Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
MC JC | ADP1‑WT | 941,306 | Δ3,549 bp | IS1236‑mediated | ACIAD0952–[ACIAD0959] | ACIAD0952, ACIAD0953, ACIAD0955, ACIAD0956, ACIAD0957, ACIAD0958, [ACIAD0959] |
Missing coverage evidence... | ||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
* | * | ÷ | ADP1‑WT | 941306 | 944854 | 3549 | 39 [0] | [0] 39 | ACIAD0952–[ACIAD0959] | ACIAD0952,ACIAD0953,ACIAD0955,ACIAD0956,ACIAD0957,ACIAD0958,[ACIAD0959] |
New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | ADP1‑WT | = 941305 | 0 (0.000) | 38 (1.100) | 31/248 | 0.2 | 100% | noncoding (1237/1237 nt) | IS1236 | repeat region |
? | ADP1‑WT | 944855 = | 0 (0.000) | noncoding (2/1237 nt) | IS1236 | repeat region |
AAAGTGCATAATCAATTGCTTGCTGTTTAAATTCAGGACTAAAACGTTTGGCCATTTCTTGGATCTCCAAAGTTAACGTTACGTTATCTTTAGAGGGAAGTACTGTCCATTATTTTGGCTAGGATCAATTGACCGCTTGATCAGCCTCTTGTGGTGTCAAAGAGGTATTTTTAGCCAGAGCCTGACTCACTTCATTTCTATCGATAGAGTTGGTCACTGTTTGTGCACGTGTTTTTAACGTATTTGATAAT > ADP1‑WT/944730‑944980 | attgagaaaatgaaaatcaaattttacaactagtgagtcatgtgatattaggttcagtattgatacataagtaatggtaatctaaattggctaaagatgaaaattgattatttaatcattaaagtc > 2:493542‑M2/126‑126 (MQ=255) attgagaaaatgaaaatcaaattttacaactagtgagtcatgtgatattaggttcagtattgatacataagtaatggtaatctaaattggctaaagatgaaaattgattatttaatcattaaagtc > 2:101650‑M2/126‑126 (MQ=255) aaaatgaaaatcaaattttacaactagtgagtcatgtgatattaggttcagtattgatacataagtaatggtaatctaaattggctaaagatgaaaattgattatttaatcattaaagtCAATTGa > 2:389527‑M2/120‑126 (MQ=255) aaaatgaaaatcaaattttacaactagtgagtcatgtgatattaggttcagtattgatacataagtaatggtaatctaaattggctaaagatgaaaattgattatttaatcattaaagtCAATTGa < 1:459946‑M2/7‑1 (MQ=255) aatgaaaatcaaattttacaactagtgagtcatgtgatattaggttcagtattgatacataagtaatggtaatctaaattggctaaagatgaaaattgattatttaatcattaaagtCAATTGAcc > 1:443509‑M2/118‑126 (MQ=255) atgaaaatcaaattttacaactagtgagtcatgtgatattaggttcagtattgatacataagtaatggtaatctaaattggctaaagatgaaaattgattatttaatcattaaagtCAATTGACCg < 2:443541‑M2/10‑1 (MQ=255) atgaaaatcaaattttacaactagtgagtcatgtgatattaggttcagtattgatacataagtaatggtaatctaaattggctaaagatgaaaattgattatttaatcattaaagtCAATTGACCg > 1:205498‑M2/117‑126 (MQ=255) tcaaattttacaactagtgagtcatgtgatattaggttcagtattgatacataagtaatggtaatctaaattggctaaagatgaaaattgattatttaatcattaaagtCAATTGACCGCTTGATc < 2:200785‑M2/17‑1 (MQ=255) caaattttacaactagtgagtcatgtgatattaggttcagtattgatacataagtaatggtaatctaaattggctaaagatgaaaattgattatttaatcattaaagtCAATTGACCGCTTGATCa < 2:456566‑M2/18‑1 (MQ=255) tacaactagtgagtcatgtgatattaggttcagtattgatacataagtaatggtaatctaaattggctaaagatgaaaattgattatttaatcattaaagtCAATTGACCGCTTGATCAGCCTCtt > 1:24887‑M2/102‑126 (MQ=255) gagtcatgtgatattaggttcagtattgatacataagtaatggtaatctaaattggctaaagatgaaaattgattatttaatcattaaagtCAATTGACCGCTTGATCAGCCTCTTGTGGTGTCaa < 1:390089‑M2/35‑1 (MQ=255) agtcatgtgatattaggttcagtattgatacataagtaatggtaatctaaattggctaaagatgaaaattgattatttaatcattaaagtCAATTGACCGCTTGATCAGCCTCTTGTGGTGTCaaa > 2:104234‑M2/91‑126 (MQ=255) tgatattaggttcagtattgatacataagtaatggtaatctaaattggctaaagatgaaaattgattatttaatcattaaagtCAATTGACCGCTTGATCAGCCTCTTGTGGTGTCAAAGAGGTAt < 1:264654‑M2/43‑1 (MQ=255) tgatattaggttcagtattgatacataagtaatggtaatctaaattggctaaagatgaaaattgattatttaatcattaaagtCAATTGACCGCTTGATCAGCCTCTTGTGGTGTCAAAGAGGTAt < 1:273531‑M2/43‑1 (MQ=255) gatattaggttcagtattgatacataagtaatggtaatctaaattggctaaagatgaaaattgattatttaatcattaaagtCAATTGACCGCTTGATCAGCCTCTTGTGGTGTCAAAGAGGTAtt < 1:375075‑M2/44‑1 (MQ=255) tattaggttcagtattgatacataagtaatggtaatctaaattggctaaagatgaaaattgattatttaatcattaaagtCAATTGACCGCTTGATCAGCCTCTTGTGGTGTCAAAGAGGTAtttt > 2:25214‑M2/81‑126 (MQ=255) tattaggttcagtattgatacataagtaatggtaatctaaattggctaaagatgaaaattgattatttaatcattaaagtCAATTGACCGCTTGATCAGCCTCTTGTGGTGTCAAAGAGGTAtttt < 2:379351‑M2/46‑1 (MQ=255) ttaggttcagtattgatacataagtaatggtaatctaaattggctaaagatgaaaattgattatttaatcattaaagtCAATTGACCGCTTGATCAGCCTCTTGTGGTGTCAAAGAGGTATTTTTa < 1:276045‑M2/48‑1 (MQ=255) ttaggttcagtattgatacataagtaatggtaatctaaattggctaaagatgaaaattgattatttaatcattaaagtCAATTGACCGCTTGATCAGCCTCTTGTGGTGTCAAAGAGGTATTTTTa < 1:197047‑M2/48‑1 (MQ=255) taggttcagtattgatacataagtaatggtaatctaaattggctaaagatgaaaattgattatttaatcattaaagtCAATTGACCGCTTGATCAGCCTCTTGTGGTGTCAAAGAGGTATTTTTAg < 2:447955‑M2/49‑1 (MQ=255) agtattgatacataagtaatggtaatctaaattggctaaagatgaaaattgattatttaatcattaaagtCAATTGACCGCTTGATCAGCCTCTTGTGGTGTCAAAGAGGTATTTTTAGCCAGAGc > 1:167257‑M2/71‑126 (MQ=255) tattgatacataagtaatggtaatctaaattggctaaagatgaaaattgattatttaatcattaaagtCAATTGACCGCTTGATCAGCCTCTTGTGGTGTCAAAGAGGTATTTTTAGCCAGAGCCt < 1:189633‑M2/58‑1 (MQ=255) ggtaatctaaattggctaaagatgaaaattgattatttaatcattaaagtCAATTGACCGCTTGATCAGCCTCTTGTGGTGTCAAAGAGGTATTTTTAGCCAGAGCCTGACTCACTTCATTTCTAt < 2:119077‑M2/76‑1 (MQ=255) ggtaatctaaattggctaaagatgaaaattgattatttaatcattaaagtCAATTGACCGCTTGATCAGCCTCTTGTGGTGTCAAAGAGGTACTTTTAGCCAGAGCCTGACTCACTTCATTTCTAt < 2:73085‑M2/76‑1 (MQ=255) taatctaaattggctaaagatgaaaattgattatttaatcattaaagtCAATTGACCGCTTGATCAGCCTCTTGTGGTGTCAAAGAGGTATTTTTAGCCAGAGCCTGACTCACTTCATTTCTATCg < 2:442874‑M2/78‑1 (MQ=255) taatctaaattggctaaagatgaaaattgattatttaatcattaaagtCAATTGACCGCTTGATCAGCCTCTTGTGGTGTCAAAGAGGTATTTTTAGCCAGAGCCTGACTCACTTCATTTCTATCg < 1:321476‑M2/78‑1 (MQ=255) taaagatgaaaattgattatttaatcattaaagtCAATTGACCGCTTGATCAGCCTCTTGTGGTGTCAAAGAGGTATTTTTAGCCAGAGCCTGACTCACTTCATTTCTATCGATAGAGTTGGTCAc > 1:389545‑M2/35‑126 (MQ=255) atgaaaattgattatttaatcattaaagtCAATTGACCGCTTGATCAGCCTCTTGTGGTGTCGAAGAGGTATTTTTAGCCAGAGCCTGACTCACTTCATTTCTATCGATAGAGTTGGTCACTGttt < 2:180662‑M2/97‑1 (MQ=255) gaaaattgattatttaatcattaaagtCAATTGACCGCTTGATCAGCCTCTTGTGGTGTCAAAGAGGTATTTTTAGCCAGAGCCTGACTCACTTCATTTCTATCGATAGAGTTGGTCACTGTTtgt > 1:158907‑M2/28‑126 (MQ=255) aattgattatttaatcattaaagtCAATTGACCGCTTGATCAGCCTCTTGTGGTGTCAAAGAGGTATTTTTAGCCAGAGCCTGACTCACTTCATTTCTATCGATAGAGTTGGTCACTGTTTGTGCa < 2:205182‑M2/102‑1 (MQ=255) gattatttaatcattaaagtCAATTGACCGCTTGATCAGCCTCTTGTGGTGTCAAAGAGGTATTTTTAGCCAGAGCCTGACTCACTTCATTTCTATCGATAGAGTTGGTCACTGTTTGTGCACgtg < 1:25247‑M2/106‑1 (MQ=255) gattatttaatcattaaagtCAATTGACCGCTTGATCAGCCTCTTGTGGTGTCAAAGAGGTATTTTTAGCCAGAGCCTGACTCACTTCATTTCTATCGATAGAGTTGGTCACTGTTTGTGCACgtg > 2:2977‑M2/21‑126 (MQ=255) attatttaatcattaaagtCAATTGACCGCTTGATCAGCCTCTTGTGGTGTCAAAGAGGTATTTTTAGCCAGAGCCTGACTCACTTCATTTCTATCGATAGAGTTGGTCACTGTTTGTGCACgtgt > 2:70672‑M2/20‑126 (MQ=255) attatttaatcattaaagtCAATTGACCGCTTGATCAGCCTCTTGTGGTGTCAAAGAGGTATTTTTAGCCAGAGCCCGACTCACTTCATTTCTATCGATAGAGTTGGTCACTGTTTGTGCACgtgt > 2:67589‑M2/20‑126 (MQ=255) ttatttaatcattaaagtCAATTGACCGCTTGATCAGCCTCTTGTGGTGTCAAAGAGGTATTTTTAGCCAGAGCCTGACTCACTTCATTTCTATCGATAGAGTTGGTCACTGTTTGTGCACGTGtt > 2:373808‑M2/19‑126 (MQ=255) aatcattaaagtCAATTGACCGCTTGATCAGCCTCTTGTGGTGTCAAAGAGGTATTTTTAGCCAGAGCCTGACTCACTTCATTTCTATCGATAGAGTTGGTCACTGTTTGTGCACGTGTTTTTAAc > 1:381013‑M2/13‑126 (MQ=255) aatcattaaagtCAATTGACCGCTTGATCAGCCTCTTGTGGTGTCAAAGAGGTATTTTTAGCCAGAGCCTGACTCACTTCATTTCTATCGATAGAGTTGGTCACTGTTTGTGCACGTGTTTTTAAc > 2:441972‑M2/13‑126 (MQ=255) taaagtCAATTGACCGCTTGATCAGCCTCTTGTGGTGTCAAAGAGGTATTTTTAGCCAGAGCCTGACTCACTTCATTTCTATCGATAGAGTTGGTCACTGTTTGTGCACGTGTTTTTAACGTAttt < 1:104359‑M2/120‑1 (MQ=255) cAATTGACCGCTTGATCAGCCTCTTGTGGTGTCAAAGAGGTATTTTTAGCCAGAGCCTGACTCACTTCATTTCTATCGATAGAGTTGGTCACTGTTTGTGCACGTGTTTTTAACGTATTTGATAAt < 2:24854/126‑1 (MQ=255) | AAAGTGCATAATCAATTGCTTGCTGTTTAAATTCAGGACTAAAACGTTTGGCCATTTCTTGGATCTCCAAAGTTAACGTTACGTTATCTTTAGAGGGAAGTACTGTCCATTATTTTGGCTAGGATCAATTGACCGCTTGATCAGCCTCTTGTGGTGTCAAAGAGGTATTTTTAGCCAGAGCCTGACTCACTTCATTTCTATCGATAGAGTTGGTCACTGTTTGTGCACGTGTTTTTAACGTATTTGATAAT > ADP1‑WT/944730‑944980 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |