Predicted mutation | ||||||
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evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
MC JC | ADP1‑WT | 941,306 | Δ3,549 bp | IS1236‑mediated | ACIAD0952–[ACIAD0959] | ACIAD0952, ACIAD0953, ACIAD0955, ACIAD0956, ACIAD0957, ACIAD0958, [ACIAD0959] |
Missing coverage evidence... | ||||||||||
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seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
* | * | ÷ | ADP1‑WT | 941306 | 944854 | 3549 | 39 [0] | [0] 39 | ACIAD0952–[ACIAD0959] | ACIAD0952,ACIAD0953,ACIAD0955,ACIAD0956,ACIAD0957,ACIAD0958,[ACIAD0959] |
New junction evidence | |||||||||||
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seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | ADP1‑WT | = 941305 | 0 (0.000) | 38 (1.100) | 31/248 | 0.2 | 100% | noncoding (1237/1237 nt) | IS1236 | repeat region |
? | ADP1‑WT | 944855 = | 0 (0.000) | noncoding (2/1237 nt) | IS1236 | repeat region |
TATTGAGAAAATGAAAATCAAATTTTACAACTAGTGAGTCATGTGATATTAGGTTCAGTATTGATACATAAGTAATGGTAATCTAAATTGGCTAAAGATGAAAATTGATTATTTAATCATTAAAGTGATCCTAGACAGTATCGTGGACAACAAATCCCTCTAAATTCTTGAAATATTTCTGTTCAAAGGCTTCTGGGCTTAACCAGCCGTTTGTAGAATGTCGTCTGATTCGATTGTAATAAATCT > ADP1‑WT/941180‑941425 | tatTGAGAAAATGAAAATCAAATTTTACAACTAGTGAGTCATGTGATATTAGGTTCAGTATTGATACATAAGTAATGGTAATCTAAATTGGCTAAAGATGAAAATTGATTATTTAATCATTAAAGT > 1:140617‑M1/1‑126 (MQ=255) atTGAGAAAATGAAAATCAAATTTTACAACTAGTGAGTCATGTGATATTAGGTTCAGTATTGATACATAAGTAATGGTAATCTAAATTGGCTAAAGATGAAAATTGATTATTTAATCATTAAAGTc > 2:101650‑M1/1‑125 (MQ=255) atTGAGAAAATGAAAATCAAATTTTACAACTAGTGAGTCATGTGATATTAGGTTCAGTATTGATACATAAGTAATGGTAATCTAAATTGGCTAAAGATGAAAATTGATTATTTAATCATTAAAGTc > 2:493542‑M1/1‑125 (MQ=255) aaaatgaaaatCAAATTTTACAACTAGTGAGTCATGTGATATTAGGTTCAGTATTGATACATAAGTAATGGTAATCTAAATTGGCTAAAGATGAAAATTGATTATTTAATCATTAAAGTcaattga < 1:459946‑M1/126‑8 (MQ=255) 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TATTGAGAAAATGAAAATCAAATTTTACAACTAGTGAGTCATGTGATATTAGGTTCAGTATTGATACATAAGTAATGGTAATCTAAATTGGCTAAAGATGAAAATTGATTATTTAATCATTAAAGTGATCCTAGACAGTATCGTGGACAACAAATCCCTCTAAATTCTTGAAATATTTCTGTTCAAAGGCTTCTGGGCTTAACCAGCCGTTTGTAGAATGTCGTCTGATTCGATTGTAATAAATCT > ADP1‑WT/941180‑941425 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |