| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| MC JC | ADP1‑WT | 941,306 | Δ3,549 bp | IS1236‑mediated | ACIAD0952–[ACIAD0959] | ACIAD0952, ACIAD0953, ACIAD0955, ACIAD0956, ACIAD0957, ACIAD0958, [ACIAD0959] |
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
| * | * | ÷ | ADP1‑WT | 941306 | 944854 | 3549 | 39 [0] | [0] 39 | ACIAD0952–[ACIAD0959] | ACIAD0952,ACIAD0953,ACIAD0955,ACIAD0956,ACIAD0957,ACIAD0958,[ACIAD0959] |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | ADP1‑WT | = 941305 | 0 (0.000) | 38 (1.100) | 31/248 | 0.2 | 100% | noncoding (1237/1237 nt) | IS1236 | repeat region |
| ? | ADP1‑WT | 944855 = | 0 (0.000) | noncoding (2/1237 nt) | IS1236 | repeat region | |||||
TATTGAGAAAATGAAAATCAAATTTTACAACTAGTGAGTCATGTGATATTAGGTTCAGTATTGATACATAAGTAATGGTAATCTAAATTGGCTAAAGATGAAAATTGATTATTTAATCATTAAAGT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > ADP1‑WT/941180‑941305‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑tCAATTGACCGCTTGATCAGCCTCTTGTGGTGTCAAAGAGGTATTTTTAGCCAGAGCCTGACTCACTTCATTTCTATCGATAGAGTTGGTCACTGTTTGTGCACGTGTTTTTAACGTATTT > ADP1‑WT/944855‑944974 TATTGAGAAAATGAAAATCAAATTTTACAACTAGTGAGTCATGTGATATTAGGTTCAGTATTGATACATAAGTAATGGTAATCTAAATTGGCTAAAGATGAAAATTGATTATTTAATCATTAAAGT > 1:140617/1‑126 ATTGAGAAAATGAAAATCAAATTTTACAACTAGTGAGTCATGTGATATTAGGTTCAGTATTGATACATAAGTAATGGTAATCTAAATTGGCTAAAGATGAAAATTGATTATTTAATCATTAAAGTC > 2:101650/1‑126 ATTGAGAAAATGAAAATCAAATTTTACAACTAGTGAGTCATGTGATATTAGGTTCAGTATTGATACATAAGTAATGGTAATCTAAATTGGCTAAAGATGAAAATTGATTATTTAATCATTAAAGTC > 2:493542/1‑126 AAAATGAAAATCAAATTTTACAACTAGTGAGTCATGTGATATTAGGTTCAGTATTGATACATAAGTAATGGTAATCTAAATTGGCTAAAGATGAAAATTGATTATTTAATCATTAAAGTCAATTGA < 1:459946/126‑1 AAAATGAAAATCAAATTTTACAACTAGTGAGTCATGTGATATTAGGTTCAGTATTGATACATAAGTAATGGTAATCTAAATTGGCTAAAGATGAAAATTGATTATTTAATCATTAAAGTCAATTGA > 2:389527/1‑126 AATGAAAATCAAATTTTACAACTAGTGAGTCATGTGATATTAGGTTCAGTATTGATACATAAGTAATGGTAATCTAAATTGGCTAAAGATGAAAATTGATTATTTAATCATTAAAGTCAATTGACC > 1:443509/1‑126 ATGAAAATCAAATTTTACAACTAGTGAGTCATGTGATATTAGGTTCAGTATTGATACATAAGTAATGGTAATCTAAATTGGCTAAAGATGAAAATTGATTATTTAATCATTAAAGTCAATTGACCG > 1:205498/1‑126 ATGAAAATCAAATTTTACAACTAGTGAGTCATGTGATATTAGGTTCAGTATTGATACATAAGTAATGGTAATCTAAATTGGCTAAAGATGAAAATTGATTATTTAATCATTAAAGTCAATTGACCG < 2:443541/126‑1 TCAAATTTTACAACTAGTGAGTCATGTGATATTAGGTTCAGTATTGATACATAAGTAATGGTAATCTAAATTGGCTAAAGATGAAAATTGATTATTTAATCATTAAAGTCAATTGACCGCTTGATC < 2:200785/126‑1 CAAATTTTACAACTAGTGAGTCATGTGATATTAGGTTCAGTATTGATACATAAGTAATGGTAATCTAAATTGGCTAAAGATGAAAATTGATTATTTAATCATTAAAGTCAATTGACCGCTTGATCA < 2:456566/126‑1 TACAACTAGTGAGTCATGTGATATTAGGTTCAGTATTGATACATAAGTAATGGTAATCTAAATTGGCTAAAGATGAAAATTGATTATTTAATCATTAAAGTCAATTGACCGCTTGATCAGCCTCTT > 1:24887/1‑126 GAGTCATGTGATATTAGGTTCAGTATTGATACATAAGTAATGGTAATCTAAATTGGCTAAAGATGAAAATTGATTATTTAATCATTAAAGTCAATTGACCGCTTGATCAGCCTCTTGTGGTGTCAA < 1:390089/126‑1 AGTCATGTGATATTAGGTTCAGTATTGATACATAAGTAATGGTAATCTAAATTGGCTAAAGATGAAAATTGATTATTTAATCATTAAAGTCAATTGACCGCTTGATCAGCCTCTTGTGGTGTCAAA > 2:104234/1‑126 TGATATTAGGTTCAGTATTGATACATAAGTAATGGTAATCTAAATTGGCTAAAGATGAAAATTGATTATTTAATCATTAAAGTCAATTGACCGCTTGATCAGCCTCTTGTGGTGTCAAAGAGGTAT < 1:264654/126‑1 TGATATTAGGTTCAGTATTGATACATAAGTAATGGTAATCTAAATTGGCTAAAGATGAAAATTGATTATTTAATCATTAAAGTCAATTGACCGCTTGATCAGCCTCTTGTGGTGTCAAAGAGGTAT < 1:273531/126‑1 GATATTAGGTTCAGTATTGATACATAAGTAATGGTAATCTAAATTGGCTAAAGATGAAAATTGATTATTTAATCATTAAAGTCAATTGACCGCTTGATCAGCCTCTTGTGGTGTCAAAGAGGTATT < 1:375075/126‑1 TATTAGGTTCAGTATTGATACATAAGTAATGGTAATCTAAATTGGCTAAAGATGAAAATTGATTATTTAATCATTAAAGTCAATTGACCGCTTGATCAGCCTCTTGTGGTGTCAAAGAGGTATTTT < 2:379351/126‑1 TATTAGGTTCAGTATTGATACATAAGTAATGGTAATCTAAATTGGCTAAAGATGAAAATTGATTATTTAATCATTAAAGTCAATTGACCGCTTGATCAGCCTCTTGTGGTGTCAAAGAGGTATTTT > 2:25214/1‑126 TTAGGTTCAGTATTGATACATAAGTAATGGTAATCTAAATTGGCTAAAGATGAAAATTGATTATTTAATCATTAAAGTCAATTGACCGCTTGATCAGCCTCTTGTGGTGTCAAAGAGGTATTTTTA < 1:276045/126‑1 TTAGGTTCAGTATTGATACATAAGTAATGGTAATCTAAATTGGCTAAAGATGAAAATTGATTATTTAATCATTAAAGTCAATTGACCGCTTGATCAGCCTCTTGTGGTGTCAAAGAGGTATTTTTA < 1:197047/126‑1 TAGGTTCAGTATTGATACATAAGTAATGGTAATCTAAATTGGCTAAAGATGAAAATTGATTATTTAATCATTAAAGTCAATTGACCGCTTGATCAGCCTCTTGTGGTGTCAAAGAGGTATTTTTAG < 2:447955/126‑1 AGTATTGATACATAAGTAATGGTAATCTAAATTGGCTAAAGATGAAAATTGATTATTTAATCATTAAAGTCAATTGACCGCTTGATCAGCCTCTTGTGGTGTCAAAGAGGTATTTTTAGCCAGAGC > 1:167257/1‑126 TATTGATACATAAGTAATGGTAATCTAAATTGGCTAAAGATGAAAATTGATTATTTAATCATTAAAGTCAATTGACCGCTTGATCAGCCTCTTGTGGTGTCAAAGAGGTATTTTTAGCCAGAGCCT < 1:189633/126‑1 GGTAATCTAAATTGGCTAAAGATGAAAATTGATTATTTAATCATTAAAGTCAATTGACCGCTTGATCAGCCTCTTGTGGTGTCAAAGAGGTATTTTTAGCCAGAGCCTGACTCACTTCATTTCTAT < 2:119077/126‑1 GGTAATCTAAATTGGCTAAAGATGAAAATTGATTATTTAATCATTAAAGTCAATTGACCGCTTGATCAGCCTCTTGTGGTGTCAAAGAGGTACTTTTAGCCAGAGCCTGACTCACTTCATTTCTAT < 2:73085/126‑1 TAATCTAAATTGGCTAAAGATGAAAATTGATTATTTAATCATTAAAGTCAATTGACCGCTTGATCAGCCTCTTGTGGTGTCAAAGAGGTATTTTTAGCCAGAGCCTGACTCACTTCATTTCTATCG < 1:321476/126‑1 TAATCTAAATTGGCTAAAGATGAAAATTGATTATTTAATCATTAAAGTCAATTGACCGCTTGATCAGCCTCTTGTGGTGTCAAAGAGGTATTTTTAGCCAGAGCCTGACTCACTTCATTTCTATCG < 2:442874/126‑1 TAAAGATGAAAATTGATTATTTAATCATTAAAGTCAATTGACCGCTTGATCAGCCTCTTGTGGTGTCAAAGAGGTATTTTTAGCCAGAGCCTGACTCACTTCATTTCTATCGATAGAGTTGGTCAC > 1:389545/1‑126 ATGAAAATTGATTATTTAATCATTAAAGTCAATTGACCGCTTGATCAGCCTCTTGTGGTGTCGAAGAGGTATTTTTAGCCAGAGCCTGACTCACTTCATTTCTATCGATAGAGTTGGTCACTGTTT < 2:180662/126‑1 GAAAATTGATTATTTAATCATTAAAGTCAATTGACCGCTTGATCAGCCTCTTGTGGTGTCAAAGAGGTATTTTTAGCCAGAGCCTGACTCACTTCATTTCTATCGATAGAGTTGGTCACTGTTTGT > 1:158907/1‑126 AATTGATTATTTAATCATTAAAGTCAATTGACCGCTTGATCAGCCTCTTGTGGTGTCAAAGAGGTATTTTTAGCCAGAGCCTGACTCACTTCATTTCTATCGATAGAGTTGGTCACTGTTTGTGCA < 2:205182/126‑1 GATTATTTAATCATTAAAGTCAATTGACCGCTTGATCAGCCTCTTGTGGTGTCAAAGAGGTATTTTTAGCCAGAGCCTGACTCACTTCATTTCTATCGATAGAGTTGGTCACTGTTTGTGCACGTG > 2:2977/1‑126 GATTATTTAATCATTAAAGTCAATTGACCGCTTGATCAGCCTCTTGTGGTGTCAAAGAGGTATTTTTAGCCAGAGCCTGACTCACTTCATTTCTATCGATAGAGTTGGTCACTGTTTGTGCACGTG < 1:25247/126‑1 ATTATTTAATCATTAAAGTCAATTGACCGCTTGATCAGCCTCTTGTGGTGTCAAAGAGGTATTTTTAGCCAGAGCCTGACTCACTTCATTTCTATCGATAGAGTTGGTCACTGTTTGTGCACGTGT > 2:70672/1‑126 ATTATTTAATCATTAAAGTCAATTGACCGCTTGATCAGCCTCTTGTGGTGTCAAAGAGGTATTTTTAGCCAGAGCCCGACTCACTTCATTTCTATCGATAGAGTTGGTCACTGTTTGTGCACGTGT > 2:67589/1‑126 TTATTTAATCATTAAAGTCAATTGACCGCTTGATCAGCCTCTTGTGGTGTCAAAGAGGTATTTTTAGCCAGAGCCTGACTCACTTCATTTCTATCGATAGAGTTGGTCACTGTTTGTGCACGTGTT > 2:373808/1‑126 AATCATTAAAGTCAATTGACCGCTTGATCAGCCTCTTGTGGTGTCAAAGAGGTATTTTTAGCCAGAGCCTGACTCACTTCATTTCTATCGATAGAGTTGGTCACTGTTTGTGCACGTGTTTTTAAC > 1:381013/1‑126 AATCATTAAAGTCAATTGACCGCTTGATCAGCCTCTTGTGGTGTCAAAGAGGTATTTTTAGCCAGAGCCTGACTCACTTCATTTCTATCGATAGAGTTGGTCACTGTTTGTGCACGTGTTTTTAAC > 2:441972/1‑126 TAAAGTCAATTGACCGCTTGATCAGCCTCTTGTGGTGTCAAAGAGGTATTTTTAGCCAGAGCCTGACTCACTTCATTTCTATCGATAGAGTTGGTCACTGTTTGTGCACGTGTTTTTAACGTATTT < 1:104359/126‑1 TATTGAGAAAATGAAAATCAAATTTTACAACTAGTGAGTCATGTGATATTAGGTTCAGTATTGATACATAAGTAATGGTAATCTAAATTGGCTAAAGATGAAAATTGATTATTTAATCATTAAAGT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > ADP1‑WT/941180‑941305‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑tCAATTGACCGCTTGATCAGCCTCTTGTGGTGTCAAAGAGGTATTTTTAGCCAGAGCCTGACTCACTTCATTTCTATCGATAGAGTTGGTCACTGTTTGTGCACGTGTTTTTAACGTATTT > ADP1‑WT/944855‑944974 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |