| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | 223 | = 698 | 0 (0.000) | 64 (1.130) +AGTTGGCAGCATCAC |
50/170 | 0.2 | 86.2% | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| ? | 36 | 4798 = | 24 (0.360) | intergenic (–/–) | –/– | –/– | |||||
Only 100 of 103 total aligned reads displayed.
ATAAAAATTCCCTGAATTAAAAAATCCATTGATATAATTTATAGATACAGACAGTAAAATGTTCTGCCACGTTACAATACTCTTATCAGTAATAGGCTGGCAAAAACTTTATTGCTTTATAAGATGCTTGCGCACGTAAGAAGAGAGTGGTATTAAACAAATGTATAATTACTTTATTTTTATTGGGTTAAACTATGAATA > 36/4698‑4898 | aTAAAAATTCCCTGAATTAAAAAATCCATTGATATAATTTATAGATACAGACAGTAAAATGTTCTGCCACGTTAGAATACTCTTATCAGTAATAGGCTGGc > 2:1404503/1‑101 (MQ=255)aTAAAAATTCCCTGAATTAAAAAATCCATTGATATAATTTATAGATACAGACAGTAAAATGTTCTGCCACGTTACAATACTCTTATCAGTAATAGGCTGGc > 2:866993/1‑101 (MQ=255)aTAAAAATTCCCTGAATTAAAAAATCCATTGATATAATTTATAGATACAGACAGTAAAATGTTCTGCCACGTTACAATACTCTTATCAGTAATAGGCTGGc > 2:656674/1‑101 (MQ=255)aTAAAAATTCCCTGAATTAAAAAATCCATTGATATAATTTATAGATACAGACAGTAAAATGTTCTGCCACGTTACAATACTCTTATCAGTAATAGGCTGGc > 1:1326852/1‑101 (MQ=255) aaaTTCCCTGAATTAAAAAATCCATTGATATAATTTATAGATACAGACAGTAAAATGTTCTGCCACGTTACAATACTCTTATCAGTAATAGGCTGGCaaaa > 2:545779/1‑101 (MQ=255) aaaTTCCCTGAATTAAAAAATCCATTGATATAATTTATAGATACAGACAGTAAAATGTTCTGCCACGTTACAATACTCTTATCAGTAATAGGCTGGCaaaa > 2:532379/1‑101 (MQ=255) aaaTTCCCTGAATTAAAAAATCCATTGATATAATTTATAGATACAGACAGTAAAATGTTCTGCCACGTTACAATACTCTTATCAGTAATAGGCTGGCaaaa > 2:1265412/1‑101 (MQ=255) aaTTCCCTGAATTAAAAAATCCATTGATATAATTTATAGATACAGACAGTAAAATGTTCTGCCACGTTACAATACTCTTATCAGTAATAGGCTGGCaaaaa > 2:1176790/1‑101 (MQ=255) tagctgaacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcacCAAAAAc < 1:355898‑M2/7‑1 (MQ=255) aTTCCCTGAATTAAAAAATCCATTGATATAATTTATAGATACAGACAGTAAAATGTTCTGCCACGTTACAATACTCTTATCAGTAATAGGCTGGCAAAAAc < 2:811276/101‑1 (MQ=255) ttCCCTGAATTAAAAAATCCATTGATATAATTTATAGATACAGACAGTAAAATGTTCTGCCACGTTACAATACTCTTATCAGTAATAGGCTGGCAAAAACt > 2:334972/1‑101 (MQ=255) ttCCCTGAATTAAAAAATCCATTGATATAATTTATAGATACAGACAGTAAAATGTTCTGCCACGTTACAATACTCTTATCAGTAATAGGCTGGCAAAAACt < 1:378122/101‑1 (MQ=255) agctgaacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcacCAAAAACt > 2:159495‑M2/94‑101 (MQ=255) agctgaacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcacCAAAAACt < 1:47454‑M2/8‑1 (MQ=255) gctgaacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcacCAAAAACtt > 1:1069191‑M2/93‑101 (MQ=255) ccTGAATTAAAAAATCCATTGATATAATTTATAGATACAGACAGTAAAATGTTCTGCCACGTTACAATACTCTTATCAGTAATAGGCTGGCAAAAACtttg > 2:1651545/1‑100 (MQ=255) ccTGAATTAAAAAATCCATTGATATAATTTATAGATACAGACAGTAAAATGTTCTGCCACGTTACAATACTCTTATCAGTAATAGGCTGGCAAAAACtttg < 2:1698424/101‑2 (MQ=255) gAATTAAAAAATCCATTGATATAATTTATAGATACAGACAGTAAAATGTTCTGCCACGTTACAATACTCTTATCAGTAATAGGCTGGCAAAAACtttggta < 2:754503/101‑5 (MQ=255) gAATTAAAAAATCCATTGATATAATTTATAGATACAGACAGTAAAATGTTCTGCCACGTTACAATACTCTTATCAGTAATAGGCTGGCAAAAACtttggta < 2:1161758/101‑5 (MQ=255) aggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcacCAAAAACTTTATTGCt > 2:1501403‑M2/86‑101 (MQ=255) aTTAAAAAATCCATTGATATAATTTATAGATACAGACAGTAAAATGTTCTGCCACGTTACAATACTCTTATCAGTAATAGGCTGGCAAAAACtttggtaat < 1:192399/101‑7 (MQ=255) aTTAAAAAATCCATTGATATAATTTATAGATACAGACAGTAAAATGTTCTGCCACGTTACAATACTCTTATCAGTAATAGGCTGGCAAAAACtttggtaat > 2:1013350/1‑95 (MQ=255) aTTAAAAAATCCATTGATATAATTTATAGATACAGACAGTAAAATGTTCTGCCACGTTACAATACTCTTATCAGTAATAGGCTGGCAAAAACtttggtaat < 2:962973/101‑7 (MQ=255) aTTAAAAAATCCATTGATATAATTTATAGATACAGACAGTAAAATGTTCTGCCACGTTACAATACTCTTATCAGTAATAGGCTGGCAAAAACtttggtaat < 1:1550349/101‑7 (MQ=255) ttAAAAAATCCATTGATATAATTTATAGATACAGACAGTAAAATGTTCTGCCACGTTACAATACTCTTATCAGTAATAGGCTGGCAAAAACtttggtaatg < 2:1488572/101‑8 (MQ=255) gagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcacCAAAAACTTTATTGCttt < 2:1022882‑M2/18‑1 (MQ=255) aaaaaaTCCATTGATATAATTTATAGATACAGACAGTAAAATGTTCTGCCACGTTACAATACTCTTATCAGTAATAGGCTGGCAAAAACtttggtaatgac < 2:1052291/101‑10 (MQ=255) aaaaaTCCATTGATATAATTTATAGATACAGACAGTAAAATGTTCTGCCACGTTACAATACTCTTATCAGTAATAGGCTGGCAAAAACtttggtaatgact > 1:171633/1‑91 (MQ=255) aaaaaTCCATTGATATAATTTAGAGATACAGCCAGTAAAATGTGCTGCCCCGTTTCAATACGCTTATCAGTAATAGGCTTGCAAAAACtttggtaatgact < 2:298398/101‑11 (MQ=255) acagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcacCAAAAACTTTATTGCTTTATAAg < 2:448539‑M2/23‑1 (MQ=255) cagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcacCAAAAACTTTATTGCTTTATAAGa < 2:1408816‑M2/24‑1 (MQ=255) cagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcacCAAAAACTTTATTGCTTTATAAGa < 1:403830‑M2/24‑1 (MQ=255) ctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcacCAAAAACTTTATTGCTTTATAAGATGc < 2:1570839‑M2/27‑1 (MQ=255) ctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcacCAAAAACTTTATTGCTTTATAAGATGc < 1:459377‑M2/27‑1 (MQ=255) gatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcacCAAAAACTTTATTGCTTTATAAGATGCtt < 1:505325‑M2/29‑1 (MQ=255) atagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcacCAAAAACTTTATTGCTTTATAAGATGCTTg > 2:1575818‑M2/72‑101 (MQ=255) atagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcacCAAAAACTTTATTGCTTTATAAGATGCTTg > 2:1133380‑M2/72‑101 (MQ=255) tagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcacCAAAAACTTTATTGCTTTATAAGATGCTTgc < 2:352358‑M2/31‑1 (MQ=255) agaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcacCAAAAACTTTATTGCTTTATAAGATGCTTgcg < 1:1264499‑M2/32‑1 (MQ=255) agaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcacCAAAAACTTTATTGCTTTATAAGATGCTTgcg > 2:1633452‑M2/70‑101 (MQ=255) aagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcacCAAAAACTTTATTGCTTTATAAGATGCTTGCGCACGTaag > 1:72456‑M2/62‑101 (MQ=255) gccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcacCAAAAACTTTATTGCTTTATAAGATGCTTGCGCACGTaagaa < 1:1542925‑M2/42‑1 (MQ=255) cactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggaagcggcacCAAACGATTTATTGCCTTATAAGATGCTTGCGCCCGTAagaaga < 2:1717243‑M2/44‑1 (MQ=255) actggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcacCAAAAACTTTATTGCTTTATAAGATGCTTGCGCACGTAAGAagag > 2:239766‑M2/57‑101 (MQ=255) ctggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcacCAAAAACTTTATTGCTTTATAAGATGCTTGCGCACGTAAGAagaga < 2:1172176‑M2/46‑1 (MQ=255) ctggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcacCAAAAACTTTATTGCTTTATAAGATGCTTGCGCACGTAAGAagaga < 1:1627274‑M2/46‑1 (MQ=255) ctggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcacCAAAAACTTTATTGCTTTATAAGATGCTTGCGCACGTAAGAagaga > 2:801151‑M2/56‑101 (MQ=255) ctggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcacCAAAAACTTTATTGCTTTATAAGATGCTTGCGCACGTAAGAagaga < 2:1126711‑M2/46‑1 (MQ=255) agcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcacCAAAAACTTTATTGCTTTATAAGATGCTTGCGCACGTAAGAAGAGAGTgg > 1:314973‑M2/52‑101 (MQ=255) cacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcacCAAAAACTTTATTGCTTTATAAGATGCTTGCGCACGTAAGAAGAGAGTGGTa < 2:1450242‑M2/52‑1 (MQ=255) cacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcacCAAAAACTTTATTGCTTTATAAGATGCTTGCGCACGTAAGAAGAGAGTGGTa < 1:477924‑M2/52‑1 (MQ=255) acctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcacCAAAAACTTTATTGCTTTATAAGATGCTTGCGCACGTAAGAAGAGAGTGGTAt < 1:1133385‑M2/53‑1 (MQ=255) acctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcacCAAAAACTTTATTGCTTTATAAGATGCTTGCGCACGTAAGAAGAGAGTGGTAt > 1:1533563‑M2/49‑101 (MQ=255) cctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcacCAAAAACTTTATTGCTTTATAAGATGCTTGCGCACGTAAGAAGAGAGTGGTAtt < 2:756567‑M2/54‑1 (MQ=255) ctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcacCAAAAACTTTATTGCTTTATAAGATGCTTGCGCACGTAAGAAGAGAGTGGTATTa < 1:159495‑M2/55‑1 (MQ=255) ctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcacCAAAAACTTTATTGCTTTATAAGATGCTTGCGCACGTAAGAAGAGAGTGGTATTa > 1:1304902‑M2/47‑101 (MQ=255) ctcaaaaacaccatcatacactaaagcagtaagttggcagcatcacCAAAAACTTTATTGTTTTATAAGATGCTTGCGCACGTAAGAAGAGAGTGGTATTa < 1:964634‑M2/55‑1 (MQ=255) aaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcacCAAAAACTTTATTGCTTTATAAGATGCTTGCGCACGTAAGAAGAGAGTGGTATTAAAc > 2:491477‑M2/44‑101 (MQ=255) aaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcacCAAAAACTTTATTGCTTTATAAGATGCTTGCGCACGTAAGAAGAGAGTGGTATTAAACa < 1:856405‑M2/59‑1 (MQ=255) aaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcacCAAAAACTTTATTGCTTTATAAGATGCTTGCGCACGTAAGAAGAGAGTGGTATTAAACaa > 1:11053‑M2/42‑101 (MQ=255) aaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcacCAAAAACTTTATTGCTTTATAAGATGCTTGCGCACGTAAGAAGAGAGTGGTATTAAACaa > 1:504724‑M2/42‑101 (MQ=255) aacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcacCAAAAACTTTATTGCTTTATAAGATGCTTGCGCACGTAAGAAGAGAGTGGTATTAAACaaa < 1:1150129‑M2/61‑1 (MQ=255) acaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcacCAAAAACTTTATTGCTTTATAAGATGCTTGCGCACGTAAGAAGAGAGTGGTATTAAACAAAt < 2:597592‑M2/62‑1 (MQ=255) accatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcacCAAAAACTTTATTGCTTTATAAGATGCTTGCGCACGTAAGAAGAGAGTGGTATTAAACAAATGt > 1:352252‑M2/38‑101 (MQ=255) catcatacactaaatcagtaagttggcagcatcacCAAAAACTTTATTGCTTTATAAGATGCTTGCGCACGTAAGAAGAGAGTGGTATTAAACAAATGtat < 1:466669‑M2/66‑1 (MQ=255) catcatacactaaatcagtaagttggcagcatcacCAAAAACTTTATTGCTTTATAAGATGCTTGCGCACGTAAGAAGAGAGTGGTATTAAACAAATGtat > 2:1309192‑M2/36‑101 (MQ=255) atcatacactaaatcagtaagttggcagcatcacCAAAAACTTTATTGCTTTATAAGATGCTTGCGCACGTAAGAAGAGAGTGGTATTAAACAAATGtata < 2:979001‑M2/67‑1 (MQ=255) atcatacactaaatcagtaagttggcagcatcacCAAAAACTTTATTGCTTTATAAGATGCTTGCGCACGTAAGAAGAGAGTGGTATTAAACAAATGtata > 2:845521‑M2/35‑101 (MQ=255) atcatacactaaatcagtaagttggcagcatcacCAAAAACTTTATTGCTTTATAAGATGCTTGCGCACGTAAGAAGAGAGTGGTATTAAACAAATGtata > 2:132818‑M2/35‑101 (MQ=255) atcatacactaaatcagtaagttggcagcatcacCAAAAACTTTATTGCTTTATAAGATGCTTGCGCACGTAAGAAGAGAGTGGTATTAAACAAATGtata > 2:517925‑M2/35‑101 (MQ=255) atcatacactaaatcagtaagttggcagcatcacCAAAAACTTTATTGCTTTATAAGATGCTTGCGCACGTAAGAAGAGAGTGGTATTAAACAAATGtata > 2:466877‑M2/35‑101 (MQ=255) catacactaaatcagtaagttggcagcatcacCAAAAACTTTATTGCTTTATAAGATGCTTGCGCACGTAAGAAGAGAGTGGTATTAAACAAATGTATAAt < 1:132818‑M2/69‑1 (MQ=255) atacactaaatcagtaagttggcagcatcacCAAAAACTTTATTGCTTTATAAGATGCTTGCGCACGTAAGAAGAGAGTGGTATTAAACAAATGTATAAtt < 2:529345‑M2/70‑1 (MQ=255) acactaaatcagtaagttggcagcatcacCAAAAACTTTATTGCTTTATAAGATGCTTGCGCACGTAAGAAGAGAGTGGTATTAAACAAATGTATAATTAc > 1:1017944‑M2/30‑101 (MQ=255) acactaaatcagtaagttggcagcatcacCAAAAACTTTATTGCTTTATAAGATGCTTGCGCACGTAAGAAGAGAGTGGTATTAAACAAATGTATAATTAc > 1:841237‑M2/30‑101 (MQ=255) cactaaatcagtaagttggcagcatcacCAAAAACTTTATTGCTTTATAAGATGCTTGCGCACGTAAGAAGAGAGTGGTATTAAACAAATGTATAATTACt > 2:438608‑M2/29‑101 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |