| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| JC JC | REL606 | 2,196,656 | IS150 (–) +3 bp | 100% | coding (1350‑1352/1992 nt) | cirA ← | ferric iron‑catecholate outer membrane transporter |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | REL606 | = 666130 | NA (NA) | 28 (1.060) | 21/276 | NT | 100% | noncoding (1443/1443 nt) | IS150 | repeat region |
| ? | REL606 | = 2196658 | 0 (0.000) | coding (1350/1992 nt) | cirA | ferric iron‑catecholate outer membrane transporter | |||||
| * | ? | REL606 | 2196656 = | 0 (0.000) | 20 (0.750) | 13/278 | NT | 100% | coding (1352/1992 nt) | cirA | ferric iron‑catecholate outer membrane transporter |
| ? | REL606 | 3651091 = | NA (NA) | noncoding (1/1443 nt) | IS150 | repeat region | |||||
GCCCGGTGCAGCGTTGACGTCAGACGTACGGCTGATGCTGATACGATCTTTCACATCGTTACGGAAAACGGTAACGCTGGATTCAACCCCTTCCAGCCAGCCTTCTTCACCCATGTAGTAAAGCCCCAGCTCCCAACTTTCGCTGGTTTCTGGTTTCAGATCCGGGCTACCCACAATCTTACATGCGCCACGGCAGGAATTGCTCGTCCAGTCAGGGCTAAGTTGCAACAGAGAAGGTGCTTTAAATGCCGTCGCCCAGCCCCCTTTCACCGTTACGGTGTCGGTGGCGTTATA > REL606/2196511‑2196804 | gCCCGGTGCAGCGTTGACGTCAGACGTACGGCTGATGCTGATACGATCTTTCACATCGTTACGGAAAACGGTAACGCTGGATTCAACCCCTTCCAGCCAGCCTTCTTCACCCATGTAGTAAAGCCCCAGCTCGCAACTTTCGCTGGTTtg < 1:435773‑M2/150‑3 (MQ=255)gCCCGGTGCAGCGTTGACGTCAGACGTACGGCTGATGCTGATACGATCTTTCACATCGTTACGGAAAACGGTAACGCTGGATTCAACCCCTTCCAGCCAGCCTTCTTCACCCATGTAGTAAAGCCCCAGCTCCCAACTTTCGCTGGTTtg < 2:647688‑M2/150‑3 (MQ=255) cGGTGCAGCGTTGACGTCAGACGTACGGCTGATGCTGATACGATCTTTCACATCGTTACGGAAAACGGTAACGCTGGATTCAACCCCTTCCAGCCAGCCTTCTTCACCCATGTAGTAAAGCCCCAGCTCCCAACTTTCGCTGGTTtgtac > 2:35228‑M2/1‑145 (MQ=255) cGGTGCAGCGTTGACGTCAGACGTACGGCTGATGCTGATACGATCTTTCACATCGTTACGGAAAACGGTAACGCTGGATTCAACCCCTTCCAGCCAGCCTTCTTCACCCATGTAGTAAAGCCCCAGCTCCCAACTTTCGCTGGTTtgtac > 2:101934‑M2/1‑145 (MQ=255) cGGTGCAGCGTTGACGTCAGACGTACGGCTGATGCTGATACGATCTTTCACATCGTTACGGAAAACGGTAACGCTGGATTCAACCCCTTCCAGCCAGCCTTCTTCACCCATGTAGTAAAGCCCCAGCTCCCAACTTTCGCTGGTTtgtac > 2:616532‑M2/1‑145 (MQ=255) cGGTGCAGCGTTGACGTCAGACGTACGGCTGATGCTGATACGATCTTTCACATCGTTACGGAAAACGGTAACGCTGGATTCAACCCCTTCCAGCCAGCCTTCTTCACCCATGTAGTAAAGCCCCAGCTCCCAACTTTCGCTGGTTtgtac > 2:295925‑M2/1‑145 (MQ=255) cGGTGCAGCGTGTACGTAAGACGTACGGCTTATGCTGATACGATCTTTCACTTCGTTACGGAAAACGGTAACGCTGGATTCAACCCCTTCCAGCCAGCCTTCTGCATCCATGTAGTAAGGCCCCAGCTCCCAACTTTCGCTGGTTtgtac > 1:203109‑M2/1‑145 (MQ=255) ggTGCAGCGTTGACGTCAGACGTACGGCTGATGCTGATACGATCTTTCACATCGTTACGGAAAACGGTAACGCTGGATTCAACCCCTTCCAGCCAGCCTTCTTCACCCATGTAGTAAAGCCCCAGCTCCCAACTTTCGCTGGTTtgtact > 2:199493‑M2/1‑144 (MQ=255) 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GCCCGGTGCAGCGTTGACGTCAGACGTACGGCTGATGCTGATACGATCTTTCACATCGTTACGGAAAACGGTAACGCTGGATTCAACCCCTTCCAGCCAGCCTTCTTCACCCATGTAGTAAAGCCCCAGCTCCCAACTTTCGCTGGTTTCTGGTTTCAGATCCGGGCTACCCACAATCTTACATGCGCCACGGCAGGAATTGCTCGTCCAGTCAGGGCTAAGTTGCAACAGAGAAGGTGCTTTAAATGCCGTCGCCCAGCCCCCTTTCACCGTTACGGTGTCGGTGGCGTTATA > REL606/2196511‑2196804 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |