttcaggctaattcttctgctgttgtagtattcaa < 1:256815‑M2/150‑119 (MQ=255) gtaAAGCCCCAGCTCCCAACTTTCGCTGGTTtgtactgaccccaaaaagttggacagttaaacacgaggcatataggtctgattccgatattcaattggagtcagaccttttaatttcaggctaattcttctgctgttgtagtattcaat > 2:281607‑M2/1‑31 (MQ=255) acagcCCCAGCTCCCACGTTTCGTTGGTTtgtactgaccacaaaaagttggacagttaaactcgatgcatatatgtctgattccgatattcaattggagtcagaccttttaatttcaggctaattcttctgctgttggagtattcaatat > 1:2440‑M2/3‑29 (MQ=255) aaaGCCCCAGCTCCCAACTTTCGCTGGTTtgtactgaccccaaaaagttggacagttaaacacgaggcatataggtctgattccgatattcaattggagtcagaccttttaatttcaggctaattcttctgctgttgtagtattcaatat > 1:627269‑M2/1‑29 (MQ=255) cgtccaacaaaatgggtgcagtacaGTTTCTGGTTTCAGATCCGGGCTACCCACAATCTTACATGCGCCACGGCAGGAATTGCTCGTCCAGTCAGGGCTAAGTTGCAACAGAGAAGGTGCTTTAAATGCCGTCGCCCAGCCCCCTTTCAc > 1:212534‑M1/26‑150 (MQ=255) gCCCCAGCTCCCAACTTTCGCTGGTTtgtactgaccccaaaaagttggacagttaaacacgaggcatataggtctgattccgatattcaattggagtcagaccttttaatttcaggctaattcttctgctgttgtagtattcaatatatt < 2:361513‑M2/150‑125 (MQ=255) ccccAGCTCCCAACTTTCGCTGGTTtgtactgaccccaaaaagttggacagttaaacacgaggcatataggtctgattccgatattcaattggagtcagaccttttaatttcaggctaattcttctgctgttgtagtattcaatatattc > 2:176633‑M2/1‑25 (MQ=255) cccAGCTCCCAACTTTCGCTGGTTtgtactgaccccaaaaagttggacagttaaacacgaggcatataggtctgattccgatattcaattggagtcagaccttttaatttcaggctaattcttctgctgttgtagtattcaatatattcc > 1:78020‑M2/1‑24 (MQ=255) cTTTCGCTGGTTtgtactgaccccaaaaagttggacagttaaacacgaggcatataggtctgattccgatattcaattggagtcagaccttttaatttcaggctaattcttctgctgttgtagtattcaatatattccgtaacagcatcc > 2:560037‑M2/1‑12 (MQ=255) tgtacaGTTTCTGGTTTCAGATCCGGGCTACCCACAATCTTACATGCGCCACGGCAGGAATTGCTCGTCCAGTCAGGGCTAAGTTGCAACAGAGAAGGTGCTTTAAATGCCGTCGCCCAGCCCCCTTTCACCGTTACGGTGTCGGTGGCg > 1:452534‑M1/7‑150 (MQ=255) agggtttgtactgaccccaaaaagttggacagttaaacacgaggcatataggtctgattccgatattcaattggagtcagaccttttaatttcaggctaattcttctgctgttgtagtattcaatatattccgtaacagcatccttcagt > 2:16599‑M2/3‑6 (MQ=255) tGGTTtgtactgaccccaaaaagttggacagttaaacacgaggcatataggtctgattccgatattcaattggagtcagaccttttaatttcaggctaattcttctgctgttgtagtattcaatatattccgtaacagcatccttcagtt > 2:257549‑M2/1‑5 (MQ=255) ggTTtgtactgaccccaaaaagttggacagttaaacacgaggcatataggtctgattccgatattcaattggagtcagaccttttaatttcaggctaattcttctgctgttgtagtattcaatatattccgtaacagcatccttcagttc > 2:290581‑M2/1‑4 (MQ=255) ggTTtgtactgaccccaaaaagttggacagttaaacacgaggcatataggtctgattccgatattcaattggagtcagaccttttaatttcaggctaattcttctgctgttgtagtattcaatatattccgtaacagcatccttcagttc < 1:289756‑M2/150‑147 (MQ=255) ggTTtgtactgaccccaaaaagttggacagttaaacacgaggcatataggtctgattccgatattcaattggagtcagaccttttaatttcaggctaattcttctgctgttgtagtattcaatatattccgtaacagcatccttcagtct < 1:16547‑M2/150‑147 (MQ=255) | GCCCGGTGCAGCGTTGACGTCAGACGTACGGCTGATGCTGATACGATCTTTCACATCGTTACGGAAAACGGTAACGCTGGATTCAACCCCTTCCAGCCAGCCTTCTTCACCCATGTAGTAAAGCCCCAGCTCCCAACTTTCGCTGGTTTCTGGTTTCAGATCCGGGCTACCCACAATCTTACATGCGCCACGGCAGGAATTGCTCGTCCAGTCAGGGCTAAGTTGCAACAGAGAAGGTGCTTTAAATGCCGTCGCCCAGCCCCCTTTCACCGTTACGGTGTCGGTGGCGTTATA > REL606/2196511‑2196804 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |